MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR03

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013746	AATCCG	2	12	7036	7047	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	284172861
2	NC_013746	CTGTGT	2	12	11525	11536	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	284172865
3	NC_013746	ACTCCC	2	12	16264	16275	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	284172869
4	NC_013746	CTTCCA	2	12	18432	18443	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	284172871
5	NC_013746	TCGACA	2	12	21957	21968	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	284172874
6	NC_013746	GGACGC	2	12	23798	23809	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	284172875
7	NC_013746	CGCTGG	2	12	23976	23987	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	284172875
8	NC_013746	ATTCGG	2	12	30587	30598	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	284172879
9	NC_013746	GACGTA	2	12	40908	40919	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284172894
10	NC_013746	CCTGCC	2	12	55510	55521	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	284172909
11	NC_013746	TAGTCG	2	12	56458	56469	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	284172911
12	NC_013746	TCGATA	2	12	61078	61089	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	284172917
13	NC_013746	TCCCGG	2	12	61805	61816	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	284172917
14	NC_013746	CGTCCG	2	12	65187	65198	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	284172919
15	NC_013746	TGGCGT	2	12	67244	67255	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	284172920
16	NC_013746	GAGTTC	2	12	67416	67427	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	284172920
17	NC_013746	TCTCTT	2	12	71631	71642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172922
18	NC_013746	TCGCTC	2	12	81471	81482	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	284172928
19	NC_013746	GTCCCG	2	12	83083	83094	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	284172929
20	NC_013746	ATCGCC	2	12	87810	87821	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	284172935
21	NC_013746	CCGTGA	2	12	90540	90551	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	284172937
22	NC_013746	AGAAAC	2	12	91048	91059	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	284172937
23	NC_013746	ACTGGA	2	12	97835	97846	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284172942
24	NC_013746	TCTGAT	2	12	97997	98008	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	284172942
25	NC_013746	AGACGA	2	12	106888	106899	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	284172951
26	NC_013746	TGAGAG	2	12	108296	108307	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	284172953
27	NC_013746	ATGTTA	2	12	108927	108938	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	284172954
28	NC_013746	CGGCTT	2	12	115375	115386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172963
29	NC_013746	CAGATC	2	12	115848	115859	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	284172963
30	NC_013746	TCGGTG	2	12	116103	116114	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	284172963
31	NC_013746	ATCTTC	2	12	132072	132083	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	284172989
32	NC_013746	TCCACG	2	12	139233	139244	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	284172995
33	NC_013746	GACGAG	2	12	141502	141513	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	284172996
34	NC_013746	GATCGA	2	12	147537	147548	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284173002
35	NC_013746	GATCGG	2	12	159673	159684	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	284173014
36	NC_013746	ACGTCA	2	12	160595	160606	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	284173015
37	NC_013746	CACGAA	2	12	163536	163547	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	284173015
38	NC_013746	TCGCTG	2	12	164620	164631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284173016
39	NC_013746	ATCTCG	2	12	166245	166256	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	284173016
40	NC_013746	GGCGCT	2	12	167403	167414	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	284173017
41	NC_013746	GCTTCC	2	12	168221	168232	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	284173018
42	NC_013746	GAAGCT	2	12	172220	172231	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284173021
43	NC_013746	CGCTGG	2	12	172358	172369	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	284173021
44	NC_013746	ATCGTG	2	12	174441	174452	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	284173023
45	NC_013746	TCACGT	2	12	175866	175877	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	284173024
46	NC_013746	AGCAGT	2	12	178688	178699	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284173028

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.