MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 66729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_013158	CGA	2	6	290983	290988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051393
6002	NC_013158	CCG	2	6	290994	290999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051393
6003	NC_013158	ACG	2	6	291045	291050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051394
6004	NC_013158	CCGG	2	8	291053	291060	0 %	0 %	50 %	50 %	257051394
6005	NC_013158	CGTT	2	8	291096	291103	0 %	50 %	25 %	25 %	257051394
6006	NC_013158	ACGA	2	8	291162	291169	50 %	0 %	25 %	25 %	257051394
6007	NC_013158	TGA	2	6	291267	291272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051394
6008	NC_013158	GAC	2	6	291363	291368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051395
6009	NC_013158	GC	3	6	291382	291387	0 %	0 %	50 %	50 %	257051395
6010	NC_013158	CCG	2	6	291388	291393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051395
6011	NC_013158	TCGG	2	8	291397	291404	0 %	25 %	50 %	25 %	257051395
6012	NC_013158	GAA	2	6	291407	291412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051395
6013	NC_013158	AGCA	2	8	291456	291463	50 %	0 %	25 %	25 %	257051395
6014	NC_013158	TCG	2	6	291499	291504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051395
6015	NC_013158	GGA	2	6	291605	291610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051395
6016	NC_013158	GTCG	2	8	291636	291643	0 %	25 %	50 %	25 %	257051395
6017	NC_013158	GTC	2	6	291666	291671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051395
6018	NC_013158	GCC	2	6	291769	291774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051395
6019	NC_013158	GGTC	2	8	291776	291783	0 %	25 %	50 %	25 %	257051395
6020	NC_013158	CGC	2	6	291815	291820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051395
6021	NC_013158	TCGA	2	8	291836	291843	25 %	25 %	25 %	25 %	257051395
6022	NC_013158	TCG	3	9	291892	291900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051395
6023	NC_013158	CGT	2	6	291926	291931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051395
6024	NC_013158	CCGC	2	8	291946	291953	0 %	0 %	25 %	75 %	257051395
6025	NC_013158	GAC	2	6	291978	291983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051395
6026	NC_013158	CGGG	2	8	292054	292061	0 %	0 %	75 %	25 %	257051395
6027	NC_013158	CGC	2	6	292097	292102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051395
6028	NC_013158	TCG	2	6	292117	292122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051395
6029	NC_013158	TCG	2	6	292153	292158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051395
6030	NC_013158	CCG	2	6	292219	292224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051395
6031	NC_013158	CAG	2	6	292278	292283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051395
6032	NC_013158	ATCG	2	8	292284	292291	25 %	25 %	25 %	25 %	257051395
6033	NC_013158	CGC	2	6	292332	292337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051395
6034	NC_013158	GAT	2	6	292344	292349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051395
6035	NC_013158	CCT	3	9	292418	292426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051395
6036	NC_013158	CCG	2	6	292526	292531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051395
6037	NC_013158	TCG	2	6	292570	292575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051395
6038	NC_013158	CCGTC	2	10	292631	292640	0 %	20 %	20 %	60 %	257051395
6039	NC_013158	GAC	3	9	292796	292804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051396
6040	NC_013158	GAG	2	6	292829	292834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051396
6041	NC_013158	CCGA	2	8	292841	292848	25 %	0 %	25 %	50 %	257051396
6042	NC_013158	GAG	2	6	292871	292876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051396
6043	NC_013158	GC	3	6	293101	293106	0 %	0 %	50 %	50 %	257051396
6044	NC_013158	TCG	2	6	293118	293123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051396
6045	NC_013158	GC	4	8	293155	293162	0 %	0 %	50 %	50 %	257051396
6046	NC_013158	GAC	2	6	293171	293176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051396
6047	NC_013158	ACGTC	2	10	293244	293253	20 %	20 %	20 %	40 %	257051396
6048	NC_013158	CGAACC	2	12	293257	293268	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	257051396
6049	NC_013158	CGA	2	6	293272	293277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051396
6050	NC_013158	GCG	2	6	293421	293426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051396
6051	NC_013158	ACC	2	6	293444	293449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051396
6052	NC_013158	CGAGTC	2	12	293458	293469	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257051396
6053	NC_013158	ACA	2	6	293637	293642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051397
6054	NC_013158	CAA	2	6	293650	293655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051397
6055	NC_013158	ATC	2	6	293723	293728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051397
6056	NC_013158	GAC	2	6	293749	293754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051397
6057	NC_013158	CGA	2	6	293773	293778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051397
6058	NC_013158	TCG	2	6	293790	293795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051397
