MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR03

Total Repeats: 325

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013746	GACG	2	8	858	865	25 %	0 %	50 %	25 %	284172856
2	NC_013746	ACGG	2	8	2351	2358	25 %	0 %	50 %	25 %	284172857
3	NC_013746	GATG	2	8	3310	3317	25 %	25 %	50 %	0 %	284172858
4	NC_013746	AGCG	2	8	3434	3441	25 %	0 %	50 %	25 %	284172858
5	NC_013746	TCAG	2	8	3604	3611	25 %	25 %	25 %	25 %	284172858
6	NC_013746	TTCA	2	8	4363	4370	25 %	50 %	0 %	25 %	284172859
7	NC_013746	TGGA	2	8	4439	4446	25 %	25 %	50 %	0 %	284172859
8	NC_013746	GGTG	2	8	5858	5865	0 %	25 %	75 %	0 %	284172860
9	NC_013746	ATCG	2	8	6006	6013	25 %	25 %	25 %	25 %	284172860
10	NC_013746	CTCG	2	8	6269	6276	0 %	25 %	25 %	50 %	284172860
11	NC_013746	TGTT	2	8	6843	6850	0 %	75 %	25 %	0 %	284172861
12	NC_013746	GGGA	2	8	8688	8695	25 %	0 %	75 %	0 %	284172862
13	NC_013746	AGCA	2	8	9131	9138	50 %	0 %	25 %	25 %	284172862
14	NC_013746	CTGG	2	8	11201	11208	0 %	25 %	50 %	25 %	284172864
15	NC_013746	GATC	3	12	11427	11438	25 %	25 %	25 %	25 %	284172865
16	NC_013746	TCGG	2	8	11982	11989	0 %	25 %	50 %	25 %	284172866
17	NC_013746	TTCG	2	8	12026	12033	0 %	50 %	25 %	25 %	284172866
18	NC_013746	CACG	2	8	12106	12113	25 %	0 %	25 %	50 %	284172866
19	NC_013746	CGAG	2	8	12138	12145	25 %	0 %	50 %	25 %	284172866
20	NC_013746	TGCT	2	8	13826	13833	0 %	50 %	25 %	25 %	284172868
21	NC_013746	CGAT	2	8	14012	14019	25 %	25 %	25 %	25 %	284172868
22	NC_013746	CCCA	2	8	14502	14509	25 %	0 %	0 %	75 %	284172868
23	NC_013746	ATTT	2	8	14818	14825	25 %	75 %	0 %	0 %	284172868
24	NC_013746	CGTC	2	8	15376	15383	0 %	25 %	25 %	50 %	284172869
25	NC_013746	CGCA	2	8	16003	16010	25 %	0 %	25 %	50 %	284172869
26	NC_013746	CGTC	2	8	17331	17338	0 %	25 %	25 %	50 %	284172870
27	NC_013746	CGAT	2	8	17477	17484	25 %	25 %	25 %	25 %	284172870
28	NC_013746	ACGA	2	8	17572	17579	50 %	0 %	25 %	25 %	284172870
29	NC_013746	GAGT	2	8	18346	18353	25 %	25 %	50 %	0 %	284172871
30	NC_013746	GCTG	2	8	19137	19144	0 %	25 %	50 %	25 %	284172872
31	NC_013746	TGAC	2	8	19208	19215	25 %	25 %	25 %	25 %	284172872
32	NC_013746	TTCC	2	8	19479	19486	0 %	50 %	0 %	50 %	284172872
33	NC_013746	AGTC	2	8	20797	20804	25 %	25 %	25 %	25 %	284172873
34	NC_013746	TGGC	2	8	21786	21793	0 %	25 %	50 %	25 %	284172874
35	NC_013746	AAAG	2	8	21823	21830	75 %	0 %	25 %	0 %	284172874
36	NC_013746	CCAC	2	8	23721	23728	25 %	0 %	0 %	75 %	284172875
37	NC_013746	GCTG	2	8	23814	23821	0 %	25 %	50 %	25 %	284172875
38	NC_013746	CGGG	2	8	28103	28110	0 %	0 %	75 %	25 %	284172877
39	NC_013746	GACT	2	8	28276	28283	25 %	25 %	25 %	25 %	284172877
40	NC_013746	CCCA	2	8	28747	28754	25 %	0 %	0 %	75 %	284172878
41	NC_013746	GGGT	2	8	31004	31011	0 %	25 %	75 %	0 %	284172880
42	NC_013746	ATCA	2	8	32390	32397	50 %	25 %	0 %	25 %	284172881
43	NC_013746	CTTC	2	8	32664	32671	0 %	50 %	0 %	50 %	284172882
44	NC_013746	GTCG	2	8	33646	33653	0 %	25 %	50 %	25 %	284172884
45	NC_013746	TGAC	2	8	33665	33672	25 %	25 %	25 %	25 %	284172884
