MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hirschia baltica ATCC 49814 chromosome

Total Repeats: 59882

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_012982	GT	4	8	170533	170540	0 %	50 %	50 %	0 %	254292534
3002	NC_012982	CTG	2	6	170557	170562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292534
3003	NC_012982	CAT	2	6	170572	170577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292534
3004	NC_012982	TTC	2	6	170654	170659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292534
3005	NC_012982	T	6	6	170674	170679	0 %	100 %	0 %	0 %	254292534
3006	NC_012982	TGA	2	6	170754	170759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292534
3007	NC_012982	ATG	2	6	170816	170821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292534
3008	NC_012982	CTGC	2	8	170925	170932	0 %	25 %	25 %	50 %	254292534
3009	NC_012982	TGC	2	6	170990	170995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292534
3010	NC_012982	CTG	2	6	171001	171006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292534
3011	NC_012982	ATA	2	6	171063	171068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292534
3012	NC_012982	GC	3	6	171293	171298	0 %	0 %	50 %	50 %	254292535
3013	NC_012982	GGCG	2	8	171358	171365	0 %	0 %	75 %	25 %	254292535
3014	NC_012982	TCA	2	6	171454	171459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292535
3015	NC_012982	GT	3	6	171527	171532	0 %	50 %	50 %	0 %	254292535
3016	NC_012982	GCT	2	6	171673	171678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292535
3017	NC_012982	ACC	2	6	171687	171692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254292535
3018	NC_012982	GC	3	6	171738	171743	0 %	0 %	50 %	50 %	254292535
3019	NC_012982	CAT	2	6	171758	171763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292535
3020	NC_012982	CAC	2	6	171794	171799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254292535
3021	NC_012982	GAC	2	6	171814	171819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292535
3022	NC_012982	AC	3	6	171818	171823	50 %	0 %	0 %	50 %	254292535
3023	NC_012982	CCA	2	6	171844	171849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254292535
3024	NC_012982	TTG	2	6	171853	171858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292535
3025	NC_012982	T	6	6	171900	171905	0 %	100 %	0 %	0 %	254292535
3026	NC_012982	CAT	2	6	171920	171925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292535
3027	NC_012982	AT	3	6	171967	171972	50 %	50 %	0 %	0 %	254292535
3028	NC_012982	GAAA	2	8	171993	172000	75 %	0 %	25 %	0 %	254292535
3029	NC_012982	TGA	2	6	172013	172018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292535
3030	NC_012982	TCAT	2	8	172117	172124	25 %	50 %	0 %	25 %	254292535
3031	NC_012982	ATC	2	6	172203	172208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292535
3032	NC_012982	ACA	2	6	172219	172224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254292535
3033	NC_012982	CCA	2	6	172264	172269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254292535
3034	NC_012982	TTC	2	6	172305	172310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292535
3035	NC_012982	GA	3	6	172338	172343	50 %	0 %	50 %	0 %	254292535
3036	NC_012982	TCG	2	6	172384	172389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292535
3037	NC_012982	CGAG	2	8	172417	172424	25 %	0 %	50 %	25 %	254292535
3038	NC_012982	AAAT	2	8	172434	172441	75 %	25 %	0 %	0 %	254292535
3039	NC_012982	GTTT	2	8	172757	172764	0 %	75 %	25 %	0 %	254292536
3040	NC_012982	AT	3	6	172825	172830	50 %	50 %	0 %	0 %	254292536
3041	NC_012982	CAT	2	6	172852	172857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292536
3042	NC_012982	ACA	2	6	172943	172948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254292536
3043	NC_012982	T	6	6	173090	173095	0 %	100 %	0 %	0 %	254292536
3044	NC_012982	GAG	2	6	173139	173144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254292536
3045	NC_012982	T	6	6	173149	173154	0 %	100 %	0 %	0 %	254292536
3046	NC_012982	GCAA	2	8	173189	173196	50 %	0 %	25 %	25 %	254292536
3047	NC_012982	CTT	2	6	173214	173219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292536
3048	NC_012982	CG	4	8	173279	173286	0 %	0 %	50 %	50 %	254292536
3049	NC_012982	GC	3	6	173342	173347	0 %	0 %	50 %	50 %	254292536
3050	NC_012982	TTC	2	6	173362	173367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292536
3051	NC_012982	TTC	2	6	173416	173421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292536
3052	NC_012982	CGC	2	6	173476	173481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254292536
3053	NC_012982	GC	3	6	173583	173588	0 %	0 %	50 %	50 %	254292536
3054	NC_012982	CTT	2	6	173601	173606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292536
3055	NC_012982	CAT	2	6	173637	173642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292536
