MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 plasmid pHLAC01

Total Repeats: 7124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012030	GAG	2	6	266415	266420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481388
4502	NC_012030	AGCCG	2	10	266423	266432	20 %	0 %	40 %	40 %	222481388
4503	NC_012030	ACGA	2	8	266445	266452	50 %	0 %	25 %	25 %	222481388
4504	NC_012030	GGC	2	6	266480	266485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481388
4505	NC_012030	CAC	2	6	266490	266495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222481388
4506	NC_012030	GAA	2	6	266498	266503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222481388
4507	NC_012030	TCT	3	9	266512	266520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481388
4508	NC_012030	CGT	2	6	266561	266566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481388
4509	NC_012030	TTC	3	9	266622	266630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481388
4510	NC_012030	CGA	2	6	266639	266644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481388
4511	NC_012030	CAT	2	6	266747	266752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481389
4512	NC_012030	AGG	2	6	266773	266778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481389
4513	NC_012030	CGA	2	6	266786	266791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481389
4514	NC_012030	AAC	2	6	266815	266820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222481389
4515	NC_012030	TGGC	2	8	266832	266839	0 %	25 %	50 %	25 %	222481389
4516	NC_012030	CTC	2	6	266859	266864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481389
4517	NC_012030	GGA	2	6	266882	266887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481389
4518	NC_012030	TC	3	6	266966	266971	0 %	50 %	0 %	50 %	222481389
4519	NC_012030	GAC	2	6	266987	266992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481389
4520	NC_012030	CGATGC	2	12	267011	267022	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222481389
4521	NC_012030	CTA	2	6	267041	267046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481389
4522	NC_012030	CGG	2	6	267083	267088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481389
4523	NC_012030	CGT	2	6	267104	267109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481389
4524	NC_012030	CT	3	6	267114	267119	0 %	50 %	0 %	50 %	222481389
4525	NC_012030	GAC	2	6	267133	267138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481389
4526	NC_012030	A	7	7	267229	267235	100 %	0 %	0 %	0 %	222481389
4527	NC_012030	GAA	2	6	267288	267293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222481389
4528	NC_012030	CGTC	2	8	267439	267446	0 %	25 %	25 %	50 %	222481389
4529	NC_012030	TCG	2	6	267448	267453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481389
4530	NC_012030	AGG	2	6	267469	267474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481389
4531	NC_012030	TGT	2	6	267485	267490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222481389
4532	NC_012030	GTC	2	6	269305	269310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481390
4533	NC_012030	CTC	2	6	269312	269317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481390
4534	NC_012030	CGTCGA	2	12	269339	269350	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222481390
4535	NC_012030	CGA	2	6	269354	269359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481390
4536	NC_012030	GAC	2	6	269418	269423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481390
4537	NC_012030	CGG	2	6	269426	269431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481390
4538	NC_012030	TCGC	2	8	269433	269440	0 %	25 %	25 %	50 %	222481390
4539	NC_012030	CCT	3	9	269453	269461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481390
4540	NC_012030	CA	3	6	269573	269578	50 %	0 %	0 %	50 %	222481391
4541	NC_012030	ACC	2	6	269588	269593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222481391
4542	NC_012030	GTT	2	6	269653	269658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222481391
4543	NC_012030	GTGG	2	8	269698	269705	0 %	25 %	75 %	0 %	222481391
4544	NC_012030	CCG	2	6	269721	269726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481391
4545	NC_012030	TCG	2	6	269796	269801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481391
4546	NC_012030	AAGTC	2	10	269805	269814	40 %	20 %	20 %	20 %	222481391
4547	NC_012030	GGA	2	6	269824	269829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481391
4548	NC_012030	GTC	2	6	269873	269878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481391
4549	NC_012030	CGA	2	6	269920	269925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481391
4550	NC_012030	GTC	2	6	269945	269950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481391
4551	NC_012030	GAC	2	6	269960	269965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481391
4552	NC_012030	CGC	2	6	269980	269985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481391
4553	NC_012030	GAC	2	6	269996	270001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481391
4554	NC_012030	GTC	2	6	270008	270013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481391
4555	NC_012030	GCGCT	2	10	270052	270061	0 %	20 %	40 %	40 %	222481391
4556	NC_012030	CCGT	2	8	270063	270070	0 %	25 %	25 %	50 %	222481391
4557	NC_012030	GTG	2	6	270220	270225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222481391
4558	NC_012030	AGG	2	6	270268	270273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481391
