MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hirschia baltica ATCC 49814 chromosome

Total Repeats: 59882

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012982	TTG	2	6	200286	200291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292564
3502	NC_012982	GCTA	2	8	200511	200518	25 %	25 %	25 %	25 %	254292565
3503	NC_012982	GC	3	6	200552	200557	0 %	0 %	50 %	50 %	254292565
3504	NC_012982	GAT	3	9	200590	200598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292565
3505	NC_012982	GCAG	2	8	200609	200616	25 %	0 %	50 %	25 %	254292565
3506	NC_012982	AT	3	6	200841	200846	50 %	50 %	0 %	0 %	254292565
3507	NC_012982	GTT	2	6	200860	200865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292565
3508	NC_012982	CCA	2	6	200905	200910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254292566
3509	NC_012982	AAT	2	6	200984	200989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292566
3510	NC_012982	TGT	2	6	201065	201070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292566
3511	NC_012982	TTG	2	6	201118	201123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292566
3512	NC_012982	GTT	2	6	201204	201209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292567
3513	NC_012982	AG	3	6	201224	201229	50 %	0 %	50 %	0 %	254292567
3514	NC_012982	AAGC	2	8	201287	201294	50 %	0 %	25 %	25 %	254292567
3515	NC_012982	TTC	2	6	201365	201370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292567
3516	NC_012982	CAT	2	6	201427	201432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292567
3517	NC_012982	TTG	2	6	201458	201463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292567
3518	NC_012982	TTGA	2	8	201488	201495	25 %	50 %	25 %	0 %	254292567
3519	NC_012982	AAATG	2	10	201542	201551	60 %	20 %	20 %	0 %	254292567
3520	NC_012982	ATC	3	9	201563	201571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292567
3521	NC_012982	GGCA	2	8	201750	201757	25 %	0 %	50 %	25 %	254292567
3522	NC_012982	A	6	6	201771	201776	100 %	0 %	0 %	0 %	254292567
3523	NC_012982	CCGAAA	2	12	202121	202132	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	254292568
3524	NC_012982	GC	3	6	202187	202192	0 %	0 %	50 %	50 %	254292568
3525	NC_012982	CAT	2	6	202277	202282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292568
3526	NC_012982	TCT	3	9	202397	202405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292568
3527	NC_012982	AAG	2	6	202409	202414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292568
3528	NC_012982	TGA	2	6	202434	202439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292568
3529	NC_012982	TGG	2	6	202440	202445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254292568
3530	NC_012982	TTC	2	6	202463	202468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292568
3531	NC_012982	AACTG	2	10	202494	202503	40 %	20 %	20 %	20 %	254292568
3532	NC_012982	AGA	3	9	202521	202529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292568
3533	NC_012982	TCAAA	2	10	202545	202554	60 %	20 %	0 %	20 %	254292568
3534	NC_012982	A	6	6	202552	202557	100 %	0 %	0 %	0 %	254292568
3535	NC_012982	GCA	2	6	202564	202569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292568
3536	NC_012982	AGA	2	6	202617	202622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292568
3537	NC_012982	AAC	2	6	202623	202628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254292568
3538	NC_012982	TTG	2	6	202655	202660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292568
3539	NC_012982	TCT	2	6	202668	202673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292568
3540	NC_012982	ACA	2	6	202724	202729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254292568
3541	NC_012982	CCG	2	6	202764	202769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254292568
3542	NC_012982	ATG	2	6	202783	202788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292568
3543	NC_012982	CTG	2	6	202799	202804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292568
3544	NC_012982	TG	4	8	202806	202813	0 %	50 %	50 %	0 %	254292568
3545	NC_012982	CTG	2	6	202838	202843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292568
3546	NC_012982	GTG	2	6	202853	202858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254292568
3547	NC_012982	ATGG	2	8	202915	202922	25 %	25 %	50 %	0 %	254292568
3548	NC_012982	GAC	2	6	202932	202937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292568
3549	NC_012982	AGA	2	6	202943	202948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292568
3550	NC_012982	CAA	2	6	202976	202981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254292568
3551	NC_012982	GTC	2	6	203174	203179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292568
3552	NC_012982	CAT	2	6	203210	203215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292568
3553	NC_012982	ACG	2	6	203291	203296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292568
3554	NC_012982	CTA	2	6	203442	203447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292568
