MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013422	ATC	2	6	55702	55707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854679
1002	NC_013422	CGA	2	6	55728	55733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854679
1003	NC_013422	CAG	2	6	55792	55797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854679
1004	NC_013422	CTT	2	6	55810	55815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261854679
1005	NC_013422	CTT	2	6	55839	55844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261854679
1006	NC_013422	GCT	2	6	55877	55882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854679
1007	NC_013422	GAC	2	6	55885	55890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854679
1008	NC_013422	TGG	2	6	55926	55931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854679
1009	NC_013422	GCA	2	6	55959	55964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854679
1010	NC_013422	TGA	2	6	56061	56066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854679
1011	NC_013422	CAT	2	6	56076	56081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854679
1012	NC_013422	A	7	7	56263	56269	100 %	0 %	0 %	0 %	261854679
1013	NC_013422	CCT	2	6	56362	56367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261854680
1014	NC_013422	TGC	2	6	56373	56378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854680
1015	NC_013422	CAG	2	6	56426	56431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854680
1016	NC_013422	CGG	2	6	56484	56489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854680
1017	NC_013422	CG	3	6	56538	56543	0 %	0 %	50 %	50 %	261854680
1018	NC_013422	CATC	2	8	56593	56600	25 %	25 %	0 %	50 %	261854680
1019	NC_013422	AGC	2	6	56694	56699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854680
1020	NC_013422	GC	3	6	56698	56703	0 %	0 %	50 %	50 %	261854680
1021	NC_013422	GCG	2	6	56715	56720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854680
1022	NC_013422	GA	3	6	56856	56861	50 %	0 %	50 %	0 %	261854680
1023	NC_013422	CTC	2	6	56885	56890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261854680
1024	NC_013422	CAC	2	6	56915	56920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261854680
1025	NC_013422	CGG	2	6	56932	56937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854680
1026	NC_013422	GAT	2	6	56954	56959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854680
1027	NC_013422	T	6	6	56981	56986	0 %	100 %	0 %	0 %	261854680
1028	NC_013422	GTC	2	6	57023	57028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854680
1029	NC_013422	A	7	7	57122	57128	100 %	0 %	0 %	0 %	261854680
1030	NC_013422	CAC	2	6	57143	57148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261854680
1031	NC_013422	T	6	6	57152	57157	0 %	100 %	0 %	0 %	261854680
1032	NC_013422	ATC	2	6	57230	57235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854680
1033	NC_013422	TGA	2	6	57390	57395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854680
1034	NC_013422	TGG	2	6	57433	57438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854680
1035	NC_013422	AGC	2	6	57441	57446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854680
1036	NC_013422	GT	3	6	57548	57553	0 %	50 %	50 %	0 %	261854680
1037	NC_013422	CTGG	2	8	57701	57708	0 %	25 %	50 %	25 %	261854680
1038	NC_013422	GC	3	6	57716	57721	0 %	0 %	50 %	50 %	261854680
1039	NC_013422	GC	3	6	57898	57903	0 %	0 %	50 %	50 %	261854681
1040	NC_013422	CT	3	6	57962	57967	0 %	50 %	0 %	50 %	261854681
1041	NC_013422	GCC	2	6	57970	57975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854681
1042	NC_013422	GTCG	2	8	57997	58004	0 %	25 %	50 %	25 %	261854681
1043	NC_013422	GCC	2	6	58055	58060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854681
1044	NC_013422	TCA	3	9	58113	58121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854681
1045	NC_013422	CG	3	6	58151	58156	0 %	0 %	50 %	50 %	261854681
1046	NC_013422	AGC	2	6	58173	58178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854681
1047	NC_013422	TGGT	2	8	58251	58258	0 %	50 %	50 %	0 %	261854681
1048	NC_013422	TGGCCG	2	12	58275	58286	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	261854681
1049	NC_013422	GGC	2	6	58342	58347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854681
1050	NC_013422	A	6	6	58493	58498	100 %	0 %	0 %	0 %	261854681
1051	NC_013422	GCC	2	6	58526	58531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854681
1052	NC_013422	GCA	2	6	58594	58599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854681
1053	NC_013422	CG	3	6	58606	58611	0 %	0 %	50 %	50 %	261854681
1054	NC_013422	CAC	2	6	58860	58865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261854682
1055	NC_013422	CGC	2	6	58870	58875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854682
1056	NC_013422	TTG	2	6	58879	58884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261854682
1057	NC_013422	GGC	2	6	58960	58965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854682
1058	NC_013422	TGC	2	6	58976	58981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854682
