MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori G27 chromosome

Total Repeats: 1106

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011333	TAAAA	2	10	1591	1600	80 %	20 %	0 %	0 %	208433979
2	NC_011333	GTTTT	2	10	1708	1717	0 %	80 %	20 %	0 %	208433980
3	NC_011333	TTTCT	2	10	8156	8165	0 %	80 %	0 %	20 %	208433985
4	NC_011333	TCGCT	2	10	10876	10885	0 %	40 %	20 %	40 %	208433987
5	NC_011333	TGCCA	2	10	11630	11639	20 %	20 %	20 %	40 %	208433988
6	NC_011333	TGGTG	2	10	12522	12531	0 %	40 %	60 %	0 %	208433989
7	NC_011333	CAAAA	2	10	18393	18402	80 %	0 %	0 %	20 %	208433994
8	NC_011333	CCATG	2	10	23270	23279	20 %	20 %	20 %	40 %	208433998
9	NC_011333	CTCTT	2	10	23300	23309	0 %	60 %	0 %	40 %	208433998
10	NC_011333	CAAGC	2	10	28114	28123	40 %	0 %	20 %	40 %	208434000
11	NC_011333	GCTGG	2	10	28487	28496	0 %	20 %	60 %	20 %	208434000
12	NC_011333	TGATT	2	10	28570	28579	20 %	60 %	20 %	0 %	208434000
13	NC_011333	TTTTA	2	10	29040	29049	20 %	80 %	0 %	0 %	208434001
14	NC_011333	CTTGT	2	10	30609	30618	0 %	60 %	20 %	20 %	208434003
15	NC_011333	TCAAA	2	10	30827	30836	60 %	20 %	0 %	20 %	208434003
16	NC_011333	GTGGG	2	10	33906	33915	0 %	20 %	80 %	0 %	208434006
17	NC_011333	CAAAA	2	10	40653	40662	80 %	0 %	0 %	20 %	208434014
18	NC_011333	CAAAC	2	10	41576	41585	60 %	0 %	0 %	40 %	208434014
19	NC_011333	TTACT	2	10	43088	43097	20 %	60 %	0 %	20 %	208434016
20	NC_011333	TAAAA	2	10	46943	46952	80 %	20 %	0 %	0 %	208434017
21	NC_011333	TCCCA	2	10	47955	47964	20 %	20 %	0 %	60 %	208434018
22	NC_011333	GCTCC	2	10	48276	48285	0 %	20 %	20 %	60 %	208434018
23	NC_011333	AAAAT	2	10	48455	48464	80 %	20 %	0 %	0 %	208434018
24	NC_011333	TCGCA	2	10	48813	48822	20 %	20 %	20 %	40 %	208434018
25	NC_011333	AGGCT	2	10	50693	50702	20 %	20 %	40 %	20 %	208434020
26	NC_011333	GAGAT	2	10	51903	51912	40 %	20 %	40 %	0 %	208434021
27	NC_011333	TAAAA	2	10	53252	53261	80 %	20 %	0 %	0 %	208434022
28	NC_011333	GCTTT	2	10	53352	53361	0 %	60 %	20 %	20 %	208434022
29	NC_011333	CTTGA	2	10	53775	53784	20 %	40 %	20 %	20 %	208434023
30	NC_011333	AAATA	2	10	54596	54605	80 %	20 %	0 %	0 %	208434024
31	NC_011333	TGAAA	2	10	57743	57752	60 %	20 %	20 %	0 %	208434025
32	NC_011333	TCAAA	2	10	57997	58006	60 %	20 %	0 %	20 %	208434025
33	NC_011333	CAGCA	2	10	58944	58953	40 %	0 %	20 %	40 %	208434026
34	NC_011333	TCAAA	2	10	61752	61761	60 %	20 %	0 %	20 %	208434026
35	NC_011333	TGTTT	2	10	64309	64318	0 %	80 %	20 %	0 %	208434029
36	NC_011333	TTTCT	2	10	75163	75172	0 %	80 %	0 %	20 %	208434036
37	NC_011333	CTTCT	2	10	75480	75489	0 %	60 %	0 %	40 %	208434036
38	NC_011333	TGCCT	2	10	75557	75566	0 %	40 %	20 %	40 %	208434036
39	NC_011333	TCCAA	2	10	75969	75978	40 %	20 %	0 %	40 %	208434037
40	NC_011333	TTTTG	2	10	79260	79269	0 %	80 %	20 %	0 %	208434040
41	NC_011333	ACGCC	2	10	79566	79575	20 %	0 %	20 %	60 %	208434040
42	NC_011333	AAAGC	2	10	80332	80341	60 %	0 %	20 %	20 %	208434041
43	NC_011333	ATGCC	2	10	88351	88360	20 %	20 %	20 %	40 %	208434046
44	NC_011333	TTGAT	2	10	89398	89407	20 %	60 %	20 %	0 %	208434048
45	NC_011333	GGCGT	2	10	91212	91221	0 %	20 %	60 %	20 %	208434050
46	NC_011333	TCAAT	2	10	93797	93806	40 %	40 %	0 %	20 %	208434051
