MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori G27 chromosome

Total Repeats: 29602

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011333	TTCA	2	8	178855	178862	25 %	50 %	0 %	25 %	208434129
3002	NC_011333	TGA	2	6	179024	179029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208434129
3003	NC_011333	TCA	2	6	179040	179045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	208434129
3004	NC_011333	GAA	2	6	179053	179058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	208434129
3005	NC_011333	AAG	2	6	179195	179200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	208434129
3006	NC_011333	GTTTAA	2	12	179268	179279	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	208434129
3007	NC_011333	AAG	2	6	179312	179317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	208434129
3008	NC_011333	GAGC	2	8	179354	179361	25 %	0 %	50 %	25 %	208434129
3009	NC_011333	G	6	6	179461	179466	0 %	0 %	100 %	0 %	208434129
3010	NC_011333	ATTTG	2	10	179550	179559	20 %	60 %	20 %	0 %	208434129
3011	NC_011333	T	7	7	179566	179572	0 %	100 %	0 %	0 %	208434129
3012	NC_011333	TAA	2	6	179634	179639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	208434129
3013	NC_011333	GAGC	2	8	179682	179689	25 %	0 %	50 %	25 %	208434130
3014	NC_011333	AATTG	2	10	179706	179715	40 %	40 %	20 %	0 %	208434130
3015	NC_011333	GC	3	6	179781	179786	0 %	0 %	50 %	50 %	208434130
3016	NC_011333	AAATC	2	10	179789	179798	60 %	20 %	0 %	20 %	208434130
3017	NC_011333	A	6	6	179870	179875	100 %	0 %	0 %	0 %	208434130
3018	NC_011333	ATG	2	6	179894	179899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208434130
3019	NC_011333	ATAC	2	8	179903	179910	50 %	25 %	0 %	25 %	208434130
3020	NC_011333	AG	3	6	179925	179930	50 %	0 %	50 %	0 %	208434130
3021	NC_011333	A	6	6	180115	180120	100 %	0 %	0 %	0 %	208434130
3022	NC_011333	AGA	2	6	180204	180209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	208434130
3023	NC_011333	ATC	2	6	180889	180894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	208434131
3024	NC_011333	A	6	6	181060	181065	100 %	0 %	0 %	0 %	208434131
3025	NC_011333	CTC	2	6	181072	181077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	208434131
3026	NC_011333	GATT	2	8	181089	181096	25 %	50 %	25 %	0 %	208434131
3027	NC_011333	CTT	2	6	181104	181109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208434131
3028	NC_011333	AAATG	2	10	181212	181221	60 %	20 %	20 %	0 %	208434131
3029	NC_011333	GCTC	2	8	181234	181241	0 %	25 %	25 %	50 %	208434131
3030	NC_011333	GTG	2	6	181247	181252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	208434131
3031	NC_011333	AG	3	6	181268	181273	50 %	0 %	50 %	0 %	208434131
3032	NC_011333	TCT	2	6	181349	181354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208434131
3033	NC_011333	GT	4	8	181445	181452	0 %	50 %	50 %	0 %	208434131
3034	NC_011333	TG	3	6	181484	181489	0 %	50 %	50 %	0 %	208434131
3035	NC_011333	TCAA	2	8	181502	181509	50 %	25 %	0 %	25 %	208434131
3036	NC_011333	CT	3	6	181562	181567	0 %	50 %	0 %	50 %	208434131
3037	NC_011333	G	6	6	181659	181664	0 %	0 %	100 %	0 %	208434131
3038	NC_011333	ATG	2	6	181721	181726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208434131
3039	NC_011333	TCT	2	6	181733	181738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208434131
3040	NC_011333	CTTT	2	8	181820	181827	0 %	75 %	0 %	25 %	208434131
3041	NC_011333	ATTTTT	2	12	181892	181903	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	208434131
3042	NC_011333	TCA	2	6	181963	181968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	208434132
3043	NC_011333	TGTAA	2	10	182001	182010	40 %	40 %	20 %	0 %	208434132
3044	NC_011333	TGA	2	6	182024	182029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208434132
3045	NC_011333	TCA	2	6	182068	182073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	208434132
3046	NC_011333	T	6	6	182091	182096	0 %	100 %	0 %	0 %	208434132
3047	NC_011333	GTT	2	6	182123	182128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208434132
3048	NC_011333	GCC	2	6	182133	182138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	208434132
3049	NC_011333	ATTT	2	8	182202	182209	25 %	75 %	0 %	0 %	208434132
3050	NC_011333	CTTG	2	8	182210	182217	0 %	50 %	25 %	25 %	208434132
3051	NC_011333	TGG	2	6	182393	182398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	208434132
3052	NC_011333	CCGCTC	2	12	182425	182436	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	208434132
3053	NC_011333	CTTT	2	8	182455	182462	0 %	75 %	0 %	25 %	208434132
3054	NC_011333	TAA	2	6	182564	182569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	208434133
3055	NC_011333	AAG	2	6	182587	182592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	208434133
3056	NC_011333	GAT	2	6	182615	182620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208434133
3057	NC_011333	T	6	6	182656	182661	0 %	100 %	0 %	0 %	208434133
3058	NC_011333	GGGT	2	8	182665	182672	0 %	25 %	75 %	0 %	208434133
3059	NC_011333	A	6	6	182849	182854	100 %	0 %	0 %	0 %	208434133
3060	NC_011333	GAA	2	6	182875	182880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	208434133
