MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 68328

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012029	GAC	2	6	189806	189811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478614
4502	NC_012029	AACGTG	2	12	189827	189838	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222478614
4503	NC_012029	TCG	2	6	189903	189908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478614
4504	NC_012029	TCG	2	6	189972	189977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478614
4505	NC_012029	ACGGCG	2	12	189981	189992	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222478614
4506	NC_012029	GCA	2	6	190012	190017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478614
4507	NC_012029	CTT	2	6	190028	190033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478614
4508	NC_012029	CGC	2	6	190036	190041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478614
4509	NC_012029	TCT	2	6	190102	190107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478614
4510	NC_012029	CTG	2	6	190118	190123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478614
4511	NC_012029	CGT	2	6	190147	190152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478614
4512	NC_012029	TCG	2	6	190188	190193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478614
4513	NC_012029	CTC	2	6	190235	190240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478614
4514	NC_012029	GGA	2	6	190273	190278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478614
4515	NC_012029	CCG	2	6	190306	190311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478614
4516	NC_012029	GC	3	6	190344	190349	0 %	0 %	50 %	50 %	222478614
4517	NC_012029	CAG	2	6	190367	190372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478614
4518	NC_012029	TCG	3	9	190389	190397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478614
4519	NC_012029	TCC	2	6	190422	190427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478614
4520	NC_012029	TCG	2	6	190428	190433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478614
4521	NC_012029	AGG	2	6	190440	190445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478614
4522	NC_012029	CGC	2	6	190450	190455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478614
4523	NC_012029	GAA	2	6	190573	190578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222478614
4524	NC_012029	CCT	2	6	190818	190823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478615
4525	NC_012029	TCG	2	6	190910	190915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478615
4526	NC_012029	CTC	2	6	191002	191007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478615
4527	NC_012029	GCTTCG	2	12	191058	191069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478615
4528	NC_012029	CTT	2	6	191155	191160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478615
4529	NC_012029	CCG	2	6	191168	191173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478615
4530	NC_012029	TCG	2	6	191186	191191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478615
4531	NC_012029	CGC	2	6	191202	191207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478615
4532	NC_012029	CG	4	8	191214	191221	0 %	0 %	50 %	50 %	222478615
4533	NC_012029	CGA	2	6	191229	191234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478615
4534	NC_012029	TCG	2	6	191261	191266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478615
4535	NC_012029	GTC	2	6	191269	191274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478615
4536	NC_012029	CTG	2	6	191302	191307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478615
4537	NC_012029	CCT	2	6	191310	191315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478615
4538	NC_012029	GATGTC	2	12	191359	191370	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222478615
4539	NC_012029	CCT	2	6	191385	191390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478615
4540	NC_012029	GAT	2	6	191395	191400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478615
4541	NC_012029	CTT	3	9	191416	191424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478615
4542	NC_012029	GAA	2	6	191434	191439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222478615
4543	NC_012029	CCG	2	6	191440	191445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478615
4544	NC_012029	TCA	2	6	191495	191500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478615
4545	NC_012029	CG	3	6	191501	191506	0 %	0 %	50 %	50 %	222478615
4546	NC_012029	GTC	2	6	191509	191514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478615
4547	NC_012029	AGG	2	6	191547	191552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478615
4548	NC_012029	CCT	2	6	191562	191567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478615
4549	NC_012029	GGC	2	6	191641	191646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478615
4550	NC_012029	ATCCC	2	10	191725	191734	20 %	20 %	0 %	60 %	222478615
4551	NC_012029	ATA	2	6	191756	191761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222478615
4552	NC_012029	CTG	2	6	191776	191781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478615
4553	NC_012029	GGTCGT	2	12	191814	191825	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	222478615
4554	NC_012029	CTT	2	6	191836	191841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222478615
4555	NC_012029	CTC	2	6	191842	191847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478615
4556	NC_012029	GAG	2	6	191857	191862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478615
4557	NC_012029	TCG	2	6	191864	191869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478615
4558	NC_012029	CGT	2	6	191940	191945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478615
4559	NC_012029	GCC	2	6	192070	192075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478615
4560	NC_012029	TCG	2	6	192105	192110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478615
4561	NC_012029	GGA	2	6	192138	192143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478615
4562	NC_012029	CGA	2	6	192195	192200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478615
4563	NC_012029	CAG	2	6	192286	192291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478615
4564	NC_012029	CAG	2	6	192427	192432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478615
4565	NC_012029	GAC	2	6	192439	192444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478615
4566	NC_012029	GA	3	6	192498	192503	50 %	0 %	50 %	0 %	222478615
4567	NC_012029	TCGA	2	8	192509	192516	25 %	25 %	25 %	25 %	222478615
