MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 66729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013158	TTCG	2	8	45971	45978	0 %	50 %	25 %	25 %	257051134
1002	NC_013158	GC	3	6	45993	45998	0 %	0 %	50 %	50 %	257051134
1003	NC_013158	AGTC	2	8	46031	46038	25 %	25 %	25 %	25 %	257051134
1004	NC_013158	CTC	2	6	46175	46180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051134
1005	NC_013158	ACG	2	6	46227	46232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051134
1006	NC_013158	ATCG	2	8	46244	46251	25 %	25 %	25 %	25 %	257051134
1007	NC_013158	TCGG	2	8	46268	46275	0 %	25 %	50 %	25 %	257051134
1008	NC_013158	ACG	2	6	46284	46289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051134
1009	NC_013158	GGAC	2	8	46291	46298	25 %	0 %	50 %	25 %	257051134
1010	NC_013158	CGT	2	6	46327	46332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051134
1011	NC_013158	TCG	3	9	46359	46367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051134
1012	NC_013158	GGC	2	6	46390	46395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051134
1013	NC_013158	TCGC	2	8	46457	46464	0 %	25 %	25 %	50 %	257051134
1014	NC_013158	TTC	2	6	46490	46495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051134
1015	NC_013158	CGG	2	6	46531	46536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051134
1016	NC_013158	TTG	2	6	46828	46833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257051135
1017	NC_013158	GTC	2	6	46839	46844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051135
1018	NC_013158	GTACC	2	10	46929	46938	20 %	20 %	20 %	40 %	257051135
1019	NC_013158	GTTC	2	8	46988	46995	0 %	50 %	25 %	25 %	257051135
1020	NC_013158	CTAT	2	8	47056	47063	25 %	50 %	0 %	25 %	257051135
1021	NC_013158	TGA	2	6	47228	47233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051136
1022	NC_013158	CGA	2	6	47262	47267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051136
1023	NC_013158	GTC	2	6	47281	47286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051136
1024	NC_013158	CGA	2	6	47298	47303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051136
1025	NC_013158	CGT	3	9	47310	47318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051136
1026	NC_013158	GGC	2	6	47329	47334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051136
1027	NC_013158	GT	3	6	47353	47358	0 %	50 %	50 %	0 %	257051136
1028	NC_013158	GCG	2	6	47396	47401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051136
1029	NC_013158	CGA	2	6	47463	47468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051136
1030	NC_013158	CCGGGA	2	12	47481	47492	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	257051136
1031	NC_013158	GAG	2	6	47566	47571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051136
1032	NC_013158	GAC	2	6	47587	47592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051136
1033	NC_013158	AGG	2	6	47594	47599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051136
1034	NC_013158	CAC	2	6	47604	47609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051136
1035	NC_013158	GCCG	2	8	47644	47651	0 %	0 %	50 %	50 %	257051136
1036	NC_013158	CGT	2	6	47712	47717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051136
1037	NC_013158	GAG	2	6	47812	47817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051136
1038	NC_013158	ATC	2	6	47935	47940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051136
1039	NC_013158	CCT	2	6	47972	47977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051136
1040	NC_013158	GCG	2	6	47993	47998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051136
1041	NC_013158	CGGCGA	2	12	48033	48044	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	257051136
1042	NC_013158	GTC	2	6	48046	48051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051136
1043	NC_013158	GCG	2	6	48110	48115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051136
1044	NC_013158	ACG	2	6	48137	48142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051136
1045	NC_013158	CGA	2	6	48204	48209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051136
1046	NC_013158	GGCT	2	8	48244	48251	0 %	25 %	50 %	25 %	257051136
1047	NC_013158	CGCCA	2	10	48268	48277	20 %	0 %	20 %	60 %	257051136
1048	NC_013158	GCC	2	6	48393	48398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051136
1049	NC_013158	ACC	2	6	48400	48405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051136
1050	NC_013158	ACG	2	6	48491	48496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051136
1051	NC_013158	CGG	2	6	48503	48508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051136
1052	NC_013158	CGA	2	6	48537	48542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051136
1053	NC_013158	CGCC	2	8	48660	48667	0 %	0 %	25 %	75 %	257051137
1054	NC_013158	CCA	2	6	48669	48674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051137
1055	NC_013158	GTC	2	6	48691	48696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051137
1056	NC_013158	CCG	2	6	48746	48751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051137
1057	NC_013158	CGG	2	6	48762	48767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051137
1058	NC_013158	CGT	2	6	48828	48833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051137
1059	NC_013158	CGTCGA	2	12	48903	48914	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257051137
1060	NC_013158	CGT	2	6	48963	48968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051137
1061	NC_013158	CGA	2	6	48999	49004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051137
1062	NC_013158	GATC	2	8	49031	49038	25 %	25 %	25 %	25 %	257051137
1063	NC_013158	TG	3	6	49203	49208	0 %	50 %	50 %	0 %	257051137
1064	NC_013158	GTC	2	6	49225	49230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051137
1065	NC_013158	AGT	2	6	49277	49282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051137
1066	NC_013158	CGGC	2	8	49300	49307	0 %	0 %	50 %	50 %	257051137
1067	NC_013158	CGC	2	6	49425	49430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051137
1068	NC_013158	CGGG	2	8	49467	49474	0 %	0 %	75 %	25 %	257051137
1069	NC_013158	CAC	2	6	49486	49491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051137
1070	NC_013158	CAGG	2	8	49545	49552	25 %	0 %	50 %	25 %	257051137
1071	NC_013158	TCG	2	6	49619	49624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051137
1072	NC_013158	CGA	2	6	49704	49709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051137
1073	NC_013158	CGT	2	6	49716	49721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051137
1074	NC_013158	AAG	2	6	49842	49847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051138
1075	NC_013158	CTG	2	6	49864	49869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051138
1076	NC_013158	TCG	2	6	49926	49931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051138
