MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 2070

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013158	GGACG	2	10	501	510	20 %	0 %	60 %	20 %	257051091
2	NC_013158	CCGGC	2	10	3397	3406	0 %	0 %	40 %	60 %	257051095
3	NC_013158	CGAGC	2	10	3601	3610	20 %	0 %	40 %	40 %	257051095
4	NC_013158	CCGGA	2	10	3772	3781	20 %	0 %	40 %	40 %	257051095
5	NC_013158	CGGTC	2	10	5823	5832	0 %	20 %	40 %	40 %	257051097
6	NC_013158	CGGTT	2	10	6280	6289	0 %	40 %	40 %	20 %	257051097
7	NC_013158	TCGCT	2	10	8863	8872	0 %	40 %	20 %	40 %	257051099
8	NC_013158	TCGCA	2	10	9650	9659	20 %	20 %	20 %	40 %	257051100
9	NC_013158	CCGTC	2	10	10634	10643	0 %	20 %	20 %	60 %	257051101
10	NC_013158	CCGTC	2	10	10984	10993	0 %	20 %	20 %	60 %	257051101
11	NC_013158	CGAAT	2	10	11060	11069	40 %	20 %	20 %	20 %	257051101
12	NC_013158	TCGCA	2	10	11081	11090	20 %	20 %	20 %	40 %	257051101
13	NC_013158	ATCCG	2	10	12449	12458	20 %	20 %	20 %	40 %	257051101
14	NC_013158	CGTTG	2	10	13555	13564	0 %	40 %	40 %	20 %	257051102
15	NC_013158	ACTCG	2	10	14050	14059	20 %	20 %	20 %	40 %	257051102
16	NC_013158	GACCA	2	10	14485	14494	40 %	0 %	20 %	40 %	257051103
17	NC_013158	TCGAC	2	10	15645	15654	20 %	20 %	20 %	40 %	257051104
18	NC_013158	CGAAC	2	10	16919	16928	40 %	0 %	20 %	40 %	257051105
19	NC_013158	CGTCC	2	10	17282	17291	0 %	20 %	20 %	60 %	257051105
20	NC_013158	GATCG	2	10	18222	18231	20 %	20 %	40 %	20 %	257051105
21	NC_013158	ATCCT	2	10	19666	19675	20 %	40 %	0 %	40 %	257051107
22	NC_013158	CCCCG	2	10	22263	22272	0 %	0 %	20 %	80 %	257051110
23	NC_013158	CTTCC	2	10	22935	22944	0 %	40 %	0 %	60 %	257051111
24	NC_013158	ACCCG	2	10	25636	25645	20 %	0 %	20 %	60 %	257051113
25	NC_013158	ACGGC	2	10	26213	26222	20 %	0 %	40 %	40 %	257051113
26	NC_013158	GGATC	2	10	27683	27692	20 %	20 %	40 %	20 %	257051114
27	NC_013158	AGCGA	2	10	27863	27872	40 %	0 %	40 %	20 %	257051114
28	NC_013158	CGAGT	2	10	29114	29123	20 %	20 %	40 %	20 %	257051116
29	NC_013158	GACGT	2	10	30453	30462	20 %	20 %	40 %	20 %	257051118
30	NC_013158	TGCCG	2	10	31665	31674	0 %	20 %	40 %	40 %	257051120
31	NC_013158	CGATC	2	10	32174	32183	20 %	20 %	20 %	40 %	257051120
32	NC_013158	CCCGG	2	10	35262	35271	0 %	0 %	40 %	60 %	257051124
33	NC_013158	ACGTC	2	10	35528	35537	20 %	20 %	20 %	40 %	257051125
34	NC_013158	TCGCC	2	10	36962	36971	0 %	20 %	20 %	60 %	257051125
35	NC_013158	ACCGG	2	10	37385	37394	20 %	0 %	40 %	40 %	257051126
36	NC_013158	GCGTC	2	10	38020	38029	0 %	20 %	40 %	40 %	257051126
37	NC_013158	TCGGT	2	10	38367	38376	0 %	40 %	40 %	20 %	257051126
