MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 51491

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012029	ACA	2	6	823	828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222478440
2	NC_012029	CGA	2	6	884	889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478440
3	NC_012029	CGA	2	6	905	910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478440
4	NC_012029	CGA	2	6	928	933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478440
5	NC_012029	GCG	2	6	1003	1008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478440
6	NC_012029	CTC	2	6	1019	1024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478440
7	NC_012029	GTC	2	6	1047	1052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478440
8	NC_012029	CGA	5	15	1055	1069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478440
9	NC_012029	CGA	2	6	1085	1090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478440
10	NC_012029	TCC	2	6	1129	1134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478440
11	NC_012029	CCT	2	6	1138	1143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478440
12	NC_012029	CGA	2	6	1192	1197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478440
13	NC_012029	ACG	2	6	1321	1326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478440
14	NC_012029	GAA	2	6	1412	1417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222478440
15	NC_012029	GCC	3	9	1467	1475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478440
16	NC_012029	GCC	2	6	1485	1490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478440
17	NC_012029	CGA	2	6	1517	1522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478440
18	NC_012029	CGA	2	6	1538	1543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478440
19	NC_012029	GGA	2	6	1568	1573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478440
20	NC_012029	CTT	2	6	1616	1621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478440
21	NC_012029	GTT	2	6	1650	1655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222478440
22	NC_012029	CGA	2	6	1664	1669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478440
23	NC_012029	GAC	2	6	1698	1703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478440
24	NC_012029	ACG	2	6	1852	1857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478440
25	NC_012029	TCC	2	6	1876	1881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478440
26	NC_012029	GAC	2	6	1923	1928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478440
27	NC_012029	GCG	2	6	1944	1949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478440
28	NC_012029	CGC	2	6	1952	1957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478440
29	NC_012029	TCG	2	6	2038	2043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478440
30	NC_012029	CGT	2	6	2090	2095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478440
31	NC_012029	GAA	2	6	2159	2164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222478440
32	NC_012029	GAG	2	6	2220	2225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478440
33	NC_012029	TCA	2	6	2266	2271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478440
34	NC_012029	CGT	3	9	2303	2311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478440
35	NC_012029	GAG	2	6	2364	2369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478440
36	NC_012029	TCT	2	6	2584	2589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478441
37	NC_012029	ACG	2	6	2652	2657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478441
38	NC_012029	TCG	2	6	2659	2664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478441
39	NC_012029	GTT	2	6	2804	2809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222478441
40	NC_012029	TGA	2	6	2821	2826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478441
41	NC_012029	CGT	2	6	2830	2835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478441
42	NC_012029	CGG	2	6	2869	2874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478441
43	NC_012029	TCG	2	6	2889	2894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478441
44	NC_012029	TCC	2	6	2919	2924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478441
45	NC_012029	GTC	2	6	2958	2963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478441
46	NC_012029	GGT	2	6	2970	2975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478441
47	NC_012029	CAC	2	6	2984	2989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478441
48	NC_012029	CGG	2	6	3161	3166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478441
49	NC_012029	CGC	2	6	3172	3177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478441
50	NC_012029	GAA	2	6	3297	3302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222478441
51	NC_012029	CGC	2	6	3502	3507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478441
52	NC_012029	CGT	2	6	3514	3519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478441
53	NC_012029	CGC	2	6	3520	3525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478441
54	NC_012029	CGT	2	6	3535	3540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478441
55	NC_012029	TCG	2	6	3582	3587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478441
56	NC_012029	CCG	2	6	3588	3593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478441
57	NC_012029	CCG	2	6	3828	3833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478442
58	NC_012029	GTC	2	6	3848	3853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478442
59	NC_012029	GAC	2	6	3866	3871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478442
60	NC_012029	CAC	2	6	3883	3888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478442
61	NC_012029	TCT	2	6	4130	4135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478442
62	NC_012029	CAG	2	6	4228	4233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478442
63	NC_012029	CAC	2	6	4274	4279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478442
64	NC_012029	ACC	2	6	4416	4421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478442
65	NC_012029	CGG	2	6	4450	4455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478442
66	NC_012029	CGC	2	6	4462	4467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478442
67	NC_012029	GAT	2	6	4468	4473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478442
68	NC_012029	CCA	2	6	4497	4502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478442
