MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 68328

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012029	CGA	2	6	46710	46715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478483
1002	NC_012029	TCG	2	6	46718	46723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478483
1003	NC_012029	GT	3	6	46802	46807	0 %	50 %	50 %	0 %	222478483
1004	NC_012029	CTCG	2	8	46837	46844	0 %	25 %	25 %	50 %	222478483
1005	NC_012029	TCG	2	6	46847	46852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478483
1006	NC_012029	CTC	2	6	46882	46887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478483
1007	NC_012029	CTC	2	6	46972	46977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478483
1008	NC_012029	TCT	2	6	46979	46984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478483
1009	NC_012029	AGT	2	6	47170	47175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478484
1010	NC_012029	CGT	2	6	47182	47187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478484
1011	NC_012029	TCGCG	2	10	47224	47233	0 %	20 %	40 %	40 %	222478484
1012	NC_012029	CAG	2	6	47246	47251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478484
1013	NC_012029	CGG	3	9	47278	47286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478484
1014	NC_012029	CGG	2	6	47317	47322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478484
1015	NC_012029	CTC	2	6	47327	47332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478484
1016	NC_012029	CTT	2	6	47354	47359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478484
1017	NC_012029	TGG	2	6	47371	47376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478484
1018	NC_012029	CGA	2	6	47419	47424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478484
1019	NC_012029	CTC	2	6	47477	47482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478484
1020	NC_012029	GTC	2	6	47510	47515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478484
1021	NC_012029	TCG	2	6	47688	47693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478485
1022	NC_012029	CG	3	6	47729	47734	0 %	0 %	50 %	50 %	222478485
1023	NC_012029	CGG	2	6	47749	47754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478485
1024	NC_012029	AGT	2	6	47779	47784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478485
1025	NC_012029	GTC	2	6	47790	47795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478485
1026	NC_012029	CGC	2	6	47830	47835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478485
1027	NC_012029	CGT	2	6	47851	47856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478485
1028	NC_012029	GTCG	2	8	47939	47946	0 %	25 %	50 %	25 %	222478485
1029	NC_012029	CGG	2	6	47953	47958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478485
1030	NC_012029	C	6	6	47972	47977	0 %	0 %	0 %	100 %	222478485
1031	NC_012029	CGT	2	6	48004	48009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478485
1032	NC_012029	CGC	2	6	48037	48042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478485
1033	NC_012029	CTC	2	6	48065	48070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478485
1034	NC_012029	ACC	2	6	48071	48076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478485
1035	NC_012029	CGCGC	2	10	48104	48113	0 %	0 %	40 %	60 %	222478485
1036	NC_012029	GTC	2	6	48119	48124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478485
1037	NC_012029	CTC	2	6	48137	48142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478485
1038	NC_012029	CGT	2	6	48157	48162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478485
1039	NC_012029	GC	3	6	48171	48176	0 %	0 %	50 %	50 %	222478485
1040	NC_012029	TCG	2	6	48180	48185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478485
1041	NC_012029	CGT	2	6	48197	48202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478485
1042	NC_012029	CGC	2	6	48218	48223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478485
1043	NC_012029	TCG	2	6	48234	48239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478485
1044	NC_012029	GTC	3	9	48260	48268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478485
1045	NC_012029	TCG	2	6	48288	48293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478485
1046	NC_012029	CCG	2	6	48306	48311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478485
1047	NC_012029	GCCG	2	8	48317	48324	0 %	0 %	50 %	50 %	222478485
1048	NC_012029	TCCGAC	2	12	48351	48362	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222478485
1049	NC_012029	GTC	2	6	48437	48442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478485
1050	NC_012029	GAT	2	6	48464	48469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478485
1051	NC_012029	CGT	2	6	48475	48480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478485
1052	NC_012029	TCG	2	6	48567	48572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478485
1053	NC_012029	ACG	2	6	48576	48581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478485
1054	NC_012029	TCG	2	6	48607	48612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478485
1055	NC_012029	ACC	2	6	48633	48638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478485
1056	NC_012029	CGC	2	6	48646	48651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478485
1057	NC_012029	AGCG	2	8	48652	48659	25 %	0 %	50 %	25 %	222478485
1058	NC_012029	GGT	2	6	48680	48685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478485
1059	NC_012029	TCC	2	6	48702	48707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478485
1060	NC_012029	TCGCGC	2	12	48708	48719	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222478485
1061	NC_012029	GAG	2	6	49015	49020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478486
1062	NC_012029	GAG	2	6	49030	49035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478486
1063	NC_012029	TCC	2	6	49043	49048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478486
1064	NC_012029	GGCC	2	8	49065	49072	0 %	0 %	50 %	50 %	222478486
1065	NC_012029	CGGG	2	8	49086	49093	0 %	0 %	75 %	25 %	222478486
1066	NC_012029	GAA	2	6	49173	49178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222478486
1067	NC_012029	ACG	2	6	49220	49225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478486
1068	NC_012029	ACG	2	6	49504	49509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478487
