MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 66729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_013158	CGA	2	6	119363	119368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051212
2502	NC_013158	GCC	2	6	119377	119382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051212
2503	NC_013158	ACG	2	6	119980	119985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051213
2504	NC_013158	TCG	2	6	120071	120076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051213
2505	NC_013158	GAC	2	6	120106	120111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051213
2506	NC_013158	AC	3	6	120180	120185	50 %	0 %	0 %	50 %	257051213
2507	NC_013158	CGA	2	6	120231	120236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051213
2508	NC_013158	CGA	2	6	120267	120272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051213
2509	NC_013158	ACA	2	6	120362	120367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051213
2510	NC_013158	TCA	2	6	120374	120379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051213
2511	NC_013158	ACG	2	6	120398	120403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051213
2512	NC_013158	GA	3	6	120425	120430	50 %	0 %	50 %	0 %	257051213
2513	NC_013158	TCAC	2	8	120454	120461	25 %	25 %	0 %	50 %	257051213
2514	NC_013158	AGT	2	6	120464	120469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051213
2515	NC_013158	GAT	2	6	120473	120478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051214
2516	NC_013158	CG	3	6	120492	120497	0 %	0 %	50 %	50 %	257051214
2517	NC_013158	CTC	2	6	120516	120521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051214
2518	NC_013158	CAA	2	6	120533	120538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051214
2519	NC_013158	CGA	2	6	120625	120630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051214
2520	NC_013158	CGC	2	6	120710	120715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051214
2521	NC_013158	ATT	3	9	120721	120729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257051214
2522	NC_013158	TCGA	2	8	120889	120896	25 %	25 %	25 %	25 %	257051214
2523	NC_013158	GAT	2	6	120903	120908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051214
2524	NC_013158	GAT	2	6	120939	120944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051214
2525	NC_013158	GAC	2	6	121388	121393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051215
2526	NC_013158	GAT	2	6	121511	121516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051215
2527	NC_013158	CGT	2	6	121570	121575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051215
2528	NC_013158	CGA	2	6	121791	121796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051216
2529	NC_013158	ACG	2	6	121829	121834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051216
2530	NC_013158	GTCG	2	8	121843	121850	0 %	25 %	50 %	25 %	257051216
2531	NC_013158	CGA	2	6	121947	121952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051216
2532	NC_013158	CGT	2	6	122053	122058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051216
2533	NC_013158	CGA	2	6	122094	122099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051216
2534	NC_013158	GAAC	2	8	122137	122144	50 %	0 %	25 %	25 %	257051216
2535	NC_013158	CCA	2	6	122188	122193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051216
2536	NC_013158	CAA	2	6	122395	122400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051216
2537	NC_013158	GAA	2	6	122506	122511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051216
2538	NC_013158	CGA	2	6	122515	122520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051216
2539	NC_013158	TCG	2	6	122619	122624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051216
2540	NC_013158	CGG	2	6	122632	122637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051216
2541	NC_013158	GC	4	8	122706	122713	0 %	0 %	50 %	50 %	257051216
2542	NC_013158	GAC	2	6	122723	122728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051216
2543	NC_013158	TCC	2	6	122754	122759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051216
2544	NC_013158	TTC	2	6	122820	122825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051216
2545	NC_013158	ACG	2	6	122832	122837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051216
2546	NC_013158	CGT	2	6	122887	122892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051216
2547	NC_013158	ACG	2	6	122900	122905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051216
2548	NC_013158	AGG	2	6	123016	123021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051217
2549	NC_013158	CTG	2	6	123029	123034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051217
2550	NC_013158	CTT	2	6	123041	123046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051217
2551	NC_013158	TCC	2	6	123075	123080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051217
2552	NC_013158	GTCG	2	8	123152	123159	0 %	25 %	50 %	25 %	257051217
2553	NC_013158	CGA	2	6	123172	123177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051217
2554	NC_013158	CGAC	2	8	123262	123269	25 %	0 %	25 %	50 %	257051217
2555	NC_013158	TCG	2	6	123330	123335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051217
2556	NC_013158	GCC	2	6	123352	123357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051217
2557	NC_013158	CGGG	2	8	123366	123373	0 %	0 %	75 %	25 %	257051217
2558	NC_013158	GCC	2	6	123377	123382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051217
2559	NC_013158	GAC	2	6	123389	123394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051217
2560	NC_013158	TCG	3	9	123408	123416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051217
2561	NC_013158	CGA	2	6	123427	123432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051217
