MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 2

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012028	T	6	6	717	722	0 %	100 %	0 %	0 %	222475683
2	NC_012028	T	6	6	7792	7797	0 %	100 %	0 %	0 %	222475689
3	NC_012028	G	6	6	7822	7827	0 %	0 %	100 %	0 %	222475689
4	NC_012028	A	6	6	8237	8242	100 %	0 %	0 %	0 %	222475690
5	NC_012028	A	6	6	8713	8718	100 %	0 %	0 %	0 %	222475690
6	NC_012028	A	6	6	10030	10035	100 %	0 %	0 %	0 %	222475691
7	NC_012028	A	6	6	16744	16749	100 %	0 %	0 %	0 %	222475696
8	NC_012028	T	6	6	20948	20953	0 %	100 %	0 %	0 %	222475699
9	NC_012028	T	6	6	23409	23414	0 %	100 %	0 %	0 %	222475702
10	NC_012028	T	6	6	24225	24230	0 %	100 %	0 %	0 %	222475702
11	NC_012028	C	6	6	26018	26023	0 %	0 %	0 %	100 %	222475703
12	NC_012028	G	6	6	29709	29714	0 %	0 %	100 %	0 %	222475704
13	NC_012028	C	6	6	32583	32588	0 %	0 %	0 %	100 %	222475709
14	NC_012028	G	6	6	37497	37502	0 %	0 %	100 %	0 %	222475716
15	NC_012028	T	6	6	38651	38656	0 %	100 %	0 %	0 %	222475716
16	NC_012028	C	6	6	39273	39278	0 %	0 %	0 %	100 %	222475718
17	NC_012028	T	7	7	49331	49337	0 %	100 %	0 %	0 %	222475723
18	NC_012028	A	6	6	60216	60221	100 %	0 %	0 %	0 %	222475732
19	NC_012028	G	6	6	60513	60518	0 %	0 %	100 %	0 %	222475732
20	NC_012028	C	6	6	61382	61387	0 %	0 %	0 %	100 %	222475733
21	NC_012028	T	6	6	71054	71059	0 %	100 %	0 %	0 %	222475742
22	NC_012028	C	6	6	79806	79811	0 %	0 %	0 %	100 %	222475752
23	NC_012028	T	6	6	81992	81997	0 %	100 %	0 %	0 %	222475754
24	NC_012028	T	6	6	86706	86711	0 %	100 %	0 %	0 %	222475755
25	NC_012028	A	6	6	89939	89944	100 %	0 %	0 %	0 %	222475758
26	NC_012028	G	6	6	113670	113675	0 %	0 %	100 %	0 %	222475780
27	NC_012028	A	6	6	121053	121058	100 %	0 %	0 %	0 %	222475787
28	NC_012028	G	6	6	131048	131053	0 %	0 %	100 %	0 %	222475794
29	NC_012028	C	6	6	134269	134274	0 %	0 %	0 %	100 %	222475797
30	NC_012028	C	6	6	145985	145990	0 %	0 %	0 %	100 %	222475808
31	NC_012028	A	6	6	158040	158045	100 %	0 %	0 %	0 %	222475825
32	NC_012028	G	6	6	174215	174220	0 %	0 %	100 %	0 %	222475837
33	NC_012028	G	6	6	174237	174242	0 %	0 %	100 %	0 %	222475837
34	NC_012028	G	6	6	175618	175623	0 %	0 %	100 %	0 %	222475838
35	NC_012028	C	6	6	182944	182949	0 %	0 %	0 %	100 %	222475846
36	NC_012028	A	6	6	201209	201214	100 %	0 %	0 %	0 %	222475860
37	NC_012028	G	6	6	209826	209831	0 %	0 %	100 %	0 %	222475873
38	NC_012028	G	6	6	214912	214917	0 %	0 %	100 %	0 %	222475876
39	NC_012028	A	6	6	216013	216018	100 %	0 %	0 %	0 %	222475877
40	NC_012028	T	6	6	222717	222722	0 %	100 %	0 %	0 %	222475879
41	NC_012028	C	6	6	229238	229243	0 %	0 %	0 %	100 %	222475884
42	NC_012028	A	7	7	246001	246007	100 %	0 %	0 %	0 %	222475896
43	NC_012028	G	6	6	253384	253389	0 %	0 %	100 %	0 %	222475903
