MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 66729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013158	GCTC	2	8	193086	193093	0 %	25 %	25 %	50 %	257051283
4002	NC_013158	CTC	2	6	193127	193132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051283
4003	NC_013158	GATCG	2	10	193133	193142	20 %	20 %	40 %	20 %	257051283
4004	NC_013158	GGC	2	6	193186	193191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051283
4005	NC_013158	CGT	2	6	193258	193263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051283
4006	NC_013158	GATG	2	8	193348	193355	25 %	25 %	50 %	0 %	257051283
4007	NC_013158	CGG	2	6	193400	193405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051284
4008	NC_013158	AGCC	2	8	193456	193463	25 %	0 %	25 %	50 %	257051284
4009	NC_013158	CGA	2	6	193479	193484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051284
4010	NC_013158	GCG	2	6	193492	193497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051284
4011	NC_013158	CGT	2	6	193533	193538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051284
4012	NC_013158	CGG	2	6	193598	193603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051284
4013	NC_013158	TCG	2	6	193634	193639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051284
4014	NC_013158	CCG	3	9	193667	193675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051284
4015	NC_013158	GCC	2	6	193750	193755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051284
4016	NC_013158	GAG	2	6	193756	193761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051284
4017	NC_013158	AATG	2	8	193768	193775	50 %	25 %	25 %	0 %	257051284
4018	NC_013158	GCTC	2	8	193782	193789	0 %	25 %	25 %	50 %	257051285
4019	NC_013158	GGA	2	6	193792	193797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051285
4020	NC_013158	CATC	2	8	193951	193958	25 %	25 %	0 %	50 %	257051285
4021	NC_013158	CGA	3	9	194032	194040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051285
4022	NC_013158	CGA	2	6	194053	194058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051285
4023	NC_013158	GCC	2	6	194075	194080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051285
4024	NC_013158	GAC	2	6	194173	194178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051285
4025	NC_013158	TGA	2	6	194253	194258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051286
4026	NC_013158	GTC	2	6	194263	194268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051286
4027	NC_013158	TCG	2	6	194342	194347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051286
4028	NC_013158	ACGG	2	8	194491	194498	25 %	0 %	50 %	25 %	257051286
4029	NC_013158	CGAT	2	8	194610	194617	25 %	25 %	25 %	25 %	257051286
4030	NC_013158	GGC	2	6	194667	194672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051286
4031	NC_013158	TCG	2	6	194744	194749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051286
4032	NC_013158	GCC	2	6	194775	194780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051286
4033	NC_013158	ACGC	2	8	194821	194828	25 %	0 %	25 %	50 %	257051286
4034	NC_013158	CGT	2	6	194889	194894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051286
4035	NC_013158	CG	3	6	194904	194909	0 %	0 %	50 %	50 %	257051286
4036	NC_013158	GTG	2	6	194989	194994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051286
4037	NC_013158	GCA	2	6	195014	195019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051286
4038	NC_013158	CGT	2	6	195033	195038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051286
4039	NC_013158	CGG	2	6	195157	195162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051286
4040	NC_013158	ACG	2	6	195188	195193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051286
4041	NC_013158	ACC	2	6	195263	195268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051286
4042	NC_013158	CGA	3	9	195317	195325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051287
4043	NC_013158	GATCG	2	10	195354	195363	20 %	20 %	40 %	20 %	257051287
4044	NC_013158	GATCG	2	10	195375	195384	20 %	20 %	40 %	20 %	257051287
4045	NC_013158	GAC	2	6	195506	195511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051287
4046	NC_013158	CAA	2	6	195539	195544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051287
4047	NC_013158	ACG	2	6	195568	195573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051287
4048	NC_013158	AGG	2	6	195589	195594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051287
4049	NC_013158	GC	3	6	195704	195709	0 %	0 %	50 %	50 %	257051287
4050	NC_013158	CGTC	2	8	195869	195876	0 %	25 %	25 %	50 %	257051287
4051	NC_013158	ACG	2	6	195889	195894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051287
4052	NC_013158	CGAC	2	8	195982	195989	25 %	0 %	25 %	50 %	257051287
4053	NC_013158	CACG	2	8	196125	196132	25 %	0 %	25 %	50 %	257051287
4054	NC_013158	CTGA	2	8	196143	196150	25 %	25 %	25 %	25 %	257051287
4055	NC_013158	CCG	2	6	196156	196161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051287
4056	NC_013158	GT	3	6	196257	196262	0 %	50 %	50 %	0 %	257051287
4057	NC_013158	GAC	2	6	196299	196304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051287
4058	NC_013158	TCG	2	6	196325	196330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051287
4059	NC_013158	TC	3	6	196359	196364	0 %	50 %	0 %	50 %	257051287
4060	NC_013158	ACG	2	6	196420	196425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051287
4061	NC_013158	GA	3	6	196426	196431	50 %	0 %	50 %	0 %	257051287
