MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR03

Total Repeats: 169

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013746	AG	3	6	3318	3323	50 %	0 %	50 %	0 %	284172858
2	NC_013746	GT	3	6	3532	3537	0 %	50 %	50 %	0 %	284172858
3	NC_013746	TC	3	6	3544	3549	0 %	50 %	0 %	50 %	284172858
4	NC_013746	TC	3	6	5909	5914	0 %	50 %	0 %	50 %	284172860
5	NC_013746	TC	3	6	6861	6866	0 %	50 %	0 %	50 %	284172861
6	NC_013746	GA	3	6	8960	8965	50 %	0 %	50 %	0 %	284172862
7	NC_013746	GA	3	6	9072	9077	50 %	0 %	50 %	0 %	284172862
8	NC_013746	TA	3	6	9080	9085	50 %	50 %	0 %	0 %	284172862
9	NC_013746	GA	3	6	11158	11163	50 %	0 %	50 %	0 %	284172864
10	NC_013746	GA	3	6	11676	11681	50 %	0 %	50 %	0 %	284172866
11	NC_013746	TC	3	6	12012	12017	0 %	50 %	0 %	50 %	284172866
12	NC_013746	AG	3	6	14452	14457	50 %	0 %	50 %	0 %	284172868
13	NC_013746	CT	3	6	14587	14592	0 %	50 %	0 %	50 %	284172868
14	NC_013746	TC	3	6	14827	14832	0 %	50 %	0 %	50 %	284172868
15	NC_013746	GA	3	6	15870	15875	50 %	0 %	50 %	0 %	284172869
16	NC_013746	CG	3	6	19096	19101	0 %	0 %	50 %	50 %	284172872
17	NC_013746	AG	3	6	19185	19190	50 %	0 %	50 %	0 %	284172872
18	NC_013746	GA	3	6	19664	19669	50 %	0 %	50 %	0 %	284172872
19	NC_013746	CA	3	6	20962	20967	50 %	0 %	0 %	50 %	284172873
20	NC_013746	TC	3	6	21019	21024	0 %	50 %	0 %	50 %	284172873
21	NC_013746	GA	3	6	21025	21030	50 %	0 %	50 %	0 %	284172873
22	NC_013746	CT	3	6	24099	24104	0 %	50 %	0 %	50 %	284172875
23	NC_013746	AC	3	6	27466	27471	50 %	0 %	0 %	50 %	284172876
24	NC_013746	GC	3	6	28047	28052	0 %	0 %	50 %	50 %	284172877
25	NC_013746	GT	3	6	28285	28290	0 %	50 %	50 %	0 %	284172878
26	NC_013746	AG	3	6	28477	28482	50 %	0 %	50 %	0 %	284172878
27	NC_013746	AG	3	6	28772	28777	50 %	0 %	50 %	0 %	284172878
28	NC_013746	GA	3	6	32447	32452	50 %	0 %	50 %	0 %	284172881
29	NC_013746	CG	4	8	36643	36650	0 %	0 %	50 %	50 %	284172887
30	NC_013746	CA	3	6	37655	37660	50 %	0 %	0 %	50 %	284172889
31	NC_013746	CT	3	6	39765	39770	0 %	50 %	0 %	50 %	284172893
32	NC_013746	TC	3	6	40935	40940	0 %	50 %	0 %	50 %	284172894
33	NC_013746	CA	3	6	41351	41356	50 %	0 %	0 %	50 %	284172894
34	NC_013746	GA	4	8	41449	41456	50 %	0 %	50 %	0 %	284172895
35	NC_013746	GA	3	6	41655	41660	50 %	0 %	50 %	0 %	284172895
36	NC_013746	AT	3	6	41825	41830	50 %	50 %	0 %	0 %	284172895
37	NC_013746	TA	3	6	42013	42018	50 %	50 %	0 %	0 %	284172895
38	NC_013746	TC	3	6	47253	47258	0 %	50 %	0 %	50 %	284172900
39	NC_013746	GA	3	6	49218	49223	50 %	0 %	50 %	0 %	284172901
40	NC_013746	GT	3	6	49327	49332	0 %	50 %	50 %	0 %	284172901
41	NC_013746	AT	3	6	51004	51009	50 %	50 %	0 %	0 %	284172904
42	NC_013746	AT	3	6	51068	51073	50 %	50 %	0 %	0 %	284172904
43	NC_013746	TC	3	6	52250	52255	0 %	50 %	0 %	50 %	284172906
44	NC_013746	CG	3	6	52379	52384	0 %	0 %	50 %	50 %	284172906