3056	NC_012982	CGA	2	6	173660	173665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292536
3057	NC_012982	GCA	2	6	173672	173677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292536
3058	NC_012982	ATC	3	9	173689	173697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292536
3059	NC_012982	T	7	7	173723	173729	0 %	100 %	0 %	0 %	254292536
3060	NC_012982	T	6	6	173733	173738	0 %	100 %	0 %	0 %	254292536
3061	NC_012982	T	6	6	173743	173748	0 %	100 %	0 %	0 %	254292536
3062	NC_012982	GTT	2	6	173822	173827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292536
3063	NC_012982	AGCAA	2	10	173864	173873	60 %	0 %	20 %	20 %	254292536
3064	NC_012982	GAA	2	6	173882	173887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292536
3065	NC_012982	ACA	2	6	173901	173906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254292536
3066	NC_012982	GAT	2	6	174013	174018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292537
3067	NC_012982	CTT	2	6	174118	174123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292537
3068	NC_012982	TGCT	2	8	174130	174137	0 %	50 %	25 %	25 %	254292537
3069	NC_012982	GCC	2	6	174161	174166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254292537
3070	NC_012982	GC	3	6	174284	174289	0 %	0 %	50 %	50 %	254292537
3071	NC_012982	TCC	2	6	174317	174322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254292537
3072	NC_012982	TTC	2	6	174341	174346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292537
3073	NC_012982	CTT	2	6	174707	174712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292538
3074	NC_012982	TCA	2	6	174844	174849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292538
3075	NC_012982	ATC	2	6	174862	174867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292538
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3077	NC_012982	GC	3	6	175121	175126	0 %	0 %	50 %	50 %	254292539
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3079	NC_012982	CG	4	8	175170	175177	0 %	0 %	50 %	50 %	254292539
3080	NC_012982	GCG	2	6	175203	175208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292539
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3082	NC_012982	GTG	2	6	175302	175307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254292539
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3086	NC_012982	CTGT	2	8	175487	175494	0 %	50 %	25 %	25 %	254292539
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3088	NC_012982	CCA	2	6	175609	175614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254292539
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3091	NC_012982	CGC	2	6	175862	175867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254292540
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3093	NC_012982	TGA	2	6	175955	175960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292540
3094	NC_012982	TG	3	6	175968	175973	0 %	50 %	50 %	0 %	254292540
3095	NC_012982	CAA	2	6	176021	176026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254292540
3096	NC_012982	GCT	2	6	176080	176085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292540
3097	NC_012982	CTG	2	6	176135	176140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292540
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3099	NC_012982	ATCA	2	8	176190	176197	50 %	25 %	0 %	25 %	254292540
3100	NC_012982	GCG	2	6	176229	176234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292540
3101	NC_012982	CG	4	8	176333	176340	0 %	0 %	50 %	50 %	254292540
3102	NC_012982	TCT	2	6	176341	176346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292540
3103	NC_012982	ACC	2	6	176370	176375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254292540
3104	NC_012982	TTG	2	6	176496	176501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292540
3105	NC_012982	TGT	2	6	176508	176513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292540
3106	NC_012982	ACC	2	6	176544	176549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254292540
3107	NC_012982	TGG	2	6	176558	176563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254292540
3108	NC_012982	GCG	2	6	176821	176826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292540
3109	NC_012982	GCAA	2	8	176929	176936	50 %	0 %	25 %	25 %	254292540
3110	NC_012982	ATC	2	6	177087	177092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292541
3111	NC_012982	CAA	2	6	177125	177130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254292541
3112	NC_012982	CGA	2	6	177227	177232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292541
3113	NC_012982	AG	3	6	177270	177275	50 %	0 %	50 %	0 %	254292541
3114	NC_012982	AGGA	2	8	177285	177292	50 %	0 %	50 %	0 %	254292541
3115	NC_012982	TGC	2	6	177318	177323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292541
