MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Hirschia baltica ATCC 49814 plasmid pHbal01

Total Repeats: 163

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012983	AC	3	6	717	722	50 %	0 %	0 %	50 %	254295497
2	NC_012983	TG	3	6	1114	1119	0 %	50 %	50 %	0 %	254295497
3	NC_012983	AC	3	6	1253	1258	50 %	0 %	0 %	50 %	254295497
4	NC_012983	GC	3	6	1646	1651	0 %	0 %	50 %	50 %	254295497
5	NC_012983	GC	3	6	2117	2122	0 %	0 %	50 %	50 %	254295497
6	NC_012983	AG	3	6	4681	4686	50 %	0 %	50 %	0 %	254295498
7	NC_012983	AT	3	6	4717	4722	50 %	50 %	0 %	0 %	254295498
8	NC_012983	CG	3	6	6141	6146	0 %	0 %	50 %	50 %	254295499
9	NC_012983	AC	3	6	6425	6430	50 %	0 %	0 %	50 %	254295499
10	NC_012983	CG	3	6	7351	7356	0 %	0 %	50 %	50 %	254295501
11	NC_012983	AG	3	6	8383	8388	50 %	0 %	50 %	0 %	254295502
12	NC_012983	AC	3	6	10139	10144	50 %	0 %	0 %	50 %	254295503
13	NC_012983	TG	3	6	10401	10406	0 %	50 %	50 %	0 %	254295504
14	NC_012983	TC	3	6	10805	10810	0 %	50 %	0 %	50 %	254295504
15	NC_012983	GC	3	6	11877	11882	0 %	0 %	50 %	50 %	254295505
16	NC_012983	AG	3	6	12425	12430	50 %	0 %	50 %	0 %	254295506
17	NC_012983	GC	3	6	12726	12731	0 %	0 %	50 %	50 %	254295506
18	NC_012983	GC	3	6	12864	12869	0 %	0 %	50 %	50 %	254295506
19	NC_012983	AT	3	6	13432	13437	50 %	50 %	0 %	0 %	254295507
20	NC_012983	GT	3	6	14080	14085	0 %	50 %	50 %	0 %	254295508
21	NC_012983	TG	3	6	14210	14215	0 %	50 %	50 %	0 %	254295508
22	NC_012983	AC	3	6	15695	15700	50 %	0 %	0 %	50 %	254295508
23	NC_012983	AT	3	6	17022	17027	50 %	50 %	0 %	0 %	254295510
24	NC_012983	GC	3	6	18216	18221	0 %	0 %	50 %	50 %	254295511
25	NC_012983	CA	3	6	18412	18417	50 %	0 %	0 %	50 %	254295511
26	NC_012983	GC	3	6	19029	19034	0 %	0 %	50 %	50 %	254295511
27	NC_012983	CT	3	6	19054	19059	0 %	50 %	0 %	50 %	254295511
28	NC_012983	TG	3	6	19086	19091	0 %	50 %	50 %	0 %	254295511
29	NC_012983	TA	3	6	19780	19785	50 %	50 %	0 %	0 %	254295511
30	NC_012983	TG	3	6	19802	19807	0 %	50 %	50 %	0 %	254295511
31	NC_012983	AT	4	8	21797	21804	50 %	50 %	0 %	0 %	254295515
32	NC_012983	AT	3	6	22568	22573	50 %	50 %	0 %	0 %	254295515
33	NC_012983	CA	3	6	22744	22749	50 %	0 %	0 %	50 %	254295515
34	NC_012983	GC	3	6	24386	24391	0 %	0 %	50 %	50 %	254295516
35	NC_012983	AC	3	6	24562	24567	50 %	0 %	0 %	50 %	254295516
36	NC_012983	GT	3	6	25035	25040	0 %	50 %	50 %	0 %	254295517
37	NC_012983	CG	3	6	26056	26061	0 %	0 %	50 %	50 %	254295518
38	NC_012983	GC	3	6	26217	26222	0 %	0 %	50 %	50 %	254295518
39	NC_012983	AT	4	8	26715	26722	50 %	50 %	0 %	0 %	254295518
40	NC_012983	TG	3	6	27374	27379	0 %	50 %	50 %	0 %	254295519
41	NC_012983	CA	3	6	28304	28309	50 %	0 %	0 %	50 %	254295520
42	NC_012983	GC	3	6	28885	28890	0 %	0 %	50 %	50 %	254295520
43	NC_012983	GT	3	6	29012	29017	0 %	50 %	50 %	0 %	254295520
44	NC_012983	GC	3	6	29076	29081	0 %	0 %	50 %	50 %	254295520
45	NC_012983	GC	3	6	29117	29122	0 %	0 %	50 %	50 %	254295520
46	NC_012983	TC	3	6	29619	29624	0 %	50 %	0 %	50 %	254295521