3555	NC_012982	ATG	2	6	203589	203594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292569
3556	NC_012982	GCA	2	6	203778	203783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292569
3557	NC_012982	GATGG	2	10	203795	203804	20 %	20 %	60 %	0 %	254292569
3558	NC_012982	T	7	7	203817	203823	0 %	100 %	0 %	0 %	254292569
3559	NC_012982	CAC	2	6	203842	203847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254292569
3560	NC_012982	TGA	2	6	203912	203917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292569
3561	NC_012982	CGA	2	6	203954	203959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292569
3562	NC_012982	GATT	2	8	203991	203998	25 %	50 %	25 %	0 %	254292569
3563	NC_012982	AATGG	2	10	204200	204209	40 %	20 %	40 %	0 %	254292570
3564	NC_012982	GCTTT	2	10	204260	204269	0 %	60 %	20 %	20 %	254292570
3565	NC_012982	GC	3	6	204322	204327	0 %	0 %	50 %	50 %	254292570
3566	NC_012982	GA	3	6	204328	204333	50 %	0 %	50 %	0 %	254292570
3567	NC_012982	GAA	2	6	204338	204343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292570
3568	NC_012982	GAA	2	6	204401	204406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292570
3569	NC_012982	TGC	2	6	204466	204471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292570
3570	NC_012982	GAT	2	6	204488	204493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292570
3571	NC_012982	GTC	2	6	204499	204504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292570
3572	NC_012982	CTG	2	6	204510	204515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292570
3573	NC_012982	ATT	2	6	204632	204637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254292570
3574	NC_012982	CAA	2	6	204711	204716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254292570
3575	NC_012982	GAA	2	6	204728	204733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292570
3576	NC_012982	GAA	2	6	204755	204760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292570
3577	NC_012982	ATT	2	6	204770	204775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254292570
3578	NC_012982	TGAT	2	8	205008	205015	25 %	50 %	25 %	0 %	254292570
3579	NC_012982	GAA	2	6	205094	205099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292570
3580	NC_012982	ATG	2	6	205137	205142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292570
3581	NC_012982	CAA	2	6	205207	205212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254292570
3582	NC_012982	GAA	2	6	205220	205225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292570
3583	NC_012982	CTTG	2	8	205249	205256	0 %	50 %	25 %	25 %	254292570
3584	NC_012982	TTG	2	6	205304	205309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292570
3585	NC_012982	GCA	2	6	205315	205320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292570
3586	NC_012982	TGA	2	6	205384	205389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292570
3587	NC_012982	TGC	2	6	205401	205406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292570
3588	NC_012982	TGA	2	6	205483	205488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292570
3589	NC_012982	CAA	2	6	205526	205531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254292570
3590	NC_012982	GCTGTG	2	12	205559	205570	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	254292570
3591	NC_012982	GGC	2	6	205574	205579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292570
3592	NC_012982	TGG	2	6	205582	205587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254292570
3593	NC_012982	TGA	2	6	205663	205668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292570
3594	NC_012982	GC	3	6	205683	205688	0 %	0 %	50 %	50 %	254292570
3595	NC_012982	ATT	2	6	205690	205695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254292570
3596	NC_012982	TG	3	6	205708	205713	0 %	50 %	50 %	0 %	254292570
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3598	NC_012982	ATTG	2	8	205840	205847	25 %	50 %	25 %	0 %	254292570
3599	NC_012982	TTG	2	6	205851	205856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292570
3600	NC_012982	CGC	2	6	205871	205876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254292570
3601	NC_012982	CGC	2	6	205971	205976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254292570
3602	NC_012982	GAC	2	6	205978	205983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292570
3603	NC_012982	GCA	2	6	206038	206043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292570
3604	NC_012982	ATTCT	2	10	206058	206067	20 %	60 %	0 %	20 %	254292570
3605	NC_012982	TTGA	2	8	206093	206100	25 %	50 %	25 %	0 %	254292570
3606	NC_012982	CAA	2	6	206118	206123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254292570
3607	NC_012982	TGA	2	6	206179	206184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292570
3608	NC_012982	ATGC	2	8	206264	206271	25 %	25 %	25 %	25 %	254292570
3609	NC_012982	TGA	2	6	206272	206277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292570
3610	NC_012982	GCG	2	6	206278	206283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292570