46	NC_013746	AGGA	2	8	33791	33798	50 %	0 %	50 %	0 %	284172884
47	NC_013746	GGTC	2	8	33816	33823	0 %	25 %	50 %	25 %	284172884
48	NC_013746	GAGG	2	8	33960	33967	25 %	0 %	75 %	0 %	284172884
49	NC_013746	GTCG	2	8	36400	36407	0 %	25 %	50 %	25 %	284172887
50	NC_013746	TCGG	2	8	36443	36450	0 %	25 %	50 %	25 %	284172887
51	NC_013746	TGCT	2	8	37467	37474	0 %	50 %	25 %	25 %	284172888
52	NC_013746	CGAT	2	8	37591	37598	25 %	25 %	25 %	25 %	284172889
53	NC_013746	ATCA	2	8	38147	38154	50 %	25 %	0 %	25 %	284172890
54	NC_013746	CGAA	2	8	38225	38232	50 %	0 %	25 %	25 %	284172890
55	NC_013746	CGGG	2	8	39266	39273	0 %	0 %	75 %	25 %	284172892
56	NC_013746	TGAC	2	8	39332	39339	25 %	25 %	25 %	25 %	284172892
57	NC_013746	CCGA	2	8	40537	40544	25 %	0 %	25 %	50 %	284172893
58	NC_013746	GGTC	2	8	40691	40698	0 %	25 %	50 %	25 %	284172893
59	NC_013746	GACC	2	8	40772	40779	25 %	0 %	25 %	50 %	284172893
60	NC_013746	CCGA	2	8	40972	40979	25 %	0 %	25 %	50 %	284172894
61	NC_013746	CCTC	2	8	41155	41162	0 %	25 %	0 %	75 %	284172894
62	NC_013746	TTCG	2	8	41211	41218	0 %	50 %	25 %	25 %	284172894
63	NC_013746	CTGC	2	8	41542	41549	0 %	25 %	25 %	50 %	284172895
64	NC_013746	GCCC	2	8	41867	41874	0 %	0 %	25 %	75 %	284172895
65	NC_013746	GTCG	2	8	41980	41987	0 %	25 %	50 %	25 %	284172895
66	NC_013746	TTGA	2	8	41996	42003	25 %	50 %	25 %	0 %	284172895
67	NC_013746	GGAC	2	8	42269	42276	25 %	0 %	50 %	25 %	284172895
68	NC_013746	GCCC	2	8	42319	42326	0 %	0 %	25 %	75 %	284172895
69	NC_013746	AGCC	2	8	42658	42665	25 %	0 %	25 %	50 %	284172895
70	NC_013746	TGAT	2	8	43223	43230	25 %	50 %	25 %	0 %	284172896
71	NC_013746	CAGT	2	8	45407	45414	25 %	25 %	25 %	25 %	284172897
72	NC_013746	CTTC	2	8	45477	45484	0 %	50 %	0 %	50 %	284172897
73	NC_013746	GAAC	2	8	45978	45985	50 %	0 %	25 %	25 %	284172899
74	NC_013746	TTGA	2	8	46091	46098	25 %	50 %	25 %	0 %	284172899
75	NC_013746	GTCG	2	8	48014	48021	0 %	25 %	50 %	25 %	284172901
76	NC_013746	TCGA	2	8	48070	48077	25 %	25 %	25 %	25 %	284172901
77	NC_013746	AGCG	2	8	48618	48625	25 %	0 %	50 %	25 %	284172901
78	NC_013746	CCGT	2	8	48815	48822	0 %	25 %	25 %	50 %	284172901
79	NC_013746	CAGC	2	8	48872	48879	25 %	0 %	25 %	50 %	284172901
80	NC_013746	CGTG	2	8	48959	48966	0 %	25 %	50 %	25 %	284172901
81	NC_013746	GTCC	2	8	49394	49401	0 %	25 %	25 %	50 %	284172901
82	NC_013746	CGGT	2	8	50265	50272	0 %	25 %	50 %	25 %	284172902
83	NC_013746	GACC	2	8	50359	50366	25 %	0 %	25 %	50 %	284172902
84	NC_013746	GGTA	2	8	50547	50554	25 %	25 %	50 %	0 %	284172903
85	NC_013746	CTTC	2	8	52340	52347	0 %	50 %	0 %	50 %	284172906
86	NC_013746	ATCG	2	8	52368	52375	25 %	25 %	25 %	25 %	284172906
87	NC_013746	CCGG	2	8	52399	52406	0 %	0 %	50 %	50 %	284172906
88	NC_013746	CTCG	2	8	52625	52632	0 %	25 %	25 %	50 %	284172906
89	NC_013746	CTTC	2	8	52847	52854	0 %	50 %	0 %	50 %	284172906
90	NC_013746	GAGC	2	8	53895	53902	25 %	0 %	50 %	25 %	284172908
91	NC_013746	CCGC	2	8	54997	55004	0 %	0 %	25 %	75 %	284172909
92	NC_013746	CGGT	2	8	55207	55214	0 %	25 %	50 %	25 %	284172909
