MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 34637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011852	CCA	2	6	150719	150724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219870408
2502	NC_011852	GCT	2	6	150779	150784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219870408
2503	NC_011852	TAA	2	6	150816	150821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870408
2504	NC_011852	TTG	2	6	150835	150840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870408
2505	NC_011852	CTT	2	6	150843	150848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219870408
2506	NC_011852	TGT	2	6	150866	150871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870408
2507	NC_011852	AAGA	2	8	151024	151031	75 %	0 %	25 %	0 %	219870409
2508	NC_011852	A	6	6	151049	151054	100 %	0 %	0 %	0 %	219870409
2509	NC_011852	TTA	2	6	151114	151119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870409
2510	NC_011852	TGT	2	6	151176	151181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870409
2511	NC_011852	AGA	2	6	151185	151190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870409
2512	NC_011852	TCGT	2	8	151221	151228	0 %	50 %	25 %	25 %	219870409
2513	NC_011852	CTT	2	6	151280	151285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219870409
2514	NC_011852	ACT	2	6	151294	151299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870409
2515	NC_011852	TTCCTC	2	12	151307	151318	0 %	50 %	0 %	50 %	219870409
2516	NC_011852	GAA	2	6	151327	151332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870409
2517	NC_011852	CGT	2	6	151333	151338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219870409
2518	NC_011852	TTAA	2	8	151345	151352	50 %	50 %	0 %	0 %	219870409
2519	NC_011852	AGAA	2	8	151436	151443	75 %	0 %	25 %	0 %	219870409
2520	NC_011852	ATG	2	6	151460	151465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870409
2521	NC_011852	GAT	2	6	151480	151485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870409
2522	NC_011852	A	6	6	151513	151518	100 %	0 %	0 %	0 %	219870409
2523	NC_011852	AGAA	2	8	151544	151551	75 %	0 %	25 %	0 %	219870409
2524	NC_011852	A	6	6	151705	151710	100 %	0 %	0 %	0 %	219870410
2525	NC_011852	A	6	6	151717	151722	100 %	0 %	0 %	0 %	219870410
2526	NC_011852	GAA	2	6	151752	151757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870410
2527	NC_011852	GAG	2	6	151806	151811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219870410
2528	NC_011852	CTT	2	6	151813	151818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219870410
2529	NC_011852	AGC	2	6	151910	151915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219870410
2530	NC_011852	ATT	2	6	151960	151965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870410
2531	NC_011852	TTTA	2	8	151978	151985	25 %	75 %	0 %	0 %	219870410
2532	NC_011852	TA	3	6	152212	152217	50 %	50 %	0 %	0 %	219870410
2533	NC_011852	ATT	2	6	152229	152234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870410
2534	NC_011852	ATTT	2	8	152239	152246	25 %	75 %	0 %	0 %	219870410
2535	NC_011852	TAT	2	6	152336	152341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870410
2536	NC_011852	TAT	2	6	152378	152383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870410
2537	NC_011852	TGA	2	6	152395	152400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870410
2538	NC_011852	GCAATA	2	12	152599	152610	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	219870411
2539	NC_011852	ATA	2	6	152686	152691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870411
2540	NC_011852	TCA	2	6	152761	152766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870411
2541	NC_011852	TAA	2	6	152796	152801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870411
2542	NC_011852	GAA	2	6	152862	152867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870411
2543	NC_011852	TAA	2	6	152874	152879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870411
2544	NC_011852	AAC	2	6	152881	152886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870411
2545	NC_011852	CAA	2	6	152891	152896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870411
2546	NC_011852	ACC	2	6	152919	152924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219870411
2547	NC_011852	CTG	3	9	152936	152944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219870411
2548	NC_011852	AT	3	6	152950	152955	50 %	50 %	0 %	0 %	219870411
2549	NC_011852	CTG	2	6	152957	152962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219870411
2550	NC_011852	ACT	2	6	152994	152999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870411
2551	NC_011852	AAGT	2	8	153011	153018	50 %	25 %	25 %	0 %	219870411
2552	NC_011852	TAA	2	6	153054	153059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870411
2553	NC_011852	GAT	2	6	153258	153263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870411
2554	NC_011852	AGC	2	6	153327	153332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219870411
2555	NC_011852	CAT	2	6	153348	153353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870411
2556	NC_011852	AAG	2	6	153362	153367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870411
2557	NC_011852	TGC	2	6	153429	153434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219870411
2558	NC_011852	ATTCCA	2	12	153457	153468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870411
2559	NC_011852	CACG	2	8	153508	153515	25 %	0 %	25 %	50 %	219870411
2560	NC_011852	TAAA	2	8	153539	153546	75 %	25 %	0 %	0 %	219870411
2561	NC_011852	AATA	2	8	153717	153724	75 %	25 %	0 %	0 %	219870411
2562	NC_011852	CAG	2	6	153731	153736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219870411
