MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 66729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013158	GAG	2	6	144770	144775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051238
3002	NC_013158	TGGA	2	8	144798	144805	25 %	25 %	50 %	0 %	257051238
3003	NC_013158	CCG	2	6	144865	144870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051238
3004	NC_013158	CAC	2	6	144907	144912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051238
3005	NC_013158	CA	3	6	144980	144985	50 %	0 %	0 %	50 %	257051238
3006	NC_013158	GTTGA	2	10	144992	145001	20 %	40 %	40 %	0 %	257051238
3007	NC_013158	GAC	2	6	145034	145039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051238
3008	NC_013158	TCG	2	6	145068	145073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051238
3009	NC_013158	TGAGC	2	10	145111	145120	20 %	20 %	40 %	20 %	257051238
3010	NC_013158	CGAC	2	8	145152	145159	25 %	0 %	25 %	50 %	257051238
3011	NC_013158	GTC	2	6	145160	145165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051238
3012	NC_013158	GAC	2	6	145175	145180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051238
3013	NC_013158	CGA	2	6	145204	145209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051238
3014	NC_013158	CGT	3	9	145210	145218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051238
3015	NC_013158	CGA	2	6	145219	145224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051238
3016	NC_013158	CGCC	2	8	145240	145247	0 %	0 %	25 %	75 %	257051238
3017	NC_013158	CGA	3	9	145291	145299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051238
3018	NC_013158	CGT	2	6	145342	145347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051238
3019	NC_013158	TGA	2	6	145400	145405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051238
3020	NC_013158	TC	3	6	145671	145676	0 %	50 %	0 %	50 %	257051239
3021	NC_013158	CG	3	6	145685	145690	0 %	0 %	50 %	50 %	257051239
3022	NC_013158	GCG	2	6	145710	145715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051239
3023	NC_013158	ATC	2	6	145718	145723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051239
3024	NC_013158	GT	3	6	145725	145730	0 %	50 %	50 %	0 %	257051239
3025	NC_013158	TTC	2	6	145742	145747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051239
3026	NC_013158	GGCT	2	8	145748	145755	0 %	25 %	50 %	25 %	257051239
3027	NC_013158	GTG	2	6	145797	145802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051239
3028	NC_013158	GAC	2	6	145816	145821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051239
3029	NC_013158	CGT	2	6	145828	145833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051239
3030	NC_013158	ATG	2	6	145892	145897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051239
3031	NC_013158	GCTGCC	2	12	145922	145933	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	257051239
3032	NC_013158	GCT	2	6	145975	145980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051239
3033	NC_013158	AGC	2	6	146008	146013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051239
3034	NC_013158	TCGG	2	8	146246	146253	0 %	25 %	50 %	25 %	257051240
3035	NC_013158	TGG	2	6	146270	146275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051240
3036	NC_013158	GTC	2	6	146329	146334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051240
3037	NC_013158	GAGT	2	8	146392	146399	25 %	25 %	50 %	0 %	257051240
3038	NC_013158	GGAC	2	8	146471	146478	25 %	0 %	50 %	25 %	257051240
3039	NC_013158	TCC	2	6	146489	146494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051240
3040	NC_013158	TCGAA	2	10	146564	146573	40 %	20 %	20 %	20 %	257051240
3041	NC_013158	GTC	2	6	146626	146631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051240
3042	NC_013158	GAT	2	6	146685	146690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051240
3043	NC_013158	GA	3	6	146830	146835	50 %	0 %	50 %	0 %	257051240
3044	NC_013158	TCG	2	6	146862	146867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051240
3045	NC_013158	TG	3	6	146927	146932	0 %	50 %	50 %	0 %	257051240
3046	NC_013158	TCG	2	6	147026	147031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051240
3047	NC_013158	CGC	2	6	147069	147074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051240
3048	NC_013158	CGT	2	6	147084	147089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051240
3049	NC_013158	CGG	2	6	147135	147140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051240
3050	NC_013158	CTC	2	6	147166	147171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051240
3051	NC_013158	CGA	2	6	147234	147239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051240
3052	NC_013158	TCG	2	6	147272	147277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051240
3053	NC_013158	AAC	2	6	147391	147396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051240
3054	NC_013158	GCGA	2	8	147437	147444	25 %	0 %	50 %	25 %	257051240
3055	NC_013158	GTC	3	9	147454	147462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051240
3056	NC_013158	CAG	2	6	147466	147471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051240
3057	NC_013158	TGT	2	6	147500	147505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257051240
3058	NC_013158	CAT	2	6	147535	147540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051240