38	NC_013158	GGCCA	2	10	42741	42750	20 %	0 %	40 %	40 %	257051131
39	NC_013158	CGGCC	2	10	43259	43268	0 %	0 %	40 %	60 %	257051132
40	NC_013158	AGCGA	2	10	44364	44373	40 %	0 %	40 %	20 %	257051134
41	NC_013158	GTACC	2	10	46929	46938	20 %	20 %	20 %	40 %	257051135
42	NC_013158	CGCCA	2	10	48268	48277	20 %	0 %	20 %	60 %	257051136
43	NC_013158	TGGCT	2	10	51378	51387	0 %	40 %	40 %	20 %	257051141
44	NC_013158	GACGA	2	10	55538	55547	40 %	0 %	40 %	20 %	257051144
45	NC_013158	TTCCT	2	10	57336	57345	0 %	60 %	0 %	40 %	257051146
46	NC_013158	GGCCG	2	10	58103	58112	0 %	0 %	60 %	40 %	257051146
47	NC_013158	TGGAT	2	10	59770	59779	20 %	40 %	40 %	0 %	257051148
48	NC_013158	ATTCG	2	10	67274	67283	20 %	40 %	20 %	20 %	257051155
49	NC_013158	CCGAC	2	10	68715	68724	20 %	0 %	20 %	60 %	257051157
50	NC_013158	CCGGC	2	10	69535	69544	0 %	0 %	40 %	60 %	257051157
51	NC_013158	GGCGA	2	10	70888	70897	20 %	0 %	60 %	20 %	257051158
52	NC_013158	GCGTG	2	10	71283	71292	0 %	20 %	60 %	20 %	257051158
53	NC_013158	TCGCC	2	10	79331	79340	0 %	20 %	20 %	60 %	257051166
54	NC_013158	CCGGA	2	10	79920	79929	20 %	0 %	40 %	40 %	257051166
55	NC_013158	CTCGG	2	10	83167	83176	0 %	20 %	40 %	40 %	257051170
56	NC_013158	GAACG	2	10	86911	86920	40 %	0 %	40 %	20 %	257051175
57	NC_013158	CCGGA	2	10	88393	88402	20 %	0 %	40 %	40 %	257051177
58	NC_013158	GTGAC	2	10	89058	89067	20 %	20 %	40 %	20 %	257051179
59	NC_013158	CGTGG	2	10	89476	89485	0 %	20 %	60 %	20 %	257051180
60	NC_013158	GTCGA	2	10	90955	90964	20 %	20 %	40 %	20 %	257051181
61	NC_013158	CGTTC	2	10	96079	96088	0 %	40 %	20 %	40 %	257051189
62	NC_013158	TCGTC	2	10	97525	97534	0 %	40 %	20 %	40 %	257051190
63	NC_013158	CCTCG	2	10	97858	97867	0 %	20 %	20 %	60 %	257051190
64	NC_013158	CGAGT	2	10	105331	105340	20 %	20 %	40 %	20 %	257051196
65	NC_013158	TGCCG	2	10	107760	107769	0 %	20 %	40 %	40 %	257051201
66	NC_013158	GGAGT	2	10	108313	108322	20 %	20 %	60 %	0 %	257051202
67	NC_013158	CCGAC	2	10	108733	108742	20 %	0 %	20 %	60 %	257051202
68	NC_013158	GGCCT	2	10	108758	108767	0 %	20 %	40 %	40 %	257051202
69	NC_013158	TGGCC	2	10	109309	109318	0 %	20 %	40 %	40 %	257051202
70	NC_013158	TCGGA	2	10	112085	112094	20 %	20 %	40 %	20 %	257051206
71	NC_013158	TCGGC	2	10	114110	114119	0 %	20 %	40 %	40 %	257051209
72	NC_013158	CGGCG	2	10	119331	119340	0 %	0 %	60 %	40 %	257051212
73	NC_013158	GTTCT	2	10	126145	126154	0 %	60 %	20 %	20 %	257051218
74	NC_013158	TCACC	2	10	128741	128750	20 %	20 %	0 %	60 %	257051220
75	NC_013158	GCGCG	2	10	130753	130762	0 %	0 %	60 %	40 %	257051221
