MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 plasmid pHLAC01

Total Repeats: 875

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012030	TCGC	2	8	309	316	0 %	25 %	25 %	50 %	222481152
2	NC_012030	GGAT	2	8	2138	2145	25 %	25 %	50 %	0 %	222481154
3	NC_012030	CGAC	2	8	2187	2194	25 %	0 %	25 %	50 %	222481154
4	NC_012030	CCGA	2	8	2677	2684	25 %	0 %	25 %	50 %	222481154
5	NC_012030	ACGC	2	8	2699	2706	25 %	0 %	25 %	50 %	222481154
6	NC_012030	TCCA	2	8	2822	2829	25 %	25 %	0 %	50 %	222481154
7	NC_012030	CACG	2	8	2873	2880	25 %	0 %	25 %	50 %	222481154
8	NC_012030	TTCG	2	8	3268	3275	0 %	50 %	25 %	25 %	222481155
9	NC_012030	ACCT	2	8	3615	3622	25 %	25 %	0 %	50 %	222481155
10	NC_012030	CTCG	2	8	3641	3648	0 %	25 %	25 %	50 %	222481155
11	NC_012030	ACGA	2	8	4002	4009	50 %	0 %	25 %	25 %	222481155
12	NC_012030	GCAG	2	8	4147	4154	25 %	0 %	50 %	25 %	222481156
13	NC_012030	TCTG	2	8	4619	4626	0 %	50 %	25 %	25 %	222481156
14	NC_012030	TGAC	2	8	4635	4642	25 %	25 %	25 %	25 %	222481156
15	NC_012030	ACGC	2	8	4686	4693	25 %	0 %	25 %	50 %	222481156
16	NC_012030	ACTG	2	8	4748	4755	25 %	25 %	25 %	25 %	222481156
17	NC_012030	GTTC	2	8	5043	5050	0 %	50 %	25 %	25 %	222481156
18	NC_012030	TCAA	2	8	5100	5107	50 %	25 %	0 %	25 %	222481156
19	NC_012030	CGGT	2	8	5193	5200	0 %	25 %	50 %	25 %	222481156
20	NC_012030	GACC	2	8	5973	5980	25 %	0 %	25 %	50 %	222481157
21	NC_012030	GTAC	2	8	6425	6432	25 %	25 %	25 %	25 %	222481157
22	NC_012030	CAAA	2	8	7073	7080	75 %	0 %	0 %	25 %	222481158
23	NC_012030	CGTA	2	8	7262	7269	25 %	25 %	25 %	25 %	222481159
24	NC_012030	AGAT	2	8	7302	7309	50 %	25 %	25 %	0 %	222481159
25	NC_012030	GACG	2	8	7801	7808	25 %	0 %	50 %	25 %	222481159
26	NC_012030	CTCG	2	8	8044	8051	0 %	25 %	25 %	50 %	222481159
27	NC_012030	ATTA	2	8	8401	8408	50 %	50 %	0 %	0 %	222481160
28	NC_012030	GAAG	2	8	8638	8645	50 %	0 %	50 %	0 %	222481160
29	NC_012030	GGTG	2	8	8666	8673	0 %	25 %	75 %	0 %	222481160
30	NC_012030	CCGA	2	8	8755	8762	25 %	0 %	25 %	50 %	222481160
31	NC_012030	CGTG	2	8	9382	9389	0 %	25 %	50 %	25 %	222481161
32	NC_012030	TCGA	2	8	9505	9512	25 %	25 %	25 %	25 %	222481161
33	NC_012030	CCCA	2	8	9910	9917	25 %	0 %	0 %	75 %	222481161
34	NC_012030	GGGT	2	8	9995	10002	0 %	25 %	75 %	0 %	222481161
35	NC_012030	TTGG	2	8	11878	11885	0 %	50 %	50 %	0 %	222481162
36	NC_012030	GGTT	2	8	11894	11901	0 %	50 %	50 %	0 %	222481162
37	NC_012030	CACC	2	8	12624	12631	25 %	0 %	0 %	75 %	222481162
38	NC_012030	GTTG	2	8	12993	13000	0 %	50 %	50 %	0 %	222481162
39	NC_012030	ATCT	2	8	13394	13401	25 %	50 %	0 %	25 %	222481163
40	NC_012030	GGCG	2	8	13437	13444	0 %	0 %	75 %	25 %	222481163
41	NC_012030	GTCG	2	8	13542	13549	0 %	25 %	50 %	25 %	222481163
42	NC_012030	ACTC	2	8	13967	13974	25 %	25 %	0 %	50 %	222481163
43	NC_012030	GCAA	2	8	14293	14300	50 %	0 %	25 %	25 %	222481163
44	NC_012030	GCCA	2	8	14398	14405	25 %	0 %	25 %	50 %	222481163
45	NC_012030	CGAC	2	8	15750	15757	25 %	0 %	25 %	50 %	222481164
46	NC_012030	CGAC	2	8	16369	16376	25 %	0 %	25 %	50 %	222481165
47	NC_012030	TCGT	2	8	16557	16564	0 %	50 %	25 %	25 %	222481166