2562	NC_013158	GCC	2	6	123446	123451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051217
2563	NC_013158	CGT	2	6	123478	123483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051217
2564	NC_013158	GCC	2	6	123527	123532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051217
2565	NC_013158	CGT	2	6	123541	123546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051217
2566	NC_013158	CGC	2	6	123568	123573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051217
2567	NC_013158	GGTT	2	8	123574	123581	0 %	50 %	50 %	0 %	257051217
2568	NC_013158	CTC	2	6	123644	123649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051217
2569	NC_013158	GCG	2	6	123650	123655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051217
2570	NC_013158	GAT	2	6	123683	123688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051217
2571	NC_013158	TCG	2	6	123723	123728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051217
2572	NC_013158	GTA	2	6	123749	123754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051217
2573	NC_013158	TCT	2	6	123780	123785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051217
2574	NC_013158	TCGA	2	8	123807	123814	25 %	25 %	25 %	25 %	257051217
2575	NC_013158	CGC	2	6	123961	123966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051217
2576	NC_013158	GCC	2	6	123990	123995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051217
2577	NC_013158	CAT	2	6	124125	124130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051218
2578	NC_013158	TCG	2	6	124157	124162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051218
2579	NC_013158	TGA	2	6	124188	124193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051218
2580	NC_013158	CGA	2	6	124212	124217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051218
2581	NC_013158	CG	4	8	124218	124225	0 %	0 %	50 %	50 %	257051218
2582	NC_013158	TCG	2	6	124226	124231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051218
2583	NC_013158	CGG	2	6	124257	124262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051218
2584	NC_013158	GTT	2	6	124303	124308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257051218
2585	NC_013158	CGA	2	6	124311	124316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051218
2586	NC_013158	GACT	2	8	124320	124327	25 %	25 %	25 %	25 %	257051218
2587	NC_013158	GTT	2	6	124360	124365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257051218
2588	NC_013158	GTC	2	6	124384	124389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051218
2589	NC_013158	GC	3	6	124403	124408	0 %	0 %	50 %	50 %	257051218
2590	NC_013158	TCG	2	6	124428	124433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051218
2591	NC_013158	GGA	2	6	124443	124448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051218
2592	NC_013158	GAC	2	6	124482	124487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051218
2593	NC_013158	CCG	2	6	124492	124497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051218
2594	NC_013158	GCC	2	6	124526	124531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051218
2595	NC_013158	TCG	2	6	124614	124619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051218
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2597	NC_013158	CGGC	2	8	124641	124648	0 %	0 %	50 %	50 %	257051218
2598	NC_013158	GCC	2	6	124666	124671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051218
2599	NC_013158	GAC	2	6	124711	124716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051218
2600	NC_013158	CGT	2	6	124720	124725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051218
2601	NC_013158	TCG	2	6	124796	124801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051218
2602	NC_013158	CGA	2	6	124830	124835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051218
2603	NC_013158	CCG	2	6	124847	124852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051218
2604	NC_013158	TCCT	2	8	124912	124919	0 %	50 %	0 %	50 %	257051218
2605	NC_013158	CGA	2	6	124920	124925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051218
2606	NC_013158	GCG	2	6	124959	124964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051218
2607	NC_013158	GAT	2	6	124966	124971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051218
2608	NC_013158	GAG	2	6	124993	124998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051218
2609	NC_013158	CGG	2	6	125001	125006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051218
2610	NC_013158	TCG	2	6	125048	125053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051218
2611	NC_013158	GTG	2	6	125084	125089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051218
2612	NC_013158	CGT	3	9	125121	125129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051218
2613	NC_013158	CGG	2	6	125145	125150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051218
2614	NC_013158	GTC	2	6	125197	125202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051218
2615	NC_013158	TCG	2	6	125247	125252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051218
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2618	NC_013158	TGC	2	6	125388	125393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051218
2619	NC_013158	CGT	2	6	125398	125403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051218
2620	NC_013158	TCG	2	6	125435	125440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051218
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2734	NC_013158	GCGCG	2	10	130753	130762	0 %	0 %	60 %	40 %	257051221
2735	NC_013158	GTC	2	6	130772	130777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051221
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2737	NC_013158	TCA	2	6	130821	130826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051221
