MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 2

Total Repeats: 9430

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_012028	CG	3	6	181871	181876	0 %	0 %	50 %	50 %	222475844
3002	NC_012028	TCA	2	6	181889	181894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475844
3003	NC_012028	GTG	2	6	181916	181921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475844
3004	NC_012028	CGA	2	6	181925	181930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475844
3005	NC_012028	GAC	2	6	182019	182024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475844
3006	NC_012028	ACG	2	6	182041	182046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475844
3007	NC_012028	CCA	2	6	182048	182053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475844
3008	NC_012028	GCG	2	6	182062	182067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475844
3009	NC_012028	ACA	2	6	182090	182095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222475844
3010	NC_012028	CCAG	2	8	182096	182103	25 %	0 %	25 %	50 %	222475844
3011	NC_012028	CCG	2	6	182144	182149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475844
3012	NC_012028	GAT	2	6	182161	182166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475844
3013	NC_012028	AGCC	2	8	182174	182181	25 %	0 %	25 %	50 %	222475844
3014	NC_012028	TCGA	2	8	182191	182198	25 %	25 %	25 %	25 %	222475845
3015	NC_012028	ACT	2	6	182257	182262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475845
3016	NC_012028	TCC	2	6	182291	182296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475845
3017	NC_012028	AG	3	6	182326	182331	50 %	0 %	50 %	0 %	222475845
3018	NC_012028	CA	3	6	182466	182471	50 %	0 %	0 %	50 %	222475845
3019	NC_012028	GATC	2	8	182522	182529	25 %	25 %	25 %	25 %	222475845
3020	NC_012028	TGG	2	6	182562	182567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475845
3021	NC_012028	GAC	2	6	182569	182574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475845
3022	NC_012028	TCG	2	6	182618	182623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475845
3023	NC_012028	AGC	2	6	182628	182633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475845
3024	NC_012028	ACG	2	6	182639	182644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475845
3025	NC_012028	GCA	2	6	182703	182708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475845
3026	NC_012028	CT	3	6	182739	182744	0 %	50 %	0 %	50 %	222475845
3027	NC_012028	AGT	3	9	182750	182758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475845
3028	NC_012028	CTTG	2	8	182898	182905	0 %	50 %	25 %	25 %	222475846
3029	NC_012028	C	6	6	182944	182949	0 %	0 %	0 %	100 %	222475846
3030	NC_012028	TCG	2	6	182966	182971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475846
3031	NC_012028	CT	3	6	182993	182998	0 %	50 %	0 %	50 %	222475846
3032	NC_012028	TCGT	2	8	183071	183078	0 %	50 %	25 %	25 %	222475846
3033	NC_012028	TGT	2	6	183095	183100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222475846
3034	NC_012028	CGCA	2	8	183120	183127	25 %	0 %	25 %	50 %	222475846
3035	NC_012028	GTATC	2	10	183193	183202	20 %	40 %	20 %	20 %	222475846
3036	NC_012028	CGG	2	6	183239	183244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475846
3037	NC_012028	CGT	2	6	183363	183368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475846
3038	NC_012028	GTC	2	6	183385	183390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475846
3039	NC_012028	CGA	2	6	183467	183472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475846
3040	NC_012028	TCG	2	6	183485	183490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475846
3041	NC_012028	GTC	2	6	183523	183528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475846
3042	NC_012028	AC	3	6	183535	183540	50 %	0 %	0 %	50 %	222475846
3043	NC_012028	TTC	2	6	183586	183591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475846
3044	NC_012028	GTT	2	6	183723	183728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222475846
3045	NC_012028	GGT	2	6	183756	183761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475846
3046	NC_012028	GTG	2	6	183769	183774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475846
3047	NC_012028	TTCG	2	8	183832	183839	0 %	50 %	25 %	25 %	222475846
3048	NC_012028	ACGG	2	8	183844	183851	25 %	0 %	50 %	25 %	222475846
3049	NC_012028	CGT	3	9	183883	183891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475846
3050	NC_012028	CTT	2	6	183907	183912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475846
3051	NC_012028	ACC	2	6	183950	183955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475846
3052	NC_012028	CGT	2	6	183957	183962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475846
3053	NC_012028	TG	3	6	183974	183979	0 %	50 %	50 %	0 %	222475846
3054	NC_012028	CAGC	2	8	183983	183990	25 %	0 %	25 %	50 %	222475846
3055	NC_012028	CGT	2	6	183999	184004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475846
3056	NC_012028	TCC	2	6	184114	184119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475847
