MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Haliangium ochraceum DSM 14365 chromosome

Total Repeats: 6156

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013440	GCGCC	2	10	455	464	0 %	0 %	40 %	60 %	262193327
2	NC_013440	GGGCA	2	10	3526	3535	20 %	0 %	60 %	20 %	262193329
3	NC_013440	CGACG	2	10	4425	4434	20 %	0 %	40 %	40 %	262193329
4	NC_013440	AGGTG	2	10	11857	11866	20 %	20 %	60 %	0 %	262193334
5	NC_013440	GCATC	2	10	13180	13189	20 %	20 %	20 %	40 %	262193335
6	NC_013440	GACGG	2	10	13818	13827	20 %	0 %	60 %	20 %	262193336
7	NC_013440	CGGCG	2	10	14399	14408	0 %	0 %	60 %	40 %	262193337
8	NC_013440	CGCTG	2	10	14773	14782	0 %	20 %	40 %	40 %	262193337
9	NC_013440	GCTGC	2	10	17340	17349	0 %	20 %	40 %	40 %	262193339
10	NC_013440	CGGGG	2	10	18001	18010	0 %	0 %	80 %	20 %	262193340
11	NC_013440	TGCTC	2	10	18518	18527	0 %	40 %	20 %	40 %	262193341
12	NC_013440	AGGCC	2	10	19564	19573	20 %	0 %	40 %	40 %	262193342
13	NC_013440	AATCG	2	10	22324	22333	40 %	20 %	20 %	20 %	262193345
14	NC_013440	GCCGA	2	10	24341	24350	20 %	0 %	40 %	40 %	262193347
15	NC_013440	AGCCG	2	10	26026	26035	20 %	0 %	40 %	40 %	262193347
16	NC_013440	AGCCG	2	10	27425	27434	20 %	0 %	40 %	40 %	262193349
17	NC_013440	TGCTC	2	10	27602	27611	0 %	40 %	20 %	40 %	262193349
18	NC_013440	GCCCA	2	10	27733	27742	20 %	0 %	20 %	60 %	262193349
19	NC_013440	CGGCG	2	10	31134	31143	0 %	0 %	60 %	40 %	262193349
20	NC_013440	GGGCG	2	10	32193	32202	0 %	0 %	80 %	20 %	262193349
21	NC_013440	CGGCG	2	10	32481	32490	0 %	0 %	60 %	40 %	262193349
22	NC_013440	GCGTC	2	10	32833	32842	0 %	20 %	40 %	40 %	262193349
23	NC_013440	ACTTC	2	10	34022	34031	20 %	40 %	0 %	40 %	262193350
24	NC_013440	GCGCG	2	10	35546	35555	0 %	0 %	60 %	40 %	262193351
25	NC_013440	GCTCG	2	10	35805	35814	0 %	20 %	40 %	40 %	262193351
26	NC_013440	CCGGC	2	10	36386	36395	0 %	0 %	40 %	60 %	262193351
27	NC_013440	CGGCG	2	10	36524	36533	0 %	0 %	60 %	40 %	262193351
28	NC_013440	GCGCG	2	10	37202	37211	0 %	0 %	60 %	40 %	262193351
29	NC_013440	CCGAC	2	10	39587	39596	20 %	0 %	20 %	60 %	262193352
30	NC_013440	CGAGC	2	10	39883	39892	20 %	0 %	40 %	40 %	262193352
31	NC_013440	CGGCG	2	10	42139	42148	0 %	0 %	60 %	40 %	262193355
32	NC_013440	GACCG	2	10	44798	44807	20 %	0 %	40 %	40 %	262193356
33	NC_013440	GGCGC	2	10	45915	45924	0 %	0 %	60 %	40 %	262193357
34	NC_013440	CGCGC	2	10	45933	45942	0 %	0 %	40 %	60 %	262193357
35	NC_013440	CGGTC	2	10	46623	46632	0 %	20 %	40 %	40 %	262193357
36	NC_013440	GAACA	2	10	47892	47901	60 %	0 %	20 %	20 %	262193358
37	NC_013440	GAACA	2	10	48734	48743	60 %	0 %	20 %	20 %	262193359
38	NC_013440	AGCCC	2	10	49368	49377	20 %	0 %	20 %	60 %	262193359
39	NC_013440	CGGCC	2	10	50050	50059	0 %	0 %	40 %	60 %	262193360
40	NC_013440	AGCGC	2	10	53138	53147	20 %	0 %	40 %	40 %	262193360
41	NC_013440	TCGCC	2	10	53452	53461	0 %	20 %	20 %	60 %	262193360
42	NC_013440	GCCGC	2	10	59810	59819	0 %	0 %	40 %	60 %	262193361
43	NC_013440	GCCAG	2	10	61963	61972	20 %	0 %	40 %	40 %	262193362
44	NC_013440	GCCAG	2	10	64733	64742	20 %	0 %	40 %	40 %	262193363
45	NC_013440	CGGCC	2	10	70328	70337	0 %	0 %	40 %	60 %	262193365
46	NC_013440	GCCCG	2	10	76816	76825	0 %	0 %	40 %	60 %	262193371