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3117	NC_012982	TCG	2	6	177463	177468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292541
3118	NC_012982	GTC	2	6	177476	177481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292541
3119	NC_012982	CTG	2	6	177506	177511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292541
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3121	NC_012982	GCC	2	6	177549	177554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254292541
3122	NC_012982	CGC	2	6	177584	177589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254292541
3123	NC_012982	CTG	2	6	177662	177667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292541
3124	NC_012982	GA	3	6	177688	177693	50 %	0 %	50 %	0 %	254292541
3125	NC_012982	CG	4	8	177837	177844	0 %	0 %	50 %	50 %	254292541
3126	NC_012982	CGG	3	9	177856	177864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292541
3127	NC_012982	ATC	2	6	177873	177878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292541
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3129	NC_012982	TCT	2	6	177982	177987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292541
3130	NC_012982	T	6	6	177996	178001	0 %	100 %	0 %	0 %	254292541
3131	NC_012982	CGA	2	6	178142	178147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292541
3132	NC_012982	ACA	2	6	178171	178176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254292541
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3134	NC_012982	CTT	2	6	178231	178236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292542
3135	NC_012982	TTC	2	6	178238	178243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292542
3136	NC_012982	GGC	2	6	178265	178270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292542
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3147	NC_012982	TGA	2	6	179020	179025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292542
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3151	NC_012982	AT	3	6	179253	179258	50 %	50 %	0 %	0 %	254292542
3152	NC_012982	AGC	2	6	179341	179346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292543
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3157	NC_012982	TGT	2	6	179665	179670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292543
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3188	NC_012982	TGA	2	6	181008	181013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292545
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3202	NC_012982	T	6	6	182088	182093	0 %	100 %	0 %	0 %	254292546
3203	NC_012982	TGT	2	6	182125	182130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292546
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3205	NC_012982	CTG	2	6	182238	182243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292546
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3208	NC_012982	A	6	6	182845	182850	100 %	0 %	0 %	0 %	254292547
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3212	NC_012982	CAT	2	6	183065	183070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292547
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3216	NC_012982	GAT	2	6	183345	183350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292547
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3219	NC_012982	AAT	2	6	183455	183460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292548
3220	NC_012982	GCA	2	6	183573	183578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292548
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3223	NC_012982	TG	3	6	183638	183643	0 %	50 %	50 %	0 %	254292548
3224	NC_012982	ATC	2	6	183656	183661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292548
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3227	NC_012982	TGA	2	6	183736	183741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292548
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3229	NC_012982	GTC	2	6	183950	183955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292548
3230	NC_012982	CAT	3	9	184234	184242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292549
3231	NC_012982	AT	3	6	184269	184274	50 %	50 %	0 %	0 %	254292549
3232	NC_012982	TGT	2	6	184284	184289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292549
3233	NC_012982	CACG	2	8	184351	184358	25 %	0 %	25 %	50 %	254292549
3234	NC_012982	GGC	2	6	184394	184399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292549
3235	NC_012982	TA	3	6	184405	184410	50 %	50 %	0 %	0 %	254292549
3236	NC_012982	GCG	2	6	184455	184460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292549
3237	NC_012982	T	6	6	184464	184469	0 %	100 %	0 %	0 %	254292549
3238	NC_012982	GATG	2	8	184560	184567	25 %	25 %	50 %	0 %	254292549