4568	NC_012029	GA	3	6	192515	192520	50 %	0 %	50 %	0 %	222478615
4569	NC_012029	CGT	2	6	192534	192539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478615
4570	NC_012029	CAG	2	6	192601	192606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478615
4571	NC_012029	GTC	2	6	192619	192624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478615
4572	NC_012029	CGC	2	6	192693	192698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478615
4573	NC_012029	GCG	2	6	192741	192746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478615
4574	NC_012029	CGT	2	6	192765	192770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478615
4575	NC_012029	GAC	2	6	192778	192783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478615
4576	NC_012029	TCG	3	9	192788	192796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478615
4577	NC_012029	GAT	2	6	192820	192825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222478615
4578	NC_012029	CTC	2	6	192829	192834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478615
4579	NC_012029	CGG	2	6	192854	192859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478615
4580	NC_012029	TCG	2	6	192860	192865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478615
4581	NC_012029	CGT	2	6	192954	192959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478615
4582	NC_012029	GTC	2	6	193046	193051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478615
4583	NC_012029	GTC	2	6	193057	193062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478615
4584	NC_012029	CGC	2	6	193116	193121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478615
4585	NC_012029	CG	3	6	193158	193163	0 %	0 %	50 %	50 %	222478615
4586	NC_012029	CAC	2	6	193171	193176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478615
4587	NC_012029	CTC	2	6	193183	193188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478615
4588	NC_012029	CGT	2	6	193266	193271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478615
4589	NC_012029	CGT	2	6	193275	193280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478615
4590	NC_012029	GCCG	2	8	193290	193297	0 %	0 %	50 %	50 %	222478615
4591	NC_012029	TCG	2	6	193319	193324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478615
4592	NC_012029	ATC	2	6	193361	193366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222478615
4593	NC_012029	TCG	2	6	193403	193408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478615
4594	NC_012029	CGCC	2	8	193436	193443	0 %	0 %	25 %	75 %	222478615
4595	NC_012029	CGA	2	6	193449	193454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478615
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4598	NC_012029	TC	3	6	193502	193507	0 %	50 %	0 %	50 %	222478615
4599	NC_012029	CGT	2	6	193512	193517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478615
4600	NC_012029	CGA	2	6	193531	193536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478615
4601	NC_012029	GCC	2	6	193725	193730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478616
4602	NC_012029	GAGGTG	2	12	193731	193742	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	222478616
4603	NC_012029	CGG	2	6	193751	193756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478616
4604	NC_012029	GTG	2	6	193761	193766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478616
4605	NC_012029	CGC	2	6	193775	193780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478616
4606	NC_012029	CGA	2	6	193946	193951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478617
4607	NC_012029	GAC	2	6	193953	193958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478617
4608	NC_012029	CGA	2	6	194045	194050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478617
4609	NC_012029	GCG	2	6	194053	194058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478617
4610	NC_012029	GCGA	2	8	194070	194077	25 %	0 %	50 %	25 %	222478617
4611	NC_012029	CG	3	6	194097	194102	0 %	0 %	50 %	50 %	222478617
4612	NC_012029	TCG	3	9	194104	194112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478617
4613	NC_012029	CGC	2	6	194129	194134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478617
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4616	NC_012029	GGT	2	6	194179	194184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222478617
4617	NC_012029	CGGTC	2	10	194192	194201	0 %	20 %	40 %	40 %	222478617
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4619	NC_012029	CTC	2	6	194217	194222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222478617
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4861	NC_012029	GTCG	2	8	202695	202702	0 %	25 %	50 %	25 %	222478625
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4981	NC_012029	GCG	2	6	207442	207447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478628
4982	NC_012029	GAG	3	9	207465	207473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222478628
4983	NC_012029	TCG	2	6	207508	207513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478628
4984	NC_012029	ACG	2	6	207545	207550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478628
4985	NC_012029	CGTT	2	8	207551	207558	0 %	50 %	25 %	25 %	222478628
4986	NC_012029	CAC	2	6	207582	207587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478629
4987	NC_012029	GGC	2	6	207614	207619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478629
4988	NC_012029	CGG	2	6	207677	207682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222478629
4989	NC_012029	CGAT	2	8	207768	207775	25 %	25 %	25 %	25 %	222478629
4990	NC_012029	CGT	2	6	207800	207805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478629
4991	NC_012029	CGAT	2	8	207951	207958	25 %	25 %	25 %	25 %	222478629
4992	NC_012029	CCTC	2	8	207985	207992	0 %	25 %	0 %	75 %	222478629
4993	NC_012029	CGC	2	6	208006	208011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478629
4994	NC_012029	GCC	2	6	208026	208031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478629
4995	NC_012029	CAG	2	6	208040	208045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478629
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4997	NC_012029	CTG	2	6	208090	208095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222478629
4998	NC_012029	CGC	2	6	208160	208165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222478629
4999	NC_012029	CGA	2	6	208195	208200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222478629
5000	NC_012029	ACC	2	6	208262	208267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222478630

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