47	NC_013440	GCCGG	2	10	79917	79926	0 %	0 %	60 %	40 %	262193375
48	NC_013440	GCGCC	2	10	80841	80850	0 %	0 %	40 %	60 %	262193376
49	NC_013440	CGGCG	2	10	83095	83104	0 %	0 %	60 %	40 %	262193377
50	NC_013440	CGAGC	2	10	85549	85558	20 %	0 %	40 %	40 %	262193380
51	NC_013440	CGGCG	2	10	86858	86867	0 %	0 %	60 %	40 %	262193381
52	NC_013440	CCGCG	2	10	86927	86936	0 %	0 %	40 %	60 %	262193381
53	NC_013440	CAGCG	2	10	87534	87543	20 %	0 %	40 %	40 %	262193382
54	NC_013440	GCTGG	2	10	90036	90045	0 %	20 %	60 %	20 %	262193384
55	NC_013440	GCGCG	2	10	91770	91779	0 %	0 %	60 %	40 %	262193385
56	NC_013440	GCGCC	2	10	93742	93751	0 %	0 %	40 %	60 %	262193388
57	NC_013440	CGCGA	2	10	95077	95086	20 %	0 %	40 %	40 %	262193390
58	NC_013440	CAGCT	2	10	101305	101314	20 %	20 %	20 %	40 %	262193393
59	NC_013440	ACGCG	2	10	106500	106509	20 %	0 %	40 %	40 %	262193395
60	NC_013440	GCCCG	3	15	114621	114635	0 %	0 %	40 %	60 %	262193399
61	NC_013440	CCAGG	2	10	115713	115722	20 %	0 %	40 %	40 %	262193400
62	NC_013440	GCGCC	2	10	115935	115944	0 %	0 %	40 %	60 %	262193400
63	NC_013440	CCAGC	2	10	117814	117823	20 %	0 %	20 %	60 %	262193402
64	NC_013440	CCGCC	2	10	118683	118692	0 %	0 %	20 %	80 %	262193402
65	NC_013440	GGACG	2	10	119940	119949	20 %	0 %	60 %	20 %	262193403
66	NC_013440	AGAGC	2	10	121572	121581	40 %	0 %	40 %	20 %	262193403
67	NC_013440	GGGTC	2	10	124403	124412	0 %	20 %	60 %	20 %	262193405
68	NC_013440	CAGCG	2	10	125337	125346	20 %	0 %	40 %	40 %	262193405
69	NC_013440	CGCAG	2	10	126643	126652	20 %	0 %	40 %	40 %	262193405
70	NC_013440	GCTGG	2	10	126719	126728	0 %	20 %	60 %	20 %	262193405
71	NC_013440	GCTCC	2	10	129244	129253	0 %	20 %	20 %	60 %	262193406
72	NC_013440	GCGCT	2	10	129580	129589	0 %	20 %	40 %	40 %	262193407
73	NC_013440	GTGGC	2	10	131814	131823	0 %	20 %	60 %	20 %	262193408
74	NC_013440	GCGCC	2	10	131888	131897	0 %	0 %	40 %	60 %	262193408
75	NC_013440	AGCGC	2	10	131908	131917	20 %	0 %	40 %	40 %	262193408
76	NC_013440	GCGCC	2	10	132778	132787	0 %	0 %	40 %	60 %	262193409
77	NC_013440	GCGCC	2	10	135568	135577	0 %	0 %	40 %	60 %	262193410
78	NC_013440	AGGGC	2	10	136567	136576	20 %	0 %	60 %	20 %	262193412
79	NC_013440	CGGCG	3	15	137290	137304	0 %	0 %	60 %	40 %	262193412
80	NC_013440	GCCGA	2	10	138192	138201	20 %	0 %	40 %	40 %	262193412
81	NC_013440	GGCGC	2	10	138446	138455	0 %	0 %	60 %	40 %	262193412
82	NC_013440	CCGCA	2	10	138556	138565	20 %	0 %	20 %	60 %	262193412
83	NC_013440	AGGCC	2	10	140450	140459	20 %	0 %	40 %	40 %	262193414
84	NC_013440	AGCGC	2	10	147307	147316	20 %	0 %	40 %	40 %	262193420
85	NC_013440	GGATG	2	10	147434	147443	20 %	20 %	60 %	0 %	262193420
86	NC_013440	GCCGC	2	10	148941	148950	0 %	0 %	40 %	60 %	262193421
87	NC_013440	CCTGG	2	10	150168	150177	0 %	20 %	40 %	40 %	262193423
88	NC_013440	TCACC	2	10	150945	150954	20 %	20 %	0 %	60 %	262193424
89	NC_013440	GGCGC	2	10	151002	151011	0 %	0 %	60 %	40 %	262193424
90	NC_013440	GGCGC	2	10	151206	151215	0 %	0 %	60 %	40 %	262193424
91	NC_013440	CGAGG	2	10	154082	154091	20 %	0 %	60 %	20 %	262193425
92	NC_013440	CTTTC	2	10	155960	155969	0 %	60 %	0 %	40 %	262193426
93	NC_013440	ACGCC	2	10	157186	157195	20 %	0 %	20 %	60 %	262193427
