MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 68328

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_012029	CGGCGA	2	12	130651	130662	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222478562
3002	NC_012029	GCG	2	6	130682	130687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478562
3003	NC_012029	TCGGCG	2	12	130716	130727	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222478562
3004	NC_012029	CGA	2	6	130771	130776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478562
3005	NC_012029	TTC	2	6	130784	130789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478562
3006	NC_012029	CGA	2	6	130795	130800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478562
3007	NC_012029	GAG	2	6	130853	130858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478562
3008	NC_012029	TCGC	2	8	130874	130881	0 %	25 %	25 %	50 %	222478562
3009	NC_012029	GGC	2	6	130958	130963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478562
3010	NC_012029	GTG	2	6	130987	130992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478562
3011	NC_012029	CTGC	2	8	130994	131001	0 %	25 %	25 %	50 %	222478562
3012	NC_012029	ACG	2	6	131076	131081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478562
3013	NC_012029	AACGG	2	10	131099	131108	40 %	0 %	40 %	20 %	222478562
3014	NC_012029	ACG	2	6	131283	131288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478563
3015	NC_012029	CGGT	2	8	131334	131341	0 %	25 %	50 %	25 %	222478563
3016	NC_012029	ACG	2	6	131369	131374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478563
3017	NC_012029	ACA	2	6	131406	131411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222478563
3018	NC_012029	CGGC	2	8	131418	131425	0 %	0 %	50 %	50 %	222478563
3019	NC_012029	ACT	2	6	131451	131456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478563
3020	NC_012029	CGT	2	6	131518	131523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478563
3021	NC_012029	GCG	2	6	131526	131531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478563
3022	NC_012029	GGCGAG	2	12	131585	131596	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	222478563
3023	NC_012029	TCG	2	6	131610	131615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478563
3024	NC_012029	TG	3	6	131637	131642	0 %	50 %	50 %	0 %	222478563
3025	NC_012029	AAC	2	6	131657	131662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222478563
3026	NC_012029	CGG	2	6	131704	131709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478563
3027	NC_012029	CGA	3	9	131773	131781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478563
3028	NC_012029	GAG	2	6	131801	131806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478563
3029	NC_012029	TGA	2	6	131832	131837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478563
3030	NC_012029	GC	3	6	131838	131843	0 %	0 %	50 %	50 %	222478563
3031	NC_012029	CGGCGA	2	12	131866	131877	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222478563
3032	NC_012029	CG	3	6	131900	131905	0 %	0 %	50 %	50 %	222478563
3033	NC_012029	ACG	2	6	132069	132074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478563
3034	NC_012029	GC	3	6	132167	132172	0 %	0 %	50 %	50 %	222478563
3035	NC_012029	CGG	2	6	132175	132180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478563
3036	NC_012029	CGA	2	6	132208	132213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478563
3037	NC_012029	CCG	2	6	132231	132236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478563
3038	NC_012029	CGG	2	6	132247	132252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478563
3039	NC_012029	CAG	2	6	132253	132258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478563
3040	NC_012029	ACG	2	6	132285	132290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478563
3041	NC_012029	ACC	3	9	132329	132337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478563
3042	NC_012029	CGC	2	6	132361	132366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478563
3043	NC_012029	TCG	2	6	132384	132389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478563
3044	NC_012029	CG	4	8	132388	132395	0 %	0 %	50 %	50 %	222478563
3045	NC_012029	TC	4	8	132495	132502	0 %	50 %	0 %	50 %	222478563
3046	NC_012029	CGA	3	9	132568	132576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478563
3047	NC_012029	GACAAC	2	12	132758	132769	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	222478564
3048	NC_012029	GCT	2	6	132799	132804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478564
3049	NC_012029	GAC	2	6	132853	132858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478564
3050	NC_012029	AAC	2	6	132890	132895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222478564
3051	NC_012029	CCG	2	6	132903	132908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478564
3052	NC_012029	TCG	2	6	132924	132929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478564
3053	NC_012029	GCA	2	6	132934	132939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478564
3054	NC_012029	GC	3	6	132975	132980	0 %	0 %	50 %	50 %	222478564
3055	NC_012029	ACG	2	6	132990	132995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478564
3056	NC_012029	CGC	2	6	133015	133020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478564
3057	NC_012029	ACG	2	6	133026	133031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478564
3058	NC_012029	GA	3	6	133035	133040	50 %	0 %	50 %	0 %	222478564
3059	NC_012029	GAC	2	6	133061	133066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478564
3060	NC_012029	CGC	2	6	133122	133127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478564
3061	NC_012029	GAG	2	6	133166	133171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478564
3062	NC_012029	GCG	2	6	133296	133301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478564
3063	NC_012029	CGC	2	6	133339	133344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478564
3064	NC_012029	ACG	2	6	133380	133385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478564
3065	NC_012029	ACG	3	9	133404	133412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478564
3066	NC_012029	CAT	2	6	133426	133431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478564
3067	NC_012029	CGG	2	6	133474	133479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478564
3068	NC_012029	GTG	2	6	133481	133486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478564
3069	NC_012029	GAC	2	6	133528	133533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478564