48	NC_012030	CAGC	2	8	18247	18254	25 %	0 %	25 %	50 %	222481168
49	NC_012030	TCGC	2	8	18282	18289	0 %	25 %	25 %	50 %	222481168
50	NC_012030	TCGA	2	8	19408	19415	25 %	25 %	25 %	25 %	222481169
51	NC_012030	AGCA	2	8	19683	19690	50 %	0 %	25 %	25 %	222481169
52	NC_012030	CGAA	2	8	19964	19971	50 %	0 %	25 %	25 %	222481169
53	NC_012030	CACG	2	8	20028	20035	25 %	0 %	25 %	50 %	222481169
54	NC_012030	TTCC	2	8	20564	20571	0 %	50 %	0 %	50 %	222481170
55	NC_012030	GACC	2	8	21641	21648	25 %	0 %	25 %	50 %	222481172
56	NC_012030	GTTG	2	8	22617	22624	0 %	50 %	50 %	0 %	222481172
57	NC_012030	CTCG	2	8	23004	23011	0 %	25 %	25 %	50 %	222481172
58	NC_012030	TCGC	2	8	23077	23084	0 %	25 %	25 %	50 %	222481172
59	NC_012030	GGCG	2	8	23310	23317	0 %	0 %	75 %	25 %	222481172
60	NC_012030	ACTT	2	8	23545	23552	25 %	50 %	0 %	25 %	222481172
61	NC_012030	TATT	2	8	23600	23607	25 %	75 %	0 %	0 %	222481172
62	NC_012030	GGAT	2	8	24210	24217	25 %	25 %	50 %	0 %	222481172
63	NC_012030	ATGG	2	8	24319	24326	25 %	25 %	50 %	0 %	222481172
64	NC_012030	TCTG	2	8	24819	24826	0 %	50 %	25 %	25 %	222481172
65	NC_012030	GATC	2	8	24970	24977	25 %	25 %	25 %	25 %	222481172
66	NC_012030	ACTC	2	8	25196	25203	25 %	25 %	0 %	50 %	222481172
67	NC_012030	CTAA	2	8	25300	25307	50 %	25 %	0 %	25 %	222481172
68	NC_012030	TGAC	2	8	25405	25412	25 %	25 %	25 %	25 %	222481172
69	NC_012030	CCCA	2	8	25963	25970	25 %	0 %	0 %	75 %	222481173
70	NC_012030	ACGA	2	8	26031	26038	50 %	0 %	25 %	25 %	222481173
71	NC_012030	ATCG	2	8	26850	26857	25 %	25 %	25 %	25 %	222481173
72	NC_012030	GATC	2	8	27122	27129	25 %	25 %	25 %	25 %	222481173
73	NC_012030	GAAC	2	8	27162	27169	50 %	0 %	25 %	25 %	222481173
74	NC_012030	TCGG	2	8	27283	27290	0 %	25 %	50 %	25 %	222481173
75	NC_012030	TCTG	2	8	27760	27767	0 %	50 %	25 %	25 %	222481173
76	NC_012030	CGAC	2	8	27995	28002	25 %	0 %	25 %	50 %	222481173
77	NC_012030	ACGA	2	8	28589	28596	50 %	0 %	25 %	25 %	222481174
78	NC_012030	TCAA	2	8	29113	29120	50 %	25 %	0 %	25 %	222481175
79	NC_012030	AGGG	2	8	29560	29567	25 %	0 %	75 %	0 %	222481175
80	NC_012030	CGTG	2	8	29729	29736	0 %	25 %	50 %	25 %	222481175
81	NC_012030	TTCG	2	8	29961	29968	0 %	50 %	25 %	25 %	222481175
82	NC_012030	TCCT	2	8	30009	30016	0 %	50 %	0 %	50 %	222481175
83	NC_012030	TTCG	2	8	30126	30133	0 %	50 %	25 %	25 %	222481175
84	NC_012030	CTTG	2	8	30701	30708	0 %	50 %	25 %	25 %	222481175
85	NC_012030	ATGA	2	8	30730	30737	50 %	25 %	25 %	0 %	222481175
86	NC_012030	CGAC	2	8	31769	31776	25 %	0 %	25 %	50 %	222481177
87	NC_012030	TGGA	2	8	31794	31801	25 %	25 %	50 %	0 %	222481177
88	NC_012030	CAAG	2	8	32627	32634	50 %	0 %	25 %	25 %	222481178
89	NC_012030	TCCA	2	8	33098	33105	25 %	25 %	0 %	50 %	222481179
90	NC_012030	GGTC	2	8	33371	33378	0 %	25 %	50 %	25 %	222481179
91	NC_012030	AGAT	2	8	33968	33975	50 %	25 %	25 %	0 %	222481180
92	NC_012030	CCAG	2	8	34337	34344	25 %	0 %	25 %	50 %	222481180
93	NC_012030	GTCT	2	8	35781	35788	0 %	50 %	25 %	25 %	222481181
94	NC_012030	GTAA	2	8	36172	36179	50 %	25 %	25 %	0 %	222481182