94	NC_013440	CGCGC	2	10	158048	158057	0 %	0 %	40 %	60 %	262193427
95	NC_013440	GGGGC	2	10	158255	158264	0 %	0 %	80 %	20 %	262193427
96	NC_013440	GCGCC	2	10	158519	158528	0 %	0 %	40 %	60 %	262193427
97	NC_013440	TCAGC	2	10	162582	162591	20 %	20 %	20 %	40 %	262193429
98	NC_013440	CGGCG	2	10	163898	163907	0 %	0 %	60 %	40 %	262193430
99	NC_013440	AGCGC	2	10	166916	166925	20 %	0 %	40 %	40 %	262193432
100	NC_013440	GCGCC	2	10	167178	167187	0 %	0 %	40 %	60 %	262193432
101	NC_013440	GCGCC	2	10	177904	177913	0 %	0 %	40 %	60 %	262193438
102	NC_013440	GGTCG	2	10	178796	178805	0 %	20 %	60 %	20 %	262193438
103	NC_013440	CGGCG	2	10	179540	179549	0 %	0 %	60 %	40 %	262193439
104	NC_013440	ACGGC	2	10	180833	180842	20 %	0 %	40 %	40 %	262193440
105	NC_013440	GCTCA	2	10	181164	181173	20 %	20 %	20 %	40 %	262193440
106	NC_013440	AGCTG	2	10	183528	183537	20 %	20 %	40 %	20 %	262193443
107	NC_013440	GAGCT	2	10	188942	188951	20 %	20 %	40 %	20 %	262193445
108	NC_013440	AGCTC	2	10	192769	192778	20 %	20 %	20 %	40 %	262193450
109	NC_013440	GGTCG	2	10	192968	192977	0 %	20 %	60 %	20 %	262193450
110	NC_013440	GCCCA	2	10	193788	193797	20 %	0 %	20 %	60 %	262193450
111	NC_013440	GCGCC	2	10	194981	194990	0 %	0 %	40 %	60 %	262193450
112	NC_013440	GCGCC	2	10	195244	195253	0 %	0 %	40 %	60 %	262193450
113	NC_013440	GGCCA	2	10	195515	195524	20 %	0 %	40 %	40 %	262193450
114	NC_013440	GGGAT	2	10	198565	198574	20 %	20 %	60 %	0 %	262193453
115	NC_013440	AGGCC	2	10	203285	203294	20 %	0 %	40 %	40 %	262193457
116	NC_013440	CGGCG	2	10	206285	206294	0 %	0 %	60 %	40 %	262193460
117	NC_013440	GCTCA	2	10	206776	206785	20 %	20 %	20 %	40 %	262193461
118	NC_013440	GCCGC	2	10	206965	206974	0 %	0 %	40 %	60 %	262193461
119	NC_013440	GGTCT	2	10	209513	209522	0 %	40 %	40 %	20 %	262193464
120	NC_013440	CCCGG	2	10	209946	209955	0 %	0 %	40 %	60 %	262193465
121	NC_013440	CTCGA	2	10	210206	210215	20 %	20 %	20 %	40 %	262193465
122	NC_013440	CGGCC	2	10	211618	211627	0 %	0 %	40 %	60 %	262193466
123	NC_013440	GCCGC	2	10	213883	213892	0 %	0 %	40 %	60 %	262193468
124	NC_013440	CGGCG	2	10	216399	216408	0 %	0 %	60 %	40 %	262193471
125	NC_013440	CGCGC	2	10	216976	216985	0 %	0 %	40 %	60 %	262193472
126	NC_013440	GCCGC	2	10	218116	218125	0 %	0 %	40 %	60 %	262193473
127	NC_013440	GGCGC	2	10	220802	220811	0 %	0 %	60 %	40 %	262193476
128	NC_013440	CCGCG	2	10	226292	226301	0 %	0 %	40 %	60 %	262193478
129	NC_013440	TGGCG	2	10	227471	227480	0 %	20 %	60 %	20 %	262193478
130	NC_013440	GCGCC	2	10	232936	232945	0 %	0 %	40 %	60 %	262193481
131	NC_013440	GTGCA	2	10	234096	234105	20 %	20 %	40 %	20 %	262193482
132	NC_013440	CTCAT	2	10	234690	234699	20 %	40 %	0 %	40 %	262193483
133	NC_013440	CGATC	2	10	236096	236105	20 %	20 %	20 %	40 %	262193484
134	NC_013440	GCCGA	2	10	239150	239159	20 %	0 %	40 %	40 %	262193486
135	NC_013440	GCGGA	2	10	239328	239337	20 %	0 %	60 %	20 %	262193487
136	NC_013440	CGATC	2	10	239576	239585	20 %	20 %	20 %	40 %	262193487
137	NC_013440	CCGGC	2	10	240690	240699	0 %	0 %	40 %	60 %	262193487
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139	NC_013440	CGCAT	2	10	249213	249222	20 %	20 %	20 %	40 %	262193492
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