3611	NC_012982	CAG	2	6	206334	206339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292570
3612	NC_012982	AGC	2	6	206424	206429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292570
3613	NC_012982	GTG	2	6	206457	206462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254292570
3614	NC_012982	G	6	6	206519	206524	0 %	0 %	100 %	0 %	254292570
3615	NC_012982	ACCA	2	8	206545	206552	50 %	0 %	0 %	50 %	254292570
3616	NC_012982	TGT	2	6	206570	206575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292570
3617	NC_012982	GCC	2	6	206605	206610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254292570
3618	NC_012982	AT	3	6	206730	206735	50 %	50 %	0 %	0 %	254292571
3619	NC_012982	GCT	2	6	206736	206741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292571
3620	NC_012982	TGCT	2	8	206787	206794	0 %	50 %	25 %	25 %	254292571
3621	NC_012982	TTG	2	6	206837	206842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292571
3622	NC_012982	TCA	2	6	206863	206868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292571
3623	NC_012982	CAT	2	6	206975	206980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292571
3624	NC_012982	AG	3	6	207004	207009	50 %	0 %	50 %	0 %	254292571
3625	NC_012982	ATTG	2	8	207010	207017	25 %	50 %	25 %	0 %	254292571
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3628	NC_012982	TCA	2	6	207082	207087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292571
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3636	NC_012982	TCT	2	6	207280	207285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292571
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3728	NC_012982	GT	3	6	211852	211857	0 %	50 %	50 %	0 %	254292574
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3740	NC_012982	GAT	2	6	212577	212582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292575
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3742	NC_012982	GC	3	6	212630	212635	0 %	0 %	50 %	50 %	254292575
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3744	NC_012982	CGA	2	6	212664	212669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292575
3745	NC_012982	GGC	2	6	212773	212778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292575
3746	NC_012982	GAA	2	6	212822	212827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292575
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3752	NC_012982	TGA	2	6	213126	213131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292575
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3783	NC_012982	ATG	2	6	215326	215331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292577
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3847	NC_012982	AATA	2	8	218983	218990	75 %	25 %	0 %	0 %	254292581
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3850	NC_012982	CAC	2	6	219244	219249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254292581
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3854	NC_012982	T	6	6	219461	219466	0 %	100 %	0 %	0 %	254292581
3855	NC_012982	T	6	6	219482	219487	0 %	100 %	0 %	0 %	254292581
3856	NC_012982	ACG	2	6	219569	219574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292581
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3858	NC_012982	T	7	7	219646	219652	0 %	100 %	0 %	0 %	254292581
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3863	NC_012982	CTT	2	6	219844	219849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292581
3864	NC_012982	GT	4	8	219959	219966	0 %	50 %	50 %	0 %	254292581
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3867	NC_012982	ATC	2	6	220056	220061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292581
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3987	NC_012982	TC	3	6	226775	226780	0 %	50 %	0 %	50 %	254292585
3988	NC_012982	TTG	2	6	226817	226822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292585
3989	NC_012982	TGG	2	6	226905	226910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254292585
3990	NC_012982	A	7	7	227047	227053	100 %	0 %	0 %	0 %	254292585
3991	NC_012982	TAA	2	6	227061	227066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292585
3992	NC_012982	TTG	2	6	227117	227122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292585
3993	NC_012982	GCTG	2	8	227149	227156	0 %	25 %	50 %	25 %	254292585
3994	NC_012982	ACA	2	6	227239	227244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254292585
3995	NC_012982	GAT	2	6	227287	227292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292585
3996	NC_012982	CGC	2	6	227299	227304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254292585
3997	NC_012982	GC	3	6	227358	227363	0 %	0 %	50 %	50 %	254292585
3998	NC_012982	TGC	2	6	227376	227381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292585
3999	NC_012982	AGC	2	6	227475	227480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292585
4000	NC_012982	GTC	2	6	227497	227502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292585

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