MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 68328

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_012029	CGC	2	6	225639	225644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478648
5502	NC_012029	GGC	2	6	225649	225654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478648
5503	NC_012029	TCC	2	6	225692	225697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478648
5504	NC_012029	CGA	2	6	225771	225776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478648
5505	NC_012029	CTC	2	6	225793	225798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478648
5506	NC_012029	CGT	2	6	225811	225816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478648
5507	NC_012029	TCGA	2	8	225824	225831	25 %	25 %	25 %	25 %	222478648
5508	NC_012029	GCG	2	6	225878	225883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478648
5509	NC_012029	TCG	2	6	225902	225907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478648
5510	NC_012029	GAC	2	6	225928	225933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478648
5511	NC_012029	GTG	2	6	226072	226077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478648
5512	NC_012029	TCT	2	6	226119	226124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478648
5513	NC_012029	TCC	2	6	226133	226138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478648
5514	NC_012029	GGC	2	6	226198	226203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478648
5515	NC_012029	CCT	2	6	226227	226232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478648
5516	NC_012029	GGC	2	6	226265	226270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478648
5517	NC_012029	TCA	2	6	226320	226325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478648
5518	NC_012029	GCC	2	6	226337	226342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478648
5519	NC_012029	TCT	2	6	226361	226366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478648
5520	NC_012029	CGA	2	6	226416	226421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478648
5521	NC_012029	CGC	2	6	226444	226449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478648
5522	NC_012029	GTC	2	6	226456	226461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478648
5523	NC_012029	TCGGC	2	10	226515	226524	0 %	20 %	40 %	40 %	222478648
5524	NC_012029	TCG	2	6	226568	226573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478648
5525	NC_012029	GGC	2	6	226680	226685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478648
5526	NC_012029	CGA	2	6	226707	226712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478648
5527	NC_012029	CGA	2	6	226737	226742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478648
5528	NC_012029	CGT	3	9	226773	226781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478648
5529	NC_012029	TCG	2	6	226844	226849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478648
5530	NC_012029	CGA	2	6	226869	226874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478648
5531	NC_012029	GGT	2	6	226882	226887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478648
5532	NC_012029	AG	3	6	226893	226898	50 %	0 %	50 %	0 %	222478648
5533	NC_012029	TTC	2	6	226913	226918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478648
5534	NC_012029	GAC	2	6	226951	226956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478648
5535	NC_012029	GAC	2	6	226990	226995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478648
5536	NC_012029	CTC	2	6	227002	227007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478648
5537	NC_012029	GTT	2	6	227056	227061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222478648
5538	NC_012029	GCC	2	6	227068	227073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478648
5539	NC_012029	ACG	2	6	227075	227080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478648
5540	NC_012029	GAG	2	6	227093	227098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478648
5541	NC_012029	GTCG	2	8	227136	227143	0 %	25 %	50 %	25 %	222478648
5542	NC_012029	GAC	2	6	227158	227163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478648
5543	NC_012029	ACC	2	6	227174	227179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478648
5544	NC_012029	CGA	2	6	227183	227188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478648
5545	NC_012029	TCG	2	6	227189	227194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478648
5546	NC_012029	CCT	2	6	227202	227207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478648
5547	NC_012029	AC	3	6	227243	227248	50 %	0 %	0 %	50 %	222478648
5548	NC_012029	CGAG	2	8	227271	227278	25 %	0 %	50 %	25 %	222478648
5549	NC_012029	GCG	2	6	227358	227363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478648
5550	NC_012029	ACG	2	6	227366	227371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478648
5551	NC_012029	CCGG	2	8	227372	227379	0 %	0 %	50 %	50 %	222478648
5552	NC_012029	TCG	2	6	227429	227434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478648
5553	NC_012029	TCC	2	6	227468	227473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478648
5554	NC_012029	GCC	2	6	227522	227527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478648
5555	NC_012029	GCCGAC	2	12	227720	227731	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222478649
5556	NC_012029	CCG	2	6	227790	227795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478649
5557	NC_012029	CGA	2	6	227824	227829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478649
5558	NC_012029	GAG	2	6	227867	227872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478649
5559	NC_012029	CGA	2	6	227878	227883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478649
5560	NC_012029	CGA	2	6	227917	227922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478649
5561	NC_012029	ACC	2	6	227949	227954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478649
5562	NC_012029	CGT	2	6	227959	227964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478649
5563	NC_012029	GC	4	8	227994	228001	0 %	0 %	50 %	50 %	222478649
5564	NC_012029	CTT	2	6	228337	228342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478650
5565	NC_012029	CCT	2	6	228460	228465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478650
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5567	NC_012029	TTG	2	6	228953	228958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222478651
5568	NC_012029	TCG	2	6	228965	228970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478651
5569	NC_012029	CTC	2	6	229006	229011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478651
5570	NC_012029	CGA	2	6	229032	229037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478651
5571	NC_012029	GC	3	6	229046	229051	0 %	0 %	50 %	50 %	222478651
5572	NC_012029	CGG	2	6	229053	229058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478651
