MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 chromosome

Total Repeats: 92875

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013743	CGG	2	6	20563	20568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163314
502	NC_013743	GACCGC	2	12	20589	20600	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	284163314
503	NC_013743	CGAC	2	8	20781	20788	25 %	0 %	25 %	50 %	284163315
504	NC_013743	CGC	2	6	20794	20799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163315
505	NC_013743	GCT	2	6	20806	20811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163315
506	NC_013743	TCGA	2	8	20823	20830	25 %	25 %	25 %	25 %	284163315
507	NC_013743	CGT	2	6	20863	20868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163315
508	NC_013743	TCCC	2	8	20888	20895	0 %	25 %	0 %	75 %	284163315
509	NC_013743	CGG	2	6	20949	20954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163315
510	NC_013743	CTT	2	6	21007	21012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284163315
511	NC_013743	CGG	2	6	21058	21063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163315
512	NC_013743	CGC	2	6	21076	21081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163315
513	NC_013743	TCG	2	6	21084	21089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163315
514	NC_013743	GTC	3	9	21182	21190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163315
515	NC_013743	CGAA	2	8	21223	21230	50 %	0 %	25 %	25 %	284163315
516	NC_013743	CTCGT	2	10	21237	21246	0 %	40 %	20 %	40 %	284163315
517	NC_013743	GTC	2	6	21251	21256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163315
518	NC_013743	GTCG	2	8	21271	21278	0 %	25 %	50 %	25 %	284163316
519	NC_013743	CAA	2	6	21287	21292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284163316
520	NC_013743	TCG	2	6	21294	21299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163316
521	NC_013743	CGA	2	6	21340	21345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163316
522	NC_013743	GCG	2	6	21354	21359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163316
523	NC_013743	GAC	2	6	21377	21382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163316
524	NC_013743	GGC	2	6	21383	21388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163316
525	NC_013743	CGA	2	6	21400	21405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163316
526	NC_013743	GGC	2	6	21415	21420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163316
527	NC_013743	GACCG	2	10	21422	21431	20 %	0 %	40 %	40 %	284163316
528	NC_013743	CTC	2	6	21518	21523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163316
529	NC_013743	GAC	2	6	21554	21559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163316
530	NC_013743	TCG	2	6	21582	21587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163316
531	NC_013743	AGG	2	6	21654	21659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163316
532	NC_013743	CGT	2	6	21664	21669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163316
533	NC_013743	TCG	2	6	21684	21689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163316
534	NC_013743	GTC	3	9	21690	21698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163316
535	NC_013743	GGTC	2	8	21727	21734	0 %	25 %	50 %	25 %	284163316
536	NC_013743	CCGGG	2	10	21748	21757	0 %	0 %	60 %	40 %	284163316
537	NC_013743	CGA	2	6	22163	22168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163317
538	NC_013743	GTC	2	6	22198	22203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163317
539	NC_013743	ACG	2	6	22213	22218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163317
540	NC_013743	TTC	2	6	22237	22242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284163317
541	NC_013743	TCG	2	6	22247	22252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163317
542	NC_013743	CGA	2	6	22260	22265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163317
543	NC_013743	GAC	2	6	22321	22326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163317
544	NC_013743	GAG	2	6	22363	22368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163317
545	NC_013743	CGC	2	6	22382	22387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163317
546	NC_013743	GAC	2	6	22389	22394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163317
547	NC_013743	CGG	2	6	22401	22406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163317
548	NC_013743	GCT	2	6	22407	22412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163317
549	NC_013743	ACC	2	6	22426	22431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284163317
550	NC_013743	GAC	2	6	22443	22448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163317
551	NC_013743	CTG	2	6	22494	22499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163317
552	NC_013743	CGA	2	6	22545	22550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163317
553	NC_013743	ACAA	2	8	22583	22590	75 %	0 %	0 %	25 %	284163317
554	NC_013743	CGCGC	2	10	22591	22600	0 %	0 %	40 %	60 %	284163317
555	NC_013743	GAG	2	6	22630	22635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163317
556	NC_013743	TCG	2	6	22681	22686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163317
557	NC_013743	GCC	2	6	22690	22695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163317
558	NC_013743	GGCG	2	8	22696	22703	0 %	0 %	75 %	25 %	284163317
559	NC_013743	CCG	2	6	22707	22712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163317
560	NC_013743	GAG	2	6	22747	22752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163317
561	NC_013743	GT	3	6	23009	23014	0 %	50 %	50 %	0 %	284163318
562	NC_013743	CCG	2	6	23045	23050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163318
563	NC_013743	GCT	2	6	23064	23069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163318
564	NC_013743	TCC	3	9	23090	23098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163318
565	NC_013743	GATCCG	2	12	23145	23156	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	284163318
566	NC_013743	CGA	2	6	23172	23177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163318
567	NC_013743	TCG	2	6	23192	23197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163318
568	NC_013743	CGA	2	6	23205	23210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163318
569	NC_013743	AGT	2	6	23271	23276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284163318
570	NC_013743	GTG	2	6	23296	23301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284163318
571	NC_013743	ATGGT	2	10	23433	23442	20 %	40 %	40 %	0 %	284163319
572	NC_013743	ACG	2	6	23460	23465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163319
