MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 2

Total Repeats: 9430

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_012028	CGA	2	6	499983	499988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
9002	NC_012028	A	6	6	499999	500004	100 %	0 %	0 %	0 %	222476133
9003	NC_012028	GAAACG	2	12	500017	500028	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	222476133
9004	NC_012028	TGA	2	6	500046	500051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222476133
9005	NC_012028	GGA	2	6	500130	500135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222476133
9006	NC_012028	GAA	2	6	500256	500261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222476133
9007	NC_012028	ACT	2	6	500331	500336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222476133
9008	NC_012028	GGA	2	6	500337	500342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222476133
9009	NC_012028	CG	3	6	500380	500385	0 %	0 %	50 %	50 %	222476133
9010	NC_012028	AGTC	2	8	500386	500393	25 %	25 %	25 %	25 %	222476133
9011	NC_012028	GGA	2	6	500397	500402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222476133
9012	NC_012028	TGGC	2	8	500404	500411	0 %	25 %	50 %	25 %	222476133
9013	NC_012028	ACG	2	6	500435	500440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
9014	NC_012028	TC	3	6	500479	500484	0 %	50 %	0 %	50 %	222476133
9015	NC_012028	TCG	2	6	500543	500548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476133
9016	NC_012028	CTG	2	6	500549	500554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476133
9017	NC_012028	TCT	2	6	500558	500563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222476133
9018	NC_012028	GC	3	6	500574	500579	0 %	0 %	50 %	50 %	222476133
9019	NC_012028	TCGCA	2	10	500617	500626	20 %	20 %	20 %	40 %	222476133
9020	NC_012028	CCG	2	6	500653	500658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222476133
9021	NC_012028	ACG	2	6	500705	500710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
9022	NC_012028	GGA	2	6	500805	500810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222476133
9023	NC_012028	GCGCC	2	10	500840	500849	0 %	0 %	40 %	60 %	222476133
9024	NC_012028	ACG	2	6	500912	500917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
9025	NC_012028	AG	3	6	500934	500939	50 %	0 %	50 %	0 %	222476133
9026	NC_012028	CGA	2	6	500952	500957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
9027	NC_012028	CCGC	2	8	500969	500976	0 %	0 %	25 %	75 %	222476133
9028	NC_012028	GAA	2	6	500977	500982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222476133
9029	NC_012028	ACG	2	6	501011	501016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
9030	NC_012028	CAG	2	6	501073	501078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
9031	NC_012028	CGA	2	6	501165	501170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
9032	NC_012028	GGATCT	2	12	501180	501191	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222476133
9033	NC_012028	GGA	2	6	501258	501263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222476133
9034	NC_012028	GAA	2	6	501301	501306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222476133
9035	NC_012028	AAG	2	6	501340	501345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222476133
9036	NC_012028	AGA	2	6	501366	501371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222476133
9037	NC_012028	CGA	2	6	501405	501410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
9038	NC_012028	CAGG	2	8	501447	501454	25 %	0 %	50 %	25 %	222476133
9039	NC_012028	CGA	2	6	501462	501467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
9040	NC_012028	GAT	2	6	501508	501513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222476133
9041	NC_012028	GAC	2	6	501532	501537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
9042	NC_012028	TGC	2	6	501540	501545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476133
9043	NC_012028	TGG	2	6	501563	501568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222476133
9044	NC_012028	AGG	2	6	501578	501583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222476133
9045	NC_012028	CGA	2	6	501584	501589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
9046	NC_012028	GAC	2	6	501636	501641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
9047	NC_012028	GCCGAA	2	12	501679	501690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
9048	NC_012028	GT	3	6	501695	501700	0 %	50 %	50 %	0 %	222476133
9049	NC_012028	CGA	2	6	501702	501707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
9050	NC_012028	AAG	2	6	501715	501720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222476133
9051	NC_012028	TCG	2	6	501788	501793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476133
9052	NC_012028	CAG	2	6	501796	501801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
9053	NC_012028	CGA	2	6	501831	501836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
9054	NC_012028	CGA	2	6	501852	501857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
9055	NC_012028	CTCG	2	8	501895	501902	0 %	25 %	25 %	50 %	222476133
9056	NC_012028	CGA	2	6	501939	501944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
9057	NC_012028	CTG	2	6	501959	501964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476133
9058	NC_012028	TCG	2	6	501998	502003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476133
9059	NC_012028	GAC	2	6	502027	502032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
9060	NC_012028	CA	3	6	502067	502072	50 %	0 %	0 %	50 %	222476133
9061	NC_012028	CGA	2	6	502188	502193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
