MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 plasmid pHLAC01

Total Repeats: 7124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_012030	TCG	3	9	160662	160670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481283
2502	NC_012030	ACG	2	6	161554	161559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481284
2503	NC_012030	CT	3	6	161662	161667	0 %	50 %	0 %	50 %	222481284
2504	NC_012030	CAG	2	6	161681	161686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481284
2505	NC_012030	AGA	2	6	161733	161738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222481284
2506	NC_012030	GCT	2	6	161766	161771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481284
2507	NC_012030	TCT	2	6	161775	161780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481284
2508	NC_012030	CAG	2	6	161801	161806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481284
2509	NC_012030	AAC	2	6	161816	161821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222481284
2510	NC_012030	ACG	2	6	161831	161836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481284
2511	NC_012030	ACG	2	6	162010	162015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481285
2512	NC_012030	TGG	2	6	162062	162067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222481285
2513	NC_012030	GAC	2	6	162152	162157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481285
2514	NC_012030	GTT	2	6	162204	162209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222481285
2515	NC_012030	ACG	2	6	162298	162303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481285
2516	NC_012030	TTC	2	6	162305	162310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481285
2517	NC_012030	CAG	2	6	162316	162321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481285
2518	NC_012030	ACG	2	6	162325	162330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481285
2519	NC_012030	CGG	2	6	162356	162361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481285
2520	NC_012030	GGC	2	6	162383	162388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481285
2521	NC_012030	TTGG	2	8	162477	162484	0 %	50 %	50 %	0 %	222481285
2522	NC_012030	GGC	2	6	162509	162514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481285
2523	NC_012030	ACG	2	6	162523	162528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481285
2524	NC_012030	GTC	2	6	162594	162599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481285
2525	NC_012030	GTC	2	6	162621	162626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481285
2526	NC_012030	ACG	2	6	162631	162636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481285
2527	NC_012030	GAC	2	6	162680	162685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481285
2528	NC_012030	CTA	2	6	162694	162699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481285
2529	NC_012030	GGAT	2	8	162761	162768	25 %	25 %	50 %	0 %	222481285
2530	NC_012030	GACTG	2	10	162888	162897	20 %	20 %	40 %	20 %	222481285
2531	NC_012030	GT	3	6	162943	162948	0 %	50 %	50 %	0 %	222481285
2532	NC_012030	CTGA	2	8	162984	162991	25 %	25 %	25 %	25 %	222481285
2533	NC_012030	GTG	2	6	163001	163006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222481285
2534	NC_012030	AG	3	6	163060	163065	50 %	0 %	50 %	0 %	222481285
2535	NC_012030	AAT	2	6	163135	163140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222481285
2536	NC_012030	GTT	2	6	163350	163355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222481286
2537	NC_012030	CGA	2	6	163400	163405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481286
2538	NC_012030	GCA	2	6	163476	163481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481286
2539	NC_012030	TGA	2	6	163529	163534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481286
2540	NC_012030	GGA	2	6	163688	163693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481286
2541	NC_012030	TCC	2	6	163759	163764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481286
2542	NC_012030	GGT	2	6	163794	163799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222481286
2543	NC_012030	CTG	3	9	163819	163827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481286
2544	NC_012030	TTG	2	6	163837	163842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222481286
2545	NC_012030	GAT	2	6	163851	163856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481286
2546	NC_012030	GAT	2	6	164092	164097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481287
2547	NC_012030	CCGA	2	8	164119	164126	25 %	0 %	25 %	50 %	222481287
2548	NC_012030	CGC	2	6	164164	164169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481287
2549	NC_012030	A	6	6	164203	164208	100 %	0 %	0 %	0 %	222481287
2550	NC_012030	CGAC	2	8	164210	164217	25 %	0 %	25 %	50 %	222481287
2551	NC_012030	CTC	2	6	164425	164430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481287
2552	NC_012030	CAA	2	6	164436	164441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222481287
2553	NC_012030	CAC	2	6	164485	164490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222481287
2554	NC_012030	GA	3	6	164553	164558	50 %	0 %	50 %	0 %	222481287
2555	NC_012030	CT	3	6	164605	164610	0 %	50 %	0 %	50 %	222481287
2556	NC_012030	TCG	2	6	164621	164626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481287
2557	NC_012030	GAT	2	6	164689	164694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481287
2558	NC_012030	CCAGAT	2	12	164701	164712	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222481287
