MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori P12 plasmid HPP12

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011499	ATA	2	6	123	128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	210135771
2	NC_011499	AGT	2	6	418	423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	210135771
3	NC_011499	AAG	2	6	444	449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	210135771
4	NC_011499	AAG	2	6	521	526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	210135771
5	NC_011499	TGT	2	6	564	569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210135771
6	NC_011499	TGT	2	6	585	590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210135771
7	NC_011499	GAA	2	6	609	614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	210135771
8	NC_011499	ATG	2	6	633	638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	210135771
9	NC_011499	GTA	2	6	674	679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	210135771
10	NC_011499	TCT	2	6	783	788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	210135771
11	NC_011499	TAA	2	6	1134	1139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	210135771
12	NC_011499	TGT	2	6	1257	1262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210135772
13	NC_011499	ATC	2	6	1303	1308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	210135772
14	NC_011499	ATC	2	6	1435	1440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	210135772
15	NC_011499	TAT	2	6	1452	1457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210135772
16	NC_011499	ACA	2	6	1468	1473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	210135772
17	NC_011499	TTC	2	6	1645	1650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	210135772
18	NC_011499	ATC	2	6	1672	1677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	210135772
19	NC_011499	CTA	2	6	1703	1708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	210135772
20	NC_011499	AAT	2	6	1882	1887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	210135772
21	NC_011499	ATT	2	6	1909	1914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210135772
22	NC_011499	GGT	2	6	1956	1961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	210135772
23	NC_011499	TAA	2	6	2004	2009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	210135772
24	NC_011499	TTC	2	6	2090	2095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	210135772
25	NC_011499	AAT	2	6	2111	2116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	210135772
26	NC_011499	AAT	2	6	2173	2178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	210135772
27	NC_011499	TGT	2	6	2593	2598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210135774
28	NC_011499	GTT	2	6	2776	2781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210135774
29	NC_011499	TTG	2	6	2865	2870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210135774
30	NC_011499	TAA	2	6	2991	2996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	210135774
31	NC_011499	TGT	2	6	2999	3004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210135774
32	NC_011499	CTG	2	6	3092	3097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	210135774
33	NC_011499	ATG	2	6	3427	3432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	210135774
34	NC_011499	ATG	2	6	3442	3447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	210135774
35	NC_011499	TTG	2	6	3532	3537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210135774
36	NC_011499	TTG	2	6	3544	3549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210135774
37	NC_011499	TAG	2	6	3623	3628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	210135774
38	NC_011499	GTT	2	6	3630	3635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210135774
39	NC_011499	GTT	2	6	3974	3979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210135774
40	NC_011499	GTT	2	6	4014	4019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210135774
41	NC_011499	TGT	2	6	4023	4028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210135774
42	NC_011499	ATA	2	6	4120	4125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	210135774
43	NC_011499	GTT	2	6	4510	4515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210135777
44	NC_011499	GTT	2	6	4540	4545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210135777
45	NC_011499	TTA	2	6	4572	4577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210135777
46	NC_011499	TTA	2	6	4644	4649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210135777
47	NC_011499	TTG	2	6	4675	4680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210135777
48	NC_011499	ATG	2	6	5201	5206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	210135778
49	NC_011499	TTA	2	6	5221	5226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210135778
50	NC_011499	TGA	2	6	5232	5237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	210135778
51	NC_011499	TAC	2	6	5244	5249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	210135778
52	NC_011499	GTT	2	6	5576	5581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210135779
53	NC_011499	ATT	2	6	7581	7586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210135780
54	NC_011499	AGA	2	6	7587	7592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	210135780
55	NC_011499	AGA	2	6	7740	7745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	210135780
56	NC_011499	CAA	2	6	7754	7759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	210135780
57	NC_011499	ACC	2	6	7771	7776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	210135780
58	NC_011499	CAA	2	6	7839	7844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	210135780
59	NC_011499	CAA	2	6	7848	7853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	210135780
60	NC_011499	TTA	2	6	8012	8017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210135780
61	NC_011499	CAA	2	6	8190	8195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	210135780
62	NC_011499	CTT	2	6	8216	8221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	210135780
63	NC_011499	CAA	2	6	8530	8535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	210135780
64	NC_011499	ACA	2	6	8681	8686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	210135780
65	NC_011499	ACG	2	6	8708	8713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	210135780
66	NC_011499	CAA	2	6	8784	8789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	210135780
67	NC_011499	ACT	2	6	8805	8810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	210135780
68	NC_011499	AGA	2	6	8850	8855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	210135780
69	NC_011499	CAA	2	6	8973	8978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	210135780
70	NC_011499	TGA	2	6	9200	9205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	210135781
71	NC_011499	CAC	2	6	9237	9242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	210135781
72	NC_011499	CAA	2	6	9260	9265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	210135781
73	NC_011499	AAT	2	6	9530	9535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	210135781
74	NC_011499	GAA	2	6	9603	9608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	210135781
75	NC_011499	CAT	2	6	9806	9811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	210135781

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.