3057	NC_012028	CTG	2	6	184166	184171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475847
3058	NC_012028	GTA	2	6	184179	184184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475847
3059	NC_012028	CGT	2	6	184211	184216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475847
3060	NC_012028	GGT	2	6	184229	184234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475847
3061	NC_012028	GGTCA	2	10	184335	184344	20 %	20 %	40 %	20 %	222475847
3062	NC_012028	GTC	2	6	184362	184367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475847
3063	NC_012028	GGA	2	6	184379	184384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475847
3064	NC_012028	CA	3	6	184444	184449	50 %	0 %	0 %	50 %	222475847
3065	NC_012028	GGT	2	6	184451	184456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475847
3066	NC_012028	AGA	2	6	184812	184817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475848
3067	NC_012028	GGC	2	6	184861	184866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475848
3068	NC_012028	CAGC	2	8	184906	184913	25 %	0 %	25 %	50 %	222475848
3069	NC_012028	CGA	2	6	184926	184931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475848
3070	NC_012028	CAG	2	6	184939	184944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475848
3071	NC_012028	GAT	2	6	184954	184959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475848
3072	NC_012028	CGA	2	6	185031	185036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475848
3073	NC_012028	CCAC	2	8	185040	185047	25 %	0 %	0 %	75 %	222475848
3074	NC_012028	GCGG	2	8	185057	185064	0 %	0 %	75 %	25 %	222475848
3075	NC_012028	CAG	2	6	185102	185107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475848
3076	NC_012028	TCC	2	6	185150	185155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475848
3077	NC_012028	CCG	2	6	185162	185167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475848
3078	NC_012028	GCC	3	9	185210	185218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475848
3079	NC_012028	GACT	2	8	185233	185240	25 %	25 %	25 %	25 %	222475848
3080	NC_012028	ACG	2	6	185264	185269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475848
3081	NC_012028	GAAC	2	8	185286	185293	50 %	0 %	25 %	25 %	222475848
3082	NC_012028	TCG	2	6	185329	185334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475848
3083	NC_012028	CCG	2	6	185357	185362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475848
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3085	NC_012028	GGC	2	6	185590	185595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475848
3086	NC_012028	CGA	2	6	185608	185613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475848
3087	NC_012028	TCG	2	6	185615	185620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475848
3088	NC_012028	CT	3	6	185628	185633	0 %	50 %	0 %	50 %	222475849
3089	NC_012028	CGAGCA	2	12	185684	185695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475849
3090	NC_012028	GTA	2	6	185700	185705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475849
3091	NC_012028	ACG	2	6	185719	185724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475849
3092	NC_012028	GAGTGC	2	12	185772	185783	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222475849
3093	NC_012028	CGA	2	6	185808	185813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475849
3094	NC_012028	CGTG	2	8	185828	185835	0 %	25 %	50 %	25 %	222475849
3095	NC_012028	CGA	2	6	185843	185848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475849
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3098	NC_012028	GATC	2	8	185973	185980	25 %	25 %	25 %	25 %	222475849
3099	NC_012028	ACGCC	2	10	185991	186000	20 %	0 %	20 %	60 %	222475849
3100	NC_012028	ACG	2	6	186037	186042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475849
3101	NC_012028	CGA	2	6	186107	186112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475849
3102	NC_012028	AGT	2	6	186166	186171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475849
3103	NC_012028	AGCC	2	8	186175	186182	25 %	0 %	25 %	50 %	222475849
3104	NC_012028	ATC	2	6	186196	186201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475849
3105	NC_012028	GCC	2	6	186245	186250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475849
3106	NC_012028	GCC	3	9	186254	186262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475849
3107	NC_012028	CCG	2	6	186346	186351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475849
3108	NC_012028	CGG	2	6	186362	186367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475849
3109	NC_012028	CGA	2	6	186368	186373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475849
3110	NC_012028	CGA	2	6	186377	186382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475849
3111	NC_012028	TCA	2	6	186389	186394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475849
3112	NC_012028	CGC	2	6	186482	186487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475849
