MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 68328

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_012029	GAT	2	6	109548	109553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478544
2502	NC_012029	ATG	2	6	109606	109611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478544
2503	NC_012029	GTC	2	6	109632	109637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478544
2504	NC_012029	GTG	2	6	109678	109683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478544
2505	NC_012029	CGG	2	6	109686	109691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478544
2506	NC_012029	ATC	2	6	109711	109716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478544
2507	NC_012029	CCGG	2	8	109721	109728	0 %	0 %	50 %	50 %	222478544
2508	NC_012029	GCG	2	6	109863	109868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478544
2509	NC_012029	TCC	2	6	109870	109875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478544
2510	NC_012029	CGGA	2	8	109881	109888	25 %	0 %	50 %	25 %	222478544
2511	NC_012029	TCT	2	6	109934	109939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478544
2512	NC_012029	GTC	2	6	109968	109973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478544
2513	NC_012029	CTC	3	9	109974	109982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478544
2514	NC_012029	GTA	2	6	110046	110051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478544
2515	NC_012029	GGT	2	6	110052	110057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478544
2516	NC_012029	CGT	2	6	110147	110152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478544
2517	NC_012029	TCG	2	6	110155	110160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478544
2518	NC_012029	TCG	2	6	110200	110205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478544
2519	NC_012029	GCT	2	6	110207	110212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478544
2520	NC_012029	GTC	2	6	110261	110266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478544
2521	NC_012029	CGT	3	9	110429	110437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478544
2522	NC_012029	TCG	2	6	110462	110467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478544
2523	NC_012029	GCC	2	6	110514	110519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478544
2524	NC_012029	TCC	2	6	110557	110562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478545
2525	NC_012029	TCGG	2	8	110573	110580	0 %	25 %	50 %	25 %	222478545
2526	NC_012029	ATC	2	6	110593	110598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478545
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2529	NC_012029	GTC	2	6	110646	110651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478545
2530	NC_012029	TCG	2	6	110653	110658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478545
2531	NC_012029	GCT	2	6	110684	110689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478545
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2533	NC_012029	GAT	2	6	110796	110801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478545
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2535	NC_012029	GC	3	6	110845	110850	0 %	0 %	50 %	50 %	222478545
2536	NC_012029	TCGG	2	8	110854	110861	0 %	25 %	50 %	25 %	222478545
2537	NC_012029	CG	3	6	110888	110893	0 %	0 %	50 %	50 %	222478545
2538	NC_012029	AGA	2	6	110939	110944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222478545
2539	NC_012029	CGA	2	6	110951	110956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478545
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2544	NC_012029	CGC	2	6	111041	111046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478545
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2549	NC_012029	TCT	2	6	111220	111225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478545
2550	NC_012029	ACG	2	6	111244	111249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478545
2551	NC_012029	CACCTT	2	12	111309	111320	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	222478545
2552	NC_012029	CGA	2	6	111365	111370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478545
2553	NC_012029	CGC	2	6	111409	111414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478545
2554	NC_012029	GTC	2	6	111438	111443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478545
2555	NC_012029	CTC	2	6	111447	111452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478545
2556	NC_012029	AGC	2	6	111481	111486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478545
2557	NC_012029	TCG	2	6	111532	111537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478545
2558	NC_012029	GGTG	2	8	111539	111546	0 %	25 %	75 %	0 %	222478545
2559	NC_012029	CGC	2	6	111557	111562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478545
2560	NC_012029	GC	4	8	111561	111568	0 %	0 %	50 %	50 %	222478545
2561	NC_012029	TCC	2	6	111601	111606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478545
2562	NC_012029	CCG	2	6	111610	111615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478545
2563	NC_012029	CTC	2	6	111627	111632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478545
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2571	NC_012029	CCGG	2	8	111848	111855	0 %	0 %	50 %	50 %	222478545
2572	NC_012029	TCA	2	6	111893	111898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478545
