MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Hirschia baltica ATCC 49814 chromosome

Total Repeats: 1827

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012982	GATAA	2	10	1976	1985	60 %	20 %	20 %	0 %	254292378
2	NC_012982	TGCTT	2	10	3252	3261	0 %	60 %	20 %	20 %	254292379
3	NC_012982	AGTGA	2	10	3307	3316	40 %	20 %	40 %	0 %	254292379
4	NC_012982	GCTTG	2	10	4186	4195	0 %	40 %	40 %	20 %	254292380
5	NC_012982	TCTTG	2	10	5421	5430	0 %	60 %	20 %	20 %	254292382
6	NC_012982	CAGAC	2	10	7503	7512	40 %	0 %	20 %	40 %	254292383
7	NC_012982	CCAAT	2	10	7814	7823	40 %	20 %	0 %	40 %	254292383
8	NC_012982	GCAAC	2	10	12460	12469	40 %	0 %	20 %	40 %	254292389
9	NC_012982	CCCAT	2	10	14974	14983	20 %	20 %	0 %	60 %	254292392
10	NC_012982	CCACA	2	10	19714	19723	40 %	0 %	0 %	60 %	254292394
11	NC_012982	CAAAC	2	10	20011	20020	60 %	0 %	0 %	40 %	254292395
12	NC_012982	GAATT	2	10	20540	20549	40 %	40 %	20 %	0 %	254292395
13	NC_012982	AATAA	2	10	28752	28761	80 %	20 %	0 %	0 %	254292403
14	NC_012982	TTTTC	2	10	28825	28834	0 %	80 %	0 %	20 %	254292403
15	NC_012982	AAAGC	2	10	29094	29103	60 %	0 %	20 %	20 %	254292403
16	NC_012982	AGGTG	2	10	32317	32326	20 %	20 %	60 %	0 %	254292406
17	NC_012982	ACTTC	2	10	33428	33437	20 %	40 %	0 %	40 %	254292408
18	NC_012982	CATGC	2	10	36030	36039	20 %	20 %	20 %	40 %	254292412
19	NC_012982	TATTT	2	10	38131	38140	20 %	80 %	0 %	0 %	254292413
20	NC_012982	CAATC	2	10	38476	38485	40 %	20 %	0 %	40 %	254292413
21	NC_012982	TGGCA	2	10	39079	39088	20 %	20 %	40 %	20 %	254292414
22	NC_012982	CCCAG	2	10	40419	40428	20 %	0 %	20 %	60 %	254292416
23	NC_012982	AATGA	2	10	41917	41926	60 %	20 %	20 %	0 %	254292418
24	NC_012982	GAAAA	2	10	43779	43788	80 %	0 %	20 %	0 %	254292419
25	NC_012982	TTGGA	2	10	45000	45009	20 %	40 %	40 %	0 %	254292421
26	NC_012982	GCGTG	2	10	45641	45650	0 %	20 %	60 %	20 %	254292421
27	NC_012982	TCTGC	2	10	46153	46162	0 %	40 %	20 %	40 %	254292422
28	NC_012982	TAATG	2	10	48127	48136	40 %	40 %	20 %	0 %	254292425
29	NC_012982	GTTTT	2	10	49521	49530	0 %	80 %	20 %	0 %	254292426
30	NC_012982	TTTAC	2	10	56000	56009	20 %	60 %	0 %	20 %	254292433
31	NC_012982	TTTGC	2	10	56679	56688	0 %	60 %	20 %	20 %	254292434
32	NC_012982	ACAAT	2	10	58812	58821	60 %	20 %	0 %	20 %	254292438
33	NC_012982	TTGGC	2	10	62074	62083	0 %	40 %	40 %	20 %	254292441
34	NC_012982	GTCAT	2	10	62649	62658	20 %	40 %	20 %	20 %	254292441
35	NC_012982	AGTCT	2	10	62737	62746	20 %	40 %	20 %	20 %	254292442
36	NC_012982	CAACC	2	10	63630	63639	40 %	0 %	0 %	60 %	254292443
37	NC_012982	CAACC	2	10	64035	64044	40 %	0 %	0 %	60 %	254292443
38	NC_012982	CGATG	2	10	68158	68167	20 %	20 %	40 %	20 %	254292446
39	NC_012982	GATTT	2	10	70439	70448	20 %	60 %	20 %	0 %	254292447
40	NC_012982	TGCCG	2	10	73555	73564	0 %	20 %	40 %	40 %	254292450
41	NC_012982	GCGCG	2	10	78227	78236	0 %	0 %	60 %	40 %	254292457
42	NC_012982	GTGAA	2	10	79570	79579	40 %	20 %	40 %	0 %	254292458
43	NC_012982	ATTAT	2	10	82546	82555	40 %	60 %	0 %	0 %	254292462
44	NC_012982	TGCGT	2	10	87687	87696	0 %	40 %	40 %	20 %	254292466
45	NC_012982	CTTAG	2	10	88079	88088	20 %	40 %	20 %	20 %	254292466
46	NC_012982	TTCTT	2	10	88440	88449	0 %	80 %	0 %	20 %	254292467