4062	NC_013158	ACC	2	6	196494	196499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051287
4063	NC_013158	GAACG	2	10	196651	196660	40 %	0 %	40 %	20 %	257051288
4064	NC_013158	GTT	2	6	196665	196670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257051288
4065	NC_013158	GTC	2	6	196678	196683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051288
4066	NC_013158	G	6	6	196724	196729	0 %	0 %	100 %	0 %	257051288
4067	NC_013158	TGG	2	6	196765	196770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051288
4068	NC_013158	GAT	2	6	196782	196787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051288
4069	NC_013158	CGG	2	6	196819	196824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051288
4070	NC_013158	TCG	3	9	196887	196895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051289
4071	NC_013158	CCT	2	6	196900	196905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051289
4072	NC_013158	GCTC	2	8	196906	196913	0 %	25 %	25 %	50 %	257051289
4073	NC_013158	CGG	2	6	196953	196958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051289
4074	NC_013158	ACT	2	6	196962	196967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051289
4075	NC_013158	GTC	2	6	196994	196999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051289
4076	NC_013158	CTC	2	6	197000	197005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051289
4077	NC_013158	GCT	2	6	197023	197028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051289
4078	NC_013158	TTC	2	6	197042	197047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051289
4079	NC_013158	GGC	2	6	197048	197053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051289
4080	NC_013158	GCG	2	6	197069	197074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051289
4081	NC_013158	TCG	2	6	197238	197243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051289
4082	NC_013158	CAG	2	6	197285	197290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051289
4083	NC_013158	GCCG	2	8	197297	197304	0 %	0 %	50 %	50 %	257051289
4084	NC_013158	CGT	2	6	197383	197388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051289
4085	NC_013158	GCG	2	6	197403	197408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051289
4086	NC_013158	GGAC	2	8	197415	197422	25 %	0 %	50 %	25 %	257051289
4087	NC_013158	CGG	2	6	197484	197489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051289
4088	NC_013158	CGG	2	6	197508	197513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051289
4089	NC_013158	GGC	2	6	197549	197554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051289
4090	NC_013158	GCGATC	2	12	197588	197599	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257051289
4091	NC_013158	TCG	2	6	197643	197648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051289
4092	NC_013158	GAGC	2	8	197653	197660	25 %	0 %	50 %	25 %	257051289
4093	NC_013158	CTG	2	6	197693	197698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051289
4094	NC_013158	GTT	2	6	197791	197796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257051289
4095	NC_013158	CGC	2	6	197821	197826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051289
4096	NC_013158	GTC	2	6	197831	197836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051289
4097	NC_013158	GAT	2	6	197854	197859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051289
4098	NC_013158	GTC	2	6	197890	197895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051289
4099	NC_013158	TCG	2	6	197925	197930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051289
4100	NC_013158	CCG	2	6	197947	197952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051289
4101	NC_013158	GGA	2	6	197953	197958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051289
4102	NC_013158	TCG	2	6	197961	197966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051289
4103	NC_013158	GTC	2	6	197978	197983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051289
4104	NC_013158	GAC	2	6	198112	198117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051289
4105	NC_013158	GTG	2	6	198245	198250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051289
4106	NC_013158	GAG	2	6	198287	198292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051289
4107	NC_013158	AG	3	6	198316	198321	50 %	0 %	50 %	0 %	257051289
4108	NC_013158	AC	3	6	198563	198568	50 %	0 %	0 %	50 %	257051290
4109	NC_013158	CGC	2	6	198606	198611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051290
4110	NC_013158	GCTCG	2	10	198733	198742	0 %	20 %	40 %	40 %	257051290
4111	NC_013158	TCG	2	6	198759	198764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051290
4112	NC_013158	ACG	2	6	198780	198785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051290
4113	NC_013158	TCA	2	6	198810	198815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051290
4114	NC_013158	CGA	2	6	198817	198822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051290
4115	NC_013158	CTTCGC	2	12	198886	198897	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	257051290
4116	NC_013158	GCC	2	6	198902	198907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051290
4117	NC_013158	CTA	2	6	198955	198960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051290
4118	NC_013158	GATC	2	8	199015	199022	25 %	25 %	25 %	25 %	257051290
4119	NC_013158	CGA	3	9	199048	199056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051290
4120	NC_013158	TCG	2	6	199059	199064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051290
