MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori G27 chromosome

Total Repeats: 14627

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011333	TGA	3	9	111	119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208433977
2	NC_011333	GTT	2	6	295	300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208433977
3	NC_011333	TTC	2	6	346	351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433977
4	NC_011333	ACA	2	6	372	377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	208433977
5	NC_011333	AAT	2	6	447	452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	208433978
6	NC_011333	TTA	2	6	483	488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	208433978
7	NC_011333	CTT	2	6	790	795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433978
8	NC_011333	TGA	2	6	808	813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208433978
9	NC_011333	CCG	4	12	1033	1044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	208433979
10	NC_011333	CCA	2	6	1177	1182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	208433979
11	NC_011333	GCT	2	6	1202	1207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	208433979
12	NC_011333	GCT	2	6	1242	1247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	208433979
13	NC_011333	GGC	2	6	1393	1398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	208433979
14	NC_011333	GTT	2	6	1613	1618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208433979
15	NC_011333	TTC	2	6	1752	1757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433980
16	NC_011333	GTT	2	6	1887	1892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208433980
17	NC_011333	TTC	2	6	1974	1979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433980
18	NC_011333	TGG	2	6	2033	2038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	208433980
19	NC_011333	TCA	2	6	2041	2046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	208433980
20	NC_011333	TGA	2	6	2652	2657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208433981
21	NC_011333	GTG	2	6	2956	2961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	208433981
22	NC_011333	AGA	2	6	3054	3059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	208433981
23	NC_011333	GTG	2	6	3115	3120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	208433981
24	NC_011333	GCC	2	6	3122	3127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	208433981
25	NC_011333	GCG	2	6	3541	3546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	208433982
26	NC_011333	GGT	2	6	3567	3572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	208433982
27	NC_011333	CTA	2	6	3608	3613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	208433982
28	NC_011333	ATT	2	6	3896	3901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	208433982
29	NC_011333	GGC	2	6	3969	3974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	208433982
30	NC_011333	AAT	2	6	4627	4632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	208433983
31	NC_011333	TAG	2	6	5129	5134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208433984
32	NC_011333	ATT	2	6	5271	5276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	208433984
33	NC_011333	TGG	2	6	5369	5374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	208433984
34	NC_011333	TCT	2	6	5508	5513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433984
35	NC_011333	TTG	2	6	5572	5577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208433984
36	NC_011333	TAA	2	6	5640	5645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	208433984
37	NC_011333	TTA	2	6	5698	5703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	208433984
38	NC_011333	GTG	2	6	5767	5772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	208433984
39	NC_011333	CAA	2	6	5835	5840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	208433984
40	NC_011333	CAG	2	6	6116	6121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	208433984
41	NC_011333	CTT	2	6	6362	6367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433984
42	NC_011333	TAG	7	21	6389	6409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208433984
43	NC_011333	TTA	2	6	6418	6423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	208433984
44	NC_011333	CGT	2	6	6438	6443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	208433984
45	NC_011333	TTG	2	6	6504	6509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208433984
46	NC_011333	GTT	2	6	6573	6578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208433984
47	NC_011333	GCT	2	6	6822	6827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	208433984
48	NC_011333	GTT	2	6	6852	6857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208433984
49	NC_011333	CAT	2	6	7377	7382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	208433985
50	NC_011333	GCC	2	6	7383	7388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	208433985
51	NC_011333	TCT	2	6	7444	7449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433985
52	NC_011333	AAT	2	6	7542	7547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	208433985
53	NC_011333	CTT	2	6	7550	7555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433985
54	NC_011333	CAT	2	6	7640	7645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	208433985
55	NC_011333	ATG	2	6	7693	7698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208433985
56	NC_011333	TCA	2	6	7717	7722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	208433985
57	NC_011333	CCG	2	6	7771	7776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	208433985
58	NC_011333	CTT	2	6	7790	7795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433985
59	NC_011333	CCG	2	6	7799	7804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	208433985
60	NC_011333	CAT	2	6	7994	7999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	208433985
61	NC_011333	GTG	2	6	8026	8031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	208433985
62	NC_011333	TTC	2	6	8106	8111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433985
63	NC_011333	CCG	2	6	8125	8130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	208433985
64	NC_011333	CAC	2	6	8226	8231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	208433985
65	NC_011333	GAT	2	6	8268	8273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208433985
