MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR01

Total Repeats: 10322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013744	CTC	2	6	95	100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167036
2	NC_013744	GTG	2	6	101	106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284167036
3	NC_013744	CCT	2	6	235	240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167036
4	NC_013744	TCG	2	6	252	257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167036
5	NC_013744	GTT	2	6	368	373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284167036
6	NC_013744	GCG	2	6	409	414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167036
7	NC_013744	GGA	2	6	434	439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167036
8	NC_013744	TGA	2	6	445	450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167036
9	NC_013744	CGA	2	6	484	489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167036
10	NC_013744	CGA	2	6	526	531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167036
11	NC_013744	CTC	2	6	557	562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167036
12	NC_013744	GTT	2	6	590	595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284167036
13	NC_013744	CCG	2	6	612	617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167036
14	NC_013744	TCG	2	6	621	626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167036
15	NC_013744	CCT	2	6	730	735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167036
16	NC_013744	GAC	3	9	761	769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167036
17	NC_013744	AGT	2	6	866	871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167036
18	NC_013744	ACA	2	6	884	889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284167036
19	NC_013744	GCG	2	6	1019	1024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167037
20	NC_013744	GAC	2	6	1029	1034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167037
21	NC_013744	GTC	2	6	1044	1049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167037
22	NC_013744	CCG	2	6	1096	1101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167037
23	NC_013744	GCG	2	6	1190	1195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167037
24	NC_013744	GAT	2	6	1206	1211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167037
25	NC_013744	CGC	2	6	1229	1234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167037
26	NC_013744	CGC	2	6	1268	1273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167037
27	NC_013744	CGG	2	6	1293	1298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167037
28	NC_013744	CGG	2	6	1343	1348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167037
29	NC_013744	ACC	2	6	1448	1453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284167038
30	NC_013744	CCG	2	6	1487	1492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167038
31	NC_013744	CGC	2	6	1548	1553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167038
32	NC_013744	GTC	2	6	1661	1666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167038
33	NC_013744	CGT	2	6	1776	1781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167038
34	NC_013744	CGG	2	6	1827	1832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167038
35	NC_013744	TCG	2	6	1940	1945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167038
36	NC_013744	CCG	2	6	1956	1961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167038
37	NC_013744	CGT	2	6	1989	1994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167038
38	NC_013744	GCG	2	6	2019	2024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167038
39	NC_013744	CGT	2	6	2034	2039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167038
40	NC_013744	TTC	2	6	2096	2101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284167038
41	NC_013744	TCG	2	6	2213	2218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167038
42	NC_013744	GCC	2	6	2278	2283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167038
43	NC_013744	CGC	3	9	2304	2312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167038
44	NC_013744	CGC	2	6	2343	2348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167038
45	NC_013744	CGG	2	6	2394	2399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167038
46	NC_013744	TGG	2	6	2420	2425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284167038
47	NC_013744	ATC	2	6	2500	2505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284167038
48	NC_013744	AGC	2	6	2812	2817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167039
49	NC_013744	CGT	2	6	2819	2824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167039
50	NC_013744	GTC	2	6	2874	2879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167039
51	NC_013744	GCC	2	6	2892	2897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167039
52	NC_013744	GAA	2	6	2898	2903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284167039
53	NC_013744	CCG	2	6	2922	2927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167039
54	NC_013744	CAG	2	6	3286	3291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167040
55	NC_013744	ACC	2	6	3363	3368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284167040
56	NC_013744	CGG	4	12	3432	3443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167040
57	NC_013744	CAG	2	6	3523	3528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167040
58	NC_013744	TGG	2	6	3530	3535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284167040
59	NC_013744	CGA	2	6	3668	3673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167040
60	NC_013744	GAA	2	6	3679	3684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284167040
61	NC_013744	CGG	2	6	3749	3754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167040
62	NC_013744	CGA	3	9	3804	3812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167040
63	NC_013744	GGA	2	6	3876	3881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167040
64	NC_013744	TCG	2	6	3884	3889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167040
65	NC_013744	GAG	2	6	3895	3900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167040
66	NC_013744	AGG	2	6	3920	3925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167040
67	NC_013744	CAG	2	6	4030	4035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167040
68	NC_013744	CGT	2	6	4227	4232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167040
69	NC_013744	CGC	2	6	4323	4328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167040
70	NC_013744	CGA	2	6	4335	4340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167040
71	NC_013744	AGA	2	6	4346	4351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284167040
72	NC_013744	CGA	2	6	4849	4854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167041
73	NC_013744	TTC	2	6	4958	4963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284167041
74	NC_013744	AAG	2	6	4979	4984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284167041
75	NC_013744	GAA	2	6	4993	4998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284167041
76	NC_013744	CGC	2	6	5028	5033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167041
77	NC_013744	AGG	2	6	5034	5039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167041
78	NC_013744	CGT	2	6	5095	5100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167041
79	NC_013744	TTC	2	6	5120	5125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284167041
80	NC_013744	GCC	2	6	5146	5151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167041
81	NC_013744	TGC	2	6	5196	5201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167041
82	NC_013744	CGA	2	6	5209	5214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167041
83	NC_013744	ACG	2	6	5232	5237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167041
84	NC_013744	GCC	2	6	5518	5523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167042
85	NC_013744	CGG	2	6	5531	5536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167042
86	NC_013744	GAG	2	6	5548	5553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167042
87	NC_013744	CAT	2	6	5562	5567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284167042
88	NC_013744	ACG	2	6	5588	5593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167042
89	NC_013744	CCG	2	6	5624	5629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167042
90	NC_013744	GGC	2	6	5671	5676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167042
