MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hirschia baltica ATCC 49814 chromosome

Total Repeats: 59882

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_012982	T	6	6	114778	114783	0 %	100 %	0 %	0 %	254292494
2002	NC_012982	GT	3	6	114790	114795	0 %	50 %	50 %	0 %	254292494
2003	NC_012982	TTG	2	6	114801	114806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292494
2004	NC_012982	GT	3	6	114870	114875	0 %	50 %	50 %	0 %	254292494
2005	NC_012982	ATATA	2	10	114914	114923	60 %	40 %	0 %	0 %	254292494
2006	NC_012982	TCA	2	6	115031	115036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292494
2007	NC_012982	GCG	2	6	115093	115098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292494
2008	NC_012982	GCT	2	6	115142	115147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292494
2009	NC_012982	CGA	2	6	115206	115211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292494
2010	NC_012982	GAA	2	6	115231	115236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292494
2011	NC_012982	TTC	2	6	115244	115249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292494
2012	NC_012982	GAT	2	6	115276	115281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292494
2013	NC_012982	CTT	2	6	115366	115371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292494
2014	NC_012982	TTA	2	6	115579	115584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254292495
2015	NC_012982	CAA	2	6	115611	115616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254292495
2016	NC_012982	TTG	2	6	115622	115627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292495
2017	NC_012982	CTT	2	6	115645	115650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292495
2018	NC_012982	AAT	2	6	115735	115740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292495
2019	NC_012982	AGCT	2	8	115744	115751	25 %	25 %	25 %	25 %	254292495
2020	NC_012982	GCACCG	2	12	115772	115783	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	254292495
2021	NC_012982	TTA	2	6	115835	115840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254292495
2022	NC_012982	GGC	2	6	115861	115866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292495
2023	NC_012982	CGC	2	6	115887	115892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254292495
2024	NC_012982	GGT	2	6	115945	115950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254292495
2025	NC_012982	TGT	2	6	116080	116085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292495
2026	NC_012982	CAG	2	6	116142	116147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292495
2027	NC_012982	GCT	2	6	116150	116155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292495
2028	NC_012982	GTTT	2	8	116157	116164	0 %	75 %	25 %	0 %	254292495
2029	NC_012982	AGG	2	6	116191	116196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254292495
2030	NC_012982	ATC	2	6	116357	116362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292495
2031	NC_012982	CAT	2	6	116685	116690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292495
2032	NC_012982	CTG	2	6	116773	116778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292495
2033	NC_012982	GACA	2	8	116815	116822	50 %	0 %	25 %	25 %	254292495
2034	NC_012982	GAT	2	6	117135	117140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292496
2035	NC_012982	ATT	2	6	117310	117315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254292496
2036	NC_012982	TTGG	2	8	117323	117330	0 %	50 %	50 %	0 %	254292496
2037	NC_012982	CAA	2	6	117365	117370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254292496
2038	NC_012982	TTG	2	6	117409	117414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292496
2039	NC_012982	AT	3	6	117553	117558	50 %	50 %	0 %	0 %	254292496
2040	NC_012982	AAC	2	6	117635	117640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254292496
2041	NC_012982	GCG	2	6	117654	117659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292496
2042	NC_012982	TGC	2	6	117688	117693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292496
2043	NC_012982	AGG	2	6	117767	117772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254292496
2044	NC_012982	GGC	2	6	117779	117784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292496
2045	NC_012982	AG	3	6	117821	117826	50 %	0 %	50 %	0 %	254292496
2046	NC_012982	TGCG	2	8	117979	117986	0 %	25 %	50 %	25 %	254292496
2047	NC_012982	TTG	2	6	118003	118008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292496
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2049	NC_012982	GAA	2	6	118167	118172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292496
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2051	NC_012982	AGAT	2	8	118240	118247	50 %	25 %	25 %	0 %	254292496
2052	NC_012982	GAAT	2	8	118295	118302	50 %	25 %	25 %	0 %	254292496
2053	NC_012982	AAT	2	6	118314	118319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292496
2054	NC_012982	GAA	2	6	118326	118331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292496
2055	NC_012982	GCG	2	6	118364	118369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292496
2056	NC_012982	AGTG	2	8	118451	118458	25 %	25 %	50 %	0 %	254292496
2057	NC_012982	TTC	2	6	118466	118471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292496
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2059	NC_012982	GGC	2	6	118574	118579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292496
2060	NC_012982	ATTTAA	2	12	118667	118678	50 %	50 %	0 %	0 %	254292496
2061	NC_012982	GA	3	6	118806	118811	50 %	0 %	50 %	0 %	254292496
2062	NC_012982	TGC	2	6	118902	118907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292497
2063	NC_012982	TCA	2	6	118961	118966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292497
2064	NC_012982	GTC	2	6	119016	119021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292497
2065	NC_012982	G	8	8	119063	119070	0 %	0 %	100 %	0 %	254292497
