MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Halomicrobium mukohataei DSM 12286 chromosome

Total Repeats: 2076

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013202	GTCGA	2	10	634	643	20 %	20 %	40 %	20 %	257386086
2	NC_013202	GACGG	2	10	1765	1774	20 %	0 %	60 %	20 %	257386086
3	NC_013202	CGATC	2	10	3264	3273	20 %	20 %	20 %	40 %	257386087
4	NC_013202	CGACG	2	10	3297	3306	20 %	0 %	40 %	40 %	257386087
5	NC_013202	GCGAC	2	10	5556	5565	20 %	0 %	40 %	40 %	257386090
6	NC_013202	GGCGA	2	10	8070	8079	20 %	0 %	60 %	20 %	257386096
7	NC_013202	CGATC	2	10	9820	9829	20 %	20 %	20 %	40 %	257386096
8	NC_013202	GGCGA	2	10	10244	10253	20 %	0 %	60 %	20 %	257386096
9	NC_013202	CGTCA	2	10	10816	10825	20 %	20 %	20 %	40 %	257386098
10	NC_013202	AGCGC	2	10	10876	10885	20 %	0 %	40 %	40 %	257386099
11	NC_013202	CCGGC	2	10	12364	12373	0 %	0 %	40 %	60 %	257386101
12	NC_013202	CGACA	2	10	12808	12817	40 %	0 %	20 %	40 %	257386101
13	NC_013202	CGTCG	2	10	12985	12994	0 %	20 %	40 %	40 %	257386102
14	NC_013202	GGCTG	2	10	14223	14232	0 %	20 %	60 %	20 %	257386102
15	NC_013202	CGTCG	2	10	15174	15183	0 %	20 %	40 %	40 %	257386104
16	NC_013202	GCGAC	2	10	17512	17521	20 %	0 %	40 %	40 %	257386107
17	NC_013202	GACGC	2	10	18176	18185	20 %	0 %	40 %	40 %	257386108
18	NC_013202	CGTCG	2	10	20914	20923	0 %	20 %	40 %	40 %	257386110
19	NC_013202	GAGCA	2	10	23508	23517	40 %	0 %	40 %	20 %	257386113
20	NC_013202	TGCGC	2	10	23723	23732	0 %	20 %	40 %	40 %	257386114
21	NC_013202	CGGAC	2	10	23813	23822	20 %	0 %	40 %	40 %	257386114
22	NC_013202	GATCG	2	10	23993	24002	20 %	20 %	40 %	20 %	257386114
23	NC_013202	CCACG	2	10	25240	25249	20 %	0 %	20 %	60 %	257386115
24	NC_013202	GACCG	2	10	26036	26045	20 %	0 %	40 %	40 %	257386115
25	NC_013202	ATCGA	2	10	26463	26472	40 %	20 %	20 %	20 %	257386116
26	NC_013202	GCACA	2	10	26657	26666	40 %	0 %	20 %	40 %	257386116
27	NC_013202	GATCG	2	10	26682	26691	20 %	20 %	40 %	20 %	257386116
28	NC_013202	GCGAC	2	10	27160	27169	20 %	0 %	40 %	40 %	257386116
29	NC_013202	GCGCC	2	10	27194	27203	0 %	0 %	40 %	60 %	257386116
30	NC_013202	TCGCC	2	10	27728	27737	0 %	20 %	20 %	60 %	257386116
31	NC_013202	GACGA	2	10	27994	28003	40 %	0 %	40 %	20 %	257386116
32	NC_013202	GATCG	2	10	28412	28421	20 %	20 %	40 %	20 %	257386117
33	NC_013202	AGGTC	2	10	28745	28754	20 %	20 %	40 %	20 %	257386117
34	NC_013202	CCGTC	2	10	29889	29898	0 %	20 %	20 %	60 %	257386119
35	NC_013202	GCGGT	2	10	30461	30470	0 %	20 %	60 %	20 %	257386119
36	NC_013202	CGCGA	2	10	32136	32145	20 %	0 %	40 %	40 %	257386121
37	NC_013202	TCGGT	2	10	35313	35322	0 %	40 %	40 %	20 %	257386123
38	NC_013202	CGTGG	2	10	36187	36196	0 %	20 %	60 %	20 %	257386123
39	NC_013202	TCGAG	2	10	40429	40438	20 %	20 %	40 %	20 %	257386128
40	NC_013202	CGGTG	2	10	41868	41877	0 %	20 %	60 %	20 %	257386131
41	NC_013202	GCGCC	2	10	42552	42561	0 %	0 %	40 %	60 %	257386131
42	NC_013202	GAACG	2	10	42954	42963	40 %	0 %	40 %	20 %	257386132
43	NC_013202	AGGTC	2	10	45189	45198	20 %	20 %	40 %	20 %	257386134
44	NC_013202	GTCGT	2	10	47094	47103	0 %	40 %	40 %	20 %	257386135
45	NC_013202	GTCGT	2	10	54413	54422	0 %	40 %	40 %	20 %	257386140
46	NC_013202	AGGTG	2	10	54780	54789	20 %	20 %	60 %	0 %	257386140