91	NC_013744	CCA	2	6	5685	5690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284167042
92	NC_013744	GGC	3	9	5691	5699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167042
93	NC_013744	CGT	2	6	5724	5729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167042
94	NC_013744	TCG	2	6	5735	5740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167042
95	NC_013744	ACC	2	6	5801	5806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284167042
96	NC_013744	AGG	2	6	5861	5866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167042
97	NC_013744	CCG	2	6	5879	5884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167042
98	NC_013744	GAA	2	6	5907	5912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284167042
99	NC_013744	CGG	2	6	5924	5929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167042
100	NC_013744	ACG	2	6	5933	5938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167042
101	NC_013744	CGA	2	6	5967	5972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167042
102	NC_013744	CGG	2	6	5990	5995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167042
103	NC_013744	GCC	2	6	6040	6045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167042
104	NC_013744	GAG	2	6	6076	6081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167042
105	NC_013744	GGC	2	6	6183	6188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167042
106	NC_013744	CGC	2	6	6192	6197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167042
107	NC_013744	CGA	2	6	6201	6206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167042
108	NC_013744	CGA	2	6	6222	6227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167042
109	NC_013744	CGG	2	6	6236	6241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167042
110	NC_013744	CGC	2	6	6246	6251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167042
111	NC_013744	TGA	2	6	6300	6305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167042
112	NC_013744	TCG	2	6	6323	6328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167042
113	NC_013744	CGG	2	6	6375	6380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167042
114	NC_013744	CGA	2	6	6389	6394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167042
115	NC_013744	GCC	2	6	6430	6435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167042
116	NC_013744	GTC	2	6	6442	6447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167042
117	NC_013744	GAC	2	6	6463	6468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167042
118	NC_013744	TCC	2	6	6482	6487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167042
119	NC_013744	CGT	2	6	6534	6539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167042
120	NC_013744	GGT	2	6	6550	6555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284167042
121	NC_013744	CGA	2	6	6701	6706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167043
122	NC_013744	ACG	2	6	6793	6798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167043
123	NC_013744	CGG	2	6	6821	6826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167043
124	NC_013744	CCG	2	6	6829	6834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167043
125	NC_013744	GCG	2	6	6841	6846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167043
126	NC_013744	ACG	2	6	6883	6888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167043
127	NC_013744	CGT	2	6	6893	6898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167043
128	NC_013744	CGT	2	6	6910	6915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167043
129	NC_013744	GTC	2	6	6924	6929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167043
130	NC_013744	TGA	2	6	6943	6948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167043
131	NC_013744	GAG	2	6	7047	7052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167043
132	NC_013744	CGC	2	6	7067	7072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167043
133	NC_013744	GAA	2	6	7073	7078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284167043
134	NC_013744	GGC	2	6	7085	7090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167043
135	NC_013744	GAG	2	6	7119	7124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167043
136	NC_013744	GAG	2	6	7134	7139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167043
137	NC_013744	CTG	2	6	7160	7165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167043
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139	NC_013744	CGG	2	6	7207	7212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167043
140	NC_013744	GTC	2	6	7218	7223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167043
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150	NC_013744	TCG	2	6	8119	8124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167044
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152	NC_013744	TCG	2	6	8239	8244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167044
153	NC_013744	CTC	2	6	8271	8276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167044
154	NC_013744	TCG	2	6	8311	8316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167044
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160	NC_013744	TCG	2	6	9109	9114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167045
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162	NC_013744	GTC	2	6	9204	9209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167045
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164	NC_013744	CGG	2	6	9260	9265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167045
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242	NC_013744	TCG	2	6	13106	13111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167048
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248	NC_013744	CGA	2	6	13533	13538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167049
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250	NC_013744	CCG	2	6	13607	13612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167049
251	NC_013744	CGA	2	6	13678	13683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167049
252	NC_013744	CGA	2	6	13744	13749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167049
253	NC_013744	ATC	2	6	13817	13822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284167049
254	NC_013744	GAC	3	9	13840	13848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167049
255	NC_013744	CGA	3	9	13849	13857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167049
256	NC_013744	ACG	2	6	13907	13912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167050
257	NC_013744	CGA	2	6	14034	14039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167050
258	NC_013744	GTC	2	6	14197	14202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167050
259	NC_013744	GAG	2	6	14203	14208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167050
260	NC_013744	CGA	2	6	14223	14228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167050
261	NC_013744	GTC	2	6	14233	14238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167050
262	NC_013744	CGA	2	6	14268	14273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167050
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376	NC_013744	GAA	2	6	19335	19340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284167054
377	NC_013744	CGT	2	6	19427	19432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167054
378	NC_013744	CCT	2	6	19466	19471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167054
379	NC_013744	CGA	2	6	19538	19543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167054
380	NC_013744	GAC	2	6	19548	19553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167054
381	NC_013744	TCC	2	6	19654	19659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167054
382	NC_013744	CGT	2	6	19679	19684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167054
383	NC_013744	CGC	2	6	19695	19700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167054
384	NC_013744	TCG	2	6	19986	19991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167055
385	NC_013744	CGA	2	6	20062	20067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167055
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390	NC_013744	CGA	2	6	20362	20367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167055
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