MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 chromosome

Total Repeats: 92875

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013743	GAC	2	6	161	166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163296
2	NC_013743	CGG	2	6	220	225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163296
3	NC_013743	CGA	2	6	256	261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163296
4	NC_013743	GAGCC	2	10	263	272	20 %	0 %	40 %	40 %	284163296
5	NC_013743	CGA	2	6	283	288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163296
6	NC_013743	GCG	2	6	297	302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163296
7	NC_013743	AGG	2	6	321	326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163296
8	NC_013743	GATCA	2	10	371	380	40 %	20 %	20 %	20 %	284163296
9	NC_013743	CGA	2	6	390	395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163296
10	NC_013743	TCG	2	6	399	404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163296
11	NC_013743	CAA	2	6	595	600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284163296
12	NC_013743	GAA	2	6	610	615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284163296
13	NC_013743	CGA	2	6	628	633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163296
14	NC_013743	CGA	2	6	640	645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163296
15	NC_013743	GCT	2	6	655	660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163296
16	NC_013743	CCA	2	6	684	689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284163296
17	NC_013743	GCGGAC	2	12	692	703	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	284163296
18	NC_013743	GCC	2	6	704	709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163296
19	NC_013743	CGA	2	6	739	744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163296
20	NC_013743	GAC	3	9	773	781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163296
21	NC_013743	CCGGC	2	10	807	816	0 %	0 %	40 %	60 %	284163296
22	NC_013743	CGAA	2	8	852	859	50 %	0 %	25 %	25 %	284163296
23	NC_013743	CGA	2	6	886	891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163296
24	NC_013743	GAC	3	9	956	964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163296
25	NC_013743	CCGAT	2	10	1018	1027	20 %	20 %	20 %	40 %	284163296
26	NC_013743	ACC	2	6	1041	1046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284163296
27	NC_013743	CCTCG	2	10	1048	1057	0 %	20 %	20 %	60 %	284163296
28	NC_013743	GAG	2	6	1127	1132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163296
29	NC_013743	CCGA	2	8	1151	1158	25 %	0 %	25 %	50 %	284163296
30	NC_013743	TCT	2	6	1173	1178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284163296
31	NC_013743	ACG	2	6	1194	1199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163296
32	NC_013743	GTC	3	9	1205	1213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163296
33	NC_013743	TCG	2	6	1239	1244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163296
34	NC_013743	AGA	2	6	1245	1250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284163296
35	NC_013743	GCG	2	6	1251	1256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163296
36	NC_013743	ATC	2	6	1316	1321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163296
37	NC_013743	GAG	3	9	1385	1393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163296
38	NC_013743	ACG	2	6	1410	1415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163296
39	NC_013743	GCG	2	6	1467	1472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163296
40	NC_013743	TG	3	6	1497	1502	0 %	50 %	50 %	0 %	284163296
41	NC_013743	CG	3	6	1531	1536	0 %	0 %	50 %	50 %	284163296
42	NC_013743	CG	3	6	1538	1543	0 %	0 %	50 %	50 %	284163296
43	NC_013743	CCT	2	6	1549	1554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163296
44	NC_013743	TCG	2	6	1599	1604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163296
45	NC_013743	CGT	2	6	1648	1653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163296
46	NC_013743	ATC	2	6	1703	1708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163296
47	NC_013743	GAG	2	6	1778	1783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163296
48	NC_013743	TCA	2	6	1824	1829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163296
49	NC_013743	CGT	3	9	1861	1869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163296
50	NC_013743	GAG	2	6	1922	1927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163296
51	NC_013743	TCC	2	6	1938	1943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163296
52	NC_013743	CGA	2	6	1969	1974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163296
53	NC_013743	ACG	2	6	2135	2140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163297
54	NC_013743	CTC	2	6	2215	2220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163297
55	NC_013743	TCG	2	6	2240	2245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163297
56	NC_013743	GTC	2	6	2281	2286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163297
57	NC_013743	TCGA	2	8	2350	2357	25 %	25 %	25 %	25 %	284163297
58	NC_013743	CGA	2	6	2379	2384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163297
59	NC_013743	GAG	2	6	2401	2406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163297
60	NC_013743	GATC	2	8	2427	2434	25 %	25 %	25 %	25 %	284163297
61	NC_013743	TCC	2	6	2435	2440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163297
62	NC_013743	CGT	2	6	2475	2480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163297
