MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 1919

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011852	AT	3	6	127	132	50 %	50 %	0 %	0 %	219870280
2	NC_011852	TC	3	6	2253	2258	0 %	50 %	0 %	50 %	219870281
3	NC_011852	AT	3	6	10474	10479	50 %	50 %	0 %	0 %	219870283
4	NC_011852	AC	3	6	11278	11283	50 %	0 %	0 %	50 %	219870283
5	NC_011852	CA	3	6	12769	12774	50 %	0 %	0 %	50 %	219870286
6	NC_011852	AC	3	6	13323	13328	50 %	0 %	0 %	50 %	219870287
7	NC_011852	AG	3	6	14852	14857	50 %	0 %	50 %	0 %	219870288
8	NC_011852	TG	3	6	16253	16258	0 %	50 %	50 %	0 %	219870289
9	NC_011852	CT	3	6	17139	17144	0 %	50 %	0 %	50 %	219870290
10	NC_011852	TC	3	6	17184	17189	0 %	50 %	0 %	50 %	219870290
11	NC_011852	AT	3	6	20456	20461	50 %	50 %	0 %	0 %	219870293
12	NC_011852	AT	4	8	20913	20920	50 %	50 %	0 %	0 %	219870293
13	NC_011852	TG	3	6	21071	21076	0 %	50 %	50 %	0 %	219870293
14	NC_011852	AT	4	8	21274	21281	50 %	50 %	0 %	0 %	219870294
15	NC_011852	CT	3	6	21518	21523	0 %	50 %	0 %	50 %	219870294
16	NC_011852	AT	3	6	21542	21547	50 %	50 %	0 %	0 %	219870294
17	NC_011852	AT	3	6	22383	22388	50 %	50 %	0 %	0 %	219870295
18	NC_011852	AG	3	6	22451	22456	50 %	0 %	50 %	0 %	219870295
19	NC_011852	AG	3	6	22466	22471	50 %	0 %	50 %	0 %	219870295
20	NC_011852	GT	3	6	23598	23603	0 %	50 %	50 %	0 %	219870296
21	NC_011852	TC	3	6	23734	23739	0 %	50 %	0 %	50 %	219870296
22	NC_011852	TA	3	6	25228	25233	50 %	50 %	0 %	0 %	219870296
23	NC_011852	TC	3	6	26978	26983	0 %	50 %	0 %	50 %	219870298
24	NC_011852	TC	4	8	27270	27277	0 %	50 %	0 %	50 %	219870298
25	NC_011852	AT	3	6	28967	28972	50 %	50 %	0 %	0 %	219870300
26	NC_011852	GT	3	6	29512	29517	0 %	50 %	50 %	0 %	219870300
27	NC_011852	GA	3	6	29700	29705	50 %	0 %	50 %	0 %	219870300
28	NC_011852	CG	3	6	30827	30832	0 %	0 %	50 %	50 %	219870303
29	NC_011852	AG	3	6	34374	34379	50 %	0 %	50 %	0 %	219870306
30	NC_011852	AT	3	6	34538	34543	50 %	50 %	0 %	0 %	219870306
31	NC_011852	GA	3	6	34676	34681	50 %	0 %	50 %	0 %	219870306
32	NC_011852	TC	3	6	34753	34758	0 %	50 %	0 %	50 %	219870307
33	NC_011852	AT	3	6	35510	35515	50 %	50 %	0 %	0 %	219870307
34	NC_011852	AT	3	6	37846	37851	50 %	50 %	0 %	0 %	219870308
35	NC_011852	CT	3	6	38204	38209	0 %	50 %	0 %	50 %	219870309
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37	NC_011852	AT	3	6	38736	38741	50 %	50 %	0 %	0 %	219870309
38	NC_011852	AC	3	6	39796	39801	50 %	0 %	0 %	50 %	219870309
39	NC_011852	TC	3	6	42290	42295	0 %	50 %	0 %	50 %	219870310
40	NC_011852	GT	3	6	43477	43482	0 %	50 %	50 %	0 %	219870312
41	NC_011852	TG	3	6	44298	44303	0 %	50 %	50 %	0 %	219870312
42	NC_011852	TG	3	6	49448	49453	0 %	50 %	50 %	0 %	219870317
43	NC_011852	TC	3	6	49521	49526	0 %	50 %	0 %	50 %	219870317
44	NC_011852	AG	3	6	49543	49548	50 %	0 %	50 %	0 %	219870317
45	NC_011852	CT	3	6	50835	50840	0 %	50 %	0 %	50 %	219870319
46	NC_011852	AT	3	6	51567	51572	50 %	50 %	0 %	0 %	219870319
47	NC_011852	AG	3	6	51901	51906	50 %	0 %	50 %	0 %	219870319
48	NC_011852	TA	3	6	52123	52128	50 %	50 %	0 %	0 %	219870320
49	NC_011852	AT	3	6	52146	52151	50 %	50 %	0 %	0 %	219870320
50	NC_011852	TA	3	6	52185	52190	50 %	50 %	0 %	0 %	219870320
51	NC_011852	TA	3	6	52249	52254	50 %	50 %	0 %	0 %	219870320
52	NC_011852	AG	4	8	52626	52633	50 %	0 %	50 %	0 %	219870320
53	NC_011852	TA	3	6	52656	52661	50 %	50 %	0 %	0 %	219870320
54	NC_011852	TA	3	6	52910	52915	50 %	50 %	0 %	0 %	219870321
55	NC_011852	AT	3	6	53055	53060	50 %	50 %	0 %	0 %	219870321
56	NC_011852	TA	3	6	53064	53069	50 %	50 %	0 %	0 %	219870321
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59	NC_011852	AT	3	6	54291	54296	50 %	50 %	0 %	0 %	219870322
60	NC_011852	CT	3	6	54711	54716	0 %	50 %	0 %	50 %	219870322
61	NC_011852	AT	4	8	54733	54740	50 %	50 %	0 %	0 %	219870322
62	NC_011852	AT	3	6	55417	55422	50 %	50 %	0 %	0 %	219870323
63	NC_011852	AT	3	6	55443	55448	50 %	50 %	0 %	0 %	219870323
64	NC_011852	TA	3	6	55593	55598	50 %	50 %	0 %	0 %	219870323
65	NC_011852	TA	3	6	55953	55958	50 %	50 %	0 %	0 %	219870323
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68	NC_011852	AT	3	6	58146	58151	50 %	50 %	0 %	0 %	219870326
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111	NC_011852	TA	3	6	98857	98862	50 %	50 %	0 %	0 %	219870367
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