47	NC_011333	CTTTC	2	10	94779	94788	0 %	60 %	0 %	40 %	208434052
48	NC_011333	TGATT	2	10	97572	97581	20 %	60 %	20 %	0 %	208434055
49	NC_011333	TCTTT	2	10	97781	97790	0 %	80 %	0 %	20 %	208434055
50	NC_011333	ACGAT	2	10	103901	103910	40 %	20 %	20 %	20 %	208434060
51	NC_011333	GAATT	2	10	105742	105751	40 %	40 %	20 %	0 %	208434061
52	NC_011333	TCGTT	2	10	107643	107652	0 %	60 %	20 %	20 %	208434062
53	NC_011333	TTTTA	2	10	110355	110364	20 %	80 %	0 %	0 %	208434065
54	NC_011333	TCTTT	2	10	110952	110961	0 %	80 %	0 %	20 %	208434065
55	NC_011333	AAAGC	2	10	113719	113728	60 %	0 %	20 %	20 %	208434067
56	NC_011333	CAAAT	2	10	116080	116089	60 %	20 %	0 %	20 %	208434070
57	NC_011333	ACCCT	2	10	117509	117518	20 %	20 %	0 %	60 %	208434071
58	NC_011333	ATGCC	2	10	117641	117650	20 %	20 %	20 %	40 %	208434071
59	NC_011333	TGATT	2	10	119806	119815	20 %	60 %	20 %	0 %	208434073
60	NC_011333	AGCAG	2	10	120006	120015	40 %	0 %	40 %	20 %	208434074
61	NC_011333	ATCTT	2	10	120899	120908	20 %	60 %	0 %	20 %	208434075
62	NC_011333	AAGCC	2	10	126206	126215	40 %	0 %	20 %	40 %	208434078
63	NC_011333	TTGAT	2	10	128079	128088	20 %	60 %	20 %	0 %	208434079
64	NC_011333	TTTGA	2	10	129331	129340	20 %	60 %	20 %	0 %	208434080
65	NC_011333	GACTT	2	10	129865	129874	20 %	40 %	20 %	20 %	208434080
66	NC_011333	ATCTC	2	10	130616	130625	20 %	40 %	0 %	40 %	208434080
67	NC_011333	CGCTT	2	10	130774	130783	0 %	40 %	20 %	40 %	208434080
68	NC_011333	TGCGT	2	10	133163	133172	0 %	40 %	40 %	20 %	208434082
69	NC_011333	GAAAA	2	10	133324	133333	80 %	0 %	20 %	0 %	208434082
70	NC_011333	GAAAA	2	10	133642	133651	80 %	0 %	20 %	0 %	208434082
71	NC_011333	ATTTT	2	10	136604	136613	20 %	80 %	0 %	0 %	208434088
72	NC_011333	ATGTT	2	10	136686	136695	20 %	60 %	20 %	0 %	208434088
73	NC_011333	AAAAG	2	10	137098	137107	80 %	0 %	20 %	0 %	208434088
74	NC_011333	AAATC	2	10	139134	139143	60 %	20 %	0 %	20 %	208434089
75	NC_011333	AAAAT	2	10	140606	140615	80 %	20 %	0 %	0 %	208434090
76	NC_011333	TTTTC	2	10	143164	143173	0 %	80 %	0 %	20 %	208434092
77	NC_011333	GTAAA	2	10	143716	143725	60 %	20 %	20 %	0 %	208434093
78	NC_011333	TTCTT	2	10	145120	145129	0 %	80 %	0 %	20 %	208434094
79	NC_011333	TCTTT	2	10	145615	145624	0 %	80 %	0 %	20 %	208434095
80	NC_011333	TTTTG	2	10	146788	146797	0 %	80 %	20 %	0 %	208434096
81	NC_011333	GCGAT	2	10	147581	147590	20 %	20 %	40 %	20 %	208434096
82	NC_011333	GCTTG	2	10	147837	147846	0 %	40 %	40 %	20 %	208434096
83	NC_011333	GTCCA	2	10	148441	148450	20 %	20 %	20 %	40 %	208434097
84	NC_011333	TTTTG	2	10	148489	148498	0 %	80 %	20 %	0 %	208434097
85	NC_011333	CCAAA	2	10	150329	150338	60 %	0 %	0 %	40 %	208434098
86	NC_011333	ACGCC	2	10	153851	153860	20 %	0 %	20 %	60 %	208434100
87	NC_011333	TTATT	2	10	155747	155756	20 %	80 %	0 %	0 %	208434104
88	NC_011333	GCGTT	2	10	156114	156123	0 %	40 %	40 %	20 %	208434105
89	NC_011333	GGGGA	2	10	159810	159819	20 %	0 %	80 %	0 %	208434108
90	NC_011333	AGATT	2	10	161609	161618	40 %	40 %	20 %	0 %	208434110
91	NC_011333	AAGCC	2	10	162946	162955	40 %	0 %	20 %	40 %	208434113
92	NC_011333	GTTTT	2	10	164699	164708	0 %	80 %	20 %	0 %	208434114