63	NC_013743	ACG	2	6	2494	2499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163297
64	NC_013743	TCG	2	6	2537	2542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163297
65	NC_013743	ACG	2	6	2543	2548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163297
66	NC_013743	CGAT	2	8	2552	2559	25 %	25 %	25 %	25 %	284163297
67	NC_013743	CCGA	2	8	2560	2567	25 %	0 %	25 %	50 %	284163297
68	NC_013743	GCGACG	2	12	2579	2590	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	284163297
69	NC_013743	CGA	2	6	2628	2633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163297
70	NC_013743	CCG	2	6	2981	2986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163298
71	NC_013743	GGCC	2	8	3101	3108	0 %	0 %	50 %	50 %	284163298
72	NC_013743	CCG	2	6	3129	3134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163298
73	NC_013743	GAC	2	6	3215	3220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163298
74	NC_013743	GTC	3	9	3222	3230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163298
75	NC_013743	CGT	2	6	3286	3291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163298
76	NC_013743	GATG	2	8	3400	3407	25 %	25 %	50 %	0 %	284163298
77	NC_013743	CCG	2	6	3416	3421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163298
78	NC_013743	TTG	2	6	3462	3467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284163298
79	NC_013743	CGA	2	6	3538	3543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163298
80	NC_013743	CGA	2	6	3559	3564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163298
81	NC_013743	AGATC	2	10	3565	3574	40 %	20 %	20 %	20 %	284163298
82	NC_013743	GCG	2	6	3622	3627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163298
83	NC_013743	CGC	2	6	3634	3639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163298
84	NC_013743	CGA	2	6	3670	3675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163298
85	NC_013743	GCT	2	6	3683	3688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163298
86	NC_013743	TCG	3	9	3717	3725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163298
87	NC_013743	ACG	2	6	3744	3749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163298
88	NC_013743	CGT	2	6	3751	3756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163298
89	NC_013743	CGT	2	6	3772	3777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163298
90	NC_013743	CGT	2	6	3785	3790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163298
91	NC_013743	CGC	2	6	3791	3796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163298
92	NC_013743	CCGTC	2	10	3804	3813	0 %	20 %	20 %	60 %	284163298
93	NC_013743	CGG	2	6	3826	3831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163298
94	NC_013743	TCG	2	6	3864	3869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163298
95	NC_013743	TCG	2	6	3891	3896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163298
96	NC_013743	GTC	2	6	3899	3904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163298
97	NC_013743	GGC	2	6	4268	4273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163299
98	NC_013743	CGT	2	6	4283	4288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163299
99	NC_013743	GTC	2	6	4314	4319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163299
100	NC_013743	GACC	2	8	4322	4329	25 %	0 %	25 %	50 %	284163299
101	NC_013743	GCCG	2	8	4394	4401	0 %	0 %	50 %	50 %	284163299
102	NC_013743	CCG	2	6	4405	4410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163299
103	NC_013743	CGGG	2	8	4447	4454	0 %	0 %	75 %	25 %	284163299
104	NC_013743	G	6	6	4475	4480	0 %	0 %	100 %	0 %	284163299
105	NC_013743	CCGA	2	8	4489	4496	25 %	0 %	25 %	50 %	284163299
106	NC_013743	TCG	2	6	4579	4584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163299
107	NC_013743	CGGG	2	8	4628	4635	0 %	0 %	75 %	25 %	284163299
108	NC_013743	ACC	2	6	4639	4644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284163299
109	NC_013743	CGG	2	6	4673	4678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163299
110	NC_013743	TGA	2	6	4783	4788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284163299
111	NC_013743	CGA	2	6	4814	4819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163299
112	NC_013743	ACT	2	6	4820	4825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163299
113	NC_013743	CGA	2	6	4829	4834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163299
114	NC_013743	GAC	2	6	4863	4868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163299
115	NC_013743	TCG	2	6	4882	4887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163299
116	NC_013743	GGC	2	6	4952	4957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163299
117	NC_013743	CCT	2	6	5060	5065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163299
118	NC_013743	GGCGTC	2	12	5088	5099	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	284163299
119	NC_013743	TCG	2	6	5128	5133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163299
120	NC_013743	AGA	2	6	5173	5178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284163299
121	NC_013743	TGA	2	6	5200	5205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284163299
122	NC_013743	ACG	2	6	5218	5223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163299
123	NC_013743	CGA	2	6	5255	5260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163299
124	NC_013743	GAA	2	6	5391	5396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284163299