47	NC_012982	TGTGG	2	10	91018	91027	0 %	40 %	60 %	0 %	254292468
48	NC_012982	GAGGC	2	10	92957	92966	20 %	0 %	60 %	20 %	254292470
49	NC_012982	CTTAT	2	10	94325	94334	20 %	60 %	0 %	20 %	254292473
50	NC_012982	CGTCA	2	10	98543	98552	20 %	20 %	20 %	40 %	254292478
51	NC_012982	GTTCT	2	10	110683	110692	0 %	60 %	20 %	20 %	254292490
52	NC_012982	AGCAA	2	10	111540	111549	60 %	0 %	20 %	20 %	254292490
53	NC_012982	ATGTC	2	10	111858	111867	20 %	40 %	20 %	20 %	254292491
54	NC_012982	TAGCT	2	10	112941	112950	20 %	40 %	20 %	20 %	254292492
55	NC_012982	TGATG	2	10	113127	113136	20 %	40 %	40 %	0 %	254292492
56	NC_012982	CAGAT	2	10	113681	113690	40 %	20 %	20 %	20 %	254292492
57	NC_012982	ATATA	2	10	114914	114923	60 %	40 %	0 %	0 %	254292494
58	NC_012982	GGCAA	2	10	119848	119857	40 %	0 %	40 %	20 %	254292498
59	NC_012982	AAACC	2	10	120642	120651	60 %	0 %	0 %	40 %	254292499
60	NC_012982	TTTTG	2	10	123774	123783	0 %	80 %	20 %	0 %	254292500
61	NC_012982	GTTAC	2	10	124200	124209	20 %	40 %	20 %	20 %	254292501
62	NC_012982	TCAAA	2	10	126891	126900	60 %	20 %	0 %	20 %	254292502
63	NC_012982	CGGGA	2	10	129080	129089	20 %	0 %	60 %	20 %	254292503
64	NC_012982	TTTCC	2	10	130167	130176	0 %	60 %	0 %	40 %	254292504
65	NC_012982	TTGCT	2	10	134067	134076	0 %	60 %	20 %	20 %	254292506
66	NC_012982	CCATG	2	10	135064	135073	20 %	20 %	20 %	40 %	254292507
67	NC_012982	TCACG	2	10	138093	138102	20 %	20 %	20 %	40 %	254292508
68	NC_012982	TTCGC	2	10	139441	139450	0 %	40 %	20 %	40 %	254292508
69	NC_012982	TTGTG	2	10	141284	141293	0 %	60 %	40 %	0 %	254292510
70	NC_012982	TGGTT	2	10	142376	142385	0 %	60 %	40 %	0 %	254292511
71	NC_012982	AATTG	2	10	148137	148146	40 %	40 %	20 %	0 %	254292514
72	NC_012982	TGCAA	2	10	148839	148848	40 %	20 %	20 %	20 %	254292514
73	NC_012982	GCAAC	2	10	149239	149248	40 %	0 %	20 %	40 %	254292514
74	NC_012982	TGCGC	2	10	150933	150942	0 %	20 %	40 %	40 %	254292515
75	NC_012982	GCATC	2	10	151456	151465	20 %	20 %	20 %	40 %	254292516
76	NC_012982	AACCA	2	10	153701	153710	60 %	0 %	0 %	40 %	254292517
77	NC_012982	CGTTT	2	10	154091	154100	0 %	60 %	20 %	20 %	254292517
78	NC_012982	CAGAA	2	10	154823	154832	60 %	0 %	20 %	20 %	254292517
79	NC_012982	TTGCT	2	10	155636	155645	0 %	60 %	20 %	20 %	254292517
80	NC_012982	GAATG	2	10	157008	157017	40 %	20 %	40 %	0 %	254292520
81	NC_012982	GTGTG	2	10	162041	162050	0 %	40 %	60 %	0 %	254292524
82	NC_012982	TCTCG	2	10	163729	163738	0 %	40 %	20 %	40 %	254292526
83	NC_012982	GTTCT	2	10	167012	167021	0 %	60 %	20 %	20 %	254292529
84	NC_012982	TGACT	2	10	167206	167215	20 %	40 %	20 %	20 %	254292529
85	NC_012982	CTGTG	2	10	168682	168691	0 %	40 %	40 %	20 %	254292532
86	NC_012982	ATTTG	2	10	169037	169046	20 %	60 %	20 %	0 %	254292532
87	NC_012982	AGCAA	2	10	173864	173873	60 %	0 %	20 %	20 %	254292536
88	NC_012982	CAATA	2	10	186210	186219	60 %	20 %	0 %	20 %	254292551
89	NC_012982	AGCAA	2	10	186955	186964	60 %	0 %	20 %	20 %	254292551
90	NC_012982	AGGGA	2	10	186995	187004	40 %	0 %	60 %	0 %	254292551
91	NC_012982	CATGG	2	10	188745	188754	20 %	20 %	40 %	20 %	254292552
92	NC_012982	GATGA	2	10	189786	189795	40 %	20 %	40 %	0 %	254292552
93	NC_012982	GTCTT	2	10	193426	193435	0 %	60 %	20 %	20 %	254292557
