MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 plasmid pHLAC01

Total Repeats: 605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012030	AC	3	6	559	564	50 %	0 %	0 %	50 %	222481152
2	NC_012030	TA	3	6	1589	1594	50 %	50 %	0 %	0 %	222481153
3	NC_012030	TC	3	6	1660	1665	0 %	50 %	0 %	50 %	222481153
4	NC_012030	CA	3	6	1789	1794	50 %	0 %	0 %	50 %	222481153
5	NC_012030	TC	3	6	1947	1952	0 %	50 %	0 %	50 %	222481154
6	NC_012030	AC	3	6	3630	3635	50 %	0 %	0 %	50 %	222481155
7	NC_012030	CG	3	6	3748	3753	0 %	0 %	50 %	50 %	222481155
8	NC_012030	TC	3	6	3758	3763	0 %	50 %	0 %	50 %	222481155
9	NC_012030	CT	3	6	4718	4723	0 %	50 %	0 %	50 %	222481156
10	NC_012030	CA	3	6	4849	4854	50 %	0 %	0 %	50 %	222481156
11	NC_012030	CG	3	6	5773	5778	0 %	0 %	50 %	50 %	222481157
12	NC_012030	GC	3	6	6621	6626	0 %	0 %	50 %	50 %	222481157
13	NC_012030	GA	3	6	6907	6912	50 %	0 %	50 %	0 %	222481158
14	NC_012030	TC	3	6	7946	7951	0 %	50 %	0 %	50 %	222481159
15	NC_012030	GA	3	6	8330	8335	50 %	0 %	50 %	0 %	222481160
16	NC_012030	AC	3	6	9061	9066	50 %	0 %	0 %	50 %	222481161
17	NC_012030	GT	3	6	9146	9151	0 %	50 %	50 %	0 %	222481161
18	NC_012030	AC	3	6	9337	9342	50 %	0 %	0 %	50 %	222481161
19	NC_012030	AC	3	6	9836	9841	50 %	0 %	0 %	50 %	222481161
20	NC_012030	GA	3	6	12254	12259	50 %	0 %	50 %	0 %	222481162
21	NC_012030	TC	3	6	13580	13585	0 %	50 %	0 %	50 %	222481163
22	NC_012030	GT	3	6	14180	14185	0 %	50 %	50 %	0 %	222481163
23	NC_012030	CA	3	6	14522	14527	50 %	0 %	0 %	50 %	222481163
24	NC_012030	GA	3	6	16210	16215	50 %	0 %	50 %	0 %	222481165
25	NC_012030	TG	3	6	16691	16696	0 %	50 %	50 %	0 %	222481166
26	NC_012030	GT	3	6	18562	18567	0 %	50 %	50 %	0 %	222481168
27	NC_012030	GA	3	6	19424	19429	50 %	0 %	50 %	0 %	222481169
28	NC_012030	CA	3	6	20524	20529	50 %	0 %	0 %	50 %	222481170
29	NC_012030	CT	3	6	21871	21876	0 %	50 %	0 %	50 %	222481172
30	NC_012030	AC	3	6	23253	23258	50 %	0 %	0 %	50 %	222481172
31	NC_012030	CT	3	6	23619	23624	0 %	50 %	0 %	50 %	222481172
32	NC_012030	CG	3	6	24706	24711	0 %	0 %	50 %	50 %	222481172
33	NC_012030	GC	3	6	26600	26605	0 %	0 %	50 %	50 %	222481173
34	NC_012030	GA	3	6	27205	27210	50 %	0 %	50 %	0 %	222481173
35	NC_012030	CT	3	6	28713	28718	0 %	50 %	0 %	50 %	222481174
36	NC_012030	AG	3	6	29922	29927	50 %	0 %	50 %	0 %	222481175
37	NC_012030	AG	3	6	30056	30061	50 %	0 %	50 %	0 %	222481175
38	NC_012030	CA	3	6	31278	31283	50 %	0 %	0 %	50 %	222481176
39	NC_012030	CG	3	6	32105	32110	0 %	0 %	50 %	50 %	222481177
40	NC_012030	GA	3	6	32131	32136	50 %	0 %	50 %	0 %	222481177
41	NC_012030	AG	3	6	33198	33203	50 %	0 %	50 %	0 %	222481179
42	NC_012030	CA	3	6	34187	34192	50 %	0 %	0 %	50 %	222481180