69	NC_012029	TCG	2	6	4518	4523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478442
70	NC_012029	AGA	2	6	4528	4533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222478442
71	NC_012029	TCG	2	6	4587	4592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478442
72	NC_012029	ATG	2	6	4601	4606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478442
73	NC_012029	GGC	2	6	4708	4713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478442
74	NC_012029	CGA	2	6	4762	4767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478442
75	NC_012029	CTG	2	6	4838	4843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478442
76	NC_012029	TCG	2	6	4905	4910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478442
77	NC_012029	AGG	2	6	4950	4955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478442
78	NC_012029	TGA	2	6	4977	4982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478442
79	NC_012029	ACG	2	6	4995	5000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478442
80	NC_012029	ACG	2	6	5034	5039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478442
81	NC_012029	CAT	2	6	5050	5055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478442
82	NC_012029	ACG	2	6	5064	5069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478442
83	NC_012029	CGA	2	6	5143	5148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478442
84	NC_012029	GAG	2	6	5168	5173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478442
85	NC_012029	ACG	2	6	5184	5189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478442
86	NC_012029	AAG	2	6	5219	5224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222478442
87	NC_012029	CGC	2	6	5235	5240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478442
88	NC_012029	CGG	2	6	5245	5250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478442
89	NC_012029	GGA	2	6	5269	5274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478442
90	NC_012029	TCG	2	6	5640	5645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478443
91	NC_012029	CGA	2	6	5669	5674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478443
92	NC_012029	TCG	2	6	5703	5708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478443
93	NC_012029	CTC	2	6	5744	5749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478443
94	NC_012029	TCG	2	6	5763	5768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478443
95	NC_012029	GTA	2	6	5834	5839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478443
96	NC_012029	CAC	2	6	5846	5851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478443
97	NC_012029	CGA	2	6	5854	5859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478443
98	NC_012029	GCT	2	6	5875	5880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478443
99	NC_012029	CGT	2	6	5926	5931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478443
100	NC_012029	CGT	3	9	6025	6033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478443
101	NC_012029	CTC	2	6	6059	6064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478443
102	NC_012029	GAA	2	6	6101	6106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222478443
103	NC_012029	TCG	2	6	6185	6190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478444
104	NC_012029	CCT	3	9	6234	6242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478444
105	NC_012029	TCC	2	6	6257	6262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478444
106	NC_012029	GCG	2	6	6317	6322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478444
107	NC_012029	CGA	2	6	6327	6332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478444
108	NC_012029	CGA	2	6	6348	6353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478444
109	NC_012029	GCC	2	6	6456	6461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478444
110	NC_012029	GGA	2	6	6624	6629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478444
111	NC_012029	TCG	2	6	6753	6758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478445
112	NC_012029	CTG	2	6	6809	6814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478445
113	NC_012029	GTA	2	6	6848	6853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478445
114	NC_012029	CTC	2	6	6944	6949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478445
115	NC_012029	TCC	2	6	6990	6995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478445
116	NC_012029	TCC	2	6	7005	7010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478445
117	NC_012029	GTC	2	6	7034	7039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478445
118	NC_012029	CGT	2	6	7111	7116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478445
119	NC_012029	CGC	2	6	7397	7402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478446
120	NC_012029	CGA	2	6	7530	7535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478446
121	NC_012029	TCG	3	9	7541	7549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478446
122	NC_012029	GGC	2	6	7730	7735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478446
123	NC_012029	GTG	2	6	7736	7741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478446
124	NC_012029	CCG	2	6	7758	7763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478446
125	NC_012029	CGG	2	6	7776	7781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478446
126	NC_012029	CGG	2	6	7785	7790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478446
127	NC_012029	GAC	2	6	7795	7800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478446
128	NC_012029	GTG	2	6	7828	7833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478446
129	NC_012029	GAC	2	6	7858	7863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478446
130	NC_012029	GTC	2	6	7939	7944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478446
131	NC_012029	GTA	2	6	7945	7950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478446
132	NC_012029	CGG	2	6	7968	7973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478446
133	NC_012029	CGA	2	6	7986	7991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478446
134	NC_012029	CGC	2	6	8076	8081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478446
135	NC_012029	CTC	2	6	8125	8130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478446
136	NC_012029	TCG	2	6	8147	8152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478446