45	NC_013746	CG	3	6	52933	52938	0 %	0 %	50 %	50 %	284172906
46	NC_013746	CG	3	6	53092	53097	0 %	0 %	50 %	50 %	284172907
47	NC_013746	GA	3	6	53865	53870	50 %	0 %	50 %	0 %	284172908
48	NC_013746	GA	3	6	53903	53908	50 %	0 %	50 %	0 %	284172908
49	NC_013746	AG	3	6	54105	54110	50 %	0 %	50 %	0 %	284172908
50	NC_013746	GA	3	6	54373	54378	50 %	0 %	50 %	0 %	284172908
51	NC_013746	AG	3	6	55475	55480	50 %	0 %	50 %	0 %	284172909
52	NC_013746	AC	3	6	57124	57129	50 %	0 %	0 %	50 %	284172911
53	NC_013746	TC	3	6	57408	57413	0 %	50 %	0 %	50 %	284172911
54	NC_013746	TG	3	6	57780	57785	0 %	50 %	50 %	0 %	284172912
55	NC_013746	TG	3	6	57968	57973	0 %	50 %	50 %	0 %	284172913
56	NC_013746	CT	3	6	58003	58008	0 %	50 %	0 %	50 %	284172913
57	NC_013746	GA	3	6	58181	58186	50 %	0 %	50 %	0 %	284172913
58	NC_013746	TC	3	6	58461	58466	0 %	50 %	0 %	50 %	284172913
59	NC_013746	GA	3	6	59886	59891	50 %	0 %	50 %	0 %	284172915
60	NC_013746	CG	3	6	61537	61542	0 %	0 %	50 %	50 %	284172917
61	NC_013746	GC	4	8	63256	63263	0 %	0 %	50 %	50 %	284172918
62	NC_013746	TG	3	6	65431	65436	0 %	50 %	50 %	0 %	284172919
63	NC_013746	GC	3	6	65472	65477	0 %	0 %	50 %	50 %	284172919
64	NC_013746	CT	3	6	65788	65793	0 %	50 %	0 %	50 %	284172919
65	NC_013746	GA	4	8	66031	66038	50 %	0 %	50 %	0 %	284172919
66	NC_013746	TG	3	6	68042	68047	0 %	50 %	50 %	0 %	284172920
67	NC_013746	AC	3	6	68376	68381	50 %	0 %	0 %	50 %	284172921
68	NC_013746	AC	3	6	68387	68392	50 %	0 %	0 %	50 %	284172921
69	NC_013746	TA	3	6	71606	71611	50 %	50 %	0 %	0 %	284172922
70	NC_013746	CT	3	6	71724	71729	0 %	50 %	0 %	50 %	284172922
71	NC_013746	TG	3	6	72663	72668	0 %	50 %	50 %	0 %	284172923
72	NC_013746	CT	3	6	74731	74736	0 %	50 %	0 %	50 %	284172924
73	NC_013746	CT	3	6	74970	74975	0 %	50 %	0 %	50 %	284172924
74	NC_013746	TA	3	6	75016	75021	50 %	50 %	0 %	0 %	284172924
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81	NC_013746	GC	3	6	90683	90688	0 %	0 %	50 %	50 %	284172937
82	NC_013746	CG	3	6	93426	93431	0 %	0 %	50 %	50 %	284172939
83	NC_013746	CG	3	6	93930	93935	0 %	0 %	50 %	50 %	284172939
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103	NC_013746	TC	3	6	121909	121914	0 %	50 %	0 %	50 %	284172975
104	NC_013746	GC	3	6	122029	122034	0 %	0 %	50 %	50 %	284172975
105	NC_013746	GA	3	6	122489	122494	50 %	0 %	50 %	0 %	284172976
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108	NC_013746	AG	3	6	124137	124142	50 %	0 %	50 %	0 %	284172979
109	NC_013746	AT	3	6	124418	124423	50 %	50 %	0 %	0 %	284172979
110	NC_013746	TC	4	8	127531	127538	0 %	50 %	0 %	50 %	284172985
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112	NC_013746	GC	3	6	129075	129080	0 %	0 %	50 %	50 %	284172987
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.