43	NC_012030	GA	3	6	34551	34556	50 %	0 %	50 %	0 %	222481180
44	NC_012030	CT	3	6	35728	35733	0 %	50 %	0 %	50 %	222481181
45	NC_012030	GT	4	8	36271	36278	0 %	50 %	50 %	0 %	222481182
46	NC_012030	AT	3	6	36768	36773	50 %	50 %	0 %	0 %	222481183
47	NC_012030	GA	3	6	38504	38509	50 %	0 %	50 %	0 %	222481185
48	NC_012030	CT	4	8	38556	38563	0 %	50 %	0 %	50 %	222481185
49	NC_012030	GA	3	6	38646	38651	50 %	0 %	50 %	0 %	222481185
50	NC_012030	CA	3	6	38732	38737	50 %	0 %	0 %	50 %	222481185
51	NC_012030	CG	3	6	40419	40424	0 %	0 %	50 %	50 %	222481186
52	NC_012030	AC	3	6	40858	40863	50 %	0 %	0 %	50 %	222481186
53	NC_012030	TC	3	6	45747	45752	0 %	50 %	0 %	50 %	222481190
54	NC_012030	CA	3	6	46384	46389	50 %	0 %	0 %	50 %	222481190
55	NC_012030	CG	3	6	46436	46441	0 %	0 %	50 %	50 %	222481190
56	NC_012030	CT	3	6	46645	46650	0 %	50 %	0 %	50 %	222481190
57	NC_012030	TA	3	6	48420	48425	50 %	50 %	0 %	0 %	222481190
58	NC_012030	GA	3	6	49268	49273	50 %	0 %	50 %	0 %	222481191
59	NC_012030	GA	3	6	49300	49305	50 %	0 %	50 %	0 %	222481191
60	NC_012030	GA	3	6	49542	49547	50 %	0 %	50 %	0 %	222481192
61	NC_012030	AG	3	6	49569	49574	50 %	0 %	50 %	0 %	222481192
62	NC_012030	AG	3	6	50177	50182	50 %	0 %	50 %	0 %	222481193
63	NC_012030	TG	3	6	51284	51289	0 %	50 %	50 %	0 %	222481194
64	NC_012030	TG	3	6	51708	51713	0 %	50 %	50 %	0 %	222481195
65	NC_012030	AC	3	6	52361	52366	50 %	0 %	0 %	50 %	222481196
66	NC_012030	AT	3	6	52447	52452	50 %	50 %	0 %	0 %	222481196
67	NC_012030	CG	3	6	52788	52793	0 %	0 %	50 %	50 %	222481197
68	NC_012030	CG	3	6	58191	58196	0 %	0 %	50 %	50 %	222481200
69	NC_012030	AC	3	6	58630	58635	50 %	0 %	0 %	50 %	222481200
70	NC_012030	AG	3	6	59530	59535	50 %	0 %	50 %	0 %	222481201
71	NC_012030	TC	3	6	60610	60615	0 %	50 %	0 %	50 %	222481202
72	NC_012030	AC	3	6	61485	61490	50 %	0 %	0 %	50 %	222481203
73	NC_012030	TC	3	6	61697	61702	0 %	50 %	0 %	50 %	222481203
74	NC_012030	GA	3	6	62020	62025	50 %	0 %	50 %	0 %	222481203
75	NC_012030	AC	3	6	62161	62166	50 %	0 %	0 %	50 %	222481203
76	NC_012030	TC	3	6	62583	62588	0 %	50 %	0 %	50 %	222481204
77	NC_012030	AC	3	6	62770	62775	50 %	0 %	0 %	50 %	222481204
78	NC_012030	TC	3	6	63222	63227	0 %	50 %	0 %	50 %	222481204
79	NC_012030	CT	3	6	63386	63391	0 %	50 %	0 %	50 %	222481204
80	NC_012030	GA	3	6	64546	64551	50 %	0 %	50 %	0 %	222481205
81	NC_012030	CG	3	6	66912	66917	0 %	0 %	50 %	50 %	222481206
82	NC_012030	AC	3	6	67351	67356	50 %	0 %	0 %	50 %	222481206
83	NC_012030	TC	3	6	72578	72583	0 %	50 %	0 %	50 %	222481207
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87	NC_012030	GT	3	6	77452	77457	0 %	50 %	50 %	0 %	222481209
