MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 2

Total Repeats: 9430

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_012028	TGG	2	6	290901	290906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475942
5002	NC_012028	TCG	2	6	290954	290959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475942
5003	NC_012028	ACG	2	6	290968	290973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475942
5004	NC_012028	ACGA	2	8	290998	291005	50 %	0 %	25 %	25 %	222475942
5005	NC_012028	GGC	2	6	291196	291201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475942
5006	NC_012028	CAT	2	6	291213	291218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475942
5007	NC_012028	CCA	2	6	291238	291243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475942
5008	NC_012028	TCG	2	6	291292	291297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475942
5009	NC_012028	ACG	3	9	291301	291309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475942
5010	NC_012028	TTC	2	6	291342	291347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475942
5011	NC_012028	CGG	2	6	291416	291421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475942
5012	NC_012028	TCG	2	6	291530	291535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475942
5013	NC_012028	TCGT	2	8	291550	291557	0 %	50 %	25 %	25 %	222475942
5014	NC_012028	CCT	2	6	291581	291586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475942
5015	NC_012028	GTC	2	6	291634	291639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475942
5016	NC_012028	CGC	2	6	291672	291677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475942
5017	NC_012028	CG	3	6	291717	291722	0 %	0 %	50 %	50 %	222475942
5018	NC_012028	CGT	2	6	291749	291754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475942
5019	NC_012028	GC	3	6	291788	291793	0 %	0 %	50 %	50 %	222475942
5020	NC_012028	GGA	2	6	291818	291823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475942
5021	NC_012028	GTT	2	6	291865	291870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222475943
5022	NC_012028	CGA	2	6	291990	291995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475943
5023	NC_012028	TCG	2	6	292028	292033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475943
5024	NC_012028	CGAGC	2	10	292044	292053	20 %	0 %	40 %	40 %	222475943
5025	NC_012028	GGTGA	2	10	292105	292114	20 %	20 %	60 %	0 %	222475943
5026	NC_012028	TCG	2	6	292125	292130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475943
5027	NC_012028	CAG	2	6	292174	292179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475943
5028	NC_012028	CGT	2	6	292197	292202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475943
5029	NC_012028	CGA	2	6	292239	292244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475943
5030	NC_012028	CGA	2	6	292278	292283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475943
5031	NC_012028	TCA	2	6	292290	292295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475943
5032	NC_012028	GGT	2	6	292419	292424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475943
5033	NC_012028	TCG	2	6	292439	292444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475943
5034	NC_012028	CG	3	6	292497	292502	0 %	0 %	50 %	50 %	222475943
5035	NC_012028	GGTC	2	8	292542	292549	0 %	25 %	50 %	25 %	222475943
5036	NC_012028	TGG	2	6	292554	292559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475943
5037	NC_012028	ACG	2	6	292568	292573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475943
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5039	NC_012028	CGA	2	6	292596	292601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475943
5040	NC_012028	ACG	2	6	292643	292648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475943
5041	NC_012028	GTC	2	6	292651	292656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475943
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5043	NC_012028	CTC	2	6	292699	292704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475943
5044	NC_012028	CCG	2	6	292709	292714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475943
5045	NC_012028	GAC	2	6	292717	292722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475943
5046	NC_012028	GTC	2	6	292729	292734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475943
5047	NC_012028	CGAACG	2	12	292755	292766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475943
5048	NC_012028	CGA	2	6	292797	292802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475943
5049	NC_012028	GCCG	2	8	292806	292813	0 %	0 %	50 %	50 %	222475943
5050	NC_012028	GT	3	6	292821	292826	0 %	50 %	50 %	0 %	222475943
5051	NC_012028	TCG	2	6	292949	292954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475943
5052	NC_012028	TGT	2	6	292989	292994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222475943
5053	NC_012028	GCCG	2	8	293140	293147	0 %	0 %	50 %	50 %	222475944
5054	NC_012028	GCC	2	6	293209	293214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475944
5055	NC_012028	CGG	2	6	293220	293225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475944
5056	NC_012028	CGA	2	6	293280	293285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475944
5057	NC_012028	GTATC	2	10	293298	293307	20 %	40 %	20 %	20 %	222475944
5058	NC_012028	GTC	2	6	293308	293313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475944
5059	NC_012028	CGG	2	6	293375	293380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475944
5060	NC_012028	TCC	2	6	293402	293407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475944
5061	NC_012028	CGA	2	6	293439	293444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475944
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5065	NC_012028	CTC	2	6	293560	293565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475944
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5068	NC_012028	CGT	2	6	293733	293738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475944
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5070	NC_012028	TTC	2	6	293788	293793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475944
5071	NC_012028	CCGA	2	8	293797	293804	25 %	0 %	25 %	50 %	222475944
5072	NC_012028	CTCG	2	8	293841	293848	0 %	25 %	25 %	50 %	222475944
5073	NC_012028	GAA	2	6	293866	293871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222475944
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5080	NC_012028	GGC	2	6	294127	294132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475944
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5085	NC_012028	CGA	2	6	294300	294305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475944
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5087	NC_012028	CGT	2	6	294345	294350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475944
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5090	NC_012028	GTC	2	6	294409	294414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475944
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5093	NC_012028	TCGC	2	8	294519	294526	0 %	25 %	25 %	50 %	222475944
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5102	NC_012028	GTA	2	6	294706	294711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475944
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5104	NC_012028	CGGCGT	2	12	294765	294776	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222475944
5105	NC_012028	GCC	2	6	294802	294807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475944
5106	NC_012028	CGAT	2	8	295241	295248	25 %	25 %	25 %	25 %	222475945