3059	NC_013158	GCC	2	6	147565	147570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051240
3060	NC_013158	AGCTG	2	10	147585	147594	20 %	20 %	40 %	20 %	257051240
3061	NC_013158	AGT	2	6	147608	147613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051240
3062	NC_013158	ACGT	2	8	149304	149311	25 %	25 %	25 %	25 %	257051241
3063	NC_013158	CGA	2	6	149348	149353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051241
3064	NC_013158	CGG	2	6	149403	149408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051241
3065	NC_013158	TGGCC	2	10	149489	149498	0 %	20 %	40 %	40 %	257051241
3066	NC_013158	CGC	2	6	149555	149560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051241
3067	NC_013158	GAC	2	6	149568	149573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051241
3068	NC_013158	AGG	2	6	149611	149616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051241
3069	NC_013158	GGC	2	6	149646	149651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051241
3070	NC_013158	AGG	2	6	149694	149699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051242
3071	NC_013158	TACC	2	8	149734	149741	25 %	25 %	0 %	50 %	257051242
3072	NC_013158	TTCGA	2	10	149960	149969	20 %	40 %	20 %	20 %	257051242
3073	NC_013158	TCG	3	9	149982	149990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051242
3074	NC_013158	TCG	2	6	150025	150030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051242
3075	NC_013158	GAT	2	6	150173	150178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051242
3076	NC_013158	ACGAC	2	10	150194	150203	40 %	0 %	20 %	40 %	257051242
3077	NC_013158	TCG	2	6	150234	150239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051242
3078	NC_013158	AGC	2	6	150276	150281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051242
3079	NC_013158	CTGG	2	8	150355	150362	0 %	25 %	50 %	25 %	257051242
3080	NC_013158	CG	3	6	150388	150393	0 %	0 %	50 %	50 %	257051242
3081	NC_013158	ACG	2	6	150410	150415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051242
3082	NC_013158	GGT	2	6	150486	150491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051242
3083	NC_013158	ACT	2	6	150531	150536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051242
3084	NC_013158	CTT	2	6	150544	150549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051242
3085	NC_013158	CAC	2	6	150550	150555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051242
3086	NC_013158	AC	3	6	150554	150559	50 %	0 %	0 %	50 %	257051242
3087	NC_013158	GCG	2	6	150603	150608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051242
3088	NC_013158	ATC	2	6	150623	150628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051242
3089	NC_013158	CGAG	2	8	150839	150846	25 %	0 %	50 %	25 %	257051243
3090	NC_013158	GCA	2	6	150885	150890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051243
3091	NC_013158	CGA	2	6	150895	150900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051243
3092	NC_013158	CTT	2	6	150940	150945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051243
3093	NC_013158	CGA	3	9	150946	150954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051243
3094	NC_013158	GGACG	2	10	151063	151072	20 %	0 %	60 %	20 %	257051243
3095	NC_013158	CGT	2	6	151114	151119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051243
3096	NC_013158	TCGAGT	2	12	151194	151205	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	257051243
3097	NC_013158	TCG	2	6	151266	151271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051243
3098	NC_013158	CTC	2	6	151280	151285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051243
3099	NC_013158	GTA	2	6	151310	151315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051243
3100	NC_013158	GCT	2	6	151321	151326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051243
3101	NC_013158	GCC	2	6	151406	151411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051243
3102	NC_013158	CTC	2	6	151412	151417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051243
3103	NC_013158	ACG	2	6	151497	151502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051243
3104	NC_013158	ATC	2	6	151602	151607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051243
3105	NC_013158	TCG	3	9	151629	151637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051243
3106	NC_013158	GA	3	6	151638	151643	50 %	0 %	50 %	0 %	257051243
3107	NC_013158	CG	3	6	151786	151791	0 %	0 %	50 %	50 %	257051243
3108	NC_013158	CGT	2	6	151811	151816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051243
3109	NC_013158	TTC	2	6	151832	151837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051243
3110	NC_013158	TCG	3	9	151884	151892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051243
3111	NC_013158	GTC	2	6	151925	151930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051243
3112	NC_013158	AGC	2	6	151941	151946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051243
3113	NC_013158	CAG	2	6	151958	151963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051243
3114	NC_013158	GCC	2	6	151980	151985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051243
3115	NC_013158	TCG	2	6	152007	152012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051243
3116	NC_013158	CGA	2	6	152044	152049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051243