47	NC_013202	CGGCG	2	10	57156	57165	0 %	0 %	60 %	40 %	257386141
48	NC_013202	GACCG	2	10	57935	57944	20 %	0 %	40 %	40 %	257386141
49	NC_013202	AGTCG	2	10	57966	57975	20 %	20 %	40 %	20 %	257386141
50	NC_013202	CGTGG	2	10	58022	58031	0 %	20 %	60 %	20 %	257386141
51	NC_013202	CGCGA	2	10	60198	60207	20 %	0 %	40 %	40 %	257386145
52	NC_013202	GACCG	2	10	61430	61439	20 %	0 %	40 %	40 %	257386146
53	NC_013202	GGCCT	2	10	61910	61919	0 %	20 %	40 %	40 %	257386146
54	NC_013202	GTACC	2	10	63701	63710	20 %	20 %	20 %	40 %	257386146
55	NC_013202	CCTAT	2	10	75720	75729	20 %	40 %	0 %	40 %	257386155
56	NC_013202	TTACT	2	10	76200	76209	20 %	60 %	0 %	20 %	257386155
57	NC_013202	TTCAC	2	10	79201	79210	20 %	40 %	0 %	40 %	257386157
58	NC_013202	TTCCG	2	10	80219	80228	0 %	40 %	20 %	40 %	257386157
59	NC_013202	TGTTC	2	10	86018	86027	0 %	60 %	20 %	20 %	257386161
60	NC_013202	TCATA	2	10	86108	86117	40 %	40 %	0 %	20 %	257386161
61	NC_013202	CGCGG	2	10	88579	88588	0 %	0 %	60 %	40 %	257386163
62	NC_013202	CGTTC	2	10	90262	90271	0 %	40 %	20 %	40 %	257386163
63	NC_013202	ACGGC	2	10	91441	91450	20 %	0 %	40 %	40 %	257386165
64	NC_013202	TCGAG	2	10	92042	92051	20 %	20 %	40 %	20 %	257386165
65	NC_013202	TCGAT	2	10	93444	93453	20 %	40 %	20 %	20 %	257386167
66	NC_013202	GTCCC	2	10	95637	95646	0 %	20 %	20 %	60 %	257386169
67	NC_013202	CCAGG	2	10	105653	105662	20 %	0 %	40 %	40 %	257386179
68	NC_013202	GCGCC	2	10	106027	106036	0 %	0 %	40 %	60 %	257386180
69	NC_013202	TCGCT	2	10	107490	107499	0 %	40 %	20 %	40 %	257386180
70	NC_013202	GGCGA	2	10	107621	107630	20 %	0 %	60 %	20 %	257386180
71	NC_013202	CGGCG	2	10	107776	107785	0 %	0 %	60 %	40 %	257386180
72	NC_013202	CGGTC	2	10	108188	108197	0 %	20 %	40 %	40 %	257386181
73	NC_013202	CGGTC	2	10	110722	110731	0 %	20 %	40 %	40 %	257386183
74	NC_013202	GATCG	2	10	110900	110909	20 %	20 %	40 %	20 %	257386183
75	NC_013202	GCGTC	2	10	110971	110980	0 %	20 %	40 %	40 %	257386183
76	NC_013202	CGCGA	2	10	111778	111787	20 %	0 %	40 %	40 %	257386184
77	NC_013202	CGCCC	2	10	113915	113924	0 %	0 %	20 %	80 %	257386186
78	NC_013202	GGCGA	2	10	117511	117520	20 %	0 %	60 %	20 %	257386188
79	NC_013202	GCCGG	2	10	118782	118791	0 %	0 %	60 %	40 %	257386190
80	NC_013202	CGGCA	2	10	119195	119204	20 %	0 %	40 %	40 %	257386190
81	NC_013202	GCGGG	2	10	121280	121289	0 %	0 %	80 %	20 %	257386192
82	NC_013202	CGGCC	2	10	121550	121559	0 %	0 %	40 %	60 %	257386192
83	NC_013202	GGGGT	2	10	127449	127458	0 %	20 %	80 %	0 %	257386197
84	NC_013202	CGCGG	2	10	129324	129333	0 %	0 %	60 %	40 %	257386198
85	NC_013202	CCGAT	2	10	129776	129785	20 %	20 %	20 %	40 %	257386198
86	NC_013202	CGATC	2	10	130473	130482	20 %	20 %	20 %	40 %	257386198
87	NC_013202	CGCTC	2	10	131730	131739	0 %	20 %	20 %	60 %	257386199
88	NC_013202	GGCCG	2	10	132110	132119	0 %	0 %	60 %	40 %	257386199
89	NC_013202	GCAGA	2	10	132161	132170	40 %	0 %	40 %	20 %	257386199
90	NC_013202	GCTGG	2	10	134161	134170	0 %	20 %	60 %	20 %	257386202
91	NC_013202	GACCG	2	10	134688	134697	20 %	0 %	40 %	40 %	257386203
92	NC_013202	CTTCG	2	10	137501	137510	0 %	40 %	20 %	40 %	257386208
93	NC_013202	CGGGT	2	10	138458	138467	0 %	20 %	60 %	20 %	257386209
94	NC_013202	GTCAC	2	10	140367	140376	20 %	20 %	20 %	40 %	257386210