5107	NC_012028	ACG	2	6	295265	295270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475945
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5110	NC_012028	ATC	2	6	295388	295393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475945
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5113	NC_012028	TGG	2	6	295430	295435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475945
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5115	NC_012028	TCG	2	6	295512	295517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475945
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5117	NC_012028	GTC	2	6	295613	295618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475945
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5119	NC_012028	ACCG	2	8	295644	295651	25 %	0 %	25 %	50 %	222475945
5120	NC_012028	GCT	2	6	295678	295683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475945
5121	NC_012028	CGG	2	6	295696	295701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475945
5122	NC_012028	CGCCGT	2	12	295702	295713	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222475945
5123	NC_012028	GAT	2	6	295726	295731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475945
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5156	NC_012028	CGA	2	6	297993	297998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475949
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5224	NC_012028	ACTCC	2	10	300940	300949	20 %	20 %	0 %	60 %	222475951
5225	NC_012028	CGTCT	2	10	300960	300969	0 %	40 %	20 %	40 %	222475951
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5230	NC_012028	AGCCGT	2	12	301274	301285	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222475951
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5234	NC_012028	GGC	2	6	301398	301403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475951
5235	NC_012028	CGA	2	6	301409	301414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475951
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5237	NC_012028	ACG	2	6	301435	301440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475951
5238	NC_012028	TC	3	6	301474	301479	0 %	50 %	0 %	50 %	222475951
5239	NC_012028	CGG	2	6	301482	301487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475951
5240	NC_012028	TCGA	2	8	301488	301495	25 %	25 %	25 %	25 %	222475951
5241	NC_012028	GAC	2	6	301512	301517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475951
5242	NC_012028	GTA	2	6	301566	301571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475951
5243	NC_012028	TGG	2	6	301599	301604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222475951
5244	NC_012028	TGA	2	6	301606	301611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475951
5245	NC_012028	TTC	2	6	301653	301658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222475951
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5248	NC_012028	TCG	2	6	301723	301728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475951
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5253	NC_012028	GTC	2	6	303030	303035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475952
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5259	NC_012028	ACC	2	6	303254	303259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222475952
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5261	NC_012028	ACG	2	6	303274	303279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475952
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5266	NC_012028	CGG	2	6	303401	303406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222475952
5267	NC_012028	CGA	2	6	303409	303414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475952
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5271	NC_012028	CGA	2	6	303661	303666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475952
5272	NC_012028	CTG	2	6	303725	303730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475952
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5280	NC_012028	ACTG	2	8	304067	304074	25 %	25 %	25 %	25 %	222475953
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5342	NC_012028	ACG	2	6	306431	306436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475955
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5350	NC_012028	GAC	2	6	306685	306690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475955
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5352	NC_012028	CGA	2	6	306768	306773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475955
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5355	NC_012028	CCGT	2	8	306825	306832	0 %	25 %	25 %	50 %	222475955
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5358	NC_012028	CG	3	6	307060	307065	0 %	0 %	50 %	50 %	222475955
5359	NC_012028	TGCC	2	8	307083	307090	0 %	25 %	25 %	50 %	222475955
5360	NC_012028	TGT	2	6	307129	307134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222475955
5361	NC_012028	CCG	2	6	307169	307174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475955
5362	NC_012028	TCA	2	6	307271	307276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222475955
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5475	NC_012028	CGA	2	6	312741	312746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475960
5476	NC_012028	TCG	2	6	312749	312754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475960
5477	NC_012028	GGAC	2	8	312774	312781	25 %	0 %	50 %	25 %	222475960
5478	NC_012028	GAC	2	6	312826	312831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222475960
5479	NC_012028	GTCG	2	8	312835	312842	0 %	25 %	50 %	25 %	222475960
5480	NC_012028	GGAC	2	8	312857	312864	25 %	0 %	50 %	25 %	222475960
5481	NC_012028	TCC	2	6	312890	312895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222475960
5482	NC_012028	CACTTC	2	12	312901	312912	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	222475960
5483	NC_012028	TCG	2	6	312923	312928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475960
5484	NC_012028	GAG	2	6	312958	312963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222475960
5485	NC_012028	CCTG	2	8	312980	312987	0 %	25 %	25 %	50 %	222475960
5486	NC_012028	TGA	2	6	313023	313028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222475960
5487	NC_012028	GC	3	6	313148	313153	0 %	0 %	50 %	50 %	222475960
5488	NC_012028	TGT	2	6	313155	313160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222475960
5489	NC_012028	ACCC	2	8	313238	313245	25 %	0 %	0 %	75 %	222475960
5490	NC_012028	CCG	2	6	313283	313288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475960
5491	NC_012028	CGCTGT	2	12	313416	313427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475960
5492	NC_012028	CGT	2	6	313464	313469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475960
5493	NC_012028	ACCTG	2	10	313503	313512	20 %	20 %	20 %	40 %	222475960
5494	NC_012028	TCG	2	6	313517	313522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475960
5495	NC_012028	TCGT	2	8	313577	313584	0 %	50 %	25 %	25 %	222475960
5496	NC_012028	CA	3	6	313588	313593	50 %	0 %	0 %	50 %	222475960
5497	NC_012028	TGTGC	2	10	313829	313838	0 %	40 %	40 %	20 %	222475960
5498	NC_012028	CCG	2	6	314023	314028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222475961
5499	NC_012028	TGC	2	6	314063	314068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475961
5500	NC_012028	CGT	3	9	314099	314107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222475961

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