93	NC_011333	ATTTT	2	10	164983	164992	20 %	80 %	0 %	0 %	208434115
94	NC_011333	GGGTG	2	10	165339	165348	0 %	20 %	80 %	0 %	208434115
95	NC_011333	ATTCA	2	10	166745	166754	40 %	40 %	0 %	20 %	208434116
96	NC_011333	CACTT	2	10	166949	166958	20 %	40 %	0 %	40 %	208434116
97	NC_011333	ATCTT	2	10	170147	170156	20 %	60 %	0 %	20 %	208434119
98	NC_011333	TAATT	2	10	174641	174650	40 %	60 %	0 %	0 %	208434125
99	NC_011333	CCGCA	2	10	178063	178072	20 %	0 %	20 %	60 %	208434128
100	NC_011333	ATTTG	2	10	179550	179559	20 %	60 %	20 %	0 %	208434129
101	NC_011333	AATTG	2	10	179706	179715	40 %	40 %	20 %	0 %	208434130
102	NC_011333	AAATC	2	10	179789	179798	60 %	20 %	0 %	20 %	208434130
103	NC_011333	AAATG	2	10	181212	181221	60 %	20 %	20 %	0 %	208434131
104	NC_011333	TGTAA	2	10	182001	182010	40 %	40 %	20 %	0 %	208434132
105	NC_011333	AGCTT	2	10	183039	183048	20 %	40 %	20 %	20 %	208434133
106	NC_011333	ATAAA	2	10	183497	183506	80 %	20 %	0 %	0 %	208434133
107	NC_011333	AAAAG	2	10	184653	184662	80 %	0 %	20 %	0 %	208434135
108	NC_011333	ACCCC	2	10	184718	184727	20 %	0 %	0 %	80 %	208434135
109	NC_011333	GAAGC	2	10	184845	184854	40 %	0 %	40 %	20 %	208434136
110	NC_011333	TGAAT	2	10	185034	185043	40 %	40 %	20 %	0 %	208434136
111	NC_011333	CCTTA	2	10	188009	188018	20 %	40 %	0 %	40 %	208434138
112	NC_011333	ATTCA	2	10	192151	192160	40 %	40 %	0 %	20 %	208434141
113	NC_011333	AATCC	2	10	192828	192837	40 %	20 %	0 %	40 %	208434141
114	NC_011333	TATTG	2	10	197436	197445	20 %	60 %	20 %	0 %	208434145
115	NC_011333	TCATT	2	10	197767	197776	20 %	60 %	0 %	20 %	208434145
116	NC_011333	CTATT	2	10	198656	198665	20 %	60 %	0 %	20 %	208434147
117	NC_011333	TTTTC	2	10	199716	199725	0 %	80 %	0 %	20 %	208434148
118	NC_011333	ATTAG	2	10	201694	201703	40 %	40 %	20 %	0 %	208434150
119	NC_011333	TATTT	2	10	203477	203486	20 %	80 %	0 %	0 %	208434152
120	NC_011333	TTTCA	2	10	204133	204142	20 %	60 %	0 %	20 %	208434153
121	NC_011333	TGAAT	2	10	207123	207132	40 %	40 %	20 %	0 %	208434155
122	NC_011333	TGGGG	2	10	211151	211160	0 %	20 %	80 %	0 %	208434158
123	NC_011333	ATTCT	2	10	213584	213593	20 %	60 %	0 %	20 %	208434159
124	NC_011333	GCAAA	2	10	216188	216197	60 %	0 %	20 %	20 %	208434161
125	NC_011333	CTTTT	2	10	216229	216238	0 %	80 %	0 %	20 %	208434161
126	NC_011333	CCTAA	2	10	216972	216981	40 %	20 %	0 %	40 %	208434162
127	NC_011333	TAAAA	2	10	218395	218404	80 %	20 %	0 %	0 %	208434163
128	NC_011333	CCACC	2	10	219920	219929	20 %	0 %	0 %	80 %	208434163
129	NC_011333	TTACA	2	10	220107	220116	40 %	40 %	0 %	20 %	208434164
130	NC_011333	GTGGG	2	10	224145	224154	0 %	20 %	80 %	0 %	208434168
131	NC_011333	TGATG	2	10	224335	224344	20 %	40 %	40 %	0 %	208434168
132	NC_011333	GGTTC	2	10	224693	224702	0 %	40 %	40 %	20 %	208434169
133	NC_011333	GATTT	2	10	225646	225655	20 %	60 %	20 %	0 %	208434169
134	NC_011333	TGGGG	2	10	226447	226456	0 %	20 %	80 %	0 %	208434171
135	NC_011333	GATTG	2	10	226566	226575	20 %	40 %	40 %	0 %	208434171
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262	NC_011333	GTTTT	2	10	410682	410691	0 %	80 %	20 %	0 %	208434346
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