3070	NC_012029	TCG	2	6	133545	133550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478564
3071	NC_012029	CGT	2	6	133612	133617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478564
3072	NC_012029	GCG	2	6	133638	133643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478564
3073	NC_012029	CGG	2	6	133692	133697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478564
3074	NC_012029	ACG	2	6	133776	133781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478564
3075	NC_012029	CGA	2	6	133846	133851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478564
3076	NC_012029	CGAG	2	8	133880	133887	25 %	0 %	50 %	25 %	222478564
3077	NC_012029	CGC	2	6	133956	133961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478564
3078	NC_012029	CGC	2	6	133987	133992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478564
3079	NC_012029	CGAC	2	8	134007	134014	25 %	0 %	25 %	50 %	222478564
3080	NC_012029	TCAACG	2	12	134025	134036	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222478564
3081	NC_012029	GGCC	2	8	134062	134069	0 %	0 %	50 %	50 %	222478564
3082	NC_012029	CGGC	2	8	134070	134077	0 %	0 %	50 %	50 %	222478564
3083	NC_012029	GCG	2	6	134085	134090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478564
3084	NC_012029	TTC	2	6	134099	134104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478564
3085	NC_012029	CGC	2	6	134152	134157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478564
3086	NC_012029	TCA	2	6	134178	134183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478564
3087	NC_012029	GGA	2	6	134185	134190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478564
3088	NC_012029	ACG	2	6	134265	134270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478564
3089	NC_012029	CGA	2	6	134278	134283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478564
3090	NC_012029	GC	3	6	134426	134431	0 %	0 %	50 %	50 %	222478564
3091	NC_012029	ACG	2	6	134436	134441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478564
3092	NC_012029	AGAA	2	8	134674	134681	75 %	0 %	25 %	0 %	222478565
3093	NC_012029	CGG	2	6	134694	134699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478565
3094	NC_012029	GCC	2	6	134745	134750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478565
3095	NC_012029	ACGG	2	8	134769	134776	25 %	0 %	50 %	25 %	222478565
3096	NC_012029	GGC	2	6	134842	134847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478565
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3098	NC_012029	CGAT	2	8	134881	134888	25 %	25 %	25 %	25 %	222478565
3099	NC_012029	CGT	2	6	134891	134896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478565
3100	NC_012029	GGC	2	6	134906	134911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478565
3101	NC_012029	TCG	2	6	134923	134928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478565
3102	NC_012029	CGA	2	6	134984	134989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478565
3103	NC_012029	CCTCG	2	10	135039	135048	0 %	20 %	20 %	60 %	222478565
3104	NC_012029	CTC	2	6	135246	135251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478565
3105	NC_012029	GGC	2	6	135318	135323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478565
3106	NC_012029	GCG	2	6	135337	135342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478565
3107	NC_012029	CGC	2	6	135365	135370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478565
3108	NC_012029	GAC	2	6	135372	135377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478565
3109	NC_012029	GCG	2	6	135379	135384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478565
3110	NC_012029	CGAC	2	8	135406	135413	25 %	0 %	25 %	50 %	222478565
3111	NC_012029	GAGC	2	8	135415	135422	25 %	0 %	50 %	25 %	222478565
3112	NC_012029	GAC	2	6	135470	135475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478566
3113	NC_012029	CGAG	2	8	135489	135496	25 %	0 %	50 %	25 %	222478566
3114	NC_012029	GCC	2	6	135507	135512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478566
3115	NC_012029	CGG	2	6	135526	135531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478566
3116	NC_012029	TC	3	6	135577	135582	0 %	50 %	0 %	50 %	222478566
3117	NC_012029	AAC	2	6	135602	135607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222478566
3118	NC_012029	CGAC	2	8	135759	135766	25 %	0 %	25 %	50 %	222478566
3119	NC_012029	TCG	2	6	135816	135821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478566
3120	NC_012029	TCG	2	6	135876	135881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478566
3121	NC_012029	TCG	2	6	135894	135899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478566
3122	NC_012029	GC	3	6	135960	135965	0 %	0 %	50 %	50 %	222478566
3123	NC_012029	CGA	2	6	135967	135972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478566
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3125	NC_012029	GAC	2	6	135985	135990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478566
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3128	NC_012029	GTC	3	9	136175	136183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478566
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3134	NC_012029	CGA	2	6	136327	136332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478566
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3149	NC_012029	TCG	2	6	136721	136726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478567
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3151	NC_012029	TCG	2	6	136748	136753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478567
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3153	NC_012029	GCGA	2	8	136783	136790	25 %	0 %	50 %	25 %	222478567
3154	NC_012029	CGA	2	6	136824	136829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478567
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3157	NC_012029	TCG	2	6	136907	136912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478567
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3172	NC_012029	CGA	2	6	137433	137438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478567
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3220	NC_012029	TAC	2	6	139487	139492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478570
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3224	NC_012029	CGA	2	6	139639	139644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478570