4559	NC_012030	CGG	2	6	270337	270342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481391
4560	NC_012030	TCT	2	6	270358	270363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481391
4561	NC_012030	CGC	2	6	270364	270369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481391
4562	NC_012030	CGAC	2	8	270403	270410	25 %	0 %	25 %	50 %	222481391
4563	NC_012030	CGC	2	6	270431	270436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481391
4564	NC_012030	CTGGT	2	10	270447	270456	0 %	40 %	40 %	20 %	222481391
4565	NC_012030	GCTG	2	8	270463	270470	0 %	25 %	50 %	25 %	222481391
4566	NC_012030	ATG	2	6	270510	270515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481391
4567	NC_012030	CGT	2	6	270571	270576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481391
4568	NC_012030	CGT	2	6	270592	270597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481391
4569	NC_012030	CGCC	2	8	270610	270617	0 %	0 %	25 %	75 %	222481391
4570	NC_012030	TCG	2	6	270793	270798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481392
4571	NC_012030	GAC	2	6	270810	270815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481392
4572	NC_012030	CGG	2	6	270827	270832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481392
4573	NC_012030	ATCGAT	2	12	271065	271076	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	222481392
4574	NC_012030	CGA	2	6	271178	271183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481392
4575	NC_012030	GACT	2	8	271208	271215	25 %	25 %	25 %	25 %	222481392
4576	NC_012030	CTC	2	6	271305	271310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481393
4577	NC_012030	TGG	2	6	271347	271352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222481393
4578	NC_012030	TCG	2	6	271381	271386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481393
4579	NC_012030	GT	3	6	271404	271409	0 %	50 %	50 %	0 %	222481393
4580	NC_012030	CGA	2	6	271454	271459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481393
4581	NC_012030	GTC	2	6	271464	271469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481393
4582	NC_012030	CTT	2	6	271514	271519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222481393
4583	NC_012030	GTC	2	6	271641	271646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481393
4584	NC_012030	CCAT	2	8	271680	271687	25 %	25 %	0 %	50 %	222481393
4585	NC_012030	GGAC	2	8	271801	271808	25 %	0 %	50 %	25 %	222481394
4586	NC_012030	GAT	2	6	271857	271862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481394
4587	NC_012030	GGA	2	6	271868	271873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481394
4588	NC_012030	CCGAGT	2	12	271882	271893	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222481394
4589	NC_012030	TCC	2	6	271927	271932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481394
4590	NC_012030	CGA	2	6	271964	271969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481394
4591	NC_012030	GAC	3	9	271980	271988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481394
4592	NC_012030	CAG	2	6	272019	272024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481394
4593	NC_012030	AGA	2	6	272036	272041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222481394
4594	NC_012030	GAT	2	6	272130	272135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481394
4595	NC_012030	CGG	2	6	272151	272156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481394
4596	NC_012030	TG	3	6	272195	272200	0 %	50 %	50 %	0 %	222481394
4597	NC_012030	CGA	2	6	272240	272245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481394
4598	NC_012030	GTC	2	6	272272	272277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481394
4599	NC_012030	ATG	3	9	272326	272334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481394
4600	NC_012030	CCA	2	6	272341	272346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222481394
4601	NC_012030	ACG	2	6	272363	272368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481394
4602	NC_012030	CTG	2	6	272373	272378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481394
4603	NC_012030	TGA	2	6	272405	272410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481394
4604	NC_012030	AGT	2	6	272428	272433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481394
4605	NC_012030	CGG	2	6	272464	272469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481394
4606	NC_012030	CGA	2	6	272567	272572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481394
4607	NC_012030	CCA	2	6	272694	272699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222481394
4608	NC_012030	CCA	2	6	272893	272898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222481394
4609	NC_012030	GGC	2	6	272922	272927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222481394
4610	NC_012030	TCA	2	6	272954	272959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481394
4611	NC_012030	GTC	2	6	272980	272985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481394
4612	NC_012030	AGC	2	6	273075	273080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481394
4613	NC_012030	TGA	2	6	273098	273103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481394
4614	NC_012030	ACG	2	6	273104	273109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481394
4615	NC_012030	CCG	2	6	273115	273120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481394
4616	NC_012030	CAGC	2	8	273137	273144	25 %	0 %	25 %	50 %	222481394
4617	NC_012030	GAC	2	6	273156	273161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481394