2066	NC_012982	GTCC	2	8	119073	119080	0 %	25 %	25 %	50 %	254292497
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2070	NC_012982	TTGT	2	8	119631	119638	0 %	75 %	25 %	0 %	254292498
2071	NC_012982	TTG	2	6	119640	119645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292498
2072	NC_012982	A	7	7	119677	119683	100 %	0 %	0 %	0 %	254292498
2073	NC_012982	TGC	2	6	119737	119742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292498
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2080	NC_012982	AT	3	6	120085	120090	50 %	50 %	0 %	0 %	254292498
2081	NC_012982	TAT	2	6	120092	120097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254292498
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2089	NC_012982	A	6	6	120626	120631	100 %	0 %	0 %	0 %	254292499
2090	NC_012982	AAACC	2	10	120642	120651	60 %	0 %	0 %	40 %	254292499
2091	NC_012982	ACA	2	6	120671	120676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254292499
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2094	NC_012982	T	8	8	120844	120851	0 %	100 %	0 %	0 %	254292499
2095	NC_012982	GGC	2	6	120855	120860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292499
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2098	NC_012982	TGG	2	6	121079	121084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254292499
2099	NC_012982	GAAA	2	8	121184	121191	75 %	0 %	25 %	0 %	254292499
2100	NC_012982	GT	3	6	121195	121200	0 %	50 %	50 %	0 %	254292499
2101	NC_012982	T	6	6	121217	121222	0 %	100 %	0 %	0 %	254292499
2102	NC_012982	TAG	2	6	121399	121404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292499
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2105	NC_012982	GGC	2	6	121502	121507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292499
2106	NC_012982	ATAG	2	8	121638	121645	50 %	25 %	25 %	0 %	254292500
2107	NC_012982	TG	3	6	121722	121727	0 %	50 %	50 %	0 %	254292500
2108	NC_012982	TCA	2	6	121746	121751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292500
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2110	NC_012982	AC	3	6	122182	122187	50 %	0 %	0 %	50 %	254292500
2111	NC_012982	TCT	2	6	122223	122228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292500
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2113	NC_012982	CAG	2	6	122245	122250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292500
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2117	NC_012982	T	6	6	122498	122503	0 %	100 %	0 %	0 %	254292500
2118	NC_012982	T	6	6	122527	122532	0 %	100 %	0 %	0 %	254292500
2119	NC_012982	TAGA	2	8	122560	122567	50 %	25 %	25 %	0 %	254292500
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2121	NC_012982	TCT	2	6	122601	122606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292500
2122	NC_012982	TG	3	6	122607	122612	0 %	50 %	50 %	0 %	254292500
2123	NC_012982	TGG	2	6	122685	122690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254292500
2124	NC_012982	ATTG	2	8	122787	122794	25 %	50 %	25 %	0 %	254292500
2125	NC_012982	TGC	2	6	123029	123034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292500
2126	NC_012982	TGT	2	6	123049	123054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292500
2127	NC_012982	AT	3	6	123171	123176	50 %	50 %	0 %	0 %	254292500
2128	NC_012982	CAC	2	6	123184	123189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254292500
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2131	NC_012982	TCA	2	6	123252	123257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292500
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2136	NC_012982	GAC	2	6	123515	123520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292500
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2142	NC_012982	TCT	2	6	123855	123860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292500
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2162	NC_012982	GCC	2	6	125253	125258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254292501
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2223	NC_012982	GGTT	2	8	128871	128878	0 %	50 %	50 %	0 %	254292503
2224	NC_012982	T	6	6	128912	128917	0 %	100 %	0 %	0 %	254292503
2225	NC_012982	TTC	2	6	128970	128975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292503
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2227	NC_012982	ATC	2	6	129043	129048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292503
2228	NC_012982	CGGGA	2	10	129080	129089	20 %	0 %	60 %	20 %	254292503
2229	NC_012982	TCTG	2	8	129108	129115	0 %	50 %	25 %	25 %	254292503
2230	NC_012982	TTC	2	6	129141	129146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254292503
2231	NC_012982	GCT	3	9	129178	129186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292503
2232	NC_012982	CGC	2	6	129585	129590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254292504
2233	NC_012982	TATT	2	8	129605	129612	25 %	75 %	0 %	0 %	254292504
2234	NC_012982	GAT	2	6	129649	129654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292504
2235	NC_012982	AGT	2	6	129727	129732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292504
2236	NC_012982	AAG	2	6	129734	129739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292504
2237	NC_012982	AAATCT	2	12	129760	129771	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	254292504
2238	NC_012982	TA	3	6	129783	129788	50 %	50 %	0 %	0 %	254292504
2239	NC_012982	AAC	2	6	129843	129848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254292504
2240	NC_012982	AGC	3	9	130038	130046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292504
2241	NC_012982	TGCGGC	2	12	130062	130073	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	254292504
2242	NC_012982	TTTCC	2	10	130167	130176	0 %	60 %	0 %	40 %	254292504
2243	NC_012982	CAG	2	6	130409	130414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292504
2244	NC_012982	CAT	2	6	130459	130464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292504
