MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Hirschia baltica ATCC 49814 chromosome

Total Repeats: 40259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012982	TTG	2	6	58	63	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292377
2	NC_012982	GTG	2	6	64	69	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254292377
3	NC_012982	GCG	2	6	87	92	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292377
4	NC_012982	GCT	2	6	96	101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292377
5	NC_012982	GGC	2	6	180	185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292377
6	NC_012982	TAT	2	6	230	235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254292377
7	NC_012982	CGC	2	6	242	247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254292377
8	NC_012982	TGA	2	6	401	406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292377
9	NC_012982	TGT	2	6	476	481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292377
10	NC_012982	AAT	2	6	509	514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292377
11	NC_012982	CTG	2	6	538	543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292377
12	NC_012982	GCC	2	6	610	615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254292377
13	NC_012982	ATG	2	6	688	693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292377
14	NC_012982	GAT	3	9	930	938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292377
15	NC_012982	CAT	2	6	964	969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292377
16	NC_012982	GAA	2	6	1100	1105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292377
17	NC_012982	GAA	2	6	1155	1160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292377
18	NC_012982	GCA	2	6	1194	1199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292377
19	NC_012982	GCG	2	6	1282	1287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292377
20	NC_012982	TGA	2	6	1379	1384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292377
21	NC_012982	CAA	2	6	1421	1426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254292377
22	NC_012982	CGT	3	9	1527	1535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292377
23	NC_012982	GGA	2	6	1749	1754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254292377
24	NC_012982	ATT	2	6	1853	1858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254292377
25	NC_012982	GAA	2	6	1868	1873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292377
26	NC_012982	AGC	2	6	1883	1888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292377
27	NC_012982	AAT	2	6	1898	1903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292378
28	NC_012982	TGG	2	6	1908	1913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254292378
29	NC_012982	GGC	2	6	2061	2066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292378
30	NC_012982	TTA	2	6	2160	2165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254292378
31	NC_012982	GAA	2	6	2189	2194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292378
32	NC_012982	GAA	2	6	2221	2226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292378
33	NC_012982	GCT	2	6	2246	2251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292378
34	NC_012982	GCG	2	6	2255	2260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292378
35	NC_012982	CAT	2	6	2343	2348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292378
36	NC_012982	TAA	2	6	2386	2391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292378
37	NC_012982	AAG	2	6	2418	2423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292378
38	NC_012982	GTT	2	6	2513	2518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292378
39	NC_012982	AGG	2	6	2577	2582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254292379
40	NC_012982	GCA	2	6	2626	2631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292379
41	NC_012982	ACC	2	6	2697	2702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254292379
42	NC_012982	ATG	2	6	2726	2731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292379
43	NC_012982	CAT	2	6	2793	2798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292379
44	NC_012982	TGA	2	6	2841	2846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292379
45	NC_012982	ATA	2	6	3339	3344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292379
46	NC_012982	AGA	2	6	3364	3369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292380
47	NC_012982	AGA	3	9	3565	3573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292380
48	NC_012982	TAA	2	6	3643	3648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292380
49	NC_012982	TTG	2	6	3669	3674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292380
50	NC_012982	GTC	2	6	3891	3896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292380
51	NC_012982	TGA	2	6	3934	3939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292380
52	NC_012982	GGC	2	6	3988	3993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292380
53	NC_012982	TGA	2	6	4032	4037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292380
54	NC_012982	GAT	2	6	4268	4273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292380
55	NC_012982	GAC	2	6	4300	4305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292380
56	NC_012982	GAC	2	6	4322	4327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292381
57	NC_012982	GGC	2	6	4434	4439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292381
58	NC_012982	TGG	2	6	4491	4496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254292381
59	NC_012982	GCC	2	6	4578	4583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254292381
60	NC_012982	TCA	2	6	4618	4623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292381
61	NC_012982	GTT	2	6	4670	4675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292381
62	NC_012982	ACG	2	6	5224	5229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292381
63	NC_012982	CAT	2	6	5365	5370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292382
64	NC_012982	CTT	2	6	5371	5376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292382
65	NC_012982	GTT	2	6	5452	5457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292382
66	NC_012982	CAG	2	6	5474	5479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292382
67	NC_012982	CGT	2	6	5542	5547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292382
68	NC_012982	GTG	2	6	5631	5636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254292382
69	NC_012982	TCT	2	6	5712	5717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292382
70	NC_012982	CTA	2	6	5733	5738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292382
71	NC_012982	ATT	2	6	5880	5885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254292382
72	NC_012982	AAT	2	6	5953	5958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292383
73	NC_012982	TTC	2	6	5960	5965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292383
74	NC_012982	TTC	2	6	6016	6021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292383
75	NC_012982	TCA	2	6	6122	6127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292383
76	NC_012982	CAC	2	6	6162	6167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254292383
77	NC_012982	AGC	2	6	6172	6177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292383
78	NC_012982	TTC	2	6	6184	6189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292383
79	NC_012982	TGC	2	6	6403	6408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292383
80	NC_012982	CAT	2	6	6426	6431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292383
81	NC_012982	GGA	2	6	6527	6532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254292383
82	NC_012982	ATT	2	6	6581	6586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254292383
83	NC_012982	CAA	2	6	6669	6674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254292383
84	NC_012982	AAT	2	6	6764	6769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292383
85	NC_012982	AGA	2	6	6845	6850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292383
86	NC_012982	CTT	2	6	6912	6917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292383
87	NC_012982	ATC	2	6	7093	7098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292383
88	NC_012982	TCT	2	6	7121	7126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292383
89	NC_012982	ATC	2	6	7147	7152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292383
90	NC_012982	GGA	2	6	7228	7233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254292383
