MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori P12 chromosome

Total Repeats: 15346

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011498	GAT	3	9	124	132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	210134202
2	NC_011498	GTT	2	6	307	312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210134202
3	NC_011498	TTC	2	6	358	363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	210134202
4	NC_011498	ACA	2	6	384	389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	210134202
5	NC_011498	CAA	2	6	458	463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	210134203
6	NC_011498	TTA	2	6	495	500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210134203
7	NC_011498	TAA	2	6	652	657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	210134203
8	NC_011498	AAC	2	6	699	704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	210134203
9	NC_011498	CTT	2	6	802	807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	210134203
10	NC_011498	TGA	2	6	820	825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	210134203
11	NC_011498	TCA	2	6	960	965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	210134204
12	NC_011498	AAC	2	6	1026	1031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	210134204
13	NC_011498	CCG	3	9	1045	1053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	210134204
14	NC_011498	CCA	2	6	1189	1194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	210134204
15	NC_011498	GCT	2	6	1214	1219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	210134204
16	NC_011498	CTA	2	6	1281	1286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	210134204
17	NC_011498	GGC	2	6	1405	1410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	210134204
18	NC_011498	GCT	2	6	1449	1454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	210134204
19	NC_011498	GTT	2	6	1625	1630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210134204
20	NC_011498	CTT	2	6	1659	1664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	210134204
21	NC_011498	TTC	2	6	1764	1769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	210134205
22	NC_011498	GTT	2	6	1899	1904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210134205
23	NC_011498	TTC	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	210134205
24	NC_011498	TCA	2	6	2053	2058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	210134205
25	NC_011498	AAT	2	6	2106	2111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	210134205
26	NC_011498	GTG	2	6	2968	2973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	210134206
27	NC_011498	AGA	2	6	3066	3071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	210134206
28	NC_011498	GTG	2	6	3127	3132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	210134206
29	NC_011498	GCC	2	6	3134	3139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	210134206
30	NC_011498	GTT	2	6	3580	3585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210134207
31	NC_011498	ATT	2	6	3908	3913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210134207
32	NC_011498	GGC	2	6	3981	3986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	210134207
33	NC_011498	AAT	3	9	5139	5147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	210134208
34	NC_011498	ATT	2	6	5299	5304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210134208
35	NC_011498	TGG	2	6	5397	5402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	210134208
36	NC_011498	TCT	2	6	5536	5541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	210134208
37	NC_011498	TTG	2	6	5600	5605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210134208
38	NC_011498	GTG	2	6	5660	5665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	210134208
39	NC_011498	TAA	2	6	5668	5673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	210134208
40	NC_011498	TTA	2	6	5726	5731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210134208
41	NC_011498	GTG	2	6	5795	5800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	210134208
42	NC_011498	GTT	2	6	5815	5820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210134208
43	NC_011498	CAA	2	6	5863	5868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	210134208
44	NC_011498	TGT	2	6	5916	5921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210134208
45	NC_011498	GTT	2	6	5971	5976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210134208
46	NC_011498	CAG	2	6	6147	6152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	210134208
47	NC_011498	GTT	2	6	6199	6204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210134208
48	NC_011498	TCA	2	6	6341	6346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	210134208
49	NC_011498	TGT	2	6	6456	6461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210134208
50	NC_011498	GCT	2	6	6469	6474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	210134208
51	NC_011498	ATT	2	6	6484	6489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210134208
52	NC_011498	TTA	2	6	6500	6505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210134208
53	NC_011498	CCG	2	6	6521	6526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	210134208
54	NC_011498	TGT	2	6	6585	6590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210134208
55	NC_011498	TTG	2	6	6625	6630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210134208
56	NC_011498	GCG	2	6	6836	6841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	210134208
57	NC_011498	GCT	2	6	6949	6954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	210134208
58	NC_011498	GTT	2	6	6979	6984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210134208
59	NC_011498	CAT	2	6	7489	7494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	210134209
60	NC_011498	TCT	2	6	7556	7561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	210134209
61	NC_011498	AAT	2	6	7654	7659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	210134209
62	NC_011498	CTT	2	6	7662	7667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	210134209
63	NC_011498	CAT	2	6	7752	7757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	210134209
64	NC_011498	ATG	2	6	7805	7810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	210134209
65	NC_011498	TCA	2	6	7829	7834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	210134209
66	NC_011498	CCG	2	6	7883	7888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	210134209
67	NC_011498	CTT	2	6	7902	7907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	210134209
68	NC_011498	CCG	2	6	7911	7916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	210134209
69	NC_011498	CAT	2	6	8106	8111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	210134209
70	NC_011498	GTG	2	6	8138	8143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	210134209
71	NC_011498	TTC	2	6	8218	8223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	210134209
72	NC_011498	CCG	2	6	8237	8242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	210134209
73	NC_011498	CAC	2	6	8338	8343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	210134209
74	NC_011498	GAT	2	6	8380	8385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	210134209
75	NC_011498	GGA	2	6	8427	8432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	210134209
76	NC_011498	CTT	2	6	8592	8597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	210134209
77	NC_011498	TCT	2	6	8702	8707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	210134209
78	NC_011498	TGA	2	6	8745	8750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	210134209
79	NC_011498	CTT	2	6	8823	8828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	210134209
80	NC_011498	CTT	2	6	8901	8906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	210134209
81	NC_011498	TCT	2	6	9257	9262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	210134210
82	NC_011498	CTT	2	6	9339	9344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	210134210
83	NC_011498	GAT	3	9	9427	9435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	210134210
84	NC_011498	TCT	2	6	9455	9460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	210134210
85	NC_011498	CTA	2	6	9471	9476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	210134210
86	NC_011498	TTG	2	6	9899	9904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210134211
87	NC_011498	GAA	2	6	9915	9920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	210134211
88	NC_011498	TTA	2	6	10094	10099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210134211
89	NC_011498	AGA	2	6	10109	10114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	210134211
90	NC_011498	ACC	2	6	10117	10122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	210134211
