MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR04

Total Repeats: 3783

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_013747	CGA	2	6	112082	112087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176244
2502	NC_013747	CCT	2	6	112088	112093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176244
2503	NC_013747	CGG	2	6	112102	112107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176244
2504	NC_013747	TCG	2	6	112237	112242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176244
2505	NC_013747	AGC	2	6	112257	112262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176244
2506	NC_013747	CGC	2	6	112382	112387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176244
2507	NC_013747	GCA	2	6	112396	112401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176244
2508	NC_013747	TCG	4	12	112601	112612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176245
2509	NC_013747	CGC	2	6	112623	112628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176245
2510	NC_013747	GTC	2	6	112657	112662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176245
2511	NC_013747	CCG	2	6	112667	112672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176245
2512	NC_013747	GTC	2	6	112702	112707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176245
2513	NC_013747	TCG	2	6	112712	112717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176245
2514	NC_013747	GCC	2	6	112739	112744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176245
2515	NC_013747	GT	3	6	112862	112867	0 %	50 %	50 %	0 %	284176245
2516	NC_013747	TCGA	2	8	113230	113237	25 %	25 %	25 %	25 %	284176246
2517	NC_013747	CGGC	2	8	113261	113268	0 %	0 %	50 %	50 %	284176246
2518	NC_013747	CGCTC	2	10	113285	113294	0 %	20 %	20 %	60 %	284176246
2519	NC_013747	CGAT	2	8	113309	113316	25 %	25 %	25 %	25 %	284176246
2520	NC_013747	CG	3	6	113335	113340	0 %	0 %	50 %	50 %	284176246
2521	NC_013747	TCG	2	6	113383	113388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176246
2522	NC_013747	CCG	2	6	113389	113394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176246
2523	NC_013747	ATCCCG	2	12	113401	113412	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	284176246
2524	NC_013747	TCG	2	6	113440	113445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176246
2525	NC_013747	CGT	2	6	113450	113455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176246
2526	NC_013747	CGG	2	6	113481	113486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176246
2527	NC_013747	TTCCCC	2	12	113515	113526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176246
2528	NC_013747	GAC	2	6	113566	113571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176246
2529	NC_013747	CGC	2	6	113585	113590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176246
2530	NC_013747	ACC	2	6	113602	113607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284176246
2531	NC_013747	GCGT	2	8	113608	113615	0 %	25 %	50 %	25 %	284176246
2532	NC_013747	CCG	2	6	113616	113621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176246
2533	NC_013747	CGG	2	6	113643	113648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176246
2534	NC_013747	TCG	2	6	113743	113748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176246
2535	NC_013747	GC	3	6	113751	113756	0 %	0 %	50 %	50 %	284176246
2536	NC_013747	CG	3	6	113757	113762	0 %	0 %	50 %	50 %	284176246
2537	NC_013747	GC	3	6	113766	113771	0 %	0 %	50 %	50 %	284176246
2538	NC_013747	GCGA	2	8	113785	113792	25 %	0 %	50 %	25 %	284176246
2539	NC_013747	GC	3	6	113870	113875	0 %	0 %	50 %	50 %	284176246
2540	NC_013747	GCC	2	6	113911	113916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176246
2541	NC_013747	GCGAC	2	10	113918	113927	20 %	0 %	40 %	40 %	284176246
2542	NC_013747	CGC	2	6	113928	113933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176246
2543	NC_013747	CCG	2	6	113942	113947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176246
2544	NC_013747	GCC	2	6	113953	113958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176246
2545	NC_013747	CGA	2	6	113972	113977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176246
2546	NC_013747	GTTC	2	8	114112	114119	0 %	50 %	25 %	25 %	284176247
2547	NC_013747	CGGT	2	8	114168	114175	0 %	25 %	50 %	25 %	284176247
2548	NC_013747	CGC	3	9	114253	114261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176247
2549	NC_013747	TCGT	2	8	114263	114270	0 %	50 %	25 %	25 %	284176247
2550	NC_013747	TCCA	2	8	114306	114313	25 %	25 %	0 %	50 %	284176247
2551	NC_013747	CCG	2	6	114391	114396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176247
2552	NC_013747	GTCG	2	8	114425	114432	0 %	25 %	50 %	25 %	284176247
2553	NC_013747	GATC	2	8	114433	114440	25 %	25 %	25 %	25 %	284176247
2554	NC_013747	CGGCG	2	10	114583	114592	0 %	0 %	60 %	40 %	284176247
2555	NC_013747	GTC	2	6	114653	114658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176247
2556	NC_013747	CCG	2	6	114668	114673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176247
2557	NC_013747	GGA	2	6	114757	114762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284176247
2558	NC_013747	CGC	2	6	114812	114817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176247
2559	NC_013747	CGA	2	6	114908	114913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176247
2560	NC_013747	CG	3	6	114936	114941	0 %	0 %	50 %	50 %	284176247
2561	NC_013747	CGT	2	6	114946	114951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176247
2562	NC_013747	CGA	2	6	114982	114987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176247
2563	NC_013747	CGT	2	6	114992	114997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176247
2564	NC_013747	CGT	2	6	115003	115008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176247
2565	NC_013747	TCGA	2	8	115028	115035	25 %	25 %	25 %	25 %	284176247
2566	NC_013747	CGCC	3	12	115139	115150	0 %	0 %	25 %	75 %	284176247
2567	NC_013747	GTC	2	6	115209	115214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176247
2568	NC_013747	ATC	2	6	115236	115241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284176247
2569	NC_013747	CGA	2	6	115369	115374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176247
2570	NC_013747	CGA	2	6	115378	115383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176247
2571	NC_013747	GTA	3	9	115424	115432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176247
2572	NC_013747	CCT	2	6	115444	115449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176247
2573	NC_013747	GA	3	6	115452	115457	50 %	0 %	50 %	0 %	284176247
2574	NC_013747	TCG	2	6	115482	115487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176247
2575	NC_013747	CGG	2	6	115490	115495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176247
2576	NC_013747	CGT	3	9	115510	115518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176247