76	NC_013158	GACGG	2	10	131297	131306	20 %	0 %	60 %	20 %	257051221
77	NC_013158	ACGAA	2	10	132405	132414	60 %	0 %	20 %	20 %	257051222
78	NC_013158	GCGGT	2	10	134908	134917	0 %	20 %	60 %	20 %	257051224
79	NC_013158	TGATA	2	10	140851	140860	40 %	40 %	20 %	0 %	257051231
80	NC_013158	GTTGA	2	10	144992	145001	20 %	40 %	40 %	0 %	257051238
81	NC_013158	TGAGC	2	10	145111	145120	20 %	20 %	40 %	20 %	257051238
82	NC_013158	TCGAA	2	10	146564	146573	40 %	20 %	20 %	20 %	257051240
83	NC_013158	AGCTG	2	10	147585	147594	20 %	20 %	40 %	20 %	257051240
84	NC_013158	TGGCC	2	10	149489	149498	0 %	20 %	40 %	40 %	257051241
85	NC_013158	TTCGA	2	10	149960	149969	20 %	40 %	20 %	20 %	257051242
86	NC_013158	ACGAC	2	10	150194	150203	40 %	0 %	20 %	40 %	257051242
87	NC_013158	GGACG	2	10	151063	151072	20 %	0 %	60 %	20 %	257051243
88	NC_013158	CCAGC	2	10	153833	153842	20 %	0 %	20 %	60 %	257051244
89	NC_013158	TCCCC	2	10	155564	155573	0 %	20 %	0 %	80 %	257051244
90	NC_013158	GATCG	2	10	155946	155955	20 %	20 %	40 %	20 %	257051244
91	NC_013158	GCCGC	2	10	156343	156352	0 %	0 %	40 %	60 %	257051244
92	NC_013158	CCGGT	2	10	157625	157634	0 %	20 %	40 %	40 %	257051245
93	NC_013158	CGCGC	2	10	158875	158884	0 %	0 %	40 %	60 %	257051246
94	NC_013158	CTCGT	2	10	159340	159349	0 %	40 %	20 %	40 %	257051246
95	NC_013158	CCGTC	2	10	159805	159814	0 %	20 %	20 %	60 %	257051247
96	NC_013158	TCCAC	2	10	161288	161297	20 %	20 %	0 %	60 %	257051248
97	NC_013158	GATCG	2	10	161907	161916	20 %	20 %	40 %	20 %	257051248
98	NC_013158	CAGTC	2	10	161976	161985	20 %	20 %	20 %	40 %	257051248
99	NC_013158	CGATC	2	10	163154	163163	20 %	20 %	20 %	40 %	257051249
100	NC_013158	GCCCG	2	10	163473	163482	0 %	0 %	40 %	60 %	257051250
101	NC_013158	CCCGC	2	10	163487	163496	0 %	0 %	20 %	80 %	257051250
102	NC_013158	CCGGC	2	10	163837	163846	0 %	0 %	40 %	60 %	257051250
103	NC_013158	GCGCC	2	10	164225	164234	0 %	0 %	40 %	60 %	257051251
104	NC_013158	AACAG	2	10	166099	166108	60 %	0 %	20 %	20 %	257051253
105	NC_013158	GCGTC	2	10	166995	167004	0 %	20 %	40 %	40 %	257051255
106	NC_013158	GTCGC	2	10	167384	167393	0 %	20 %	40 %	40 %	257051255
107	NC_013158	GTGCC	2	10	168361	168370	0 %	20 %	40 %	40 %	257051256
108	NC_013158	CGTCG	2	10	170695	170704	0 %	20 %	40 %	40 %	257051259
109	NC_013158	CGTAC	2	10	172005	172014	20 %	20 %	20 %	40 %	257051261
110	NC_013158	CGATC	2	10	172997	173006	20 %	20 %	20 %	40 %	257051262
111	NC_013158	AGCGA	2	10	174070	174079	40 %	0 %	40 %	20 %	257051263
112	NC_013158	GGCGA	2	10	175413	175422	20 %	0 %	60 %	20 %	257051264
113	NC_013158	TCGGG	2	10	176966	176975	0 %	20 %	60 %	20 %	257051264