4618	NC_012030	ACG	2	6	273231	273236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481394
4619	NC_012030	G	6	6	273236	273241	0 %	0 %	100 %	0 %	222481394
4620	NC_012030	TGA	2	6	273320	273325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481394
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4622	NC_012030	CTG	2	6	273387	273392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481394
4623	NC_012030	AG	3	6	273613	273618	50 %	0 %	50 %	0 %	222481394
4624	NC_012030	AGA	3	9	273632	273640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222481394
4625	NC_012030	T	6	6	273680	273685	0 %	100 %	0 %	0 %	222481394
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4630	NC_012030	GTA	2	6	273872	273877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222481395
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4632	NC_012030	GTC	3	9	274022	274030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481395
4633	NC_012030	ACGT	2	8	274131	274138	25 %	25 %	25 %	25 %	222481395
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4650	NC_012030	CTG	2	6	275389	275394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481396
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4654	NC_012030	CT	3	6	275539	275544	0 %	50 %	0 %	50 %	222481396
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4850	NC_012030	CGA	2	6	285279	285284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481405
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4859	NC_012030	TCAAC	2	10	285666	285675	40 %	20 %	0 %	40 %	222481405
4860	NC_012030	TTCG	2	8	285698	285705	0 %	50 %	25 %	25 %	222481405
4861	NC_012030	TGG	2	6	285716	285721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222481405
4862	NC_012030	GAA	2	6	286196	286201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222481406
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4864	NC_012030	TCC	2	6	286227	286232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222481406
4865	NC_012030	TGAG	2	8	286239	286246	25 %	25 %	50 %	0 %	222481406
4866	NC_012030	CGAC	2	8	286333	286340	25 %	0 %	25 %	50 %	222481406
4867	NC_012030	CCG	2	6	286345	286350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481406
4868	NC_012030	ACGCCT	2	12	286356	286367	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222481406
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4872	NC_012030	TCG	2	6	286500	286505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481406
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4881	NC_012030	CCGTC	2	10	287308	287317	0 %	20 %	20 %	60 %	222481407
4882	NC_012030	CCG	2	6	287335	287340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481407
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4889	NC_012030	TCG	2	6	287577	287582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481407
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4962	NC_012030	GC	3	6	292177	292182	0 %	0 %	50 %	50 %	222481412
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4966	NC_012030	GAACAC	2	12	292370	292381	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	222481412
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4969	NC_012030	ATC	2	6	292490	292495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481412
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4977	NC_012030	GAAC	2	8	292796	292803	50 %	0 %	25 %	25 %	222481412
4978	NC_012030	CGA	2	6	292849	292854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481412
4979	NC_012030	CCGA	2	8	292868	292875	25 %	0 %	25 %	50 %	222481412
4980	NC_012030	CGT	2	6	292916	292921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481412
4981	NC_012030	A	6	6	292979	292984	100 %	0 %	0 %	0 %	222481412
4982	NC_012030	ATA	2	6	293036	293041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222481412
4983	NC_012030	CGTT	2	8	293050	293057	0 %	50 %	25 %	25 %	222481412
4984	NC_012030	TTCC	2	8	293260	293267	0 %	50 %	0 %	50 %	222481413
4985	NC_012030	CCA	2	6	293294	293299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222481413
4986	NC_012030	CCG	2	6	293345	293350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481413
4987	NC_012030	TCCC	2	8	293423	293430	0 %	25 %	0 %	75 %	222481413
4988	NC_012030	GTCA	2	8	293453	293460	25 %	25 %	25 %	25 %	222481413
4989	NC_012030	CAT	2	6	293593	293598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481413
4990	NC_012030	TCCAT	2	10	293601	293610	20 %	40 %	0 %	40 %	222481413
4991	NC_012030	CAG	2	6	293612	293617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481413
4992	NC_012030	CTGCA	2	10	293633	293642	20 %	20 %	20 %	40 %	222481413
4993	NC_012030	ACT	2	6	293711	293716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222481413
4994	NC_012030	ACC	2	6	293730	293735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222481413
4995	NC_012030	GAG	2	6	293739	293744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222481413
4996	NC_012030	TC	3	6	293746	293751	0 %	50 %	0 %	50 %	222481413
4997	NC_012030	CGA	2	6	293767	293772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481413
4998	NC_012030	TCG	2	6	293792	293797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222481413
4999	NC_012030	GAC	3	9	293804	293812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222481413
5000	NC_012030	CCG	2	6	293895	293900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222481413

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