47	NC_012983	TG	3	6	29839	29844	0 %	50 %	50 %	0 %	254295521
48	NC_012983	CA	3	6	30022	30027	50 %	0 %	0 %	50 %	254295521
49	NC_012983	CT	3	6	30996	31001	0 %	50 %	0 %	50 %	254295522
50	NC_012983	CA	3	6	33215	33220	50 %	0 %	0 %	50 %	254295525
51	NC_012983	CA	3	6	33316	33321	50 %	0 %	0 %	50 %	254295525
52	NC_012983	CG	3	6	33687	33692	0 %	0 %	50 %	50 %	254295525
53	NC_012983	GT	3	6	36084	36089	0 %	50 %	50 %	0 %	254295528
54	NC_012983	GA	3	6	36181	36186	50 %	0 %	50 %	0 %	254295528
55	NC_012983	AT	3	6	36544	36549	50 %	50 %	0 %	0 %	254295528
56	NC_012983	GT	3	6	36651	36656	0 %	50 %	50 %	0 %	254295528
57	NC_012983	CG	3	6	37977	37982	0 %	0 %	50 %	50 %	254295529
58	NC_012983	AT	3	6	38619	38624	50 %	50 %	0 %	0 %	254295530
59	NC_012983	GC	3	6	40202	40207	0 %	0 %	50 %	50 %	254295531
60	NC_012983	GC	3	6	40491	40496	0 %	0 %	50 %	50 %	254295531
61	NC_012983	GT	3	6	40571	40576	0 %	50 %	50 %	0 %	254295531
62	NC_012983	GC	3	6	41058	41063	0 %	0 %	50 %	50 %	254295532
63	NC_012983	AT	3	6	41413	41418	50 %	50 %	0 %	0 %	254295533
64	NC_012983	CG	3	6	43006	43011	0 %	0 %	50 %	50 %	254295534
65	NC_012983	GT	3	6	43599	43604	0 %	50 %	50 %	0 %	254295534
66	NC_012983	CG	3	6	43749	43754	0 %	0 %	50 %	50 %	254295534
67	NC_012983	AT	3	6	44440	44445	50 %	50 %	0 %	0 %	254295535
68	NC_012983	TG	3	6	44865	44870	0 %	50 %	50 %	0 %	254295535
69	NC_012983	AT	3	6	44878	44883	50 %	50 %	0 %	0 %	254295535
70	NC_012983	TC	3	6	45740	45745	0 %	50 %	0 %	50 %	254295536
71	NC_012983	AT	3	6	46050	46055	50 %	50 %	0 %	0 %	254295536
72	NC_012983	CT	3	6	46250	46255	0 %	50 %	0 %	50 %	254295536
73	NC_012983	TC	3	6	46735	46740	0 %	50 %	0 %	50 %	254295536
74	NC_012983	GT	3	6	47184	47189	0 %	50 %	50 %	0 %	254295536
75	NC_012983	CT	3	6	47549	47554	0 %	50 %	0 %	50 %	254295536
76	NC_012983	AC	3	6	48452	48457	50 %	0 %	0 %	50 %	254295537
77	NC_012983	AT	4	8	48802	48809	50 %	50 %	0 %	0 %	254295537
78	NC_012983	TA	3	6	49375	49380	50 %	50 %	0 %	0 %	254295537
79	NC_012983	GA	3	6	51064	51069	50 %	0 %	50 %	0 %	254295537
80	NC_012983	TC	3	6	51227	51232	0 %	50 %	0 %	50 %	254295538
81	NC_012983	CG	3	6	51308	51313	0 %	0 %	50 %	50 %	254295538
82	NC_012983	GC	3	6	51704	51709	0 %	0 %	50 %	50 %	254295538
83	NC_012983	AC	3	6	51744	51749	50 %	0 %	0 %	50 %	254295538
84	NC_012983	GC	3	6	51832	51837	0 %	0 %	50 %	50 %	254295538
85	NC_012983	AG	4	8	51965	51972	50 %	0 %	50 %	0 %	254295538
86	NC_012983	AC	3	6	52131	52136	50 %	0 %	0 %	50 %	254295538
87	NC_012983	GT	3	6	53421	53426	0 %	50 %	50 %	0 %	254295539
88	NC_012983	AC	3	6	53818	53823	50 %	0 %	0 %	50 %	254295540
89	NC_012983	AC	3	6	53950	53955	50 %	0 %	0 %	50 %	254295540
90	NC_012983	TG	3	6	54343	54348	0 %	50 %	50 %	0 %	254295540
91	NC_012983	CA	3	6	54426	54431	50 %	0 %	0 %	50 %	254295540
92	NC_012983	CT	4	8	54432	54439	0 %	50 %	0 %	50 %	254295540
93	NC_012983	TG	3	6	54512	54517	0 %	50 %	50 %	0 %	254295540
94	NC_012983	TA	3	6	54982	54987	50 %	50 %	0 %	0 %	254295540
95	NC_012983	CG	3	6	55011	55016	0 %	0 %	50 %	50 %	254295540