1059	NC_013422	ATG	2	6	59035	59040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854682
1060	NC_013422	TGG	2	6	59076	59081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854682
1061	NC_013422	GTGC	2	8	59248	59255	0 %	25 %	50 %	25 %	261854682
1062	NC_013422	GGC	2	6	59256	59261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854682
1063	NC_013422	ATC	2	6	59267	59272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854682
1064	NC_013422	TCG	2	6	59288	59293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854682
1065	NC_013422	TCCG	2	8	59295	59302	0 %	25 %	25 %	50 %	261854682
1066	NC_013422	GT	3	6	59312	59317	0 %	50 %	50 %	0 %	261854682
1067	NC_013422	GCGG	2	8	59332	59339	0 %	0 %	75 %	25 %	261854682
1068	NC_013422	CGTG	2	8	59370	59377	0 %	25 %	50 %	25 %	261854682
1069	NC_013422	AC	3	6	59385	59390	50 %	0 %	0 %	50 %	261854682
1070	NC_013422	ACG	2	6	59399	59404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854682
1071	NC_013422	ATT	2	6	59417	59422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261854682
1072	NC_013422	A	6	6	59476	59481	100 %	0 %	0 %	0 %	261854682
1073	NC_013422	CCG	2	6	59545	59550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854682
1074	NC_013422	GCA	2	6	59555	59560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854682
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1076	NC_013422	ACA	2	6	59600	59605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261854682
1077	NC_013422	TG	3	6	59662	59667	0 %	50 %	50 %	0 %	261854682
1078	NC_013422	GCG	2	6	59690	59695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854682
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1080	NC_013422	CGG	2	6	59763	59768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854682
1081	NC_013422	ATT	2	6	59770	59775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261854682
1082	NC_013422	CG	3	6	59805	59810	0 %	0 %	50 %	50 %	261854682
1083	NC_013422	TCG	2	6	59816	59821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854682
1084	NC_013422	TCG	2	6	59831	59836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854682
1085	NC_013422	GGC	2	6	59968	59973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854682
1086	NC_013422	CTG	2	6	59974	59979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854682
1087	NC_013422	GAC	2	6	59989	59994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854682
1088	NC_013422	GCG	2	6	59995	60000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854682
1089	NC_013422	GAG	2	6	60052	60057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261854682
1090	NC_013422	CAT	2	6	60111	60116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854682
1091	NC_013422	GCCT	2	8	60208	60215	0 %	25 %	25 %	50 %	261854682
1092	NC_013422	CTT	2	6	60249	60254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261854682
1093	NC_013422	GCG	3	9	60277	60285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854682
1094	NC_013422	CGG	2	6	60315	60320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854682
1095	NC_013422	TTC	2	6	60475	60480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261854683
1096	NC_013422	GCC	2	6	60498	60503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854683
1097	NC_013422	GGCT	2	8	60521	60528	0 %	25 %	50 %	25 %	261854683
1098	NC_013422	TTTG	2	8	60559	60566	0 %	75 %	25 %	0 %	261854683
1099	NC_013422	GGA	2	6	60612	60617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261854683
1100	NC_013422	GGC	2	6	60678	60683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854683
1101	NC_013422	CGG	2	6	60707	60712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854683
1102	NC_013422	GCC	3	9	60901	60909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854683
1103	NC_013422	GATC	2	8	60924	60931	25 %	25 %	25 %	25 %	261854683
1104	NC_013422	GCA	2	6	60948	60953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854683
1105	NC_013422	CCG	2	6	60971	60976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854683
1106	NC_013422	TGCGC	2	10	60978	60987	0 %	20 %	40 %	40 %	261854683
1107	NC_013422	AAT	2	6	60991	60996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261854683
1108	NC_013422	TCCT	2	8	61000	61007	0 %	50 %	0 %	50 %	261854683
1109	NC_013422	GAG	2	6	61018	61023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261854683
1110	NC_013422	CAGG	2	8	61039	61046	25 %	0 %	50 %	25 %	261854683
1111	NC_013422	CAG	2	6	61183	61188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854683
1112	NC_013422	GGT	2	6	61305	61310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854683
1113	NC_013422	GTCA	2	8	61354	61361	25 %	25 %	25 %	25 %	261854683
1114	NC_013422	GGC	2	6	61372	61377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854683
1115	NC_013422	TCAG	2	8	61538	61545	25 %	25 %	25 %	25 %	261854683
1116	NC_013422	CCG	2	6	61628	61633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854683