95	NC_013202	CCGTT	2	10	140515	140524	0 %	40 %	20 %	40 %	257386210
96	NC_013202	GGCCG	2	10	141254	141263	0 %	0 %	60 %	40 %	257386210
97	NC_013202	AGTCG	2	10	142950	142959	20 %	20 %	40 %	20 %	257386212
98	NC_013202	GCAGC	2	10	142964	142973	20 %	0 %	40 %	40 %	257386212
99	NC_013202	CGACG	2	10	144780	144789	20 %	0 %	40 %	40 %	257386214
100	NC_013202	CCGGG	2	10	145945	145954	0 %	0 %	60 %	40 %	257386216
101	NC_013202	ACGGC	2	10	146498	146507	20 %	0 %	40 %	40 %	257386216
102	NC_013202	GCGTC	2	10	146993	147002	0 %	20 %	40 %	40 %	257386217
103	NC_013202	CAGCG	2	10	147704	147713	20 %	0 %	40 %	40 %	257386218
104	NC_013202	CGGCG	2	10	148823	148832	0 %	0 %	60 %	40 %	257386219
105	NC_013202	TCGCA	2	10	148888	148897	20 %	20 %	20 %	40 %	257386219
106	NC_013202	CGGCG	2	10	150294	150303	0 %	0 %	60 %	40 %	257386220
107	NC_013202	GCGTC	2	10	150326	150335	0 %	20 %	40 %	40 %	257386220
108	NC_013202	GGACA	2	10	150664	150673	40 %	0 %	40 %	20 %	257386220
109	NC_013202	GGACG	2	10	151599	151608	20 %	0 %	60 %	20 %	257386221
110	NC_013202	TCCCG	2	10	152019	152028	0 %	20 %	20 %	60 %	257386221
111	NC_013202	TATGA	2	10	155865	155874	40 %	40 %	20 %	0 %	257386225
112	NC_013202	GACTG	2	10	157003	157012	20 %	20 %	40 %	20 %	257386226
113	NC_013202	TCGCT	2	10	157231	157240	0 %	40 %	20 %	40 %	257386226
114	NC_013202	CCAGT	2	10	158018	158027	20 %	20 %	20 %	40 %	257386227
115	NC_013202	CCGAT	2	10	167287	167296	20 %	20 %	20 %	40 %	257386241
116	NC_013202	TGCGA	2	10	169438	169447	20 %	20 %	40 %	20 %	257386242
117	NC_013202	GCTGT	2	10	169805	169814	0 %	40 %	40 %	20 %	257386243
118	NC_013202	GCTCG	2	10	170156	170165	0 %	20 %	40 %	40 %	257386243
119	NC_013202	AGACG	2	10	170904	170913	40 %	0 %	40 %	20 %	257386244
120	NC_013202	GGCGT	2	10	172264	172273	0 %	20 %	60 %	20 %	257386246
121	NC_013202	CGTCC	2	10	172465	172474	0 %	20 %	20 %	60 %	257386247
122	NC_013202	CCCAG	2	10	173095	173104	20 %	0 %	20 %	60 %	257386247
123	NC_013202	CGGTC	2	10	175282	175291	0 %	20 %	40 %	40 %	257386249
124	NC_013202	CGATC	2	10	176174	176183	20 %	20 %	20 %	40 %	257386250
125	NC_013202	TCGAC	2	10	176186	176195	20 %	20 %	20 %	40 %	257386250
126	NC_013202	CAGCG	2	10	176526	176535	20 %	0 %	40 %	40 %	257386250
127	NC_013202	CTCGG	2	10	177501	177510	0 %	20 %	40 %	40 %	257386251
128	NC_013202	TCGAC	2	10	178528	178537	20 %	20 %	20 %	40 %	257386253
129	NC_013202	ACCGA	2	10	180192	180201	40 %	0 %	20 %	40 %	257386255
130	NC_013202	CGGGC	2	10	180436	180445	0 %	0 %	60 %	40 %	257386255
131	NC_013202	GCAGA	2	10	180668	180677	40 %	0 %	40 %	20 %	257386255
132	NC_013202	GCGGG	2	10	183989	183998	0 %	0 %	80 %	20 %	257386259
133	NC_013202	CCGGA	2	10	184196	184205	20 %	0 %	40 %	40 %	257386259
134	NC_013202	GATCG	2	10	187348	187357	20 %	20 %	40 %	20 %	257386264
135	NC_013202	GATGG	2	10	190066	190075	20 %	20 %	60 %	0 %	257386266
136	NC_013202	CGACG	2	10	192989	192998	20 %	0 %	40 %	40 %	257386268
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259	NC_013202	CCCCG	2	10	376107	376116	0 %	0 %	20 %	80 %	257386452
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261	NC_013202	CGAAC	2	10	380059	380068	40 %	0 %	20 %	40 %	257386455
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