MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 34637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011852	TGGG	2	8	186230	186237	0 %	25 %	75 %	0 %	219870439
3002	NC_011852	GAA	2	6	186325	186330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870439
3003	NC_011852	AAT	2	6	186349	186354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870439
3004	NC_011852	GGT	2	6	186418	186423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219870439
3005	NC_011852	GCG	2	6	186463	186468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219870439
3006	NC_011852	TCG	2	6	186510	186515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219870439
3007	NC_011852	ATTG	2	8	186519	186526	25 %	50 %	25 %	0 %	219870439
3008	NC_011852	CGG	2	6	186527	186532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219870439
3009	NC_011852	TAA	2	6	186534	186539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870439
3010	NC_011852	AAG	2	6	186581	186586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870439
3011	NC_011852	GA	3	6	186601	186606	50 %	0 %	50 %	0 %	219870439
3012	NC_011852	A	7	7	186655	186661	100 %	0 %	0 %	0 %	219870439
3013	NC_011852	TGA	2	6	186663	186668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870439
3014	NC_011852	CT	3	6	186703	186708	0 %	50 %	0 %	50 %	219870439
3015	NC_011852	ATA	2	6	186719	186724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870439
3016	NC_011852	GCC	2	6	186754	186759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219870439
3017	NC_011852	CAG	2	6	186773	186778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219870439
3018	NC_011852	ACA	2	6	186832	186837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870439
3019	NC_011852	TG	3	6	186851	186856	0 %	50 %	50 %	0 %	219870439
3020	NC_011852	GCA	2	6	186862	186867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219870439
3021	NC_011852	CAG	2	6	186953	186958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219870439
3022	NC_011852	ATG	2	6	186967	186972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870439
3023	NC_011852	GAT	2	6	187030	187035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870439
3024	NC_011852	TGA	2	6	187098	187103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870439
3025	NC_011852	CG	3	6	187138	187143	0 %	0 %	50 %	50 %	219870439
3026	NC_011852	GT	3	6	187148	187153	0 %	50 %	50 %	0 %	219870439
3027	NC_011852	TGG	2	6	187184	187189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219870439
3028	NC_011852	GC	3	6	187206	187211	0 %	0 %	50 %	50 %	219870439
3029	NC_011852	AAC	2	6	187331	187336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870439
3030	NC_011852	TTTA	2	8	187411	187418	25 %	75 %	0 %	0 %	219870439
3031	NC_011852	TGA	2	6	187422	187427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870439
3032	NC_011852	ATC	2	6	187468	187473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870439
3033	NC_011852	A	6	6	187610	187615	100 %	0 %	0 %	0 %	219870440
3034	NC_011852	TGT	2	6	187707	187712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870440
3035	NC_011852	AAG	2	6	187755	187760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870440
3036	NC_011852	A	6	6	187767	187772	100 %	0 %	0 %	0 %	219870440
3037	NC_011852	AAG	2	6	187779	187784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870440
3038	NC_011852	AAT	2	6	187857	187862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870440
3039	NC_011852	TGA	2	6	187884	187889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870441
3040	NC_011852	CAG	2	6	187916	187921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219870441
3041	NC_011852	TCG	2	6	187935	187940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219870441
3042	NC_011852	AAT	2	6	188020	188025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870441
3043	NC_011852	TGA	2	6	188043	188048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870441
3044	NC_011852	TTTA	2	8	188249	188256	25 %	75 %	0 %	0 %	219870441
3045	NC_011852	TGA	2	6	188262	188267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870441
3046	NC_011852	AGA	2	6	188271	188276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870441
3047	NC_011852	CTG	2	6	188433	188438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219870442
3048	NC_011852	GCTC	2	8	188456	188463	0 %	25 %	25 %	50 %	219870442
3049	NC_011852	ATA	2	6	188489	188494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870442
3050	NC_011852	AAT	2	6	188514	188519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870442
3051	NC_011852	T	6	6	188620	188625	0 %	100 %	0 %	0 %	219870442
3052	NC_011852	TGAT	2	8	188655	188662	25 %	50 %	25 %	0 %	219870442
3053	NC_011852	CTT	2	6	188860	188865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219870442
3054	NC_011852	TA	3	6	188885	188890	50 %	50 %	0 %	0 %	219870442
3055	NC_011852	TCA	2	6	188931	188936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870442
3056	NC_011852	T	6	6	188985	188990	0 %	100 %	0 %	0 %	219870442
3057	NC_011852	ATAA	2	8	188994	189001	75 %	25 %	0 %	0 %	219870442
3058	NC_011852	TTC	2	6	189050	189055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219870442
3059	NC_011852	TTC	2	6	189092	189097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219870442
3060	NC_011852	A	7	7	189117	189123	100 %	0 %	0 %	0 %	219870442
3061	NC_011852	TCC	2	6	189138	189143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219870442
3062	NC_011852	T	6	6	189151	189156	0 %	100 %	0 %	0 %	219870442
3063	NC_011852	TCT	2	6	189252	189257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219870442
3064	NC_011852	CGT	2	6	189310	189315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219870442
3065	NC_011852	CA	3	6	189367	189372	50 %	0 %	0 %	50 %	219870443
3066	NC_011852	GGT	2	6	189410	189415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219870443
3067	NC_011852	TGT	2	6	189423	189428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870443
3068	NC_011852	AT	3	6	189440	189445	50 %	50 %	0 %	0 %	219870443
3069	NC_011852	TAAGG	2	10	189492	189501	40 %	20 %	40 %	0 %	219870443
3070	NC_011852	TGT	2	6	189548	189553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870443
3071	NC_011852	TAA	2	6	189631	189636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870443
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3073	NC_011852	TTG	2	6	189688	189693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870443
3074	NC_011852	GCC	2	6	189695	189700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219870443
