MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haliangium ochraceum DSM 14365 chromosome

Total Repeats: 237741

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013440	GCC	2	6	36559	36564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193351
1002	NC_013440	GC	3	6	36585	36590	0 %	0 %	50 %	50 %	262193351
1003	NC_013440	CG	3	6	36593	36598	0 %	0 %	50 %	50 %	262193351
1004	NC_013440	CAGC	2	8	36603	36610	25 %	0 %	25 %	50 %	262193351
1005	NC_013440	GC	3	6	36649	36654	0 %	0 %	50 %	50 %	262193351
1006	NC_013440	CTG	2	6	36666	36671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193351
1007	NC_013440	CGG	2	6	36680	36685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193351
1008	NC_013440	CG	4	8	36704	36711	0 %	0 %	50 %	50 %	262193351
1009	NC_013440	TCG	2	6	36724	36729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193351
1010	NC_013440	GCG	2	6	36748	36753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193351
1011	NC_013440	CAG	2	6	36774	36779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193351
1012	NC_013440	CTT	2	6	36789	36794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262193351
1013	NC_013440	GCT	2	6	36837	36842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193351
1014	NC_013440	GCA	2	6	36848	36853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193351
1015	NC_013440	GCG	2	6	36895	36900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193351
1016	NC_013440	GCA	2	6	36923	36928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193351
1017	NC_013440	CAC	2	6	36963	36968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262193351
1018	NC_013440	GCGA	2	8	36995	37002	25 %	0 %	50 %	25 %	262193351
1019	NC_013440	GCC	2	6	37062	37067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193351
1020	NC_013440	ACC	2	6	37075	37080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262193351
1021	NC_013440	TGA	2	6	37100	37105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193351
1022	NC_013440	CG	3	6	37158	37163	0 %	0 %	50 %	50 %	262193351
1023	NC_013440	GC	3	6	37195	37200	0 %	0 %	50 %	50 %	262193351
1024	NC_013440	GCGCG	2	10	37202	37211	0 %	0 %	60 %	40 %	262193351
1025	NC_013440	CGCC	2	8	37222	37229	0 %	0 %	25 %	75 %	262193351
1026	NC_013440	GCC	2	6	37257	37262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193351
1027	NC_013440	GTC	2	6	37266	37271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193351
1028	NC_013440	GC	3	6	37298	37303	0 %	0 %	50 %	50 %	262193351
1029	NC_013440	GCC	2	6	37329	37334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193351
1030	NC_013440	GCA	2	6	37337	37342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193351
1031	NC_013440	GC	3	6	37409	37414	0 %	0 %	50 %	50 %	262193351
1032	NC_013440	GCG	2	6	37419	37424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193351
1033	NC_013440	GAT	2	6	37437	37442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193351
1034	NC_013440	GCG	2	6	37452	37457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193351
1035	NC_013440	TGGG	2	8	37474	37481	0 %	25 %	75 %	0 %	262193351
1036	NC_013440	TCC	2	6	37495	37500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	262193351
1037	NC_013440	GTC	2	6	37506	37511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193351
1038	NC_013440	TCG	2	6	37516	37521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193351
1039	NC_013440	GTA	2	6	37527	37532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193351
1040	NC_013440	CGA	2	6	37562	37567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193351
1041	NC_013440	CCA	2	6	37607	37612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262193351
1042	NC_013440	CGG	2	6	37624	37629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193351
1043	NC_013440	CCG	2	6	37676	37681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193351
1044	NC_013440	GCC	2	6	37695	37700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193351
1045	NC_013440	GGC	2	6	37716	37721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193351
1046	NC_013440	GGC	2	6	37747	37752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193351
1047	NC_013440	CTC	2	6	37800	37805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	262193351
1048	NC_013440	TCG	2	6	37813	37818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193351
1049	NC_013440	CGA	2	6	37832	37837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193351
1050	NC_013440	CG	3	6	37859	37864	0 %	0 %	50 %	50 %	262193351
1051	NC_013440	CGA	2	6	37898	37903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193351
1052	NC_013440	ATG	2	6	37942	37947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193351
1053	NC_013440	TCC	2	6	38102	38107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	262193352
1054	NC_013440	TC	3	6	38163	38168	0 %	50 %	0 %	50 %	262193352
1055	NC_013440	TCA	2	6	38214	38219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262193352
1056	NC_013440	CG	3	6	38223	38228	0 %	0 %	50 %	50 %	262193352
1057	NC_013440	GAG	2	6	38267	38272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	262193352
1058	NC_013440	CTG	2	6	38303	38308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193352
1059	NC_013440	GCT	2	6	38341	38346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193352
1060	NC_013440	ATC	2	6	38450	38455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262193352
1061	NC_013440	GGC	2	6	38463	38468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193352
1062	NC_013440	GCT	2	6	38506	38511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193352