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2578	NC_013747	TCG	2	6	115620	115625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176247
2579	NC_013747	CGA	2	6	115634	115639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176247
2580	NC_013747	GTC	2	6	115655	115660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176247
2581	NC_013747	AAC	2	6	115718	115723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284176247
2582	NC_013747	CGC	2	6	116139	116144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176248
2583	NC_013747	ACCT	2	8	116176	116183	25 %	25 %	0 %	50 %	284176248
2584	NC_013747	CTG	3	9	116218	116226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176248
2585	NC_013747	GTC	3	9	116251	116259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176248
2586	NC_013747	ACG	2	6	116273	116278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176248
2587	NC_013747	GAC	2	6	116326	116331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176248
2588	NC_013747	GAC	2	6	116335	116340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176248
2589	NC_013747	CGG	2	6	116381	116386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176248
2590	NC_013747	ACG	2	6	116387	116392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176248
2591	NC_013747	GAC	2	6	116413	116418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176248
2592	NC_013747	CGA	2	6	116423	116428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176248
2593	NC_013747	TCG	2	6	116432	116437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176248
2594	NC_013747	CA	3	6	116460	116465	50 %	0 %	0 %	50 %	284176248
2595	NC_013747	GC	3	6	116480	116485	0 %	0 %	50 %	50 %	284176248
2596	NC_013747	CGG	2	6	116486	116491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176248
2597	NC_013747	TCCGGA	2	12	116528	116539	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	284176248
2598	NC_013747	GAC	2	6	116542	116547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176248
2599	NC_013747	CGG	2	6	116566	116571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176248
2600	NC_013747	GCT	2	6	116670	116675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176248
2601	NC_013747	CGG	3	9	116685	116693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176248
2602	NC_013747	CAC	3	9	116746	116754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284176248
2603	NC_013747	GCG	2	6	116756	116761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176248
2604	NC_013747	GCG	2	6	116777	116782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176248
2605	NC_013747	TCG	2	6	116810	116815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176248
2606	NC_013747	GGACG	2	10	116829	116838	20 %	0 %	60 %	20 %	284176248
2607	NC_013747	TCG	3	9	116870	116878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176248
2608	NC_013747	CGA	2	6	116880	116885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176248
2609	NC_013747	GTC	2	6	116926	116931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176248
2610	NC_013747	CAG	2	6	116941	116946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176248
2611	NC_013747	CGGC	2	8	116978	116985	0 %	0 %	50 %	50 %	284176248
2612	NC_013747	GCG	2	6	116998	117003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176248
2613	NC_013747	CGA	2	6	117033	117038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176248
2614	NC_013747	TCG	2	6	117095	117100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176248
2615	NC_013747	TCT	2	6	117134	117139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284176248
2616	NC_013747	GTC	3	9	117196	117204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176248
2617	NC_013747	GTC	2	6	117234	117239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176248
2618	NC_013747	AGC	2	6	117272	117277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176248
2619	NC_013747	CGT	2	6	117414	117419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176249
2620	NC_013747	CGA	2	6	117426	117431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176249
2621	NC_013747	GAC	2	6	117442	117447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176249
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2853	NC_013747	CGG	2	6	128115	128120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176258
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2855	NC_013747	CGA	2	6	128170	128175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176258
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2976	NC_013747	GAC	2	6	133055	133060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176261
2977	NC_013747	CGC	3	9	133108	133116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176261
2978	NC_013747	CCG	2	6	133230	133235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176262
2979	NC_013747	CGC	2	6	133284	133289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176262
2980	NC_013747	CGC	2	6	133342	133347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176262
2981	NC_013747	GTC	2	6	133360	133365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176262
2982	NC_013747	TCG	2	6	133367	133372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176262
2983	NC_013747	GAGCAG	2	12	133387	133398	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	284176262
2984	NC_013747	GTC	3	9	133420	133428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176262
2985	NC_013747	CCG	2	6	133455	133460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176262
2986	NC_013747	AGT	2	6	133491	133496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176262
2987	NC_013747	GCA	2	6	133509	133514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176262
2988	NC_013747	TCG	2	6	133604	133609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176262
2989	NC_013747	GGT	2	6	133668	133673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284176262
2990	NC_013747	CGT	2	6	133734	133739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176262
2991	NC_013747	CGA	2	6	133746	133751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176262
2992	NC_013747	TCGCT	2	10	133805	133814	0 %	40 %	20 %	40 %	284176262
2993	NC_013747	TCGA	2	8	133840	133847	25 %	25 %	25 %	25 %	284176262
2994	NC_013747	GTA	2	6	133849	133854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176262
2995	NC_013747	TTC	2	6	134000	134005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284176262
2996	NC_013747	GCG	2	6	134006	134011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176262
2997	NC_013747	ACG	2	6	134021	134026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176262
2998	NC_013747	GCT	2	6	134116	134121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176262
2999	NC_013747	TAACA	2	10	134135	134144	60 %	20 %	0 %	20 %	284176262
3000	NC_013747	GCGAC	2	10	134291	134300	20 %	0 %	40 %	40 %	284176263

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