96	NC_012983	TG	3	6	55392	55397	0 %	50 %	50 %	0 %	254295541
97	NC_012983	GC	4	8	55721	55728	0 %	0 %	50 %	50 %	254295541
98	NC_012983	TG	3	6	55780	55785	0 %	50 %	50 %	0 %	254295541
99	NC_012983	TA	3	6	55934	55939	50 %	50 %	0 %	0 %	254295541
100	NC_012983	CA	3	6	56026	56031	50 %	0 %	0 %	50 %	254295541
101	NC_012983	GA	3	6	56295	56300	50 %	0 %	50 %	0 %	254295542
102	NC_012983	CG	3	6	56979	56984	0 %	0 %	50 %	50 %	254295542
103	NC_012983	GC	3	6	57006	57011	0 %	0 %	50 %	50 %	254295542
104	NC_012983	AG	4	8	57745	57752	50 %	0 %	50 %	0 %	254295543
105	NC_012983	TG	3	6	58371	58376	0 %	50 %	50 %	0 %	254295543
106	NC_012983	AG	3	6	58821	58826	50 %	0 %	50 %	0 %	254295543
107	NC_012983	TG	3	6	59231	59236	0 %	50 %	50 %	0 %	254295544
108	NC_012983	TG	3	6	59815	59820	0 %	50 %	50 %	0 %	254295544
109	NC_012983	GT	3	6	60603	60608	0 %	50 %	50 %	0 %	254295544
110	NC_012983	CG	3	6	61053	61058	0 %	0 %	50 %	50 %	254295544
111	NC_012983	AG	3	6	61304	61309	50 %	0 %	50 %	0 %	254295544
112	NC_012983	AT	3	6	62306	62311	50 %	50 %	0 %	0 %	254295545
113	NC_012983	GT	3	6	62400	62405	0 %	50 %	50 %	0 %	254295545
114	NC_012983	GA	3	6	62492	62497	50 %	0 %	50 %	0 %	254295545
115	NC_012983	GC	3	6	62988	62993	0 %	0 %	50 %	50 %	254295546
116	NC_012983	AT	3	6	65025	65030	50 %	50 %	0 %	0 %	254295548
117	NC_012983	CA	3	6	66000	66005	50 %	0 %	0 %	50 %	254295550
118	NC_012983	AT	3	6	66907	66912	50 %	50 %	0 %	0 %	254295551
119	NC_012983	GA	4	8	66953	66960	50 %	0 %	50 %	0 %	254295551
120	NC_012983	TA	3	6	66997	67002	50 %	50 %	0 %	0 %	254295551
121	NC_012983	TA	4	8	67164	67171	50 %	50 %	0 %	0 %	254295551
122	NC_012983	AT	3	6	67205	67210	50 %	50 %	0 %	0 %	254295551
123	NC_012983	CT	3	6	67214	67219	0 %	50 %	0 %	50 %	254295551
124	NC_012983	TA	3	6	68278	68283	50 %	50 %	0 %	0 %	254295551
125	NC_012983	GC	3	6	68333	68338	0 %	0 %	50 %	50 %	254295551
126	NC_012983	AT	3	6	70317	70322	50 %	50 %	0 %	0 %	254295554
127	NC_012983	AT	4	8	70368	70375	50 %	50 %	0 %	0 %	254295554
128	NC_012983	AT	3	6	70457	70462	50 %	50 %	0 %	0 %	254295554
129	NC_012983	CG	3	6	71139	71144	0 %	0 %	50 %	50 %	254295555
130	NC_012983	GT	3	6	71589	71594	0 %	50 %	50 %	0 %	254295555
131	NC_012983	GT	3	6	72060	72065	0 %	50 %	50 %	0 %	254295555
132	NC_012983	CG	3	6	72470	72475	0 %	0 %	50 %	50 %	254295555
133	NC_012983	AT	3	6	73223	73228	50 %	50 %	0 %	0 %	254295556
134	NC_012983	AT	3	6	74341	74346	50 %	50 %	0 %	0 %	254295556
135	NC_012983	TA	3	6	74498	74503	50 %	50 %	0 %	0 %	254295556
136	NC_012983	TC	3	6	74798	74803	0 %	50 %	0 %	50 %	254295557
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138	NC_012983	TA	3	6	75404	75409	50 %	50 %	0 %	0 %	254295557
139	NC_012983	GT	4	8	75494	75501	0 %	50 %	50 %	0 %	254295557
140	NC_012983	TC	3	6	75675	75680	0 %	50 %	0 %	50 %	254295557
141	NC_012983	GT	3	6	75979	75984	0 %	50 %	50 %	0 %	254295558
142	NC_012983	AC	3	6	76978	76983	50 %	0 %	0 %	50 %	254295558
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.