1063	NC_013440	ACG	2	6	38529	38534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193352
1064	NC_013440	ATC	2	6	38549	38554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262193352
1065	NC_013440	GAC	2	6	38570	38575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193352
1066	NC_013440	GTC	2	6	38621	38626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193352
1067	NC_013440	CGA	2	6	38644	38649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193352
1068	NC_013440	GC	4	8	38721	38728	0 %	0 %	50 %	50 %	262193352
1069	NC_013440	GCG	2	6	38754	38759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193352
1070	NC_013440	GCCG	2	8	38782	38789	0 %	0 %	50 %	50 %	262193352
1071	NC_013440	TGC	2	6	38793	38798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193352
1072	NC_013440	GCT	2	6	38845	38850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193352
1073	NC_013440	TCG	2	6	38925	38930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193352
1074	NC_013440	CGG	3	9	38974	38982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193352
1075	NC_013440	ACG	2	6	38997	39002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193352
1076	NC_013440	TCG	2	6	39023	39028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193352
1077	NC_013440	ACG	2	6	39057	39062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193352
1078	NC_013440	CGA	2	6	39088	39093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193352
1079	NC_013440	CG	3	6	39134	39139	0 %	0 %	50 %	50 %	262193352
1080	NC_013440	CGAGGA	2	12	39220	39231	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	262193352
1081	NC_013440	ACG	2	6	39306	39311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193352
1082	NC_013440	TCT	2	6	39393	39398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262193352
1083	NC_013440	GCT	2	6	39415	39420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193352
1084	NC_013440	GAG	2	6	39452	39457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	262193352
1085	NC_013440	CG	3	6	39473	39478	0 %	0 %	50 %	50 %	262193352
1086	NC_013440	CGA	2	6	39577	39582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193352
1087	NC_013440	CCGAC	2	10	39587	39596	20 %	0 %	20 %	60 %	262193352
1088	NC_013440	CGA	2	6	39700	39705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193352
1089	NC_013440	TAC	2	6	39707	39712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262193352
1090	NC_013440	CGA	2	6	39802	39807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193352
1091	NC_013440	TCGA	2	8	39824	39831	25 %	25 %	25 %	25 %	262193352
1092	NC_013440	TGC	2	6	39864	39869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193352
1093	NC_013440	CGAGC	2	10	39883	39892	20 %	0 %	40 %	40 %	262193352
1094	NC_013440	GCT	2	6	39895	39900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193352
1095	NC_013440	GAG	2	6	39956	39961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	262193352
1096	NC_013440	GC	3	6	39962	39967	0 %	0 %	50 %	50 %	262193352
1097	NC_013440	ACCT	2	8	40007	40014	25 %	25 %	0 %	50 %	262193352
1098	NC_013440	GCG	3	9	40072	40080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193353
1099	NC_013440	TGA	2	6	40111	40116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193353
1100	NC_013440	TCG	2	6	40134	40139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193353
1101	NC_013440	CG	3	6	40210	40215	0 %	0 %	50 %	50 %	262193353
1102	NC_013440	GCTG	2	8	40228	40235	0 %	25 %	50 %	25 %	262193353
1103	NC_013440	GCCG	2	8	40238	40245	0 %	0 %	50 %	50 %	262193353
1104	NC_013440	CG	5	10	40244	40253	0 %	0 %	50 %	50 %	262193353
1105	NC_013440	GC	3	6	40299	40304	0 %	0 %	50 %	50 %	262193353
1106	NC_013440	TCG	2	6	40323	40328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193353
1107	NC_013440	CTC	2	6	40355	40360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	262193353
1108	NC_013440	GGC	2	6	40362	40367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193353
1109	NC_013440	AC	3	6	40414	40419	50 %	0 %	0 %	50 %	262193353
1110	NC_013440	GC	3	6	40474	40479	0 %	0 %	50 %	50 %	262193353
1111	NC_013440	GGCG	2	8	40480	40487	0 %	0 %	75 %	25 %	262193353
1112	NC_013440	GCT	2	6	40496	40501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193353
1113	NC_013440	CAG	2	6	40505	40510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193353
1114	NC_013440	TCG	2	6	40512	40517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193353
1115	NC_013440	GC	3	6	40599	40604	0 %	0 %	50 %	50 %	262193353
1116	NC_013440	CGC	2	6	40690	40695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193353
1117	NC_013440	TCG	2	6	40725	40730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193353
1118	NC_013440	GCG	2	6	40735	40740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193353
1119	NC_013440	GCT	2	6	40786	40791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193353
1120	NC_013440	CG	4	8	40861	40868	0 %	0 %	50 %	50 %	262193353
1121	NC_013440	CGG	2	6	40906	40911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193353
1122	NC_013440	TCG	2	6	40977	40982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193353
1123	NC_013440	GCT	2	6	41045	41050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193353
1124	NC_013440	GCCG	2	8	41051	41058	0 %	0 %	50 %	50 %	262193353
1125	NC_013440	CGA	2	6	41068	41073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193353
1126	NC_013440	CGG	2	6	41080	41085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193353
1127	NC_013440	GC	3	6	41090	41095	0 %	0 %	50 %	50 %	262193353
1128	NC_013440	CG	3	6	41097	41102	0 %	0 %	50 %	50 %	262193353
1129	NC_013440	GGCG	2	8	41104	41111	0 %	0 %	75 %	25 %	262193353
