MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 34637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011852	AAC	2	6	33910	33915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870305
502	NC_011852	CCG	2	6	33925	33930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219870305
503	NC_011852	CTT	2	6	34010	34015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219870305
504	NC_011852	CAG	2	6	34074	34079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219870305
505	NC_011852	T	7	7	34267	34273	0 %	100 %	0 %	0 %	219870306
506	NC_011852	GAAC	2	8	34300	34307	50 %	0 %	25 %	25 %	219870306
507	NC_011852	AAT	2	6	34314	34319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870306
508	NC_011852	TGT	2	6	34320	34325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870306
509	NC_011852	AG	3	6	34374	34379	50 %	0 %	50 %	0 %	219870306
510	NC_011852	TAC	2	6	34460	34465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870306
511	NC_011852	TAG	2	6	34482	34487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870306
512	NC_011852	AT	3	6	34538	34543	50 %	50 %	0 %	0 %	219870306
513	NC_011852	GTT	2	6	34559	34564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870306
514	NC_011852	ATC	2	6	34629	34634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870306
515	NC_011852	GA	3	6	34676	34681	50 %	0 %	50 %	0 %	219870306
516	NC_011852	ATA	2	6	34733	34738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870306
517	NC_011852	TC	3	6	34753	34758	0 %	50 %	0 %	50 %	219870307
518	NC_011852	CAT	2	6	34771	34776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870307
519	NC_011852	CAC	2	6	34791	34796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219870307
520	NC_011852	CTA	2	6	34830	34835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870307
521	NC_011852	TCA	2	6	34898	34903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870307
522	NC_011852	GTG	2	6	34904	34909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219870307
523	NC_011852	ATAA	2	8	34999	35006	75 %	25 %	0 %	0 %	219870307
524	NC_011852	AAG	2	6	35033	35038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870307
525	NC_011852	GTT	2	6	35041	35046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870307
526	NC_011852	CAC	2	6	35059	35064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219870307
527	NC_011852	TAC	2	6	35115	35120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870307
528	NC_011852	ACAA	2	8	35134	35141	75 %	0 %	0 %	25 %	219870307
529	NC_011852	ACC	2	6	35209	35214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219870307
530	NC_011852	ACG	2	6	35227	35232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219870307
531	NC_011852	ATA	2	6	35248	35253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870307
532	NC_011852	GCA	2	6	35258	35263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219870307
533	NC_011852	TGT	2	6	35273	35278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870307
534	NC_011852	ATCAC	2	10	35351	35360	40 %	20 %	0 %	40 %	219870307
535	NC_011852	CCA	2	6	35410	35415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219870307
536	NC_011852	TTC	2	6	35449	35454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219870307
537	NC_011852	TTC	2	6	35473	35478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219870307
538	NC_011852	AT	3	6	35510	35515	50 %	50 %	0 %	0 %	219870307
539	NC_011852	ATCAAT	2	12	35545	35556	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	219870307
540	NC_011852	ATT	2	6	35593	35598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870307
541	NC_011852	GTA	2	6	35600	35605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870307
542	NC_011852	ATC	2	6	35608	35613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870307
543	NC_011852	TGCAT	2	10	35651	35660	20 %	40 %	20 %	20 %	219870307
544	NC_011852	CCAC	2	8	35819	35826	25 %	0 %	0 %	75 %	219870307
545	NC_011852	T	6	6	35839	35844	0 %	100 %	0 %	0 %	219870307
546	NC_011852	CTT	2	6	35869	35874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219870307
547	NC_011852	GTA	3	9	35935	35943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870307
548	NC_011852	ATTT	2	8	35949	35956	25 %	75 %	0 %	0 %	219870307
549	NC_011852	CAGGGC	2	12	35994	36005	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	219870307
550	NC_011852	T	6	6	36031	36036	0 %	100 %	0 %	0 %	219870307
551	NC_011852	GAT	2	6	36037	36042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870307
552	NC_011852	TCT	2	6	36053	36058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219870307
553	NC_011852	ACCA	2	8	36103	36110	50 %	0 %	0 %	50 %	219870307
554	NC_011852	A	6	6	36165	36170	100 %	0 %	0 %	0 %	219870307
555	NC_011852	TGGAA	2	10	36178	36187	40 %	20 %	40 %	0 %	219870307
556	NC_011852	TTG	2	6	36222	36227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219870307
557	NC_011852	GCT	2	6	36302	36307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219870307
558	NC_011852	CAT	2	6	36357	36362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870307
559	NC_011852	ACA	2	6	36786	36791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870308
560	NC_011852	GTG	2	6	36804	36809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219870308
561	NC_011852	CAA	2	6	36863	36868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870308
562	NC_011852	TAAAT	2	10	36880	36889	60 %	40 %	0 %	0 %	219870308
563	NC_011852	TAT	2	6	36896	36901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219870308
564	NC_011852	TGG	2	6	36907	36912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219870308
565	NC_011852	GAA	2	6	36968	36973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219870308
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570	NC_011852	TGCG	2	8	37140	37147	0 %	25 %	50 %	25 %	219870308
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574	NC_011852	CAA	2	6	37458	37463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219870308
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592	NC_011852	ATA	2	6	38571	38576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219870309
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597	NC_011852	AT	3	6	38736	38741	50 %	50 %	0 %	0 %	219870309
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599	NC_011852	CGCT	2	8	38947	38954	0 %	25 %	25 %	50 %	219870309
600	NC_011852	TAG	2	6	38964	38969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219870309
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603	NC_011852	CTTCAT	2	12	39143	39154	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	219870309
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612	NC_011852	AC	3	6	39796	39801	50 %	0 %	0 %	50 %	219870309
613	NC_011852	CAT	2	6	39809	39814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219870309
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617	NC_011852	GCAAT	2	10	39964	39973	40 %	20 %	20 %	20 %	219870309
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628	NC_011852	TTTG	2	8	40385	40392	0 %	75 %	25 %	0 %	219870309
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753	NC_011852	CCAA	2	8	47889	47896	50 %	0 %	0 %	50 %	219870315
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