93	NC_013746	GTCC	2	8	55436	55443	0 %	25 %	25 %	50 %	284172909
94	NC_013746	TCGA	2	8	55608	55615	25 %	25 %	25 %	25 %	284172909
95	NC_013746	CGTG	2	8	56348	56355	0 %	25 %	50 %	25 %	284172911
96	NC_013746	TCGA	2	8	56359	56366	25 %	25 %	25 %	25 %	284172911
97	NC_013746	CCCT	2	8	56604	56611	0 %	25 %	0 %	75 %	284172911
98	NC_013746	GTCG	2	8	57014	57021	0 %	25 %	50 %	25 %	284172911
99	NC_013746	CCCA	2	8	58025	58032	25 %	0 %	0 %	75 %	284172913
100	NC_013746	CAGC	2	8	58386	58393	25 %	0 %	25 %	50 %	284172913
101	NC_013746	GAAG	2	8	59454	59461	50 %	0 %	50 %	0 %	284172914
102	NC_013746	ATGG	2	8	59512	59519	25 %	25 %	50 %	0 %	284172914
103	NC_013746	AGAT	2	8	59977	59984	50 %	25 %	25 %	0 %	284172915
104	NC_013746	GCCG	2	8	62165	62172	0 %	0 %	50 %	50 %	284172917
105	NC_013746	TTCC	2	8	63117	63124	0 %	50 %	0 %	50 %	284172918
106	NC_013746	GAGT	2	8	63321	63328	25 %	25 %	50 %	0 %	284172918
107	NC_013746	AATC	2	8	65496	65503	50 %	25 %	0 %	25 %	284172919
108	NC_013746	ATGC	2	8	65705	65712	25 %	25 %	25 %	25 %	284172919
109	NC_013746	CGCA	2	8	65901	65908	25 %	0 %	25 %	50 %	284172919
110	NC_013746	CGGT	2	8	66113	66120	0 %	25 %	50 %	25 %	284172919
111	NC_013746	GTCG	2	8	67337	67344	0 %	25 %	50 %	25 %	284172920
112	NC_013746	ACCG	2	8	68395	68402	25 %	0 %	25 %	50 %	284172921
113	NC_013746	TGGC	2	8	71428	71435	0 %	25 %	50 %	25 %	284172922
114	NC_013746	ATGG	2	8	71662	71669	25 %	25 %	50 %	0 %	284172922
115	NC_013746	CGAC	3	12	71752	71763	25 %	0 %	25 %	50 %	284172922
116	NC_013746	GATC	2	8	72531	72538	25 %	25 %	25 %	25 %	284172923
117	NC_013746	ATCT	2	8	72932	72939	25 %	50 %	0 %	25 %	284172923
118	NC_013746	ACTG	2	8	75776	75783	25 %	25 %	25 %	25 %	284172924
119	NC_013746	TTCC	2	8	77333	77340	0 %	50 %	0 %	50 %	284172926
120	NC_013746	TGCC	2	8	77592	77599	0 %	25 %	25 %	50 %	284172926
121	NC_013746	CCTT	2	8	77794	77801	0 %	50 %	0 %	50 %	284172926
122	NC_013746	GAGT	2	8	78652	78659	25 %	25 %	50 %	0 %	284172927
123	NC_013746	TGGT	2	8	78818	78825	0 %	50 %	50 %	0 %	284172927
124	NC_013746	TTTA	2	8	81240	81247	25 %	75 %	0 %	0 %	284172928
125	NC_013746	CGAT	2	8	81597	81604	25 %	25 %	25 %	25 %	284172928
126	NC_013746	GATC	2	8	81694	81701	25 %	25 %	25 %	25 %	284172928
127	NC_013746	TCGA	2	8	81780	81787	25 %	25 %	25 %	25 %	284172928
128	NC_013746	TCGA	2	8	82002	82009	25 %	25 %	25 %	25 %	284172928
129	NC_013746	ACGG	2	8	83104	83111	25 %	0 %	50 %	25 %	284172929
130	NC_013746	TCAT	2	8	84462	84469	25 %	50 %	0 %	25 %	284172930
131	NC_013746	GTAA	2	8	87065	87072	50 %	25 %	25 %	0 %	284172934
132	NC_013746	GGCC	2	8	87193	87200	0 %	0 %	50 %	50 %	284172934
133	NC_013746	GCTC	2	8	89686	89693	0 %	25 %	25 %	50 %	284172936
134	NC_013746	GATC	2	8	90951	90958	25 %	25 %	25 %	25 %	284172937
135	NC_013746	GTCA	2	8	92824	92831	25 %	25 %	25 %	25 %	284172938
136	NC_013746	GCGT	2	8	92926	92933	0 %	25 %	50 %	25 %	284172938
137	NC_013746	AGGT	2	8	93045	93052	25 %	25 %	50 %	0 %	284172938
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.