5573	NC_012029	CGATCT	2	12	229089	229100	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222478651
5574	NC_012029	GGAT	2	8	229106	229113	25 %	25 %	50 %	0 %	222478651
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5580	NC_012029	AGT	2	6	229326	229331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478651
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5584	NC_012029	GAT	2	6	229525	229530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478651
5585	NC_012029	GTC	2	6	229531	229536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478651
5586	NC_012029	CGCC	2	8	229545	229552	0 %	0 %	25 %	75 %	222478651
5587	NC_012029	CGA	2	6	229557	229562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478651
5588	NC_012029	GTC	2	6	229573	229578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478651
5589	NC_012029	ACC	2	6	229581	229586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478651
5590	NC_012029	TCC	2	6	229637	229642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478651
5591	NC_012029	GCC	2	6	229649	229654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478651
5592	NC_012029	GC	5	10	229665	229674	0 %	0 %	50 %	50 %	222478651
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5601	NC_012029	CAT	2	6	230801	230806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478653
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5603	NC_012029	CG	3	6	230909	230914	0 %	0 %	50 %	50 %	222478653
5604	NC_012029	CGC	2	6	230926	230931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478653
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5606	NC_012029	GCC	2	6	231020	231025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478653
5607	NC_012029	GCG	2	6	231063	231068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478653
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5609	NC_012029	CGG	2	6	231127	231132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478653
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5617	NC_012029	TCG	3	9	231381	231389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478653
5618	NC_012029	TCGA	2	8	231433	231440	25 %	25 %	25 %	25 %	222478653
5619	NC_012029	CGC	2	6	231457	231462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478653
5620	NC_012029	CGC	2	6	231469	231474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478653
5621	NC_012029	AGG	2	6	231496	231501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478653
5622	NC_012029	ACTCGC	2	12	231523	231534	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222478653
5623	NC_012029	CGA	2	6	231607	231612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478653
5624	NC_012029	TCG	2	6	231645	231650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478653
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5626	NC_012029	GTCG	2	8	231722	231729	0 %	25 %	50 %	25 %	222478653
5627	NC_012029	GC	3	6	231795	231800	0 %	0 %	50 %	50 %	222478653
5628	NC_012029	ATCG	2	8	232251	232258	25 %	25 %	25 %	25 %	222478654
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5630	NC_012029	TCGC	2	8	232301	232308	0 %	25 %	25 %	50 %	222478654
5631	NC_012029	CGT	2	6	232336	232341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478654
5632	NC_012029	ATC	2	6	232394	232399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478654
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5642	NC_012029	GC	3	6	232890	232895	0 %	0 %	50 %	50 %	222478654
5643	NC_012029	GTC	3	9	232919	232927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478654
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5659	NC_012029	GTC	2	6	233817	233822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478655
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5705	NC_012029	TCGA	2	8	235191	235198	25 %	25 %	25 %	25 %	222478655
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5712	NC_012029	CGG	2	6	235625	235630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478655
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5717	NC_012029	ACCG	2	8	235794	235801	25 %	0 %	25 %	50 %	222478655
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5720	NC_012029	GGC	2	6	235925	235930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478655
5721	NC_012029	GC	3	6	235940	235945	0 %	0 %	50 %	50 %	222478655
5722	NC_012029	GGGA	2	8	235963	235970	25 %	0 %	75 %	0 %	222478655
5723	NC_012029	AG	3	6	235992	235997	50 %	0 %	50 %	0 %	222478656
5724	NC_012029	CGC	2	6	236005	236010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478656
5725	NC_012029	GGC	2	6	236015	236020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478656
5726	NC_012029	GGCCGA	2	12	236035	236046	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222478656
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5728	NC_012029	GGT	2	6	236074	236079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478656
5729	NC_012029	CACGC	2	10	236106	236115	20 %	0 %	20 %	60 %	222478656
5730	NC_012029	CCG	2	6	236122	236127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478656
5731	NC_012029	ACG	2	6	236130	236135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478656
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5734	NC_012029	CGG	2	6	236283	236288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478656
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5736	NC_012029	CGT	2	6	236353	236358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478656
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5738	NC_012029	GC	3	6	236389	236394	0 %	0 %	50 %	50 %	222478656
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5979	NC_012029	GTA	2	6	244545	244550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478663
5980	NC_012029	TGT	2	6	244559	244564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222478663
5981	NC_012029	GTC	2	6	244619	244624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478664
5982	NC_012029	TCC	2	6	244635	244640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478664
5983	NC_012029	TCGG	2	8	244685	244692	0 %	25 %	50 %	25 %	222478664
5984	NC_012029	GAC	2	6	244703	244708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478664
5985	NC_012029	TGT	2	6	244714	244719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222478664
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5991	NC_012029	CGT	2	6	245155	245160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478664
5992	NC_012029	GAT	2	6	245246	245251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478664
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5994	NC_012029	TCGA	2	8	245277	245284	25 %	25 %	25 %	25 %	222478664
5995	NC_012029	CGT	2	6	245287	245292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478664
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