3239	NC_012982	GAT	2	6	184891	184896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292550
3240	NC_012982	AG	3	6	184937	184942	50 %	0 %	50 %	0 %	254292550
3241	NC_012982	AG	3	6	184994	184999	50 %	0 %	50 %	0 %	254292550
3242	NC_012982	CG	3	6	185002	185007	0 %	0 %	50 %	50 %	254292550
3243	NC_012982	TCA	2	6	185030	185035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292550
3244	NC_012982	GCG	3	9	185219	185227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292550
3245	NC_012982	GTT	2	6	185228	185233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292550
3246	NC_012982	GCG	2	6	185330	185335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292550
3247	NC_012982	TTG	2	6	185367	185372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292550
3248	NC_012982	GCA	2	6	185468	185473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292550
3249	NC_012982	CGC	2	6	185557	185562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254292550
3250	NC_012982	CGG	2	6	185591	185596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292550
3251	NC_012982	GC	3	6	185634	185639	0 %	0 %	50 %	50 %	254292550
3252	NC_012982	GCA	2	6	185687	185692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292550
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3255	NC_012982	GAT	2	6	185806	185811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292550
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3263	NC_012982	CAATA	2	10	186210	186219	60 %	20 %	0 %	20 %	254292551
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3275	NC_012982	TGC	2	6	186598	186603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292551
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3339	NC_012982	AT	3	6	189779	189784	50 %	50 %	0 %	0 %	254292552
3340	NC_012982	GATGA	2	10	189786	189795	40 %	20 %	40 %	0 %	254292552
3341	NC_012982	ATG	2	6	190018	190023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292552
3342	NC_012982	A	7	7	190077	190083	100 %	0 %	0 %	0 %	254292552
3343	NC_012982	TGG	2	6	190132	190137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254292552
3344	NC_012982	AAGCAG	2	12	190138	190149	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	254292552
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3346	NC_012982	T	6	6	190576	190581	0 %	100 %	0 %	0 %	254292553
3347	NC_012982	AAT	2	6	190597	190602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292553
3348	NC_012982	CTT	2	6	190617	190622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292553
3349	NC_012982	GA	4	8	190630	190637	50 %	0 %	50 %	0 %	254292553
3350	NC_012982	AAT	2	6	190653	190658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292553
3351	NC_012982	CAT	2	6	190689	190694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292553
3352	NC_012982	ATC	2	6	190738	190743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292553
3353	NC_012982	CCA	2	6	190859	190864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254292553
3354	NC_012982	TTCG	2	8	190948	190955	0 %	50 %	25 %	25 %	254292553
3355	NC_012982	CAG	2	6	191014	191019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292553
3356	NC_012982	GAC	2	6	191026	191031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292553
3357	NC_012982	CCA	2	6	191163	191168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254292554
3358	NC_012982	CGC	2	6	191197	191202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254292554
3359	NC_012982	CCG	2	6	191313	191318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254292554
3360	NC_012982	TCA	2	6	191361	191366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292554
3361	NC_012982	TCA	2	6	191409	191414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292554
3362	NC_012982	GGCA	2	8	191430	191437	25 %	0 %	50 %	25 %	254292554
3363	NC_012982	ATA	3	9	191459	191467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292554
3364	NC_012982	GCC	2	6	191489	191494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254292554
3365	NC_012982	GCTC	2	8	191536	191543	0 %	25 %	25 %	50 %	254292554
3366	NC_012982	TGA	2	6	191671	191676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292554
3367	NC_012982	TTG	2	6	191709	191714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292554
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3489	NC_012982	AGC	2	6	199459	199464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292564
3490	NC_012982	ATT	2	6	199475	199480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254292564
3491	NC_012982	TTG	2	6	199517	199522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292564
3492	NC_012982	GCG	2	6	199546	199551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292564
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