91	NC_012982	TTC	2	6	7249	7254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292383
92	NC_012982	CAG	2	6	7449	7454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292383
93	NC_012982	CTT	2	6	7593	7598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292383
94	NC_012982	TGT	2	6	7600	7605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292383
95	NC_012982	GCT	2	6	7616	7621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292383
96	NC_012982	AGC	2	6	7633	7638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292383
97	NC_012982	CAA	2	6	7695	7700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254292383
98	NC_012982	GTT	2	6	7932	7937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292383
99	NC_012982	ATA	2	6	8089	8094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292383
100	NC_012982	TGC	2	6	8218	8223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292383
101	NC_012982	CAA	2	6	8301	8306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254292383
102	NC_012982	CTT	2	6	8768	8773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292384
103	NC_012982	TCA	2	6	8845	8850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292384
104	NC_012982	CTG	2	6	8903	8908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292384
105	NC_012982	AGA	2	6	9024	9029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292384
106	NC_012982	ACG	2	6	9038	9043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292384
107	NC_012982	TGC	2	6	9054	9059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292384
108	NC_012982	TGC	2	6	9066	9071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292384
109	NC_012982	GTG	2	6	9322	9327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254292385
110	NC_012982	GTC	2	6	9410	9415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292385
111	NC_012982	TTC	2	6	9432	9437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292385
112	NC_012982	TCT	2	6	9655	9660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292385
113	NC_012982	GCG	2	6	9757	9762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292385
114	NC_012982	ACC	2	6	9780	9785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254292385
115	NC_012982	TCT	2	6	9838	9843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292385
116	NC_012982	ATG	2	6	9860	9865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292385
117	NC_012982	CGC	2	6	9899	9904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254292385
118	NC_012982	GTC	2	6	10282	10287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292385
119	NC_012982	CAA	2	6	10368	10373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254292385
120	NC_012982	CTG	2	6	10623	10628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292386
121	NC_012982	TGC	2	6	10636	10641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292386
122	NC_012982	TGA	2	6	10654	10659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292386
123	NC_012982	GTT	2	6	10667	10672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292386
124	NC_012982	CTA	2	6	10782	10787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292386
125	NC_012982	TGA	2	6	10795	10800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292386
126	NC_012982	CGT	2	6	10856	10861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292386
127	NC_012982	TGA	2	6	10867	10872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292386
128	NC_012982	GAA	3	9	10889	10897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292386
129	NC_012982	TGG	2	6	10942	10947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254292386
130	NC_012982	TGG	2	6	10960	10965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254292386
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255	NC_012982	GAA	2	6	20667	20672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292395
256	NC_012982	GTT	2	6	20707	20712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292395
257	NC_012982	TGC	2	6	20940	20945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292395
258	NC_012982	ATG	2	6	21017	21022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292395
259	NC_012982	GGC	2	6	21026	21031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292395
260	NC_012982	ATT	2	6	21207	21212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254292395
261	NC_012982	CGC	2	6	21443	21448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254292396
262	NC_012982	GCA	2	6	21485	21490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292396
263	NC_012982	ATC	2	6	21519	21524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292396
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269	NC_012982	TTC	2	6	22158	22163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292398
270	NC_012982	CAT	2	6	22211	22216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292398
271	NC_012982	TGG	2	6	22266	22271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254292398
272	NC_012982	CAT	2	6	22352	22357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292398
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275	NC_012982	ATC	2	6	22741	22746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292399
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279	NC_012982	CTT	2	6	22884	22889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292399
280	NC_012982	AAC	2	6	22920	22925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254292399
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287	NC_012982	TCC	2	6	23941	23946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254292400
288	NC_012982	TTG	2	6	24025	24030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292400
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291	NC_012982	CTT	2	6	24784	24789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292401
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352	NC_012982	ATA	2	6	30728	30733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292405
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362	NC_012982	CCA	2	6	31183	31188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254292405
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364	NC_012982	TTC	2	6	31319	31324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292405
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366	NC_012982	TCA	2	6	31377	31382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292405
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371	NC_012982	TTC	2	6	31654	31659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292406
372	NC_012982	GTT	2	6	31725	31730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292406
373	NC_012982	ATC	2	6	31813	31818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292406
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375	NC_012982	GCG	3	9	31973	31981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292406
376	NC_012982	GAA	2	6	32090	32095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292406
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378	NC_012982	GCG	2	6	32288	32293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292406
379	NC_012982	AAT	2	6	32333	32338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292406
380	NC_012982	TGA	2	6	32374	32379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292406
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382	NC_012982	AAG	2	6	32501	32506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292406
383	NC_012982	CCA	2	6	32536	32541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254292406
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400	NC_012982	GAT	2	6	34269	34274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292409
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403	NC_012982	AGC	2	6	34545	34550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292409
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454	NC_012982	TAA	2	6	40638	40643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292416
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489	NC_012982	TGA	2	6	43759	43764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292419
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500	NC_012982	TTG	2	6	45090	45095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292421

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