2245	NC_012982	GAT	2	6	130492	130497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292504
2246	NC_012982	GTTG	2	8	130548	130555	0 %	50 %	50 %	0 %	254292504
2247	NC_012982	AAG	2	6	130604	130609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292504
2248	NC_012982	CAA	2	6	130642	130647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254292504
2249	NC_012982	T	7	7	130665	130671	0 %	100 %	0 %	0 %	254292504
2250	NC_012982	ATC	2	6	130755	130760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292505
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2252	NC_012982	AAG	2	6	130792	130797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292505
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2254	NC_012982	CCT	2	6	130874	130879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254292505
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2257	NC_012982	AGT	2	6	131102	131107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292505
2258	NC_012982	GTC	2	6	131109	131114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292505
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2266	NC_012982	GTCA	2	8	131512	131519	25 %	25 %	25 %	25 %	254292505
2267	NC_012982	GTT	2	6	131535	131540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292505
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2269	NC_012982	CTG	2	6	131653	131658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292505
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2275	NC_012982	ACG	2	6	132000	132005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292505
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2284	NC_012982	ATC	2	6	132312	132317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292505
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2319	NC_012982	CATG	2	8	134025	134032	25 %	25 %	25 %	25 %	254292506
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2330	NC_012982	AT	3	6	134567	134572	50 %	50 %	0 %	0 %	254292506
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2337	NC_012982	GAT	2	6	134726	134731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292507
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2342	NC_012982	CCATG	2	10	135064	135073	20 %	20 %	20 %	40 %	254292507
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2349	NC_012982	GCA	2	6	135618	135623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292507
2350	NC_012982	ATA	2	6	135628	135633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292507
2351	NC_012982	GAA	2	6	135640	135645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292507
2352	NC_012982	AG	3	6	135686	135691	50 %	0 %	50 %	0 %	254292507
2353	NC_012982	T	7	7	135706	135712	0 %	100 %	0 %	0 %	254292507
2354	NC_012982	AAG	2	6	135817	135822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292507
2355	NC_012982	TGC	2	6	135854	135859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292507
2356	NC_012982	CAG	2	6	135864	135869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292507
2357	NC_012982	CAT	3	9	135923	135931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292507
2358	NC_012982	GCA	2	6	135939	135944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292507
2359	NC_012982	T	6	6	135974	135979	0 %	100 %	0 %	0 %	254292507
2360	NC_012982	GAA	2	6	135995	136000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292507
2361	NC_012982	GCA	2	6	136002	136007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292507
2362	NC_012982	AGAT	2	8	136060	136067	50 %	25 %	25 %	0 %	254292507
2363	NC_012982	ATC	2	6	136080	136085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254292507
2364	NC_012982	GGC	2	6	136098	136103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254292507
2365	NC_012982	AAT	2	6	136108	136113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292507
2366	NC_012982	AAG	2	6	136203	136208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292507
2367	NC_012982	CCACTG	2	12	136225	136236	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	254292507
2368	NC_012982	GGT	2	6	136701	136706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254292508
2369	NC_012982	GCC	2	6	136716	136721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254292508
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2473	NC_012982	TGC	2	6	142340	142345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292511
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2478	NC_012982	TACT	2	8	142657	142664	25 %	50 %	0 %	25 %	254292511
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2480	NC_012982	TAA	2	6	142743	142748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254292511
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2483	NC_012982	GCT	2	6	143056	143061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292512
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2486	NC_012982	TTGGTG	2	12	143168	143179	0 %	50 %	50 %	0 %	254292512
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2488	NC_012982	TGA	2	6	143205	143210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254292512
2489	NC_012982	GCT	2	6	143239	143244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292512
2490	NC_012982	TTG	2	6	143285	143290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254292512
2491	NC_012982	CGC	2	6	143325	143330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254292512
2492	NC_012982	GAA	2	6	143374	143379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292512
2493	NC_012982	AGA	2	6	143385	143390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254292512
2494	NC_012982	GCT	2	6	143464	143469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254292512
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2499	NC_012982	CGA	2	6	143646	143651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254292512
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