114	NC_013158	CGACG	2	10	178266	178275	20 %	0 %	40 %	40 %	257051265
115	NC_013158	GTGAG	2	10	179499	179508	20 %	20 %	60 %	0 %	257051268
116	NC_013158	CGTCA	2	10	179839	179848	20 %	20 %	20 %	40 %	257051268
117	NC_013158	GGCGA	2	10	180548	180557	20 %	0 %	60 %	20 %	257051269
118	NC_013158	CTGTA	2	10	181529	181538	20 %	40 %	20 %	20 %	257051269
119	NC_013158	CCGAC	2	10	182996	183005	20 %	0 %	20 %	60 %	257051272
120	NC_013158	CGAGA	2	10	183404	183413	40 %	0 %	40 %	20 %	257051273
121	NC_013158	GGAAG	2	10	187127	187136	40 %	0 %	60 %	0 %	257051276
122	NC_013158	CCGTT	2	10	189159	189168	0 %	40 %	20 %	40 %	257051280
123	NC_013158	CGCAC	2	10	191068	191077	20 %	0 %	20 %	60 %	257051282
124	NC_013158	ATCGC	2	10	191947	191956	20 %	20 %	20 %	40 %	257051282
125	NC_013158	CGAAA	2	10	192874	192883	60 %	0 %	20 %	20 %	257051283
126	NC_013158	GATCG	2	10	193133	193142	20 %	20 %	40 %	20 %	257051283
127	NC_013158	GATCG	2	10	195354	195363	20 %	20 %	40 %	20 %	257051287
128	NC_013158	GATCG	2	10	195375	195384	20 %	20 %	40 %	20 %	257051287
129	NC_013158	GAACG	2	10	196651	196660	40 %	0 %	40 %	20 %	257051288
130	NC_013158	GCTCG	2	10	198733	198742	0 %	20 %	40 %	40 %	257051290
131	NC_013158	CGGGC	2	10	199339	199348	0 %	0 %	60 %	40 %	257051290
132	NC_013158	CTCGA	2	10	201588	201597	20 %	20 %	20 %	40 %	257051293
133	NC_013158	GGCGG	2	10	201840	201849	0 %	0 %	80 %	20 %	257051293
134	NC_013158	ATCCC	2	10	203604	203613	20 %	20 %	0 %	60 %	257051294
135	NC_013158	TCGAG	2	10	203962	203971	20 %	20 %	40 %	20 %	257051294
136	NC_013158	CCCGA	2	10	205573	205582	20 %	0 %	20 %	60 %	257051295
137	NC_013158	CCCGG	2	10	206360	206369	0 %	0 %	40 %	60 %	257051296
138	NC_013158	TCGAT	2	10	207013	207022	20 %	40 %	20 %	20 %	257051296
139	NC_013158	AACCG	2	10	207783	207792	40 %	0 %	20 %	40 %	257051297
140	NC_013158	ATTCA	2	10	210990	210999	40 %	40 %	0 %	20 %	257051300
141	NC_013158	ACGAG	2	10	215878	215887	40 %	0 %	40 %	20 %	257051306
142	NC_013158	ACGGA	2	10	216709	216718	40 %	0 %	40 %	20 %	257051307
143	NC_013158	GAACG	2	10	218767	218776	40 %	0 %	40 %	20 %	257051309
144	NC_013158	CTGGG	2	10	219175	219184	0 %	20 %	60 %	20 %	257051309
145	NC_013158	CGCGT	2	10	219323	219332	0 %	20 %	40 %	40 %	257051309
146	NC_013158	TCAGT	2	10	222600	222609	20 %	40 %	20 %	20 %	257051314
147	NC_013158	TGGAC	2	10	222720	222729	20 %	20 %	40 %	20 %	257051314
148	NC_013158	GCGAC	2	10	223906	223915	20 %	0 %	40 %	40 %	257051316
149	NC_013158	GATCC	2	10	225438	225447	20 %	20 %	20 %	40 %	257051318