137	NC_012029	TCG	2	6	8243	8248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478446
138	NC_012029	TCG	2	6	8467	8472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478447
139	NC_012029	CTC	2	6	8493	8498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478447
140	NC_012029	GGT	2	6	8513	8518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478447
141	NC_012029	CGA	2	6	8537	8542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478447
142	NC_012029	CGT	2	6	8567	8572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478447
143	NC_012029	CCT	2	6	8582	8587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478447
144	NC_012029	CGC	2	6	8639	8644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478447
145	NC_012029	GAG	2	6	8685	8690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478447
146	NC_012029	CGG	2	6	8762	8767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478447
147	NC_012029	CGC	2	6	8811	8816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478447
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149	NC_012029	ATC	2	6	8874	8879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478447
150	NC_012029	TGA	2	6	8938	8943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478447
151	NC_012029	ACG	2	6	8989	8994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478447
152	NC_012029	TCG	2	6	9007	9012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478447
153	NC_012029	GAA	2	6	9021	9026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222478447
154	NC_012029	GAC	2	6	9039	9044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478447
155	NC_012029	CGG	2	6	9056	9061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478447
156	NC_012029	TCC	2	6	9088	9093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478447
157	NC_012029	CGC	2	6	9102	9107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478447
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159	NC_012029	TCG	2	6	9244	9249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478447
160	NC_012029	GAC	2	6	9252	9257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478447
161	NC_012029	TCG	2	6	9408	9413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478448
162	NC_012029	GTG	2	6	9485	9490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478448
163	NC_012029	TAC	2	6	9503	9508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478448
164	NC_012029	GTC	2	6	9524	9529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478448
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169	NC_012029	GTG	2	6	9814	9819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478448
170	NC_012029	GTC	2	6	9827	9832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478448
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172	NC_012029	GTC	2	6	9977	9982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478448
173	NC_012029	GAG	2	6	10136	10141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478449
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179	NC_012029	CGG	2	6	10535	10540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478450
180	NC_012029	CTG	2	6	10573	10578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478450
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188	NC_012029	GAG	2	6	10907	10912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478450
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235	NC_012029	CCG	2	6	13477	13482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478454
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237	NC_012029	GAG	2	6	13554	13559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478454
238	NC_012029	CGG	2	6	13561	13566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478454
239	NC_012029	ACG	2	6	13594	13599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478454
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241	NC_012029	CGC	2	6	13715	13720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478454
242	NC_012029	TGA	2	6	13741	13746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478454
243	NC_012029	GAG	2	6	13890	13895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478454
244	NC_012029	TCG	2	6	13942	13947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478454
245	NC_012029	CGG	2	6	13956	13961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478454
246	NC_012029	ACC	2	6	13969	13974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478454
247	NC_012029	CGC	2	6	13979	13984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478454
248	NC_012029	TGC	2	6	14011	14016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478454
249	NC_012029	GCT	2	6	14069	14074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478454
250	NC_012029	ATC	2	6	14103	14108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478454
251	NC_012029	CAC	2	6	14489	14494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478455
252	NC_012029	CGT	4	12	14503	14514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478455
253	NC_012029	CGC	2	6	14546	14551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478455
254	NC_012029	CTC	2	6	14567	14572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478455
255	NC_012029	CGA	3	9	14587	14595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478455
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257	NC_012029	TTC	2	6	14652	14657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478455
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377	NC_012029	GTA	2	6	28701	28706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478466
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381	NC_012029	CGA	2	6	28870	28875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478466
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401	NC_012029	CGC	2	6	29510	29515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478467
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498	NC_012029	TCC	2	6	34162	34167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478470
499	NC_012029	AGC	2	6	34375	34380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478470
500	NC_012029	CGA	2	6	34385	34390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478470

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