2559	NC_012030	TTG	2	6	164778	164783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222481287
2560	NC_012030	TGA	2	6	164802	164807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481287
2561	NC_012030	AGT	2	6	164826	164831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481287
2562	NC_012030	CAT	2	6	164886	164891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481287
2563	NC_012030	CGA	2	6	164901	164906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481287
2564	NC_012030	TCA	2	6	164909	164914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481287
2565	NC_012030	CTC	2	6	164962	164967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481287
2566	NC_012030	TGG	2	6	165077	165082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222481288
2567	NC_012030	AGCT	2	8	165104	165111	25 %	25 %	25 %	25 %	222481288
2568	NC_012030	GT	3	6	165134	165139	0 %	50 %	50 %	0 %	222481288
2569	NC_012030	CT	3	6	165252	165257	0 %	50 %	0 %	50 %	222481288
2570	NC_012030	GTC	2	6	165416	165421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481288
2571	NC_012030	AGG	2	6	165500	165505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481288
2572	NC_012030	GCT	2	6	165532	165537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481288
2573	NC_012030	GTT	2	6	165550	165555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222481288
2574	NC_012030	CTCC	2	8	165564	165571	0 %	25 %	0 %	75 %	222481288
2575	NC_012030	AGCT	2	8	165623	165630	25 %	25 %	25 %	25 %	222481288
2576	NC_012030	GCTT	2	8	165731	165738	0 %	50 %	25 %	25 %	222481288
2577	NC_012030	AGC	3	9	165749	165757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481288
2578	NC_012030	TCG	2	6	165774	165779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481288
2579	NC_012030	A	6	6	165824	165829	100 %	0 %	0 %	0 %	222481288
2580	NC_012030	TCT	2	6	165930	165935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481288
2581	NC_012030	TC	3	6	166012	166017	0 %	50 %	0 %	50 %	222481288
2582	NC_012030	GCT	2	6	166020	166025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481288
2583	NC_012030	TCG	2	6	166251	166256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481289
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2585	NC_012030	TCG	2	6	166340	166345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481289
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2587	NC_012030	CGA	2	6	166374	166379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481289
2588	NC_012030	TGT	2	6	166390	166395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222481289
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2590	NC_012030	TGA	2	6	166470	166475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481290
2591	NC_012030	TCG	2	6	166502	166507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481290
2592	NC_012030	CGTG	2	8	166559	166566	0 %	25 %	50 %	25 %	222481290
2593	NC_012030	CGT	2	6	166614	166619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481290
2594	NC_012030	GTTC	2	8	166622	166629	0 %	50 %	25 %	25 %	222481290
2595	NC_012030	ACTCC	2	10	166631	166640	20 %	20 %	0 %	60 %	222481290
2596	NC_012030	CGTCT	2	10	166651	166660	0 %	40 %	20 %	40 %	222481290
2597	NC_012030	TCG	2	6	166697	166702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481290
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2599	NC_012030	CAG	2	6	166789	166794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481290
2600	NC_012030	GCTT	2	8	166901	166908	0 %	50 %	25 %	25 %	222481290
2601	NC_012030	AGCCGT	2	12	166965	166976	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222481290
2602	NC_012030	GTA	2	6	166978	166983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481290
2603	NC_012030	CGG	2	6	166989	166994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481290
2604	NC_012030	CGG	2	6	167025	167030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481290
2605	NC_012030	GGC	2	6	167089	167094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481290
2606	NC_012030	CGA	2	6	167100	167105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481290
2607	NC_012030	TCG	2	6	167120	167125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481290
2608	NC_012030	ACG	2	6	167126	167131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481290
2609	NC_012030	TC	3	6	167165	167170	0 %	50 %	0 %	50 %	222481290
2610	NC_012030	CGG	2	6	167173	167178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481290
2611	NC_012030	TCGA	2	8	167179	167186	25 %	25 %	25 %	25 %	222481290
2612	NC_012030	GAC	2	6	167203	167208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481290
2613	NC_012030	GTA	2	6	167257	167262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481290
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2615	NC_012030	TGA	2	6	167297	167302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481290
2616	NC_012030	TTC	2	6	167344	167349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481290
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2618	NC_012030	GAA	2	6	167407	167412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222481290
2619	NC_012030	TCG	2	6	167414	167419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481290
2620	NC_012030	TGG	2	6	168172	168177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222481291
2621	NC_012030	CT	3	6	168178	168183	0 %	50 %	0 %	50 %	222481291
2622	NC_012030	GTC	2	6	168192	168197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481291