94	NC_012982	AAATG	2	10	201542	201551	60 %	20 %	20 %	0 %	254292567
95	NC_012982	AACTG	2	10	202494	202503	40 %	20 %	20 %	20 %	254292568
96	NC_012982	TCAAA	2	10	202545	202554	60 %	20 %	0 %	20 %	254292568
97	NC_012982	GATGG	2	10	203795	203804	20 %	20 %	60 %	0 %	254292569
98	NC_012982	AATGG	2	10	204200	204209	40 %	20 %	40 %	0 %	254292570
99	NC_012982	GCTTT	2	10	204260	204269	0 %	60 %	20 %	20 %	254292570
100	NC_012982	ATTCT	2	10	206058	206067	20 %	60 %	0 %	20 %	254292570
101	NC_012982	GGGAT	2	10	210811	210820	20 %	20 %	60 %	0 %	254292572
102	NC_012982	CTCTG	2	10	210824	210833	0 %	40 %	20 %	40 %	254292572
103	NC_012982	TTGGG	2	10	215807	215816	0 %	40 %	60 %	0 %	254292578
104	NC_012982	GATCA	2	10	216240	216249	40 %	20 %	20 %	20 %	254292579
105	NC_012982	CAAAA	2	10	217185	217194	80 %	0 %	0 %	20 %	254292580
106	NC_012982	ACAGG	2	10	218565	218574	40 %	0 %	40 %	20 %	254292581
107	NC_012982	TTGTT	2	10	222009	222018	0 %	80 %	20 %	0 %	254292581
108	NC_012982	TGACA	2	10	225786	225795	40 %	20 %	20 %	20 %	254292584
109	NC_012982	ATTGG	2	10	226624	226633	20 %	40 %	40 %	0 %	254292585
110	NC_012982	CTTGG	2	10	233702	233711	0 %	40 %	40 %	20 %	254292589
111	NC_012982	GAATG	2	10	233984	233993	40 %	20 %	40 %	0 %	254292589
112	NC_012982	AGCAA	2	10	235037	235046	60 %	0 %	20 %	20 %	254292589
113	NC_012982	GGCAA	2	10	235994	236003	40 %	0 %	40 %	20 %	254292590
114	NC_012982	CATCA	2	10	236436	236445	40 %	20 %	0 %	40 %	254292591
115	NC_012982	ACCAA	2	10	237459	237468	60 %	0 %	0 %	40 %	254292591
116	NC_012982	ATGGG	2	10	240978	240987	20 %	20 %	60 %	0 %	254292594
117	NC_012982	GCTGC	2	10	249054	249063	0 %	20 %	40 %	40 %	254292603
118	NC_012982	TTGGG	2	10	249633	249642	0 %	40 %	60 %	0 %	254292604
119	NC_012982	CCTTG	2	10	250500	250509	0 %	40 %	20 %	40 %	254292605
120	NC_012982	GTGAA	2	10	250510	250519	40 %	20 %	40 %	0 %	254292605
121	NC_012982	TTGCA	2	10	250606	250615	20 %	40 %	20 %	20 %	254292605
122	NC_012982	TGGCT	2	10	252646	252655	0 %	40 %	40 %	20 %	254292607
123	NC_012982	GCGAT	2	10	252719	252728	20 %	20 %	40 %	20 %	254292607
124	NC_012982	CAGAC	2	10	253338	253347	40 %	0 %	20 %	40 %	254292608
125	NC_012982	TGCGC	2	10	254650	254659	0 %	20 %	40 %	40 %	254292610
126	NC_012982	TTTGG	2	10	255000	255009	0 %	60 %	40 %	0 %	254292610
127	NC_012982	TATGG	2	10	255937	255946	20 %	40 %	40 %	0 %	254292611
128	NC_012982	TATCG	2	10	257635	257644	20 %	40 %	20 %	20 %	254292612
129	NC_012982	GTTTG	2	10	258020	258029	0 %	60 %	40 %	0 %	254292612
130	NC_012982	GCGGG	2	10	258359	258368	0 %	0 %	80 %	20 %	254292612
131	NC_012982	GCGGG	2	10	259008	259017	0 %	0 %	80 %	20 %	254292613
132	NC_012982	CATTT	2	10	262995	263004	20 %	60 %	0 %	20 %	254292617
133	NC_012982	CTGAC	2	10	264829	264838	20 %	20 %	20 %	40 %	254292618
134	NC_012982	ATTCA	2	10	265670	265679	40 %	40 %	0 %	20 %	254292619
135	NC_012982	AAAAT	2	10	269040	269049	80 %	20 %	0 %	0 %	254292624
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259	NC_012982	AAGAA	2	10	502034	502043	80 %	0 %	20 %	0 %	254292843
260	NC_012982	TTGGT	2	10	503301	503310	0 %	60 %	40 %	0 %	254292844
261	NC_012982	GATCG	2	10	503557	503566	20 %	20 %	40 %	20 %	254292845
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