2563	NC_011852	AGCC	2	8	153740	153747	25 %	0 %	25 %	50 %	219870411
2564	NC_011852	TTA	2	6	154052	154057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870412
2565	NC_011852	TAA	2	6	154066	154071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870412
2566	NC_011852	AGT	2	6	154181	154186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870412
2567	NC_011852	GA	3	6	154208	154213	50 %	0 %	50 %	0 %	219870412
2568	NC_011852	CAT	2	6	154228	154233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870412
2569	NC_011852	ATTG	2	8	154264	154271	25 %	50 %	25 %	0 %	219870412
2570	NC_011852	ATA	2	6	154404	154409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870412
2571	NC_011852	TAA	2	6	154497	154502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870412
2572	NC_011852	TTC	2	6	154531	154536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219870412
2573	NC_011852	TAA	2	6	154621	154626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870412
2574	NC_011852	GAC	2	6	154645	154650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219870412
2575	NC_011852	TAA	2	6	154666	154671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870412
2576	NC_011852	ATA	2	6	154688	154693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870412
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2578	NC_011852	GCA	2	6	154775	154780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219870412
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2580	NC_011852	TGTAC	2	10	154832	154841	20 %	40 %	20 %	20 %	219870412
2581	NC_011852	A	6	6	154861	154866	100 %	0 %	0 %	0 %	219870412
2582	NC_011852	GCCA	2	8	154904	154911	25 %	0 %	25 %	50 %	219870412
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2585	NC_011852	ATA	2	6	154977	154982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870412
2586	NC_011852	AAT	2	6	155026	155031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870412
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2588	NC_011852	AGA	2	6	155068	155073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870412
2589	NC_011852	CTT	2	6	155175	155180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219870413
2590	NC_011852	CAA	2	6	155182	155187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870413
2591	NC_011852	GCTAA	2	10	155204	155213	40 %	20 %	20 %	20 %	219870413
2592	NC_011852	TCA	2	6	155222	155227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870413
2593	NC_011852	AGT	2	6	155267	155272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870413
2594	NC_011852	TCTTCA	2	12	155297	155308	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	219870413
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2597	NC_011852	GA	3	6	155523	155528	50 %	0 %	50 %	0 %	219870413
2598	NC_011852	TCA	2	6	155543	155548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870413
2599	NC_011852	GGCA	2	8	155560	155567	25 %	0 %	50 %	25 %	219870413
2600	NC_011852	TCA	3	9	155594	155602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870413
2601	NC_011852	AAC	2	6	155618	155623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870413
2602	NC_011852	TCA	2	6	155657	155662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870413
2603	NC_011852	CAA	2	6	155719	155724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870413
2604	NC_011852	CAA	2	6	155772	155777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870413
2605	NC_011852	CACG	2	8	155787	155794	25 %	0 %	25 %	50 %	219870413
2606	NC_011852	ATT	2	6	155801	155806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870413
2607	NC_011852	CA	3	6	155878	155883	50 %	0 %	0 %	50 %	219870413
2608	NC_011852	TTC	2	6	156019	156024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219870413
2609	NC_011852	ACT	2	6	156070	156075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870413
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2612	NC_011852	A	6	6	156110	156115	100 %	0 %	0 %	0 %	219870413
2613	NC_011852	CTG	2	6	156117	156122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219870413
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2615	NC_011852	TAT	2	6	156346	156351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870414
2616	NC_011852	GCGA	2	8	156440	156447	25 %	0 %	50 %	25 %	219870414
2617	NC_011852	AAG	2	6	156455	156460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870414
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2619	NC_011852	A	6	6	156521	156526	100 %	0 %	0 %	0 %	219870414
2620	NC_011852	ATT	2	6	156597	156602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870414
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2622	NC_011852	ACCG	2	8	156626	156633	25 %	0 %	25 %	50 %	219870414
2623	NC_011852	TAA	2	6	156650	156655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870414
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2742	NC_011852	TTTCA	2	10	169248	169257	20 %	60 %	0 %	20 %	219870423
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2990	NC_011852	ATT	2	6	185522	185527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870438
2991	NC_011852	GTC	2	6	185562	185567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219870438
2992	NC_011852	TGA	2	6	185614	185619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870438
2993	NC_011852	AGA	2	6	185689	185694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870438
2994	NC_011852	GT	3	6	185742	185747	0 %	50 %	50 %	0 %	219870438
2995	NC_011852	CTT	2	6	185795	185800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219870438
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