2623	NC_012030	TCG	2	6	168493	168498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481292
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2632	NC_012030	TCG	2	6	168781	168786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481292
2633	NC_012030	CTC	2	6	168855	168860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481292
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2653	NC_012030	GTCT	2	8	169736	169743	0 %	50 %	25 %	25 %	222481293
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2724	NC_012030	GACC	2	8	174662	174669	25 %	0 %	25 %	50 %	222481301
2725	NC_012030	TTC	2	6	174829	174834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481302
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2727	NC_012030	TCT	2	6	174890	174895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481302
2728	NC_012030	ATC	3	9	174955	174963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481302
2729	NC_012030	TCG	2	6	175007	175012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481302
2730	NC_012030	TC	3	6	175027	175032	0 %	50 %	0 %	50 %	222481302
2731	NC_012030	ACG	2	6	175070	175075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481302
2732	NC_012030	GTCG	2	8	175137	175144	0 %	25 %	50 %	25 %	222481302
2733	NC_012030	TTG	2	6	175185	175190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222481302
2734	NC_012030	ACG	2	6	175215	175220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481302
2735	NC_012030	CGT	2	6	175224	175229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481302
2736	NC_012030	AGA	2	6	175297	175302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222481302
2737	NC_012030	T	6	6	175480	175485	0 %	100 %	0 %	0 %	222481302
2738	NC_012030	CTT	2	6	175498	175503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481302
2739	NC_012030	CGA	2	6	175549	175554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481302
2740	NC_012030	A	6	6	175598	175603	100 %	0 %	0 %	0 %	222481302
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2742	NC_012030	TGA	2	6	175644	175649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481302
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2744	NC_012030	GAT	2	6	175710	175715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481302
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2746	NC_012030	TGCT	2	8	175756	175763	0 %	50 %	25 %	25 %	222481302
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2863	NC_012030	CCA	2	6	183593	183598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222481309
2864	NC_012030	CTG	2	6	183618	183623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481309
2865	NC_012030	ATGT	2	8	183652	183659	25 %	50 %	25 %	0 %	222481309
2866	NC_012030	TCG	2	6	183676	183681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481309
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2892	NC_012030	CCT	2	6	184768	184773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481310
2893	NC_012030	GAC	2	6	184843	184848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481310
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2934	NC_012030	AG	3	6	187367	187372	50 %	0 %	50 %	0 %	222481310
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2974	NC_012030	TCGT	2	8	190016	190023	0 %	50 %	25 %	25 %	222481311
2975	NC_012030	ACG	3	9	190138	190146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481311
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2979	NC_012030	GCCC	2	8	190231	190238	0 %	0 %	25 %	75 %	222481311
2980	NC_012030	CGG	2	6	190240	190245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481311
2981	NC_012030	GGCG	2	8	190246	190253	0 %	0 %	75 %	25 %	222481311
2982	NC_012030	GAG	2	6	190264	190269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481311
2983	NC_012030	CGC	2	6	190324	190329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481311
2984	NC_012030	AGC	2	6	190517	190522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481312
2985	NC_012030	GCA	2	6	190573	190578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481312
2986	NC_012030	GAA	2	6	190620	190625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222481312
2987	NC_012030	GAA	2	6	190652	190657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222481312
2988	NC_012030	CCA	2	6	190735	190740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222481312
2989	NC_012030	ATT	2	6	190746	190751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222481312
2990	NC_012030	AC	3	6	190759	190764	50 %	0 %	0 %	50 %	222481312
2991	NC_012030	GTG	2	6	190840	190845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222481312
2992	NC_012030	GCA	2	6	190987	190992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481312
2993	NC_012030	ACGA	2	8	191025	191032	50 %	0 %	25 %	25 %	222481312
2994	NC_012030	ACG	2	6	191038	191043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481312
2995	NC_012030	AC	3	6	191082	191087	50 %	0 %	0 %	50 %	222481312
2996	NC_012030	TCGG	2	8	191117	191124	0 %	25 %	50 %	25 %	222481312
2997	NC_012030	ATG	2	6	191125	191130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481312
2998	NC_012030	CAT	2	6	191135	191140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481312
2999	NC_012030	TCC	2	6	191248	191253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481312
3000	NC_012030	ATC	2	6	191403	191408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481312

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