MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR02

Total Repeats: 5460

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013745	CCG	2	6	690	695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172525
2	NC_013745	AGA	2	6	802	807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284172525
3	NC_013745	ACG	2	6	906	911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172525
4	NC_013745	TCG	2	6	949	954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172525
5	NC_013745	CGG	2	6	1001	1006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172525
6	NC_013745	CGA	2	6	1024	1029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172525
7	NC_013745	ACG	2	6	1456	1461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172526
8	NC_013745	TCG	2	6	1471	1476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172526
9	NC_013745	CCG	2	6	1546	1551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172526
10	NC_013745	GAC	3	9	1770	1778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172526
11	NC_013745	GGA	2	6	1787	1792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172526
12	NC_013745	TCG	2	6	1816	1821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172526
13	NC_013745	CGA	2	6	2063	2068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172526
14	NC_013745	ACG	2	6	2074	2079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172526
15	NC_013745	GTC	2	6	2081	2086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172526
16	NC_013745	CCG	2	6	2089	2094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172526
17	NC_013745	GAG	2	6	2130	2135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172526
18	NC_013745	TCC	2	6	2155	2160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172526
19	NC_013745	GAC	2	6	2172	2177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172526
20	NC_013745	CAC	2	6	2220	2225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284172526
21	NC_013745	TCG	2	6	2245	2250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172526
22	NC_013745	CCG	2	6	2308	2313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172526
23	NC_013745	TCA	2	6	2460	2465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172527
24	NC_013745	GCA	2	6	2466	2471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172527
25	NC_013745	TCG	2	6	2488	2493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172527
26	NC_013745	GAC	2	6	2521	2526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172527
27	NC_013745	CGA	2	6	2654	2659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172527
28	NC_013745	CGG	2	6	2674	2679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172527
29	NC_013745	CGC	2	6	2720	2725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172527
30	NC_013745	CGA	2	6	2767	2772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172527
31	NC_013745	TGA	2	6	2824	2829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172527
32	NC_013745	TCA	2	6	2863	2868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172527
33	NC_013745	TCA	2	6	2911	2916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172527
34	NC_013745	TAC	2	6	2946	2951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172527
35	NC_013745	GAC	2	6	2961	2966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172527
36	NC_013745	GCG	3	9	2989	2997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172527
37	NC_013745	ACG	3	9	3091	3099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172527
38	NC_013745	AGC	2	6	3100	3105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172527
39	NC_013745	TCG	2	6	3178	3183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172527
40	NC_013745	GAC	3	9	3213	3221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172527
41	NC_013745	GCC	2	6	3371	3376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172527
42	NC_013745	GCC	2	6	3420	3425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172527
43	NC_013745	CGA	2	6	3443	3448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172527
44	NC_013745	CGG	2	6	3787	3792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172528
45	NC_013745	TGC	2	6	3815	3820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172528
46	NC_013745	TCG	4	12	3824	3835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172528
47	NC_013745	TCG	2	6	3845	3850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172528
48	NC_013745	AAC	2	6	3874	3879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284172528
49	NC_013745	CGA	2	6	3933	3938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
50	NC_013745	CGA	3	9	3990	3998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
51	NC_013745	TCG	2	6	4022	4027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172528
52	NC_013745	TCG	2	6	4109	4114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172528
53	NC_013745	CGA	2	6	4158	4163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
54	NC_013745	GCC	2	6	4243	4248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172528
55	NC_013745	CGA	2	6	4287	4292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
56	NC_013745	GTC	3	9	4300	4308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172528
57	NC_013745	CCA	2	6	4344	4349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284172528
58	NC_013745	GAG	2	6	4357	4362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172528
59	NC_013745	GAC	2	6	4368	4373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
60	NC_013745	CGA	2	6	4386	4391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
61	NC_013745	GGT	2	6	4398	4403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284172528
62	NC_013745	CGC	2	6	4421	4426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172528
63	NC_013745	TCG	2	6	4520	4525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172528
64	NC_013745	GCT	2	6	4536	4541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172528
65	NC_013745	TCG	2	6	4586	4591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172528
66	NC_013745	CGT	2	6	4608	4613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172528
67	NC_013745	CGT	2	6	4647	4652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172528
68	NC_013745	GCC	2	6	4658	4663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172528
69	NC_013745	CGA	2	6	4752	4757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
70	NC_013745	GGC	2	6	4839	4844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172528
71	NC_013745	CGA	2	6	4899	4904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
72	NC_013745	ACG	2	6	4973	4978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
73	NC_013745	GAT	2	6	5010	5015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172528
74	NC_013745	GAG	2	6	5026	5031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172528
75	NC_013745	CGC	2	6	5055	5060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172528
76	NC_013745	GAG	2	6	5101	5106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172528