3113	NC_012028	CGA	2	6	186491	186496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475849
3114	NC_012028	CAGC	2	8	186519	186526	25 %	0 %	25 %	50 %	222475849
3115	NC_012028	TTG	2	6	186856	186861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222475850
3116	NC_012028	TCG	3	9	186882	186890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475850
3117	NC_012028	TGTC	2	8	187033	187040	0 %	50 %	25 %	25 %	222475850
3118	NC_012028	GAAT	2	8	187046	187053	50 %	25 %	25 %	0 %	222475850
3119	NC_012028	TGT	2	6	187102	187107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222475850
3120	NC_012028	GAC	2	6	187115	187120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475850
3121	NC_012028	TCG	2	6	187143	187148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475850
3122	NC_012028	TCGGC	2	10	187162	187171	0 %	20 %	40 %	40 %	222475850
3123	NC_012028	TCTG	2	8	187191	187198	0 %	50 %	25 %	25 %	222475850
3124	NC_012028	GCT	2	6	187224	187229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475850
3125	NC_012028	CGA	2	6	187342	187347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475850
3126	NC_012028	AG	3	6	187367	187372	50 %	0 %	50 %	0 %	222475850
3127	NC_012028	ATCTCG	2	12	187416	187427	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222475850
3128	NC_012028	CGAC	2	8	187480	187487	25 %	0 %	25 %	50 %	222475850
3129	NC_012028	GCT	2	6	187513	187518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475850
3130	NC_012028	GCA	2	6	187539	187544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475850
3131	NC_012028	GTG	2	6	187614	187619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475850
3132	NC_012028	GAG	2	6	187736	187741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475850
3133	NC_012028	CTG	2	6	187817	187822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475850
3134	NC_012028	GTC	2	6	187824	187829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475850
3135	NC_012028	CGA	2	6	187834	187839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475850
3136	NC_012028	GAGC	2	8	187888	187895	25 %	0 %	50 %	25 %	222475850
3137	NC_012028	GCC	2	6	187899	187904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475850
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3139	NC_012028	TCG	2	6	188034	188039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475850
3140	NC_012028	ACC	2	6	188145	188150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475850
3141	NC_012028	CTG	2	6	188181	188186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475850
3142	NC_012028	GAC	2	6	188198	188203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475850
3143	NC_012028	GCG	2	6	188278	188283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475850
3144	NC_012028	GAA	2	6	188324	188329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475850
3145	NC_012028	CCA	2	6	188355	188360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475850
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3147	NC_012028	TCG	2	6	188457	188462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475850
3148	NC_012028	GTG	2	6	188473	188478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475850
3149	NC_012028	TTC	2	6	189056	189061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475851
3150	NC_012028	GTC	2	6	189074	189079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475851
3151	NC_012028	TA	3	6	189240	189245	50 %	50 %	0 %	0 %	222475852
3152	NC_012028	GTCC	2	8	189328	189335	0 %	25 %	25 %	50 %	222475852
3153	NC_012028	CCG	2	6	189348	189353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475852
3154	NC_012028	TTC	2	6	189374	189379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475852
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3156	NC_012028	TC	4	8	189399	189406	0 %	50 %	0 %	50 %	222475852
3157	NC_012028	CGA	2	6	189441	189446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475852
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3159	NC_012028	GTC	2	6	189574	189579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475853
3160	NC_012028	TCC	2	6	189587	189592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475853
3161	NC_012028	TCG	2	6	189633	189638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475853
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3163	NC_012028	GAAT	2	8	189655	189662	50 %	25 %	25 %	0 %	222475853
3164	NC_012028	TTCGAG	2	12	189710	189721	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222475853
3165	NC_012028	TCGGGA	2	12	189741	189752	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222475853
3166	NC_012028	CGG	2	6	189778	189783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475853
3167	NC_012028	CCGG	2	8	189815	189822	0 %	0 %	50 %	50 %	222475853
3168	NC_012028	GTC	2	6	189833	189838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475853
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3174	NC_012028	GCA	2	6	190060	190065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475853
