MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR03

Total Repeats: 2279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013746	TCC	2	6	90864	90869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172937
1002	NC_013746	GATC	2	8	90951	90958	25 %	25 %	25 %	25 %	284172937
1003	NC_013746	CGCTG	2	10	90985	90994	0 %	20 %	40 %	40 %	284172937
1004	NC_013746	AGAAAC	2	12	91048	91059	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	284172937
1005	NC_013746	GAT	2	6	91107	91112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172937
1006	NC_013746	T	6	6	92750	92755	0 %	100 %	0 %	0 %	284172938
1007	NC_013746	GCA	2	6	92814	92819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172938
1008	NC_013746	GTCA	2	8	92824	92831	25 %	25 %	25 %	25 %	284172938
1009	NC_013746	TTC	2	6	92920	92925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172938
1010	NC_013746	GCGT	2	8	92926	92933	0 %	25 %	50 %	25 %	284172938
1011	NC_013746	TCG	2	6	93017	93022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172938
1012	NC_013746	GTT	2	6	93032	93037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284172938
1013	NC_013746	AGGT	2	8	93045	93052	25 %	25 %	50 %	0 %	284172938
1014	NC_013746	TCGG	2	8	93056	93063	0 %	25 %	50 %	25 %	284172938
1015	NC_013746	TCA	2	6	93143	93148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172938
1016	NC_013746	ACC	2	6	93159	93164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284172939
1017	NC_013746	CAA	2	6	93175	93180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284172939
1018	NC_013746	TCG	2	6	93192	93197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172939
1019	NC_013746	TTC	2	6	93201	93206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172939
1020	NC_013746	TGT	2	6	93370	93375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284172939
1021	NC_013746	GAG	2	6	93392	93397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172939
1022	NC_013746	TGG	2	6	93414	93419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284172939
1023	NC_013746	CG	3	6	93426	93431	0 %	0 %	50 %	50 %	284172939
1024	NC_013746	CGA	2	6	93571	93576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172939
1025	NC_013746	AGC	2	6	93645	93650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172939
1026	NC_013746	CGA	3	9	93700	93708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172939
1027	NC_013746	CTCG	2	8	93734	93741	0 %	25 %	25 %	50 %	284172939
1028	NC_013746	TCG	2	6	93798	93803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172939
1029	NC_013746	AAG	2	6	93804	93809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284172939
1030	NC_013746	CAT	2	6	93904	93909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172939
1031	NC_013746	TAGC	2	8	93919	93926	25 %	25 %	25 %	25 %	284172939
1032	NC_013746	CG	3	6	93930	93935	0 %	0 %	50 %	50 %	284172939
1033	NC_013746	GGTCA	2	10	94408	94417	20 %	20 %	40 %	20 %	284172940
1034	NC_013746	GTC	2	6	94495	94500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172940
1035	NC_013746	AGGA	2	8	94525	94532	50 %	0 %	50 %	0 %	284172940
1036	NC_013746	GTA	2	6	94585	94590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172940
1037	NC_013746	GCA	2	6	94598	94603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172940
1038	NC_013746	TCG	2	6	94727	94732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172940
1039	NC_013746	GT	3	6	94804	94809	0 %	50 %	50 %	0 %	284172940
1040	NC_013746	GTG	2	6	94834	94839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284172940
1041	NC_013746	CGGT	2	8	94868	94875	0 %	25 %	50 %	25 %	284172940
1042	NC_013746	TCT	2	6	94904	94909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172940
1043	NC_013746	TTC	2	6	95069	95074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172940
1044	NC_013746	CTTG	2	8	95216	95223	0 %	50 %	25 %	25 %	284172941
1045	NC_013746	AGC	2	6	95239	95244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172941
1046	NC_013746	CGA	2	6	95267	95272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172941
1047	NC_013746	TCG	2	6	95305	95310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172941
1048	NC_013746	CGC	2	6	95334	95339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172941
1049	NC_013746	ACCG	2	8	95367	95374	25 %	0 %	25 %	50 %	284172941
1050	NC_013746	GTC	2	6	95394	95399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172941
1051	NC_013746	GAT	2	6	95450	95455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172941
1052	NC_013746	CGA	2	6	95465	95470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172941
1053	NC_013746	TCT	2	6	95474	95479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172941
1054	NC_013746	GAA	2	6	95532	95537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284172941
1055	NC_013746	TTCCG	2	10	95539	95548	0 %	40 %	20 %	40 %	284172941
1056	NC_013746	CGCGA	2	10	95556	95565	20 %	0 %	40 %	40 %	284172941