95	NC_012030	GGCT	2	8	36902	36909	0 %	25 %	50 %	25 %	222481183
96	NC_012030	CTTG	2	8	37514	37521	0 %	50 %	25 %	25 %	222481184
97	NC_012030	TGAG	2	8	38287	38294	25 %	25 %	50 %	0 %	222481185
98	NC_012030	CGCC	2	8	39819	39826	0 %	0 %	25 %	75 %	222481186
99	NC_012030	GTAC	2	8	40088	40095	25 %	25 %	25 %	25 %	222481186
100	NC_012030	CAAC	2	8	42526	42533	50 %	0 %	0 %	50 %	222481187
101	NC_012030	GGTC	2	8	42646	42653	0 %	25 %	50 %	25 %	222481187
102	NC_012030	ATCA	2	8	42854	42861	50 %	25 %	0 %	25 %	222481187
103	NC_012030	CTGG	2	8	42874	42881	0 %	25 %	50 %	25 %	222481187
104	NC_012030	CGGT	2	8	43080	43087	0 %	25 %	50 %	25 %	222481187
105	NC_012030	GATG	2	8	44549	44556	25 %	25 %	50 %	0 %	222481188
106	NC_012030	CGAC	2	8	46020	46027	25 %	0 %	25 %	50 %	222481190
107	NC_012030	GGAC	2	8	46209	46216	25 %	0 %	50 %	25 %	222481190
108	NC_012030	GCAA	2	8	46783	46790	50 %	0 %	25 %	25 %	222481190
109	NC_012030	AGGC	2	8	47199	47206	25 %	0 %	50 %	25 %	222481190
110	NC_012030	GTCC	2	8	47287	47294	0 %	25 %	25 %	50 %	222481190
111	NC_012030	TCGC	2	8	47502	47509	0 %	25 %	25 %	50 %	222481190
112	NC_012030	CAGT	2	8	47525	47532	25 %	25 %	25 %	25 %	222481190
113	NC_012030	GGTT	2	8	47895	47902	0 %	50 %	50 %	0 %	222481190
114	NC_012030	CCGA	2	8	48224	48231	25 %	0 %	25 %	50 %	222481190
115	NC_012030	GTTT	2	8	49129	49136	0 %	75 %	25 %	0 %	222481191
116	NC_012030	TACG	2	8	49163	49170	25 %	25 %	25 %	25 %	222481191
117	NC_012030	CTGT	2	8	49807	49814	0 %	50 %	25 %	25 %	222481192
118	NC_012030	GTCA	2	8	50549	50556	25 %	25 %	25 %	25 %	222481194
119	NC_012030	TCGG	2	8	50841	50848	0 %	25 %	50 %	25 %	222481194
120	NC_012030	CCAG	2	8	52033	52040	25 %	0 %	25 %	50 %	222481196
121	NC_012030	GGTC	2	8	53090	53097	0 %	25 %	50 %	25 %	222481197
122	NC_012030	AGTG	2	8	53340	53347	25 %	25 %	50 %	0 %	222481197
123	NC_012030	AACT	2	8	56361	56368	50 %	25 %	0 %	25 %	222481198
124	NC_012030	GATC	2	8	56632	56639	25 %	25 %	25 %	25 %	222481198
125	NC_012030	GACT	2	8	56642	56649	25 %	25 %	25 %	25 %	222481198
126	NC_012030	TCAA	2	8	57112	57119	50 %	25 %	0 %	25 %	222481199
127	NC_012030	CGCC	2	8	57591	57598	0 %	0 %	25 %	75 %	222481200
128	NC_012030	GTAC	2	8	57860	57867	25 %	25 %	25 %	25 %	222481200
129	NC_012030	GGAG	2	8	59709	59716	25 %	0 %	75 %	0 %	222481201
130	NC_012030	CGGA	2	8	59731	59738	25 %	0 %	50 %	25 %	222481201
131	NC_012030	TGTT	2	8	60056	60063	0 %	75 %	25 %	0 %	222481202
132	NC_012030	GACC	2	8	61388	61395	25 %	0 %	25 %	50 %	222481203
133	NC_012030	ACGA	2	8	61716	61723	50 %	0 %	25 %	25 %	222481203
134	NC_012030	CGTG	2	8	62045	62052	0 %	25 %	50 %	25 %	222481203
135	NC_012030	TAAC	2	8	62435	62442	50 %	25 %	0 %	25 %	222481203
136	NC_012030	CGCT	2	8	62802	62809	0 %	25 %	25 %	50 %	222481204
137	NC_012030	CGAG	2	8	62853	62860	25 %	0 %	50 %	25 %	222481204
138	NC_012030	GGCG	2	8	63141	63148	0 %	0 %	75 %	25 %	222481204
139	NC_012030	AATA	2	8	63303	63310	75 %	25 %	0 %	0 %	222481204
140	NC_012030	TGAA	2	8	63402	63409	50 %	25 %	25 %	0 %	222481204
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