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3179	NC_012028	TCG	2	6	190176	190181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475853
3180	NC_012028	GTCGGA	2	12	190184	190195	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222475853
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3191	NC_012028	CGT	2	6	190862	190867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475854
3192	NC_012028	GGA	2	6	190937	190942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475854
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3195	NC_012028	GAC	2	6	191061	191066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475854
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3199	NC_012028	GCT	2	6	191197	191202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475855
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3203	NC_012028	CGG	2	6	191391	191396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475855
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3207	NC_012028	ACT	2	6	191512	191517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475855
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3209	NC_012028	GCT	2	6	191623	191628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475855
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3213	NC_012028	TCG	2	6	191838	191843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475855
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3215	NC_012028	GTC	2	6	191990	191995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475855
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3220	NC_012028	CCT	2	6	192268	192273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475855
3221	NC_012028	TC	3	6	192441	192446	0 %	50 %	0 %	50 %	222475855
3222	NC_012028	CGCT	2	8	192558	192565	0 %	25 %	25 %	50 %	222475855
3223	NC_012028	TCG	2	6	192636	192641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475855
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3225	NC_012028	CTT	2	6	193685	193690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475856
3226	NC_012028	CTG	2	6	193755	193760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475856
3227	NC_012028	TCG	2	6	193779	193784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475856
3228	NC_012028	CTA	2	6	193987	193992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475856
3229	NC_012028	GAC	2	6	194003	194008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475856
3230	NC_012028	CG	3	6	194077	194082	0 %	0 %	50 %	50 %	222475856
3231	NC_012028	GAA	2	6	194086	194091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475856
3232	NC_012028	AGT	2	6	194141	194146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475856
3233	NC_012028	TTC	2	6	194159	194164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475856
3234	NC_012028	GCT	2	6	194242	194247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475856
3235	NC_012028	ATC	2	6	194279	194284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475856
3236	NC_012028	GTAC	2	8	194406	194413	25 %	25 %	25 %	25 %	222475856
3237	NC_012028	CGC	2	6	194458	194463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475856
3238	NC_012028	CAC	2	6	194484	194489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475856
3239	NC_012028	ACT	2	6	194505	194510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475856
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3241	NC_012028	GCT	2	6	194593	194598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475856
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3244	NC_012028	TGG	3	9	194690	194698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475856
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3359	NC_012028	CAC	2	6	201324	201329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475860
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3477	NC_012028	GCAA	2	8	209532	209539	50 %	0 %	25 %	25 %	222475873
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3481	NC_012028	GCG	2	6	209718	209723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475873
3482	NC_012028	GAA	2	6	209794	209799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475873
3483	NC_012028	G	6	6	209826	209831	0 %	0 %	100 %	0 %	222475873
3484	NC_012028	CA	3	6	209848	209853	50 %	0 %	0 %	50 %	222475873
3485	NC_012028	TCG	2	6	209880	209885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475873
3486	NC_012028	AGC	2	6	209973	209978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475873
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3491	NC_012028	TTG	2	6	210074	210079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222475873
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3494	NC_012028	CCG	2	6	210253	210258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475873
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