77	NC_013745	TCG	2	6	5215	5220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172528
78	NC_013745	ACG	2	6	5221	5226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
79	NC_013745	GAG	2	6	5227	5232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172528
80	NC_013745	CGT	2	6	5237	5242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172528
81	NC_013745	CGA	2	6	5247	5252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
82	NC_013745	GGC	2	6	5304	5309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172528
83	NC_013745	GCC	2	6	5317	5322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172528
84	NC_013745	GAG	2	6	5323	5328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172528
85	NC_013745	CGT	2	6	5334	5339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172528
86	NC_013745	CGA	2	6	5343	5348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
87	NC_013745	CGA	2	6	5352	5357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
88	NC_013745	CGT	2	6	5358	5363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172528
89	NC_013745	CGA	2	6	5403	5408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
90	NC_013745	CGA	2	6	5424	5429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
91	NC_013745	CGG	2	6	5496	5501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172528
92	NC_013745	AGG	2	6	5525	5530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172528
93	NC_013745	AGC	2	6	5534	5539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
94	NC_013745	CAG	2	6	5578	5583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
95	NC_013745	CGG	2	6	5600	5605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172528
96	NC_013745	CGA	2	6	5607	5612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
97	NC_013745	CGC	2	6	5613	5618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172528
98	NC_013745	GTC	2	6	5623	5628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172528
99	NC_013745	GAG	2	6	5652	5657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172528
100	NC_013745	GAG	2	6	5671	5676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172528
101	NC_013745	CGA	2	6	5754	5759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
102	NC_013745	CGA	2	6	5796	5801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
103	NC_013745	GAT	2	6	5808	5813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172528
104	NC_013745	CGC	2	6	5847	5852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172528
105	NC_013745	CCG	2	6	5855	5860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172528
106	NC_013745	CGG	2	6	5957	5962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172528
107	NC_013745	GTC	2	6	5983	5988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172528
108	NC_013745	CGA	2	6	5991	5996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
109	NC_013745	CGA	3	9	6057	6065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
110	NC_013745	CGA	3	9	6117	6125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
111	NC_013745	CGA	2	6	6129	6134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
112	NC_013745	CGA	2	6	6186	6191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172528
113	NC_013745	CGC	2	6	6375	6380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172529
114	NC_013745	GCG	2	6	6480	6485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172529
115	NC_013745	TCG	2	6	6567	6572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172529
116	NC_013745	GGC	2	6	6595	6600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172529
117	NC_013745	GAC	2	6	6614	6619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172529
118	NC_013745	CGT	2	6	6643	6648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172529
119	NC_013745	CGA	2	6	6781	6786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172529
120	NC_013745	CGA	2	6	6819	6824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172529
121	NC_013745	CGT	2	6	6886	6891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172529
122	NC_013745	CGA	2	6	6892	6897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172529
123	NC_013745	GCG	2	6	6939	6944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172529
124	NC_013745	GAC	2	6	6964	6969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172529
125	NC_013745	CTC	2	6	7112	7117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172529
126	NC_013745	CTC	2	6	7181	7186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172529
127	NC_013745	CGA	2	6	7228	7233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172529
128	NC_013745	TCG	2	6	7404	7409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172530
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253	NC_013745	TCG	2	6	14185	14190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172536
254	NC_013745	GAC	2	6	14193	14198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172536
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373	NC_013745	CGT	2	6	20922	20927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172542
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376	NC_013745	ACT	2	6	21078	21083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172542
377	NC_013745	TCA	2	6	21126	21131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172542
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379	NC_013745	CGT	2	6	21163	21168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172542
380	NC_013745	ACG	2	6	21222	21227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172542
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382	NC_013745	AAC	2	6	21254	21259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284172542
383	NC_013745	GTC	2	6	21260	21265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172542
384	NC_013745	ACG	2	6	21329	21334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172542
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388	NC_013745	CTT	2	6	21526	21531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172542
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396	NC_013745	CGA	2	6	21705	21710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172542
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404	NC_013745	CGC	2	6	22017	22022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172542
405	NC_013745	CGG	2	6	22027	22032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172542
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497	NC_013745	CGA	2	6	27670	27675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172547
498	NC_013745	GAA	2	6	27734	27739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284172547
499	NC_013745	CGT	2	6	27763	27768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172547
500	NC_013745	CGA	2	6	27772	27777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172547

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