44	NC_012028	G	6	6	277042	277047	0 %	0 %	100 %	0 %	222475931
45	NC_012028	C	6	6	280035	280040	0 %	0 %	0 %	100 %	222475932
46	NC_012028	C	6	6	286419	286424	0 %	0 %	0 %	100 %	222475936
47	NC_012028	A	6	6	286618	286623	100 %	0 %	0 %	0 %	222475936
48	NC_012028	T	6	6	288902	288907	0 %	100 %	0 %	0 %	222475938
49	NC_012028	G	6	6	298169	298174	0 %	0 %	100 %	0 %	222475949
50	NC_012028	G	6	6	314769	314774	0 %	0 %	100 %	0 %	222475963
51	NC_012028	G	7	7	314994	315000	0 %	0 %	100 %	0 %	222475963
52	NC_012028	T	6	6	319321	319326	0 %	100 %	0 %	0 %	222475966
53	NC_012028	A	6	6	320222	320227	100 %	0 %	0 %	0 %	222475967
54	NC_012028	T	6	6	323141	323146	0 %	100 %	0 %	0 %	222475970
55	NC_012028	A	6	6	335037	335042	100 %	0 %	0 %	0 %	222475984
56	NC_012028	C	6	6	340675	340680	0 %	0 %	0 %	100 %	222475990
57	NC_012028	A	6	6	342816	342821	100 %	0 %	0 %	0 %	222475993
58	NC_012028	C	6	6	344766	344771	0 %	0 %	0 %	100 %	222475996
59	NC_012028	A	6	6	357963	357968	100 %	0 %	0 %	0 %	222476013
60	NC_012028	C	6	6	359020	359025	0 %	0 %	0 %	100 %	222476014
61	NC_012028	C	6	6	365200	365205	0 %	0 %	0 %	100 %	222476021
62	NC_012028	G	6	6	368105	368110	0 %	0 %	100 %	0 %	222476025
63	NC_012028	C	6	6	368302	368307	0 %	0 %	0 %	100 %	222476025
64	NC_012028	C	6	6	374494	374499	0 %	0 %	0 %	100 %	222476034
65	NC_012028	G	6	6	379255	379260	0 %	0 %	100 %	0 %	222476041
66	NC_012028	A	6	6	381129	381134	100 %	0 %	0 %	0 %	222476044
67	NC_012028	A	6	6	381680	381685	100 %	0 %	0 %	0 %	222476045
68	NC_012028	T	7	7	395806	395812	0 %	100 %	0 %	0 %	222476060
69	NC_012028	T	7	7	397988	397994	0 %	100 %	0 %	0 %	222476063
70	NC_012028	G	6	6	399202	399207	0 %	0 %	100 %	0 %	222476065
71	NC_012028	A	6	6	404059	404064	100 %	0 %	0 %	0 %	222476074
72	NC_012028	G	6	6	418177	418182	0 %	0 %	100 %	0 %	222476085
73	NC_012028	C	6	6	438240	438245	0 %	0 %	0 %	100 %	222476095
74	NC_012028	C	6	6	438673	438678	0 %	0 %	0 %	100 %	222476095
75	NC_012028	C	6	6	441547	441552	0 %	0 %	0 %	100 %	222476096
76	NC_012028	G	6	6	446265	446270	0 %	0 %	100 %	0 %	222476100
77	NC_012028	T	6	6	454341	454346	0 %	100 %	0 %	0 %	222476110
78	NC_012028	C	6	6	482493	482498	0 %	0 %	0 %	100 %	222476124
79	NC_012028	A	6	6	486644	486649	100 %	0 %	0 %	0 %	222476125
80	NC_012028	T	6	6	489626	489631	0 %	100 %	0 %	0 %	222476126
81	NC_012028	A	6	6	491852	491857	100 %	0 %	0 %	0 %	222476127
82	NC_012028	C	6	6	495497	495502	0 %	0 %	0 %	100 %	222476130
83	NC_012028	A	6	6	499999	500004	100 %	0 %	0 %	0 %	222476133
84	NC_012028	T	7	7	507162	507168	0 %	100 %	0 %	0 %	222476137
85	NC_012028	C	6	6	510857	510862	0 %	0 %	0 %	100 %	222476139
86	NC_012028	G	6	6	515677	515682	0 %	0 %	100 %	0 %	222476144

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.