9062	NC_012028	CTC	2	6	502281	502286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222476133
9063	NC_012028	TCG	2	6	502343	502348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476133
9064	NC_012028	GTG	2	6	502367	502372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222476133
9065	NC_012028	AGT	2	6	502414	502419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222476133
9066	NC_012028	CGA	2	6	502428	502433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476133
9067	NC_012028	GAAT	2	8	502530	502537	50 %	25 %	25 %	0 %	222476133
9068	NC_012028	ATC	2	6	502612	502617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222476133
9069	NC_012028	TGA	2	6	502629	502634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222476133
9070	NC_012028	TC	3	6	502640	502645	0 %	50 %	0 %	50 %	222476133
9071	NC_012028	GAA	2	6	502648	502653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222476133
9072	NC_012028	CTT	2	6	503372	503377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222476134
9073	NC_012028	TTCG	2	8	503378	503385	0 %	50 %	25 %	25 %	222476134
9074	NC_012028	CTG	2	6	503388	503393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476134
9075	NC_012028	ACA	2	6	503404	503409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222476134
9076	NC_012028	CAT	2	6	503429	503434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222476134
9077	NC_012028	CTG	2	6	503514	503519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476134
9078	NC_012028	CCT	2	6	503573	503578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222476134
9079	NC_012028	CTCG	2	8	503585	503592	0 %	25 %	25 %	50 %	222476134
9080	NC_012028	GTC	2	6	503595	503600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476134
9081	NC_012028	TAT	2	6	503604	503609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222476134
9082	NC_012028	GCT	2	6	503969	503974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476134
9083	NC_012028	CTA	2	6	503977	503982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222476134
9084	NC_012028	TC	3	6	503993	503998	0 %	50 %	0 %	50 %	222476134
9085	NC_012028	TGC	2	6	504004	504009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476134
9086	NC_012028	TC	4	8	504035	504042	0 %	50 %	0 %	50 %	222476134
9087	NC_012028	CG	4	8	504043	504050	0 %	0 %	50 %	50 %	222476134
9088	NC_012028	GGT	2	6	504092	504097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222476134
9089	NC_012028	TCT	2	6	504100	504105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222476134
9090	NC_012028	ACT	2	6	504106	504111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222476134
9091	NC_012028	AG	3	6	504127	504132	50 %	0 %	50 %	0 %	222476134
9092	NC_012028	CTC	2	6	504193	504198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222476134
9093	NC_012028	GGAT	2	8	504237	504244	25 %	25 %	50 %	0 %	222476134
9094	NC_012028	CTCC	2	8	504310	504317	0 %	25 %	0 %	75 %	222476134
9095	NC_012028	CTT	2	6	504413	504418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222476134
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9099	NC_012028	CTC	2	6	504483	504488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222476134
9100	NC_012028	GTC	2	6	504498	504503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476134
9101	NC_012028	TC	3	6	504502	504507	0 %	50 %	0 %	50 %	222476134
9102	NC_012028	CTG	2	6	504522	504527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222476134
9103	NC_012028	CTT	2	6	504560	504565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222476134
9104	NC_012028	TGG	2	6	504628	504633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222476134
9105	NC_012028	AAGA	2	8	505006	505013	75 %	0 %	25 %	0 %	222476135
9106	NC_012028	CGA	2	6	505069	505074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476135
9107	NC_012028	TCC	2	6	505077	505082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222476135
9108	NC_012028	CGA	2	6	505180	505185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476135
9109	NC_012028	AAG	2	6	505193	505198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222476135
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9116	NC_012028	GCGT	2	8	505569	505576	0 %	25 %	50 %	25 %	222476135
9117	NC_012028	CGA	2	6	505603	505608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476135
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9120	NC_012028	CAA	2	6	505727	505732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222476135
9121	NC_012028	GAC	2	6	505760	505765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476135
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9123	NC_012028	ACG	2	6	505839	505844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222476135
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9237	NC_012028	CAA	2	6	515594	515599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222476144
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9239	NC_012028	CCT	2	6	515621	515626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222476144
9240	NC_012028	G	6	6	515677	515682	0 %	0 %	100 %	0 %	222476144
9241	NC_012028	CTA	2	6	515715	515720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222476144
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9248	NC_012028	GTA	2	6	516121	516126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222476144
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9355	NC_012028	AAGA	2	8	521425	521432	75 %	0 %	25 %	0 %	222476152
9356	NC_012028	GGA	2	6	521458	521463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222476152
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