1069	NC_012029	CG	4	8	49515	49522	0 %	0 %	50 %	50 %	222478487
1070	NC_012029	GAA	2	6	49602	49607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222478487
1071	NC_012029	CGT	3	9	49610	49618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478487
1072	NC_012029	CGT	2	6	49622	49627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478487
1073	NC_012029	GCC	2	6	49647	49652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478487
1074	NC_012029	GAA	2	6	49662	49667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222478487
1075	NC_012029	GCT	2	6	49934	49939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478488
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1077	NC_012029	CGT	2	6	49958	49963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478488
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1079	NC_012029	CG	3	6	49995	50000	0 %	0 %	50 %	50 %	222478488
1080	NC_012029	TCG	2	6	50005	50010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478488
1081	NC_012029	CGT	2	6	50015	50020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478488
1082	NC_012029	TCG	2	6	50035	50040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478488
1083	NC_012029	TCG	2	6	50044	50049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478488
1084	NC_012029	CGCT	2	8	50125	50132	0 %	25 %	25 %	50 %	222478488
1085	NC_012029	CTC	2	6	50217	50222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478488
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1087	NC_012029	GAG	2	6	50259	50264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478488
1088	NC_012029	GC	3	6	50266	50271	0 %	0 %	50 %	50 %	222478488
1089	NC_012029	TTG	2	6	50294	50299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222478488
1090	NC_012029	CGT	2	6	50363	50368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478488
1091	NC_012029	CGGC	2	8	50383	50390	0 %	0 %	50 %	50 %	222478488
1092	NC_012029	CTC	2	6	50502	50507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478489
1093	NC_012029	GC	3	6	50524	50529	0 %	0 %	50 %	50 %	222478489
1094	NC_012029	TCG	2	6	50536	50541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478489
1095	NC_012029	TCG	2	6	50575	50580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478489
1096	NC_012029	CG	4	8	50585	50592	0 %	0 %	50 %	50 %	222478489
1097	NC_012029	GGA	2	6	50616	50621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478489
1098	NC_012029	GAG	2	6	50643	50648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478489
1099	NC_012029	GAC	2	6	50679	50684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478489
1100	NC_012029	CGA	2	6	50687	50692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478489
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1102	NC_012029	CGC	2	6	50770	50775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478489
1103	NC_012029	TCCC	2	8	50776	50783	0 %	25 %	0 %	75 %	222478489
1104	NC_012029	AG	3	6	50904	50909	50 %	0 %	50 %	0 %	222478490
1105	NC_012029	TCGA	2	8	50961	50968	25 %	25 %	25 %	25 %	222478490
1106	NC_012029	GA	3	6	51194	51199	50 %	0 %	50 %	0 %	222478490
1107	NC_012029	TCG	2	6	51244	51249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478490
1108	NC_012029	TCT	2	6	51260	51265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478490
1109	NC_012029	GC	3	6	51344	51349	0 %	0 %	50 %	50 %	222478490
1110	NC_012029	GGA	2	6	51410	51415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478490
1111	NC_012029	GTT	2	6	51430	51435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222478490
1112	NC_012029	ATCG	2	8	51534	51541	25 %	25 %	25 %	25 %	222478490
1113	NC_012029	CGA	2	6	51554	51559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478490
1114	NC_012029	TCGA	2	8	51562	51569	25 %	25 %	25 %	25 %	222478490
1115	NC_012029	ACGA	2	8	51624	51631	50 %	0 %	25 %	25 %	222478490
1116	NC_012029	CTG	2	6	51708	51713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478490
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1118	NC_012029	CT	3	6	51858	51863	0 %	50 %	0 %	50 %	222478491
1119	NC_012029	CGA	2	6	51885	51890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478491
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1121	NC_012029	CCGG	2	8	51958	51965	0 %	0 %	50 %	50 %	222478491
1122	NC_012029	GT	3	6	52093	52098	0 %	50 %	50 %	0 %	222478491
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1124	NC_012029	CTT	2	6	52155	52160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478491
1125	NC_012029	CGG	2	6	52204	52209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478491
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1245	NC_012029	CG	3	6	59088	59093	0 %	0 %	50 %	50 %	222478496
1246	NC_012029	CCT	2	6	59102	59107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478496
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1482	NC_012029	C	7	7	69918	69924	0 %	0 %	0 %	100 %	222478506
1483	NC_012029	GAG	2	6	69945	69950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478506
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1488	NC_012029	CAA	2	6	70179	70184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222478506
1489	NC_012029	CAG	2	6	70185	70190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478506
1490	NC_012029	GTA	2	6	70251	70256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478506
1491	NC_012029	ATC	2	6	70321	70326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478506
1492	NC_012029	CAT	2	6	70344	70349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478506
1493	NC_012029	GTC	2	6	70407	70412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478506
1494	NC_012029	TTCC	2	8	70499	70506	0 %	50 %	0 %	50 %	222478506
1495	NC_012029	CGA	2	6	70664	70669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478506
1496	NC_012029	GTC	2	6	70671	70676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478506
1497	NC_012029	AGCC	2	8	70720	70727	25 %	0 %	25 %	50 %	222478506
1498	NC_012029	GAT	2	6	70764	70769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478506
1499	NC_012029	CCG	2	6	70796	70801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478506
1500	NC_012029	CACCG	2	10	70929	70938	20 %	0 %	20 %	60 %	222478506

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