1130	NC_013440	G	6	6	41182	41187	0 %	0 %	100 %	0 %	262193354
1131	NC_013440	GTA	2	6	41313	41318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193354
1132	NC_013440	GCG	2	6	41394	41399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193354
1133	NC_013440	GGT	2	6	41640	41645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262193354
1134	NC_013440	CGG	2	6	41749	41754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193355
1135	NC_013440	CGA	2	6	41803	41808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193355
1136	NC_013440	GCG	2	6	41818	41823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193355
1137	NC_013440	GCC	3	9	41829	41837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193355
1138	NC_013440	TGC	2	6	41905	41910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193355
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1141	NC_013440	GCC	2	6	42039	42044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193355
1142	NC_013440	CGTGCT	3	18	42100	42117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193355
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1144	NC_013440	GCGA	2	8	42168	42175	25 %	0 %	50 %	25 %	262193355
1145	NC_013440	CCT	2	6	42196	42201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	262193355
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1148	NC_013440	GGC	2	6	42267	42272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193355
1149	NC_013440	TGA	2	6	42391	42396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193355
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1152	NC_013440	GAT	3	9	42482	42490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193355
1153	NC_013440	AGC	2	6	42525	42530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193355
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1156	NC_013440	GCAG	2	8	42553	42560	25 %	0 %	50 %	25 %	262193355
1157	NC_013440	GCC	2	6	42569	42574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193355
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1159	NC_013440	AGC	2	6	42702	42707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193355
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1233	NC_013440	GAT	2	6	46152	46157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193357
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1235	NC_013440	GCC	6	18	46350	46367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193357
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1237	NC_013440	CAC	2	6	46407	46412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262193357
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1239	NC_013440	CCA	2	6	46461	46466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262193357
1240	NC_013440	CGA	2	6	46548	46553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193357
1241	NC_013440	GACGCC	2	12	46570	46581	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	262193357
1242	NC_013440	CGG	2	6	46592	46597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193357
1243	NC_013440	CGGTC	2	10	46623	46632	0 %	20 %	40 %	40 %	262193357
1244	NC_013440	GC	4	8	46640	46647	0 %	0 %	50 %	50 %	262193357
1245	NC_013440	CAG	2	6	46656	46661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193357
1246	NC_013440	GC	3	6	46682	46687	0 %	0 %	50 %	50 %	262193357
1247	NC_013440	CG	3	6	46711	46716	0 %	0 %	50 %	50 %	262193357
1248	NC_013440	CGA	2	6	46728	46733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193357
1249	NC_013440	GCT	2	6	46791	46796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193357
1250	NC_013440	CAC	2	6	46839	46844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262193357
1251	NC_013440	GCC	2	6	46888	46893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193358
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1254	NC_013440	GGC	2	6	47139	47144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193358
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1362	NC_013440	GAC	2	6	51287	51292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193360
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1368	NC_013440	GC	3	6	51518	51523	0 %	0 %	50 %	50 %	262193360
1369	NC_013440	GTC	2	6	51575	51580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193360
1370	NC_013440	GGC	2	6	51634	51639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193360
1371	NC_013440	GCCG	2	8	51734	51741	0 %	0 %	50 %	50 %	262193360
1372	NC_013440	TGA	2	6	51784	51789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193360
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1374	NC_013440	TGC	2	6	51810	51815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193360
1375	NC_013440	GCGA	2	8	51885	51892	25 %	0 %	50 %	25 %	262193360
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1377	NC_013440	CGGT	2	8	51932	51939	0 %	25 %	50 %	25 %	262193360
1378	NC_013440	CGG	2	6	51968	51973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193360
1379	NC_013440	GCA	2	6	51979	51984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193360
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1382	NC_013440	GCC	2	6	52088	52093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193360
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1495	NC_013440	GAGC	2	8	55962	55969	25 %	0 %	50 %	25 %	262193361
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1499	NC_013440	CAC	2	6	56206	56211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262193361
1500	NC_013440	GC	3	6	56223	56228	0 %	0 %	50 %	50 %	262193361

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