66	NC_011333	GGA	2	6	8315	8320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	208433985
67	NC_011333	TCT	2	6	8590	8595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433985
68	NC_011333	TGA	2	6	8633	8638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208433985
69	NC_011333	CTT	2	6	8711	8716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433985
70	NC_011333	GCA	2	6	8764	8769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	208433985
71	NC_011333	CAT	2	6	8942	8947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	208433985
72	NC_011333	TCT	2	6	9148	9153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433986
73	NC_011333	CTT	2	6	9230	9235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433986
74	NC_011333	GAT	3	9	9318	9326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208433986
75	NC_011333	TCT	2	6	9346	9351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433986
76	NC_011333	CTA	2	6	9362	9367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	208433986
77	NC_011333	TTG	2	6	9788	9793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208433987
78	NC_011333	GAA	2	6	9804	9809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	208433987
79	NC_011333	TTA	2	6	9983	9988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	208433987
80	NC_011333	AGA	2	6	9998	10003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	208433987
81	NC_011333	ACC	2	6	10006	10011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	208433987
82	NC_011333	AAG	2	6	10039	10044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	208433987
83	NC_011333	ATT	2	6	10072	10077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	208433987
84	NC_011333	CAT	2	6	10253	10258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	208433987
85	NC_011333	GTG	2	6	10287	10292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	208433987
86	NC_011333	ATG	2	6	10567	10572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208433987
87	NC_011333	AGG	2	6	10632	10637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	208433987
88	NC_011333	AAC	2	6	10659	10664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	208433987
89	NC_011333	GAT	2	6	10679	10684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208433987
90	NC_011333	AGA	2	6	11045	11050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	208433987
91	NC_011333	TTG	2	6	11058	11063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208433987
92	NC_011333	GAC	2	6	11145	11150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	208433987
93	NC_011333	TTA	3	9	11166	11174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	208433987
94	NC_011333	TTG	2	6	11223	11228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208433987
95	NC_011333	TGT	2	6	11409	11414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208433988
96	NC_011333	TGT	2	6	11577	11582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208433988
97	NC_011333	AAG	2	6	11736	11741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	208433988
98	NC_011333	GGT	2	6	11822	11827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	208433988
99	NC_011333	TTG	2	6	11913	11918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208433988
100	NC_011333	TGG	3	9	12147	12155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	208433988
101	NC_011333	GAA	3	9	12164	12172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	208433988
102	NC_011333	AGA	2	6	12268	12273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	208433988
103	NC_011333	TTA	2	6	12578	12583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	208433989
104	NC_011333	GAA	2	6	12595	12600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	208433989
105	NC_011333	GTT	2	6	12662	12667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208433989
106	NC_011333	ATT	2	6	12685	12690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	208433989
107	NC_011333	CGC	2	6	12837	12842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	208433989
108	NC_011333	CAA	2	6	12933	12938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	208433989
109	NC_011333	AAT	2	6	12967	12972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	208433989
110	NC_011333	ACC	2	6	13061	13066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	208433989
111	NC_011333	GGT	2	6	13203	13208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	208433989
112	NC_011333	TTG	2	6	13211	13216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208433989
113	NC_011333	AGA	3	9	13263	13271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	208433989
114	NC_011333	GTG	2	6	13689	13694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	208433990
115	NC_011333	GAA	2	6	13780	13785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	208433991
116	NC_011333	ATT	2	6	13967	13972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	208433991
117	NC_011333	GAA	2	6	14106	14111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	208433992
118	NC_011333	AAC	2	6	14112	14117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	208433992
119	NC_011333	ATG	2	6	14131	14136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208433992
120	NC_011333	TCC	2	6	14176	14181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	208433992
121	NC_011333	CAA	2	6	14316	14321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	208433992
122	NC_011333	AAG	2	6	14377	14382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	208433992
123	NC_011333	TAG	2	6	14644	14649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208433992
124	NC_011333	ATT	2	6	14701	14706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	208433992
125	NC_011333	GCT	2	6	14924	14929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	208433992
126	NC_011333	TTA	2	6	14992	14997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	208433992
127	NC_011333	ACC	2	6	15139	15144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	208433992
128	NC_011333	ATT	2	6	15262	15267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	208433992
129	NC_011333	AAG	2	6	15295	15300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	208433992
130	NC_011333	CAA	2	6	15308	15313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	208433992
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