1057	NC_013746	GAC	2	6	95610	95615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172941
1058	NC_013746	TAG	2	6	95668	95673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172941
1059	NC_013746	TCGGC	2	10	95684	95693	0 %	20 %	40 %	40 %	284172941
1060	NC_013746	GCG	2	6	95701	95706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172941
1061	NC_013746	CAG	2	6	95744	95749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172941
1062	NC_013746	ATG	2	6	95758	95763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172941
1063	NC_013746	GTC	2	6	95865	95870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172941
1064	NC_013746	GAT	2	6	95877	95882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172941
1065	NC_013746	GCG	2	6	95896	95901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172941
1066	NC_013746	GAA	2	6	97529	97534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284172942
1067	NC_013746	GAT	2	6	97577	97582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172942
1068	NC_013746	TCG	2	6	97586	97591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172942
1069	NC_013746	GGA	2	6	97597	97602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172942
1070	NC_013746	TTCG	2	8	97646	97653	0 %	50 %	25 %	25 %	284172942
1071	NC_013746	TTC	2	6	97672	97677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172942
1072	NC_013746	GTCG	2	8	97742	97749	0 %	25 %	50 %	25 %	284172942
1073	NC_013746	AAATC	2	10	97758	97767	60 %	20 %	0 %	20 %	284172942
1074	NC_013746	TCAT	2	8	97791	97798	25 %	50 %	0 %	25 %	284172942
1075	NC_013746	AACCA	2	10	97806	97815	60 %	0 %	0 %	40 %	284172942
1076	NC_013746	GTC	2	6	97817	97822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172942
1077	NC_013746	ACTGGA	2	12	97835	97846	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284172942
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1079	NC_013746	GCT	2	6	97913	97918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172942
1080	NC_013746	AAG	2	6	97937	97942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284172942
1081	NC_013746	AAT	2	6	97943	97948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284172942
1082	NC_013746	TCTGAT	2	12	97997	98008	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	284172942
1083	NC_013746	CCG	2	6	98037	98042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172942
1084	NC_013746	TAC	2	6	98045	98050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172942
1085	NC_013746	CAT	2	6	98065	98070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172942
1086	NC_013746	CGA	2	6	98071	98076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172942
1087	NC_013746	TAC	2	6	98078	98083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172942
1088	NC_013746	TGA	2	6	98104	98109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172942
1089	NC_013746	CCT	2	6	98137	98142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172942
1090	NC_013746	ACGC	2	8	98238	98245	25 %	0 %	25 %	50 %	284172942
1091	NC_013746	GAC	2	6	98263	98268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172942
1092	NC_013746	CGA	2	6	98324	98329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172942
1093	NC_013746	CGT	2	6	98347	98352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172942
1094	NC_013746	CGG	2	6	98388	98393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172942
1095	NC_013746	AAGG	2	8	98410	98417	50 %	0 %	50 %	0 %	284172942
1096	NC_013746	GAC	2	6	98453	98458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172942
1097	NC_013746	AAT	2	6	98600	98605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284172942
1098	NC_013746	CGC	2	6	98606	98611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172942
1099	NC_013746	CAAT	2	8	98632	98639	50 %	25 %	0 %	25 %	284172942
1100	NC_013746	GAC	2	6	98644	98649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172942
1101	NC_013746	CT	3	6	98673	98678	0 %	50 %	0 %	50 %	284172942
1102	NC_013746	GAGT	2	8	98688	98695	25 %	25 %	50 %	0 %	284172942
1103	NC_013746	TGA	2	6	98808	98813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172942
1104	NC_013746	A	6	6	99441	99446	100 %	0 %	0 %	0 %	284172943
1105	NC_013746	CGA	3	9	99502	99510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172943
1106	NC_013746	CTG	2	6	99635	99640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172944
1107	NC_013746	AGG	2	6	99684	99689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172944
1108	NC_013746	TAC	2	6	99701	99706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172944
1109	NC_013746	TCG	2	6	99753	99758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172944
1110	NC_013746	A	6	6	99773	99778	100 %	0 %	0 %	0 %	284172944
1111	NC_013746	GTC	2	6	99825	99830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172944
1112	NC_013746	CGT	2	6	99845	99850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172944