6059	NC_013158	GAA	2	6	293806	293811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051397
6060	NC_013158	TGA	2	6	293830	293835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051397
6061	NC_013158	GAG	2	6	293897	293902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051397
6062	NC_013158	GAT	2	6	293926	293931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051397
6063	NC_013158	AGA	2	6	293937	293942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051397
6064	NC_013158	GAG	2	6	293957	293962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051397
6065	NC_013158	TCA	2	6	293991	293996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051397
6066	NC_013158	CGCCAG	2	12	294020	294031	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	257051397
6067	NC_013158	CGA	3	9	294118	294126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051397
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6069	NC_013158	GTC	2	6	294212	294217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051397
6070	NC_013158	CGA	2	6	294247	294252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051397
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6073	NC_013158	GAG	2	6	294296	294301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051397
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6088	NC_013158	GAA	2	6	294799	294804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051397
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6093	NC_013158	GAG	2	6	294905	294910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051397
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6103	NC_013158	CGC	2	6	295145	295150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051397
6104	NC_013158	GC	3	6	295192	295197	0 %	0 %	50 %	50 %	257051397
6105	NC_013158	GCT	2	6	295204	295209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051397
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6108	NC_013158	CGA	4	12	295288	295299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051397
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6120	NC_013158	CCA	2	6	296001	296006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051398
6121	NC_013158	TC	3	6	296008	296013	0 %	50 %	0 %	50 %	257051398
6122	NC_013158	TCGGC	2	10	296053	296062	0 %	20 %	40 %	40 %	257051398
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6237	NC_013158	GAACGA	2	12	301797	301808	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	257051401
6238	NC_013158	GTCTCG	2	12	301813	301824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051401
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6240	NC_013158	CGA	3	9	301871	301879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051401
6241	NC_013158	GTCG	2	8	301880	301887	0 %	25 %	50 %	25 %	257051401
6242	NC_013158	CGGG	2	8	301964	301971	0 %	0 %	75 %	25 %	257051401
6243	NC_013158	GCC	2	6	302002	302007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051401
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6245	NC_013158	CGA	2	6	302072	302077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051401
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6357	NC_013158	TCG	2	6	306981	306986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051405
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6479	NC_013158	GCCG	2	8	312291	312298	0 %	0 %	50 %	50 %	257051410
6480	NC_013158	CGT	2	6	312305	312310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051410
6481	NC_013158	CCGC	2	8	312347	312354	0 %	0 %	25 %	75 %	257051410
6482	NC_013158	CGC	2	6	312366	312371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051410
6483	NC_013158	TCG	2	6	312379	312384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051410
6484	NC_013158	CCG	2	6	312402	312407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051410
6485	NC_013158	CGA	2	6	312413	312418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051410
6486	NC_013158	GAC	2	6	312439	312444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051410
6487	NC_013158	CGAT	2	8	312446	312453	25 %	25 %	25 %	25 %	257051410
6488	NC_013158	C	6	6	312500	312505	0 %	0 %	0 %	100 %	257051410
6489	NC_013158	CGA	2	6	312530	312535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051410
6490	NC_013158	CCG	2	6	312565	312570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051410
6491	NC_013158	CGG	2	6	312595	312600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051410
6492	NC_013158	GTCA	2	8	312722	312729	25 %	25 %	25 %	25 %	257051411
6493	NC_013158	GCCG	2	8	312793	312800	0 %	0 %	50 %	50 %	257051411
6494	NC_013158	CCG	2	6	312804	312809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051411
6495	NC_013158	TCG	4	12	312818	312829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051411
6496	NC_013158	CCGTC	2	10	312840	312849	0 %	20 %	20 %	60 %	257051411
6497	NC_013158	TTCG	2	8	312892	312899	0 %	50 %	25 %	25 %	257051411
6498	NC_013158	ACC	2	6	312978	312983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051411
6499	NC_013158	CGT	2	6	313044	313049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051411
6500	NC_013158	CCG	2	6	313055	313060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051411

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