3061	NC_011333	CTTT	2	8	182943	182950	0 %	75 %	0 %	25 %	208434133
3062	NC_011333	ATT	2	6	183020	183025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	208434133
3063	NC_011333	TCT	2	6	183033	183038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208434133
3064	NC_011333	AGCTT	2	10	183039	183048	20 %	40 %	20 %	20 %	208434133
3065	NC_011333	T	6	6	183106	183111	0 %	100 %	0 %	0 %	208434133
3066	NC_011333	GCTT	2	8	183112	183119	0 %	50 %	25 %	25 %	208434133
3067	NC_011333	GAGC	2	8	183121	183128	25 %	0 %	50 %	25 %	208434133
3068	NC_011333	TGT	2	6	183145	183150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208434133
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3070	NC_011333	CAA	2	6	183278	183283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	208434133
3071	NC_011333	T	6	6	183305	183310	0 %	100 %	0 %	0 %	208434133
3072	NC_011333	A	7	7	183327	183333	100 %	0 %	0 %	0 %	208434133
3073	NC_011333	A	7	7	183342	183348	100 %	0 %	0 %	0 %	208434133
3074	NC_011333	A	7	7	183391	183397	100 %	0 %	0 %	0 %	208434133
3075	NC_011333	ACCA	2	8	183408	183415	50 %	0 %	0 %	50 %	208434133
3076	NC_011333	A	6	6	183450	183455	100 %	0 %	0 %	0 %	208434133
3077	NC_011333	CAA	2	6	183491	183496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	208434133
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3079	NC_011333	AATA	2	8	183546	183553	75 %	25 %	0 %	0 %	208434133
3080	NC_011333	ACA	2	6	183595	183600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	208434133
3081	NC_011333	A	6	6	183611	183616	100 %	0 %	0 %	0 %	208434133
3082	NC_011333	GTGATA	2	12	183693	183704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208434133
3083	NC_011333	AAAC	2	8	183757	183764	75 %	0 %	0 %	25 %	208434133
3084	NC_011333	TAA	2	6	183773	183778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	208434133
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3088	NC_011333	T	7	7	183884	183890	0 %	100 %	0 %	0 %	208434134
3089	NC_011333	T	8	8	183899	183906	0 %	100 %	0 %	0 %	208434134
3090	NC_011333	TTA	2	6	183915	183920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	208434134
3091	NC_011333	T	6	6	183971	183976	0 %	100 %	0 %	0 %	208434134
3092	NC_011333	GAGATA	2	12	184009	184020	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	208434134
3093	NC_011333	GA	3	6	184024	184029	50 %	0 %	50 %	0 %	208434134
3094	NC_011333	TGG	3	9	184076	184084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	208434135
3095	NC_011333	ATTT	2	8	184196	184203	25 %	75 %	0 %	0 %	208434135
3096	NC_011333	ATG	2	6	184237	184242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208434135
3097	NC_011333	TTG	2	6	184247	184252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208434135
3098	NC_011333	T	8	8	184285	184292	0 %	100 %	0 %	0 %	208434135
3099	NC_011333	T	6	6	184367	184372	0 %	100 %	0 %	0 %	208434135
3100	NC_011333	T	6	6	184386	184391	0 %	100 %	0 %	0 %	208434135
3101	NC_011333	CTTT	2	8	184396	184403	0 %	75 %	0 %	25 %	208434135
3102	NC_011333	CT	3	6	184417	184422	0 %	50 %	0 %	50 %	208434135
3103	NC_011333	TGA	2	6	184433	184438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208434135
3104	NC_011333	A	6	6	184463	184468	100 %	0 %	0 %	0 %	208434135
3105	NC_011333	T	8	8	184473	184480	0 %	100 %	0 %	0 %	208434135
3106	NC_011333	GAA	2	6	184561	184566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	208434135
3107	NC_011333	AATAAA	2	12	184600	184611	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	208434135
3108	NC_011333	TAA	2	6	184620	184625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	208434135
3109	NC_011333	AAAAG	2	10	184653	184662	80 %	0 %	20 %	0 %	208434135
3110	NC_011333	ACCCC	2	10	184718	184727	20 %	0 %	0 %	80 %	208434135
3111	NC_011333	TAA	2	6	184731	184736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	208434135
3112	NC_011333	CAA	2	6	184780	184785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	208434136
3113	NC_011333	GA	3	6	184809	184814	50 %	0 %	50 %	0 %	208434136
3114	NC_011333	GAAGC	2	10	184845	184854	40 %	0 %	40 %	20 %	208434136
3115	NC_011333	CGC	2	6	184863	184868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	208434136
3116	NC_011333	T	6	6	184869	184874	0 %	100 %	0 %	0 %	208434136
3117	NC_011333	AGA	2	6	184902	184907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	208434136
3118	NC_011333	AGGG	2	8	184941	184948	25 %	0 %	75 %	0 %	208434136
3119	NC_011333	TTA	2	6	184982	184987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	208434136
3120	NC_011333	TGAAT	2	10	185034	185043	40 %	40 %	20 %	0 %	208434136
3121	NC_011333	ATG	2	6	185353	185358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208434136
3122	NC_011333	G	6	6	185472	185477	0 %	0 %	100 %	0 %	208434136
3123	NC_011333	AATC	2	8	185496	185503	50 %	25 %	0 %	25 %	208434136
3124	NC_011333	GAT	2	6	185553	185558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208434136
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3126	NC_011333	ACT	2	6	185621	185626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	208434136
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