91	NC_011498	AAG	2	6	10150	10155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	210134211
92	NC_011498	ATT	2	6	10183	10188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210134211
93	NC_011498	GTG	2	6	10398	10403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	210134211
94	NC_011498	AGC	2	6	10433	10438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	210134211
95	NC_011498	ATG	2	6	10678	10683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	210134211
96	NC_011498	AAC	2	6	10770	10775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	210134211
97	NC_011498	AGA	2	6	11156	11161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	210134211
98	NC_011498	TTG	2	6	11169	11174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210134211
99	NC_011498	GAC	2	6	11256	11261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	210134211
100	NC_011498	TTA	3	9	11277	11285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210134211
101	NC_011498	TTG	2	6	11334	11339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210134211
102	NC_011498	TGT	2	6	11520	11525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210134212
103	NC_011498	TGT	2	6	11688	11693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210134212
104	NC_011498	AAG	2	6	11847	11852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	210134212
105	NC_011498	GTT	2	6	11962	11967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210134212
106	NC_011498	TTG	2	6	12024	12029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210134212
107	NC_011498	TGG	3	9	12258	12266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	210134212
108	NC_011498	GAA	3	9	12275	12283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	210134212
109	NC_011498	ATT	2	6	12328	12333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210134212
110	NC_011498	AGA	2	6	12379	12384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	210134212
111	NC_011498	TTA	2	6	12691	12696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210134213
112	NC_011498	GAA	2	6	12708	12713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	210134213
113	NC_011498	GTT	2	6	12775	12780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210134213
114	NC_011498	ATT	2	6	12798	12803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210134213
115	NC_011498	ATG	2	6	12871	12876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	210134213
116	NC_011498	CAA	2	6	13046	13051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	210134213
117	NC_011498	CAA	2	6	13179	13184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	210134213
118	NC_011498	CTA	2	6	13237	13242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	210134213
119	NC_011498	GGT	2	6	13316	13321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	210134213
120	NC_011498	TTG	2	6	13324	13329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210134213
121	NC_011498	AGA	2	6	13376	13381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	210134213
122	NC_011498	GTG	2	6	13800	13805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	210134214
123	NC_011498	GAA	2	6	13891	13896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	210134215
124	NC_011498	ATT	2	6	14078	14083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210134215
125	NC_011498	GAA	2	6	14217	14222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	210134216
126	NC_011498	AAC	2	6	14223	14228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	210134216
127	NC_011498	ATG	2	6	14242	14247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	210134216
128	NC_011498	TCC	2	6	14287	14292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	210134216
129	NC_011498	TGG	2	6	14398	14403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	210134216
130	NC_011498	CAA	2	6	14427	14432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	210134216
131	NC_011498	AAG	2	6	14488	14493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	210134216
132	NC_011498	TAG	2	6	14755	14760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	210134216
133	NC_011498	ATT	2	6	14812	14817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210134216
134	NC_011498	GCT	2	6	15035	15040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	210134216
135	NC_011498	ACC	2	6	15250	15255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	210134216
136	NC_011498	ATT	2	6	15373	15378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210134216
137	NC_011498	AAG	2	6	15406	15411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	210134216
138	NC_011498	ATG	2	6	15510	15515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	210134216
139	NC_011498	AAG	2	6	15721	15726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	210134216
140	NC_011498	AGA	2	6	16007	16012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	210134216
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142	NC_011498	TAT	2	6	16825	16830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210134217
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145	NC_011498	ATT	2	6	17096	17101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210134217
146	NC_011498	TAT	2	6	17197	17202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210134217
147	NC_011498	ACA	2	6	17297	17302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	210134217
148	NC_011498	GTT	2	6	17373	17378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210134217
149	NC_011498	ATC	2	6	17509	17514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	210134217
150	NC_011498	GGT	2	6	17703	17708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	210134217
151	NC_011498	TAT	2	6	17800	17805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210134217
152	NC_011498	TTG	2	6	17813	17818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210134217
153	NC_011498	ATA	2	6	18080	18085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	210134217
154	NC_011498	TTG	2	6	18301	18306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	210134218
155	NC_011498	GTG	2	6	18367	18372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	210134218
156	NC_011498	ATC	2	6	18394	18399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	210134218
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158	NC_011498	GTG	2	6	18730	18735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	210134218
159	NC_011498	TGA	2	6	18843	18848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	210134218
160	NC_011498	TTA	2	6	18931	18936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210134218
161	NC_011498	TTC	2	6	19080	19085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	210134218
162	NC_011498	GAT	2	6	19132	19137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	210134218
163	NC_011498	CAA	2	6	19290	19295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	210134219
164	NC_011498	GAA	2	6	19416	19421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	210134219
165	NC_011498	ATT	2	6	19515	19520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	210134219
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169	NC_011498	ATA	2	6	19945	19950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	210134219
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172	NC_011498	GGC	2	6	20196	20201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	210134219
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186	NC_011498	GTG	2	6	21848	21853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	210134221
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247	NC_011498	TCT	3	9	29594	29602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	210134226
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250	NC_011498	TCT	2	6	30337	30342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	210134227
251	NC_011498	TCA	2	6	30374	30379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	210134227
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253	NC_011498	AAG	2	6	30830	30835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	210134227
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255	NC_011498	TCA	2	6	30863	30868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	210134227
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257	NC_011498	TCA	2	6	31251	31256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	210134227
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500	NC_011498	GAT	2	6	57664	57669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	210134251

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