1113	NC_013746	GTC	2	6	102392	102397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172945
1114	NC_013746	ACA	2	6	102510	102515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284172945
1115	NC_013746	CGT	2	6	102530	102535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172945
1116	NC_013746	CGA	2	6	102536	102541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172945
1117	NC_013746	TCG	2	6	102544	102549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172945
1118	NC_013746	CCT	2	6	102607	102612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172945
1119	NC_013746	TGGC	2	8	103588	103595	0 %	25 %	50 %	25 %	284172946
1120	NC_013746	CGC	2	6	103757	103762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172946
1121	NC_013746	TCG	2	6	103804	103809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172946
1122	NC_013746	CAG	2	6	104253	104258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172947
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1124	NC_013746	ATCT	2	8	104279	104286	25 %	50 %	0 %	25 %	284172947
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1244	NC_013746	CGG	2	6	111761	111766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172958
1245	NC_013746	GAC	2	6	111774	111779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172958
1246	NC_013746	CGA	2	6	111782	111787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172958
1247	NC_013746	GAC	2	6	111801	111806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172958
1248	NC_013746	CTG	2	6	111883	111888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172958
1249	NC_013746	TGA	2	6	111923	111928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172958
1250	NC_013746	CCG	2	6	112015	112020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172958
1251	NC_013746	TCG	2	6	112030	112035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172958
1252	NC_013746	AGAC	2	8	112072	112079	50 %	0 %	25 %	25 %	284172958
1253	NC_013746	TGC	2	6	112100	112105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172958
1254	NC_013746	TCG	2	6	112123	112128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172958
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1259	NC_013746	ACCGA	2	10	112453	112462	40 %	0 %	20 %	40 %	284172959
1260	NC_013746	AAG	2	6	112481	112486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284172959
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1264	NC_013746	CCA	2	6	112652	112657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284172959
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1281	NC_013746	CGGCTT	2	12	115375	115386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172963
1282	NC_013746	CAA	2	6	115433	115438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284172963
1283	NC_013746	TTGC	2	8	115535	115542	0 %	50 %	25 %	25 %	284172963
1284	NC_013746	GCT	2	6	115606	115611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172963
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1322	NC_013746	TCG	2	6	117637	117642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172965
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1335	NC_013746	GTC	2	6	119154	119159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172968
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1349	NC_013746	TCG	2	6	120721	120726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172970
1350	NC_013746	GT	3	6	120730	120735	0 %	50 %	50 %	0 %	284172970
1351	NC_013746	ATG	2	6	120757	120762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172970
1352	NC_013746	AGC	2	6	120897	120902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172971
1353	NC_013746	TCT	2	6	120904	120909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172971
1354	NC_013746	CGT	2	6	120922	120927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172971
1355	NC_013746	CGAC	2	8	120946	120953	25 %	0 %	25 %	50 %	284172971
1356	NC_013746	CGG	2	6	121091	121096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172971
1357	NC_013746	TCGC	2	8	121173	121180	0 %	25 %	25 %	50 %	284172972
1358	NC_013746	GC	3	6	121259	121264	0 %	0 %	50 %	50 %	284172972
1359	NC_013746	GAT	2	6	121340	121345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172973
1360	NC_013746	TCA	2	6	121462	121467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172973
1361	NC_013746	ACTC	2	8	121470	121477	25 %	25 %	0 %	50 %	284172974
1362	NC_013746	TGTCC	2	10	121506	121515	0 %	40 %	20 %	40 %	284172974
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1364	NC_013746	GTAC	2	8	121546	121553	25 %	25 %	25 %	25 %	284172974
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1489	NC_013746	CAAAA	2	10	129622	129631	80 %	0 %	0 %	20 %	284172988
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1491	NC_013746	CGA	2	6	129654	129659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172988
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