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3226	NC_012029	TCG	2	6	139743	139748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478570
3227	NC_012029	GAC	3	9	139763	139771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478570
3228	NC_012029	CGCGG	2	10	139801	139810	0 %	0 %	60 %	40 %	222478570
3229	NC_012029	ACG	2	6	139845	139850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478570
3230	NC_012029	GCC	2	6	139873	139878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478570
3231	NC_012029	AGC	2	6	139881	139886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478570
3232	NC_012029	TCG	2	6	139896	139901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478570
3233	NC_012029	CT	3	6	139931	139936	0 %	50 %	0 %	50 %	222478571
3234	NC_012029	CGAGCG	2	12	139996	140007	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222478571
3235	NC_012029	CAC	2	6	140063	140068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478571
3236	NC_012029	CGG	2	6	140115	140120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478571
3237	NC_012029	AGC	2	6	140238	140243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478571
3238	NC_012029	ACA	2	6	140299	140304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222478571
3239	NC_012029	CGA	3	9	140335	140343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478571
3240	NC_012029	GTC	2	6	140355	140360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478571
3241	NC_012029	GGAACG	2	12	140386	140397	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	222478571
3242	NC_012029	CGTACA	2	12	140416	140427	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222478571
3243	NC_012029	CCG	2	6	140428	140433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478571
3244	NC_012029	CGA	2	6	140482	140487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478571
3245	NC_012029	GA	3	6	140552	140557	50 %	0 %	50 %	0 %	222478571
3246	NC_012029	CGCT	2	8	140572	140579	0 %	25 %	25 %	50 %	222478571
3247	NC_012029	GCG	2	6	140598	140603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478571
3248	NC_012029	GTC	2	6	140639	140644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478571
3249	NC_012029	CGC	2	6	140661	140666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478571
3250	NC_012029	GAT	2	6	140672	140677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478571
3251	NC_012029	CGA	2	6	140689	140694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478571
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3253	NC_012029	CCCA	2	8	140706	140713	25 %	0 %	0 %	75 %	222478571
3254	NC_012029	AGC	2	6	140765	140770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478572
3255	NC_012029	CTC	2	6	140776	140781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478572
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3259	NC_012029	CCG	2	6	141068	141073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478572
3260	NC_012029	CGAGC	2	10	141087	141096	20 %	0 %	40 %	40 %	222478572
3261	NC_012029	GGC	2	6	141219	141224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478572
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3263	NC_012029	CGCA	2	8	141307	141314	25 %	0 %	25 %	50 %	222478572
3264	NC_012029	GAC	2	6	141343	141348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478572
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3268	NC_012029	GTC	2	6	141428	141433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478572
3269	NC_012029	TCG	2	6	141459	141464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478572
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3271	NC_012029	GGA	2	6	141498	141503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478572
3272	NC_012029	GC	4	8	141516	141523	0 %	0 %	50 %	50 %	222478572
3273	NC_012029	CGT	2	6	141534	141539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478572
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3280	NC_012029	CGT	2	6	141804	141809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478572
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3282	NC_012029	CAG	2	6	141832	141837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478572
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3347	NC_012029	GCC	2	6	144201	144206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478574
3348	NC_012029	ACG	2	6	144215	144220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478574
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3350	NC_012029	CGACGG	2	12	144236	144247	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222478574
3351	NC_012029	GC	3	6	144283	144288	0 %	0 %	50 %	50 %	222478574
3352	NC_012029	TCG	3	9	144292	144300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478574
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3354	NC_012029	GCT	2	6	144407	144412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478574
3355	NC_012029	GTC	2	6	144435	144440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478574
3356	NC_012029	GGAAGC	2	12	144816	144827	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	222478575
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3358	NC_012029	CGA	2	6	144867	144872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478575
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3478	NC_012029	AGG	2	6	149513	149518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478580
3479	NC_012029	ATC	2	6	149545	149550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478580
3480	NC_012029	GAG	2	6	149591	149596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478580
3481	NC_012029	CGGAGC	2	12	149627	149638	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222478580
3482	NC_012029	CCCG	2	8	149700	149707	0 %	0 %	25 %	75 %	222478580
3483	NC_012029	CGC	2	6	149720	149725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478580
3484	NC_012029	CGT	2	6	149769	149774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478580
3485	NC_012029	CGG	2	6	149790	149795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478580
3486	NC_012029	CCCCGA	2	12	149891	149902	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	222478580
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3490	NC_012029	CGGC	2	8	150008	150015	0 %	0 %	50 %	50 %	222478580
3491	NC_012029	GAC	2	6	150021	150026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478580
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