125	NC_013743	ACG	2	6	5407	5412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163299
126	NC_013743	GGA	2	6	5516	5521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163299
127	NC_013743	GCT	2	6	5602	5607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163299
128	NC_013743	AGA	2	6	5629	5634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284163299
129	NC_013743	TCG	2	6	5671	5676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163299
130	NC_013743	CCT	2	6	6128	6133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163300
131	NC_013743	TCG	2	6	6182	6187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163300
132	NC_013743	TCC	2	6	6239	6244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163300
133	NC_013743	ATCG	2	8	6314	6321	25 %	25 %	25 %	25 %	284163300
134	NC_013743	CG	3	6	6320	6325	0 %	0 %	50 %	50 %	284163300
135	NC_013743	CGC	2	6	6339	6344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163300
136	NC_013743	TCG	2	6	6351	6356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163300
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165	NC_013743	CG	3	6	7508	7513	0 %	0 %	50 %	50 %	284163301
166	NC_013743	TCT	2	6	7519	7524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284163301
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242	NC_013743	CGCTC	2	10	10813	10822	0 %	20 %	20 %	60 %	284163305
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251	NC_013743	TCG	2	6	11415	11420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163306
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254	NC_013743	CTC	2	6	11495	11500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163306
255	NC_013743	ACG	2	6	11574	11579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163306
256	NC_013743	CGA	2	6	11648	11653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163306
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258	NC_013743	CGGCC	2	10	11668	11677	0 %	0 %	40 %	60 %	284163306
259	NC_013743	CGA	2	6	11752	11757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163306
260	NC_013743	GAA	2	6	11798	11803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284163306
261	NC_013743	ACG	2	6	11877	11882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163306
262	NC_013743	CCGG	2	8	11920	11927	0 %	0 %	50 %	50 %	284163306
263	NC_013743	TCG	2	6	11935	11940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163306
264	NC_013743	GTT	2	6	11945	11950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284163306
265	NC_013743	GAT	2	6	11951	11956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284163306
266	NC_013743	CGA	2	6	12025	12030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163306
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268	NC_013743	CAG	2	6	12167	12172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163306
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270	NC_013743	CCT	2	6	12301	12306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163306
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272	NC_013743	GTC	2	6	12387	12392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163306
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302	NC_013743	CG	3	6	13671	13676	0 %	0 %	50 %	50 %	284163307
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342	NC_013743	CGGA	2	8	14863	14870	25 %	0 %	50 %	25 %	284163309
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370	NC_013743	GAG	2	6	16171	16176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163310
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372	NC_013743	CTCG	2	8	16189	16196	0 %	25 %	25 %	50 %	284163310
373	NC_013743	TGA	2	6	16245	16250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284163310
374	NC_013743	CAG	2	6	16255	16260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163310
375	NC_013743	TCC	2	6	16262	16267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163310
376	NC_013743	CGTG	2	8	16314	16321	0 %	25 %	50 %	25 %	284163310
377	NC_013743	CGTC	2	8	16371	16378	0 %	25 %	25 %	50 %	284163310
378	NC_013743	TCA	2	6	16437	16442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163310
379	NC_013743	GGATC	2	10	16711	16720	20 %	20 %	40 %	20 %	284163311
380	NC_013743	CGC	2	6	16726	16731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163311
381	NC_013743	CGC	3	9	16741	16749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163311
382	NC_013743	CGT	2	6	16774	16779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163311
383	NC_013743	ACC	2	6	16799	16804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284163311
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385	NC_013743	CGA	2	6	16837	16842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163311
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494	NC_013743	CTGT	2	8	20263	20270	0 %	50 %	25 %	25 %	284163313
495	NC_013743	GC	4	8	20330	20337	0 %	0 %	50 %	50 %	284163314
496	NC_013743	GCT	2	6	20393	20398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163314
497	NC_013743	GATC	2	8	20444	20451	25 %	25 %	25 %	25 %	284163314
498	NC_013743	CGT	2	6	20482	20487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163314
499	NC_013743	GGC	2	6	20544	20549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163314
500	NC_013743	GTCA	2	8	20550	20557	25 %	25 %	25 %	25 %	284163314

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