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2578	NC_012029	TCG	2	6	112138	112143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478545
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2583	NC_012029	CGC	2	6	112265	112270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478545
2584	NC_012029	CTTCG	2	10	112350	112359	0 %	40 %	20 %	40 %	222478545
2585	NC_012029	GTC	2	6	112381	112386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478546
2586	NC_012029	GTCG	2	8	112395	112402	0 %	25 %	50 %	25 %	222478546
2587	NC_012029	TCG	2	6	112466	112471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478546
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2590	NC_012029	GTCC	2	8	112660	112667	0 %	25 %	25 %	50 %	222478546
2591	NC_012029	ACC	2	6	112696	112701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478546
2592	NC_012029	CG	3	6	112798	112803	0 %	0 %	50 %	50 %	222478546
2593	NC_012029	GTC	2	6	112912	112917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478546
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2599	NC_012029	GAG	2	6	113032	113037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478546
2600	NC_012029	TTC	2	6	113078	113083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478546
2601	NC_012029	GTC	2	6	113132	113137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478546
2602	NC_012029	CCT	2	6	113148	113153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478546
2603	NC_012029	GTC	2	6	113188	113193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478546
2604	NC_012029	TCG	2	6	113216	113221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478546
2605	NC_012029	GACG	2	8	113272	113279	25 %	0 %	50 %	25 %	222478546
2606	NC_012029	AGC	2	6	113294	113299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478546
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2609	NC_012029	TCA	2	6	113436	113441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478546
2610	NC_012029	GCC	2	6	113473	113478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478546
2611	NC_012029	TCG	3	9	113513	113521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478546
2612	NC_012029	CGA	2	6	113595	113600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478546
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2615	NC_012029	CG	3	6	113730	113735	0 %	0 %	50 %	50 %	222478546
2616	NC_012029	TCG	2	6	113822	113827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478546
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2619	NC_012029	GTG	2	6	113875	113880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478546
2620	NC_012029	GAC	2	6	113946	113951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478547
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2971	NC_012029	AGC	2	6	128825	128830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478561
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2976	NC_012029	CGG	3	9	129055	129063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478561
2977	NC_012029	ACG	2	6	129116	129121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478561
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2979	NC_012029	GC	3	6	129149	129154	0 %	0 %	50 %	50 %	222478561
2980	NC_012029	CGTT	2	8	129161	129168	0 %	50 %	25 %	25 %	222478561
2981	NC_012029	ACGC	2	8	129709	129716	25 %	0 %	25 %	50 %	222478562
2982	NC_012029	GAC	2	6	129769	129774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478562
2983	NC_012029	GGC	2	6	129866	129871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478562
2984	NC_012029	GAA	2	6	129920	129925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222478562
2985	NC_012029	GAG	2	6	129926	129931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478562
2986	NC_012029	CGA	2	6	129967	129972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478562
2987	NC_012029	CGA	2	6	130063	130068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478562
2988	NC_012029	GCG	2	6	130086	130091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478562
2989	NC_012029	ACG	2	6	130161	130166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478562
2990	NC_012029	GGCG	2	8	130189	130196	0 %	0 %	75 %	25 %	222478562
2991	NC_012029	CGA	2	6	130222	130227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478562
2992	NC_012029	ACG	2	6	130290	130295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478562
2993	NC_012029	CAA	2	6	130303	130308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222478562
2994	NC_012029	GACGCC	2	12	130316	130327	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222478562
2995	NC_012029	GCG	2	6	130413	130418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478562
2996	NC_012029	CAA	2	6	130483	130488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222478562
2997	NC_012029	CGC	2	6	130500	130505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478562
2998	NC_012029	CTGA	2	8	130511	130518	25 %	25 %	25 %	25 %	222478562
2999	NC_012029	GAC	2	6	130526	130531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478562
3000	NC_012029	GTC	2	6	130643	130648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478562

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