3117	NC_013158	ATC	2	6	152054	152059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051243
3118	NC_013158	GGA	2	6	152086	152091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051243
3119	NC_013158	CGAC	2	8	152094	152101	25 %	0 %	25 %	50 %	257051243
3120	NC_013158	TCG	2	6	152113	152118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051243
3121	NC_013158	GGC	2	6	152237	152242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051243
3122	NC_013158	GGA	2	6	152320	152325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051243
3123	NC_013158	CGTC	2	8	152326	152333	0 %	25 %	25 %	50 %	257051243
3124	NC_013158	GGC	2	6	152396	152401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051243
3125	NC_013158	CGA	2	6	152474	152479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051243
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3130	NC_013158	GA	3	6	153226	153231	50 %	0 %	50 %	0 %	257051244
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3133	NC_013158	CGA	2	6	153500	153505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051244
3134	NC_013158	GTCA	2	8	153528	153535	25 %	25 %	25 %	25 %	257051244
3135	NC_013158	CGTG	2	8	153590	153597	0 %	25 %	50 %	25 %	257051244
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3154	NC_013158	CGT	3	9	154361	154369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051244
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3230	NC_013158	CGA	2	6	157095	157100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051245
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3232	NC_013158	GTC	2	6	157175	157180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051245
3233	NC_013158	TCG	2	6	157193	157198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051245
3234	NC_013158	TCGAAG	2	12	157208	157219	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257051245
3235	NC_013158	GTA	2	6	157279	157284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051245
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3237	NC_013158	GGC	2	6	157414	157419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051245
3238	NC_013158	CGA	2	6	157455	157460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051245
3239	NC_013158	GCTC	2	8	157464	157471	0 %	25 %	25 %	50 %	257051245
3240	NC_013158	CCGT	2	8	157506	157513	0 %	25 %	25 %	50 %	257051245
3241	NC_013158	GGT	2	6	157536	157541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051245
3242	NC_013158	CGA	2	6	157551	157556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051245
3243	NC_013158	CCT	2	6	157572	157577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051245
3244	NC_013158	CCGGT	2	10	157625	157634	0 %	20 %	40 %	40 %	257051245
3245	NC_013158	CGG	2	6	157755	157760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051245
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3333	NC_013158	CGA	2	6	162173	162178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051248
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3358	NC_013158	ACGG	2	8	163104	163111	25 %	0 %	50 %	25 %	257051249
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3470	NC_013158	GTCGC	2	10	167384	167393	0 %	20 %	40 %	40 %	257051255
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3479	NC_013158	TCC	2	6	167648	167653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051255
3480	NC_013158	GCT	2	6	167696	167701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051255
3481	NC_013158	CGA	2	6	167724	167729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051255
3482	NC_013158	GTCA	2	8	167811	167818	25 %	25 %	25 %	25 %	257051256
3483	NC_013158	CTC	2	6	167819	167824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051256
3484	NC_013158	CGA	2	6	167905	167910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051256
3485	NC_013158	CCG	2	6	167999	168004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051256
3486	NC_013158	CGG	2	6	168067	168072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051256
3487	NC_013158	TCC	2	6	168153	168158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051256
3488	NC_013158	TCC	2	6	168177	168182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051256
3489	NC_013158	TCGA	2	8	168213	168220	25 %	25 %	25 %	25 %	257051256
3490	NC_013158	TTC	2	6	168242	168247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051256
3491	NC_013158	CGG	2	6	168258	168263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051256
3492	NC_013158	CGT	2	6	168283	168288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051256
3493	NC_013158	TCG	2	6	168345	168350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051256
3494	NC_013158	GTGCC	2	10	168361	168370	0 %	20 %	40 %	40 %	257051256
3495	NC_013158	CGT	2	6	168427	168432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051256
3496	NC_013158	TCGA	2	8	168473	168480	25 %	25 %	25 %	25 %	257051256
3497	NC_013158	TTCG	2	8	168493	168500	0 %	50 %	25 %	25 %	257051256
3498	NC_013158	CGGC	2	8	168511	168518	0 %	0 %	50 %	50 %	257051256
3499	NC_013158	GAC	2	6	169272	169277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051257
3500	NC_013158	GACC	2	8	169313	169320	25 %	0 %	25 %	50 %	257051257

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