2738	NC_013158	GGA	2	6	130879	130884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051221
2739	NC_013158	GGAA	2	8	130899	130906	50 %	0 %	50 %	0 %	257051221
2740	NC_013158	CG	3	6	130952	130957	0 %	0 %	50 %	50 %	257051221
2741	NC_013158	CGT	2	6	131002	131007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051221
2742	NC_013158	CGA	2	6	131035	131040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051221
2743	NC_013158	GAA	2	6	131057	131062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051221
2744	NC_013158	GGC	2	6	131134	131139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051221
2745	NC_013158	GAG	2	6	131159	131164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051221
2746	NC_013158	ACG	2	6	131202	131207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051221
2747	NC_013158	TCA	2	6	131226	131231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051221
2748	NC_013158	ACG	3	9	131262	131270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051221
2749	NC_013158	GACG	2	8	131274	131281	25 %	0 %	50 %	25 %	257051221
2750	NC_013158	TCG	2	6	131286	131291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051221
2751	NC_013158	GACGG	2	10	131297	131306	20 %	0 %	60 %	20 %	257051221
2752	NC_013158	GTC	3	9	131345	131353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051221
2753	NC_013158	GAC	2	6	131360	131365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051221
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2757	NC_013158	CCG	2	6	131577	131582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051221
2758	NC_013158	TCA	2	6	131589	131594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051221
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2762	NC_013158	CTG	2	6	131698	131703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051221
2763	NC_013158	CAT	2	6	131734	131739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051221
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2766	NC_013158	CGT	2	6	131779	131784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051221
2767	NC_013158	CCGC	2	8	131874	131881	0 %	0 %	25 %	75 %	257051221
2768	NC_013158	CGAC	2	8	131934	131941	25 %	0 %	25 %	50 %	257051221
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2770	NC_013158	CGCA	2	8	132014	132021	25 %	0 %	25 %	50 %	257051221
2771	NC_013158	CGG	2	6	132070	132075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051221
2772	NC_013158	CGTCAT	2	12	132112	132123	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	257051221
2773	NC_013158	TGC	2	6	132211	132216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051221
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2775	NC_013158	C	6	6	132452	132457	0 %	0 %	0 %	100 %	257051222
2776	NC_013158	ACT	2	6	132468	132473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051222
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2841	NC_013158	GAG	2	6	136512	136517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051227
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2844	NC_013158	TCG	2	6	136645	136650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051227
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2849	NC_013158	CGCT	2	8	136913	136920	0 %	25 %	25 %	50 %	257051228
2850	NC_013158	ATC	2	6	136967	136972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051228
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2853	NC_013158	CGC	2	6	137142	137147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051228
2854	NC_013158	CGA	2	6	137233	137238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051228
2855	NC_013158	GT	3	6	137254	137259	0 %	50 %	50 %	0 %	257051228
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2977	NC_013158	GTCC	2	8	143101	143108	0 %	25 %	25 %	50 %	257051234
2978	NC_013158	TTC	2	6	143116	143121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051234
2979	NC_013158	TCG	3	9	143171	143179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051234
2980	NC_013158	CGT	2	6	143196	143201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051234
2981	NC_013158	TCG	2	6	143231	143236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051234
2982	NC_013158	CGA	2	6	143292	143297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051234
2983	NC_013158	TGTC	2	8	143298	143305	0 %	50 %	25 %	25 %	257051234
2984	NC_013158	CCG	2	6	143343	143348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051234
2985	NC_013158	TCG	2	6	143388	143393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051234
2986	NC_013158	GAC	2	6	143413	143418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051234
2987	NC_013158	GAC	2	6	143467	143472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051234
2988	NC_013158	TCC	2	6	143486	143491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051234
2989	NC_013158	CGA	2	6	143802	143807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051235
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2991	NC_013158	GAC	2	6	143955	143960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051236
2992	NC_013158	CGA	2	6	143975	143980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051236
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2996	NC_013158	CAGC	2	8	144107	144114	25 %	0 %	25 %	50 %	257051236
2997	NC_013158	TCG	2	6	144191	144196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051236
2998	NC_013158	AGT	2	6	144485	144490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051237
2999	NC_013158	GGC	2	6	144638	144643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051238
3000	NC_013158	GTC	2	6	144756	144761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051238

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