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3077	NC_011852	CTG	2	6	189769	189774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219870443
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3080	NC_011852	T	6	6	189823	189828	0 %	100 %	0 %	0 %	219870443
3081	NC_011852	T	6	6	189880	189885	0 %	100 %	0 %	0 %	219870443
3082	NC_011852	TGT	2	6	190249	190254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870444
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3089	NC_011852	T	7	7	190650	190656	0 %	100 %	0 %	0 %	219870445
3090	NC_011852	TAA	2	6	190684	190689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870445
3091	NC_011852	CCAATT	2	12	190759	190770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870445
3092	NC_011852	AAT	2	6	190786	190791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870445
3093	NC_011852	TCT	2	6	190806	190811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219870445
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3095	NC_011852	A	6	6	191178	191183	100 %	0 %	0 %	0 %	219870446
3096	NC_011852	CT	3	6	191335	191340	0 %	50 %	0 %	50 %	219870446
3097	NC_011852	GAAT	2	8	191514	191521	50 %	25 %	25 %	0 %	219870447
3098	NC_011852	GCG	2	6	191537	191542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219870447
3099	NC_011852	GAT	2	6	191546	191551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870447
3100	NC_011852	ATTT	2	8	191625	191632	25 %	75 %	0 %	0 %	219870447
3101	NC_011852	TGAT	2	8	191679	191686	25 %	50 %	25 %	0 %	219870447
3102	NC_011852	ACTG	2	8	191722	191729	25 %	25 %	25 %	25 %	219870447
3103	NC_011852	ATT	2	6	191794	191799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870447
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3105	NC_011852	ATGA	2	8	191894	191901	50 %	25 %	25 %	0 %	219870447
3106	NC_011852	TCAAAT	2	12	191929	191940	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	219870447
3107	NC_011852	CAAG	2	8	192201	192208	50 %	0 %	25 %	25 %	219870448
3108	NC_011852	T	6	6	192216	192221	0 %	100 %	0 %	0 %	219870448
3109	NC_011852	ATG	2	6	192255	192260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870448
3110	NC_011852	TTG	2	6	192289	192294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870448
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3112	NC_011852	AGA	2	6	192347	192352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870448
3113	NC_011852	GAAGC	2	10	192384	192393	40 %	0 %	40 %	20 %	219870448
3114	NC_011852	TTG	2	6	192493	192498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870448
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3121	NC_011852	AGC	2	6	192665	192670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219870448
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3123	NC_011852	CAA	2	6	192936	192941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870449
3124	NC_011852	TAAC	2	8	193014	193021	50 %	25 %	0 %	25 %	219870449
3125	NC_011852	AGCCA	2	10	193092	193101	40 %	0 %	20 %	40 %	219870449
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3132	NC_011852	TGA	2	6	193273	193278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870449
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3230	NC_011852	ACC	2	6	199766	199771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219870452
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3233	NC_011852	ATC	2	6	199911	199916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870452
3234	NC_011852	CAT	2	6	200020	200025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870452
3235	NC_011852	GTACC	2	10	200152	200161	20 %	20 %	20 %	40 %	219870452
3236	NC_011852	T	7	7	200194	200200	0 %	100 %	0 %	0 %	219870452
3237	NC_011852	T	6	6	200410	200415	0 %	100 %	0 %	0 %	219870453
3238	NC_011852	TAAC	2	8	200433	200440	50 %	25 %	0 %	25 %	219870453
3239	NC_011852	GTA	2	6	200465	200470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870453
3240	NC_011852	C	6	6	200476	200481	0 %	0 %	0 %	100 %	219870453
3241	NC_011852	AAT	2	6	200557	200562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870453
3242	NC_011852	CGA	2	6	200633	200638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219870453
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3244	NC_011852	TAA	2	6	200723	200728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870453
3245	NC_011852	ATA	2	6	200752	200757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870453
3246	NC_011852	ATA	2	6	200774	200779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870453
3247	NC_011852	T	6	6	200860	200865	0 %	100 %	0 %	0 %	219870453
3248	NC_011852	TGG	2	6	200874	200879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219870453
3249	NC_011852	TGAT	2	8	200909	200916	25 %	50 %	25 %	0 %	219870453
3250	NC_011852	TTG	2	6	200989	200994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870453
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3252	NC_011852	TTGT	2	8	201015	201022	0 %	75 %	25 %	0 %	219870453
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3261	NC_011852	TCA	2	6	201422	201427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870453
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3273	NC_011852	A	6	6	202564	202569	100 %	0 %	0 %	0 %	219870454
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3278	NC_011852	TCA	2	6	202760	202765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870455
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3283	NC_011852	TCT	2	6	203064	203069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219870455
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3363	NC_011852	AG	3	6	207957	207962	50 %	0 %	50 %	0 %	219870460
3364	NC_011852	GAT	3	9	207978	207986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870460
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3367	NC_011852	TAAGA	2	10	208071	208080	60 %	20 %	20 %	0 %	219870460
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3490	NC_011852	CAACG	2	10	215852	215861	40 %	0 %	20 %	40 %	219870467
3491	NC_011852	AGA	2	6	215966	215971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870467
3492	NC_011852	AAG	2	6	215989	215994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870467
3493	NC_011852	CAA	2	6	216060	216065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870467
3494	NC_011852	TGA	2	6	216116	216121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870467
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