4121	NC_013158	GAG	2	6	199097	199102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051290
4122	NC_013158	CGA	2	6	199105	199110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051290
4123	NC_013158	ACG	2	6	199118	199123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051290
4124	NC_013158	GAG	2	6	199286	199291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051290
4125	NC_013158	CGGGC	2	10	199339	199348	0 %	0 %	60 %	40 %	257051290
4126	NC_013158	GAA	2	6	199370	199375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051290
4127	NC_013158	CG	3	6	199454	199459	0 %	0 %	50 %	50 %	257051290
4128	NC_013158	GCT	2	6	199503	199508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051291
4129	NC_013158	GCC	2	6	199531	199536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051291
4130	NC_013158	ACGT	2	8	199553	199560	25 %	25 %	25 %	25 %	257051291
4131	NC_013158	GGGA	2	8	199613	199620	25 %	0 %	75 %	0 %	257051291
4132	NC_013158	CGCT	2	8	199675	199682	0 %	25 %	25 %	50 %	257051291
4133	NC_013158	CAC	2	6	199729	199734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051291
4134	NC_013158	TTC	2	6	199741	199746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051291
4135	NC_013158	GTC	2	6	199939	199944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051292
4136	NC_013158	GTC	2	6	199966	199971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051292
4137	NC_013158	CGA	2	6	200012	200017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051292
4138	NC_013158	AGGC	2	8	200033	200040	25 %	0 %	50 %	25 %	257051292
4139	NC_013158	GAC	2	6	200043	200048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051292
4140	NC_013158	CAGTCG	2	12	200093	200104	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257051292
4141	NC_013158	GCG	2	6	200127	200132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051292
4142	NC_013158	GAC	2	6	200445	200450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051293
4143	NC_013158	CCGA	2	8	200454	200461	25 %	0 %	25 %	50 %	257051293
4144	NC_013158	ACT	2	6	200530	200535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051293
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4147	NC_013158	TCG	2	6	200674	200679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051293
4148	NC_013158	CGG	2	6	200688	200693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051293
4149	NC_013158	CGA	2	6	200699	200704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051293
4150	NC_013158	ACG	2	6	200728	200733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051293
4151	NC_013158	GT	3	6	200829	200834	0 %	50 %	50 %	0 %	257051293
4152	NC_013158	GC	4	8	200987	200994	0 %	0 %	50 %	50 %	257051293
4153	NC_013158	CGA	2	6	200995	201000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051293
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4157	NC_013158	CGA	2	6	201116	201121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051293
4158	NC_013158	CGA	2	6	201142	201147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051293
4159	NC_013158	TGA	2	6	201194	201199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051293
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4161	NC_013158	G	6	6	201222	201227	0 %	0 %	100 %	0 %	257051293
4162	NC_013158	ATC	2	6	201264	201269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051293
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4172	NC_013158	CTCGA	2	10	201588	201597	20 %	20 %	20 %	40 %	257051293
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4175	NC_013158	CGA	2	6	201806	201811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051293
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4221	NC_013158	CT	3	6	203597	203602	0 %	50 %	0 %	50 %	257051294
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4229	NC_013158	TCGAG	2	10	203962	203971	20 %	20 %	40 %	20 %	257051294
4230	NC_013158	TCGACG	2	12	203979	203990	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257051294
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4237	NC_013158	GTCA	2	8	204580	204587	25 %	25 %	25 %	25 %	257051294
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4239	NC_013158	GGA	2	6	204655	204660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051294
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4481	NC_013158	ACTC	2	8	217934	217941	25 %	25 %	0 %	50 %	257051308
4482	NC_013158	CGGC	2	8	217972	217979	0 %	0 %	50 %	50 %	257051308
4483	NC_013158	GAC	2	6	217992	217997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051308
4484	NC_013158	ATG	3	9	218005	218013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051308
4485	NC_013158	GCG	2	6	218014	218019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051308
4486	NC_013158	GAC	2	6	218043	218048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051308
4487	NC_013158	CGA	2	6	218084	218089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051308
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4490	NC_013158	CAG	2	6	218175	218180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051308
4491	NC_013158	TCG	2	6	218209	218214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051308
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4499	NC_013158	GTC	3	9	218636	218644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051309
4500	NC_013158	GAACG	2	10	218767	218776	40 %	0 %	40 %	20 %	257051309

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