573	NC_013743	TCGGCG	2	12	23475	23486	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	284163319
574	NC_013743	ACG	2	6	23553	23558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163319
575	NC_013743	ATC	2	6	23597	23602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163319
576	NC_013743	GC	3	6	23605	23610	0 %	0 %	50 %	50 %	284163319
577	NC_013743	CTA	2	6	23611	23616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163319
578	NC_013743	TCG	2	6	23640	23645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163319
579	NC_013743	GAC	2	6	23666	23671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163319
580	NC_013743	GATC	2	8	23712	23719	25 %	25 %	25 %	25 %	284163319
581	NC_013743	TCG	2	6	23904	23909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163319
582	NC_013743	GGC	2	6	23929	23934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163319
583	NC_013743	GC	3	6	23947	23952	0 %	0 %	50 %	50 %	284163319
584	NC_013743	CGC	2	6	24046	24051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163319
585	NC_013743	ACG	2	6	24219	24224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163319
586	NC_013743	ACC	3	9	24249	24257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284163319
587	NC_013743	CGA	2	6	24277	24282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163319
588	NC_013743	CTC	2	6	24317	24322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163319
589	NC_013743	ACT	2	6	24339	24344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163319
590	NC_013743	CGC	2	6	24352	24357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163319
591	NC_013743	GAC	2	6	24361	24366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163319
592	NC_013743	CGA	2	6	24403	24408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163319
593	NC_013743	ACC	2	6	24540	24545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284163319
594	NC_013743	GCC	2	6	24828	24833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163320
595	NC_013743	GCTC	2	8	24860	24867	0 %	25 %	25 %	50 %	284163320
596	NC_013743	GAC	2	6	24893	24898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163320
597	NC_013743	CGA	2	6	24902	24907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163320
598	NC_013743	GGA	2	6	24944	24949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163320
599	NC_013743	GTCG	2	8	25144	25151	0 %	25 %	50 %	25 %	284163321
600	NC_013743	CGG	2	6	25175	25180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163321
601	NC_013743	CTCG	2	8	25185	25192	0 %	25 %	25 %	50 %	284163321
602	NC_013743	CG	3	6	25199	25204	0 %	0 %	50 %	50 %	284163321
603	NC_013743	GC	3	6	25236	25241	0 %	0 %	50 %	50 %	284163321
604	NC_013743	CAG	2	6	25249	25254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163321
605	NC_013743	CAG	2	6	25270	25275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163321
606	NC_013743	GCC	2	6	25276	25281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163321
607	NC_013743	CAG	2	6	25327	25332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163321
608	NC_013743	AGC	2	6	25367	25372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163321
609	NC_013743	CGATCC	2	12	25401	25412	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	284163321
610	NC_013743	GAC	2	6	25414	25419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163321
611	NC_013743	CGAACG	2	12	25425	25436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163321
612	NC_013743	CGA	2	6	25440	25445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163321
613	NC_013743	CGA	2	6	25503	25508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163321
614	NC_013743	TCCG	2	8	25567	25574	0 %	25 %	25 %	50 %	284163321
615	NC_013743	CGC	2	6	25600	25605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163321
616	NC_013743	TCG	2	6	25668	25673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163321
617	NC_013743	CCGA	2	8	25688	25695	25 %	0 %	25 %	50 %	284163321
618	NC_013743	GCC	2	6	25747	25752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163321
619	NC_013743	CGA	3	9	25839	25847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163321
620	NC_013743	CCG	2	6	25874	25879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163321
621	NC_013743	CGG	2	6	25914	25919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163321
622	NC_013743	GCC	2	6	25960	25965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163321
623	NC_013743	CGA	2	6	26049	26054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163321
624	NC_013743	C	6	6	26062	26067	0 %	0 %	0 %	100 %	284163321
625	NC_013743	CTC	2	6	26098	26103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163321
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628	NC_013743	CGA	3	9	26166	26174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163321
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730	NC_013743	GGCG	2	8	30578	30585	0 %	0 %	75 %	25 %	284163324
731	NC_013743	CGT	3	9	30590	30598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163324
732	NC_013743	CGG	2	6	30638	30643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163324
733	NC_013743	CGG	2	6	30647	30652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163324
734	NC_013743	CAG	2	6	30705	30710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163324
735	NC_013743	CGA	3	9	30746	30754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163324
736	NC_013743	GGT	2	6	30860	30865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284163325
737	NC_013743	CTC	2	6	30905	30910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163325
738	NC_013743	AGC	2	6	30912	30917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163325
739	NC_013743	CGC	2	6	30976	30981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163325
740	NC_013743	GTA	2	6	31013	31018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284163325
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742	NC_013743	GCT	2	6	31066	31071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163325
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744	NC_013743	GTC	2	6	31094	31099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163325
745	NC_013743	CGA	2	6	31123	31128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163325
746	NC_013743	TCCA	2	8	31158	31165	25 %	25 %	0 %	50 %	284163325
747	NC_013743	TCT	2	6	31192	31197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284163325
748	NC_013743	GCT	2	6	31250	31255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163325
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