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90	NC_012030	AC	3	6	78931	78936	50 %	0 %	0 %	50 %	222481211
91	NC_012030	AC	3	6	79259	79264	50 %	0 %	0 %	50 %	222481211
92	NC_012030	TG	3	6	79486	79491	0 %	50 %	50 %	0 %	222481211
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94	NC_012030	TG	3	6	80890	80895	0 %	50 %	50 %	0 %	222481211
95	NC_012030	TC	4	8	80959	80966	0 %	50 %	0 %	50 %	222481211
96	NC_012030	GA	3	6	82374	82379	50 %	0 %	50 %	0 %	222481213
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102	NC_012030	CT	3	6	86518	86523	0 %	50 %	0 %	50 %	222481216
103	NC_012030	CG	3	6	86528	86533	0 %	0 %	50 %	50 %	222481216
104	NC_012030	GA	4	8	87238	87245	50 %	0 %	50 %	0 %	222481216
105	NC_012030	AC	3	6	90096	90101	50 %	0 %	0 %	50 %	222481218
106	NC_012030	AC	3	6	90476	90481	50 %	0 %	0 %	50 %	222481219
107	NC_012030	CG	3	6	91388	91393	0 %	0 %	50 %	50 %	222481220
108	NC_012030	AC	3	6	91422	91427	50 %	0 %	0 %	50 %	222481220
109	NC_012030	AC	3	6	91917	91922	50 %	0 %	0 %	50 %	222481220
110	NC_012030	TG	3	6	93808	93813	0 %	50 %	50 %	0 %	222481222
111	NC_012030	GA	3	6	95214	95219	50 %	0 %	50 %	0 %	222481224
112	NC_012030	CT	3	6	96494	96499	0 %	50 %	0 %	50 %	222481225
113	NC_012030	AC	3	6	97051	97056	50 %	0 %	0 %	50 %	222481225
114	NC_012030	TC	3	6	97172	97177	0 %	50 %	0 %	50 %	222481225
115	NC_012030	CA	3	6	97491	97496	50 %	0 %	0 %	50 %	222481226
116	NC_012030	CT	3	6	97778	97783	0 %	50 %	0 %	50 %	222481226
117	NC_012030	GA	3	6	99279	99284	50 %	0 %	50 %	0 %	222481226
118	NC_012030	TC	3	6	99808	99813	0 %	50 %	0 %	50 %	222481226
119	NC_012030	AT	3	6	99988	99993	50 %	50 %	0 %	0 %	222481227
120	NC_012030	GT	3	6	100112	100117	0 %	50 %	50 %	0 %	222481227
121	NC_012030	CT	3	6	100792	100797	0 %	50 %	0 %	50 %	222481227
122	NC_012030	AC	3	6	102054	102059	50 %	0 %	0 %	50 %	222481228
123	NC_012030	AT	3	6	102072	102077	50 %	50 %	0 %	0 %	222481228
124	NC_012030	CT	3	6	102660	102665	0 %	50 %	0 %	50 %	222481228
125	NC_012030	AG	3	6	103119	103124	50 %	0 %	50 %	0 %	222481228
126	NC_012030	GA	4	8	104239	104246	50 %	0 %	50 %	0 %	222481230
127	NC_012030	GA	3	6	105380	105385	50 %	0 %	50 %	0 %	222481231
128	NC_012030	TC	3	6	105600	105605	0 %	50 %	0 %	50 %	222481231
129	NC_012030	TC	3	6	105700	105705	0 %	50 %	0 %	50 %	222481231
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138	NC_012030	TG	3	6	110597	110602	0 %	50 %	50 %	0 %	222481235
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140	NC_012030	AG	3	6	111416	111421	50 %	0 %	50 %	0 %	222481235
141	NC_012030	CT	3	6	111611	111616	0 %	50 %	0 %	50 %	222481235
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