1117	NC_013422	TTGCT	2	10	61709	61718	0 %	60 %	20 %	20 %	261854683
1118	NC_013422	GGC	2	6	61739	61744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854683
1119	NC_013422	GC	3	6	61915	61920	0 %	0 %	50 %	50 %	261854683
1120	NC_013422	CGTA	2	8	61941	61948	25 %	25 %	25 %	25 %	261854683
1121	NC_013422	GAC	2	6	61983	61988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854683
1122	NC_013422	GACCG	2	10	62019	62028	20 %	0 %	40 %	40 %	261854683
1123	NC_013422	AG	3	6	62102	62107	50 %	0 %	50 %	0 %	261854684
1124	NC_013422	TCT	2	6	62121	62126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261854684
1125	NC_013422	CGCT	2	8	62157	62164	0 %	25 %	25 %	50 %	261854684
1126	NC_013422	GCA	2	6	62172	62177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854684
1127	NC_013422	TCA	2	6	62259	62264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854685
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1132	NC_013422	T	6	6	62596	62601	0 %	100 %	0 %	0 %	261854685
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1134	NC_013422	GC	3	6	62793	62798	0 %	0 %	50 %	50 %	261854685
1135	NC_013422	CTGC	2	8	62836	62843	0 %	25 %	25 %	50 %	261854685
1136	NC_013422	ACTG	2	8	62862	62869	25 %	25 %	25 %	25 %	261854685
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1139	NC_013422	ATTA	2	8	62953	62960	50 %	50 %	0 %	0 %	261854685
1140	NC_013422	TGA	2	6	63002	63007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854685
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1144	NC_013422	A	7	7	63525	63531	100 %	0 %	0 %	0 %	261854686
1145	NC_013422	GTTT	2	8	63551	63558	0 %	75 %	25 %	0 %	261854686
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1151	NC_013422	ATC	2	6	63954	63959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854686
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1158	NC_013422	GATT	2	8	64491	64498	25 %	50 %	25 %	0 %	261854687
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1239	NC_013422	CGCC	2	8	69018	69025	0 %	0 %	25 %	75 %	261854691
1240	NC_013422	TTG	2	6	69055	69060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261854691
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1242	NC_013422	CGG	2	6	69242	69247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854692
1243	NC_013422	CA	3	6	69251	69256	50 %	0 %	0 %	50 %	261854692
1244	NC_013422	T	6	6	69260	69265	0 %	100 %	0 %	0 %	261854692
1245	NC_013422	GGCG	2	8	69278	69285	0 %	0 %	75 %	25 %	261854692
1246	NC_013422	CGA	2	6	69311	69316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854692
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1248	NC_013422	CCA	2	6	69397	69402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261854692
1249	NC_013422	GTCG	2	8	69593	69600	0 %	25 %	50 %	25 %	261854692
1250	NC_013422	GCC	2	6	69618	69623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854692
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1252	NC_013422	CGT	2	6	69788	69793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854692
1253	NC_013422	GC	3	6	69794	69799	0 %	0 %	50 %	50 %	261854692
1254	NC_013422	TGCC	2	8	69851	69858	0 %	25 %	25 %	50 %	261854692
1255	NC_013422	TCG	2	6	69875	69880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854692
1256	NC_013422	GCC	2	6	69903	69908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854692
1257	NC_013422	GC	3	6	69942	69947	0 %	0 %	50 %	50 %	261854692
1258	NC_013422	GCGG	2	8	70020	70027	0 %	0 %	75 %	25 %	261854692
1259	NC_013422	GCA	2	6	70043	70048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854692
1260	NC_013422	CACGG	2	10	70101	70110	20 %	0 %	40 %	40 %	261854692
1261	NC_013422	CATG	2	8	70202	70209	25 %	25 %	25 %	25 %	261854692
1262	NC_013422	GTTC	2	8	70381	70388	0 %	50 %	25 %	25 %	261854692
1263	NC_013422	GGC	2	6	70395	70400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854692
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1266	NC_013422	CGATGC	2	12	70617	70628	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	261854693
1267	NC_013422	GAT	2	6	70683	70688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854693
1268	NC_013422	CGA	2	6	70722	70727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854693
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1283	NC_013422	T	7	7	71242	71248	0 %	100 %	0 %	0 %	261854694
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1292	NC_013422	GCTG	2	8	71629	71636	0 %	25 %	50 %	25 %	261854695
1293	NC_013422	GAC	2	6	71644	71649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854695
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1372	NC_013422	GC	3	6	75573	75578	0 %	0 %	50 %	50 %	261854698
1373	NC_013422	CAT	2	6	75634	75639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854698
1374	NC_013422	TGC	2	6	75660	75665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854698
1375	NC_013422	TGG	2	6	75669	75674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854698
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