1077	NC_013158	GCG	2	6	49956	49961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051138
1078	NC_013158	CCG	2	6	50000	50005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051138
1079	NC_013158	ACC	2	6	50138	50143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051139
1080	NC_013158	GCCA	2	8	50175	50182	25 %	0 %	25 %	50 %	257051139
1081	NC_013158	CGA	3	9	50203	50211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051139
1082	NC_013158	GTC	2	6	50324	50329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051139
1083	NC_013158	CGA	2	6	50380	50385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051139
1084	NC_013158	GGA	2	6	50386	50391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051139
1085	NC_013158	CGA	2	6	50407	50412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051139
1086	NC_013158	CGC	2	6	50437	50442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051139
1087	NC_013158	GCCG	2	8	50473	50480	0 %	0 %	50 %	50 %	257051139
1088	NC_013158	TCG	2	6	50511	50516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051139
1089	NC_013158	CCG	2	6	50520	50525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051139
1090	NC_013158	TCG	3	9	50550	50558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051139
1091	NC_013158	TCG	2	6	50592	50597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051139
1092	NC_013158	TCG	2	6	50613	50618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051139
1093	NC_013158	GCC	2	6	50702	50707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051140
1094	NC_013158	ACT	2	6	50754	50759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051140
1095	NC_013158	CCG	3	9	50760	50768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051140
1096	NC_013158	CG	3	6	50767	50772	0 %	0 %	50 %	50 %	257051140
1097	NC_013158	GCT	2	6	50773	50778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051140
1098	NC_013158	CGC	2	6	50824	50829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051140
1099	NC_013158	ACGGCG	2	12	50904	50915	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	257051140
1100	NC_013158	GAC	2	6	50935	50940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051140
1101	NC_013158	GGC	2	6	50974	50979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051140
1102	NC_013158	GCC	2	6	51056	51061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051140
1103	NC_013158	TCG	3	9	51084	51092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051140
1104	NC_013158	TCG	2	6	51123	51128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051140
1105	NC_013158	GAT	2	6	51133	51138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051140
1106	NC_013158	GA	3	6	51141	51146	50 %	0 %	50 %	0 %	257051140
1107	NC_013158	ACG	2	6	51303	51308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051141
1108	NC_013158	GCTG	2	8	51367	51374	0 %	25 %	50 %	25 %	257051141
1109	NC_013158	TGGCT	2	10	51378	51387	0 %	40 %	40 %	20 %	257051141
1110	NC_013158	CCA	2	6	51395	51400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051141
1111	NC_013158	TCG	2	6	51433	51438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051141
1112	NC_013158	CGG	2	6	51455	51460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051141
1113	NC_013158	CG	3	6	51531	51536	0 %	0 %	50 %	50 %	257051141
1114	NC_013158	ATC	2	6	51573	51578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051141
1115	NC_013158	TCG	2	6	51583	51588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051141
1116	NC_013158	G	6	6	51724	51729	0 %	0 %	100 %	0 %	257051141
1117	NC_013158	CGG	2	6	51767	51772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051141
1118	NC_013158	CCG	2	6	51820	51825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051141
1119	NC_013158	GGCC	2	8	51873	51880	0 %	0 %	50 %	50 %	257051141
1120	NC_013158	CGG	2	6	51947	51952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051141
1121	NC_013158	GGC	2	6	52001	52006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051141
1122	NC_013158	ACT	2	6	52027	52032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051141
1123	NC_013158	GAG	2	6	52062	52067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051141
1124	NC_013158	CTCG	2	8	52079	52086	0 %	25 %	25 %	50 %	257051141
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1242	NC_013158	GCG	2	6	57095	57100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051146
1243	NC_013158	TCG	2	6	57186	57191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051146
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1245	NC_013158	GGC	3	9	57253	57261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051146
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1248	NC_013158	TTCCT	2	10	57336	57345	0 %	60 %	0 %	40 %	257051146
1249	NC_013158	ACT	2	6	57364	57369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051146
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1281	NC_013158	GAC	2	6	58546	58551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051147
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1367	NC_013158	ACG	2	6	62722	62727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051149
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1369	NC_013158	TGGC	2	8	63020	63027	0 %	25 %	50 %	25 %	257051150
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1371	NC_013158	GCC	2	6	63062	63067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051150
1372	NC_013158	CGA	2	6	63136	63141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051150
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1374	NC_013158	CGA	2	6	63274	63279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051150
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1392	NC_013158	ACGT	2	8	64158	64165	25 %	25 %	25 %	25 %	257051151
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1405	NC_013158	CAT	2	6	64640	64645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051152
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1493	NC_013158	GACG	2	8	68686	68693	25 %	0 %	50 %	25 %	257051157
1494	NC_013158	CCGAC	2	10	68715	68724	20 %	0 %	20 %	60 %	257051157
1495	NC_013158	CGT	2	6	68737	68742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051157
1496	NC_013158	GCC	2	6	68861	68866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051157
1497	NC_013158	TGG	2	6	68933	68938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051157
1498	NC_013158	CGT	2	6	68950	68955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051157
1499	NC_013158	CGT	2	6	69004	69009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051157
1500	NC_013158	CGC	2	6	69028	69033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051157

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