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151	NC_013158	CCGGT	2	10	227361	227370	0 %	20 %	40 %	40 %	257051321
152	NC_013158	TCGGG	2	10	228346	228355	0 %	20 %	60 %	20 %	257051322
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157	NC_013158	CGTGA	2	10	240403	240412	20 %	20 %	40 %	20 %	257051336
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168	NC_013158	GATCG	2	10	259784	259793	20 %	20 %	40 %	20 %	257051356
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170	NC_013158	GATCC	2	10	260768	260777	20 %	20 %	20 %	40 %	257051359
171	NC_013158	TCGCG	2	10	261032	261041	0 %	20 %	40 %	40 %	257051359
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174	NC_013158	CGTCC	2	10	262271	262280	0 %	20 %	20 %	60 %	257051360
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193	NC_013158	ACCGA	2	10	283718	283727	40 %	0 %	20 %	40 %	257051385
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199	NC_013158	CCGTC	2	10	292631	292640	0 %	20 %	20 %	60 %	257051395
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234	NC_013158	GACGC	2	10	340604	340613	20 %	0 %	40 %	40 %	257051440
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242	NC_013158	GCGTC	2	10	359756	359765	0 %	20 %	40 %	40 %	257051458
243	NC_013158	ATCGA	2	10	360586	360595	40 %	20 %	20 %	20 %	257051458
244	NC_013158	GATCG	2	10	361165	361174	20 %	20 %	40 %	20 %	257051458
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246	NC_013158	CCGTC	2	10	363015	363024	0 %	20 %	20 %	60 %	257051461
247	NC_013158	GAACG	2	10	363773	363782	40 %	0 %	40 %	20 %	257051462
248	NC_013158	ATCAC	2	10	369343	369352	40 %	20 %	0 %	40 %	257051464
249	NC_013158	CATAG	2	10	376373	376382	40 %	20 %	20 %	20 %	257051471
250	NC_013158	GGGGT	2	10	377020	377029	0 %	20 %	80 %	0 %	257051472
251	NC_013158	TGTCG	2	10	382097	382106	0 %	40 %	40 %	20 %	257051476
252	NC_013158	TCGAC	2	10	382477	382486	20 %	20 %	20 %	40 %	257051476
253	NC_013158	CCCGG	2	10	383131	383140	0 %	0 %	40 %	60 %	257051477
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255	NC_013158	CCGAT	2	10	383929	383938	20 %	20 %	20 %	40 %	257051478
256	NC_013158	CGGGC	2	10	383967	383976	0 %	0 %	60 %	40 %	257051478
257	NC_013158	ACACG	2	10	384434	384443	40 %	0 %	20 %	40 %	257051478
258	NC_013158	ATCGG	2	10	384678	384687	20 %	20 %	40 %	20 %	257051478
259	NC_013158	TCGCC	2	10	384886	384895	0 %	20 %	20 %	60 %	257051479
260	NC_013158	TCGCC	2	10	387300	387309	0 %	20 %	20 %	60 %	257051480
261	NC_013158	TTCCC	2	10	391366	391375	0 %	40 %	0 %	60 %	257051484
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