MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1 chromosome

Total Repeats: 18384

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011126	AAG	2	6	590	595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952381
2	NC_011126	TCT	2	6	601	606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952381
3	NC_011126	TAT	2	6	832	837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952381
4	NC_011126	ATA	2	6	853	858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952381
5	NC_011126	GAT	2	6	901	906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952381
6	NC_011126	ACA	2	6	977	982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195952381
7	NC_011126	GGT	2	6	1060	1065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952381
8	NC_011126	TGG	2	6	1070	1075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952381
9	NC_011126	GAT	2	6	1087	1092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952381
10	NC_011126	TAT	2	6	1107	1112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952381
11	NC_011126	ACC	2	6	1180	1185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195952381
12	NC_011126	AAC	2	6	1186	1191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195952381
13	NC_011126	TAA	2	6	1371	1376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952381
14	NC_011126	GTT	2	6	1790	1795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952382
15	NC_011126	AAG	2	6	1864	1869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952382
16	NC_011126	CTT	2	6	1971	1976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952382
17	NC_011126	CAT	2	6	2029	2034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952382
18	NC_011126	CCA	2	6	2046	2051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195952382
19	NC_011126	AAG	2	6	2070	2075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952382
20	NC_011126	TAT	2	6	2104	2109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952382
21	NC_011126	CCT	2	6	2321	2326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195952382
22	NC_011126	ATC	2	6	2399	2404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952382
23	NC_011126	TAT	2	6	2439	2444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952383
24	NC_011126	CAT	2	6	2502	2507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952383
25	NC_011126	TAC	2	6	2529	2534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952383
26	NC_011126	CTT	2	6	2654	2659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952383
27	NC_011126	TCT	2	6	2704	2709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952383
28	NC_011126	TTA	2	6	2714	2719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952383
29	NC_011126	TTC	2	6	2721	2726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952383
30	NC_011126	TCA	2	6	2970	2975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952384
31	NC_011126	ATA	2	6	3197	3202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952384
32	NC_011126	TGG	2	6	3228	3233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952384
33	NC_011126	TGA	2	6	3265	3270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952384
34	NC_011126	ACA	2	6	3294	3299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195952384
35	NC_011126	ACT	2	6	3437	3442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952384
36	NC_011126	CTC	2	6	3666	3671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195952384
37	NC_011126	GCA	2	6	3686	3691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195952384
38	NC_011126	ATT	3	9	3795	3803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952384
39	NC_011126	GAT	2	6	3952	3957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952384
40	NC_011126	TGG	2	6	3997	4002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952384
41	NC_011126	AGA	2	6	4138	4143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952384
42	NC_011126	GAA	2	6	4197	4202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952384
43	NC_011126	TGA	2	6	4256	4261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952384
44	NC_011126	TGC	2	6	4410	4415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195952385
45	NC_011126	ATT	2	6	4537	4542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952385
46	NC_011126	ACA	2	6	4565	4570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195952385
47	NC_011126	ACA	2	6	4577	4582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195952385
48	NC_011126	AGA	2	6	4698	4703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952385
49	NC_011126	ATA	2	6	4726	4731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952385
50	NC_011126	CTA	2	6	4748	4753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952385
51	NC_011126	TCT	2	6	4774	4779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952385
52	NC_011126	GAA	2	6	4891	4896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952385
53	NC_011126	GTG	2	6	4922	4927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952385
54	NC_011126	GAT	2	6	4939	4944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952385
55	NC_011126	CAT	2	6	4980	4985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952385
56	NC_011126	ATG	2	6	5378	5383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952385
57	NC_011126	CTA	3	9	5387	5395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952385
58	NC_011126	AAG	2	6	5686	5691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952386
59	NC_011126	AGA	2	6	5839	5844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952386
60	NC_011126	GTT	2	6	5856	5861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952386
61	NC_011126	CTT	2	6	5891	5896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952386
62	NC_011126	ATG	2	6	5928	5933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952386
63	NC_011126	TGT	2	6	5938	5943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952386
64	NC_011126	AGA	2	6	5950	5955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952386
65	NC_011126	CTT	2	6	5970	5975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952386
66	NC_011126	GAA	2	6	6053	6058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952386
67	NC_011126	GGT	3	9	6073	6081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952386
68	NC_011126	AGA	2	6	6085	6090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952386
69	NC_011126	CTG	2	6	6298	6303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195952387
70	NC_011126	ATC	2	6	6396	6401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952387
71	NC_011126	CAT	2	6	6422	6427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952387
72	NC_011126	CTT	2	6	6431	6436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952387
73	NC_011126	GCT	2	6	6599	6604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195952387
74	NC_011126	AAG	2	6	6646	6651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952387
75	NC_011126	TTA	2	6	6686	6691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952387
76	NC_011126	CTT	2	6	6704	6709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952387
77	NC_011126	TCT	2	6	6802	6807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952387
78	NC_011126	CTA	2	6	7025	7030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952387
79	NC_011126	TAG	2	6	7036	7041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952387
80	NC_011126	ATG	2	6	7057	7062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952387
81	NC_011126	CTT	3	9	7085	7093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952387
82	NC_011126	GGT	2	6	7188	7193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952387
83	NC_011126	CCA	2	6	7413	7418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195952387
84	NC_011126	TTG	2	6	7511	7516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952387
85	NC_011126	AAC	2	6	7566	7571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195952387
86	NC_011126	ATT	2	6	7587	7592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952388
87	NC_011126	TAG	2	6	7696	7701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952388
88	NC_011126	GGT	2	6	7814	7819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952388
89	NC_011126	AAG	2	6	7828	7833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952388
90	NC_011126	CTT	2	6	8148	8153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952388
91	NC_011126	GGT	2	6	8582	8587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952388
92	NC_011126	AAG	2	6	8775	8780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952389
93	NC_011126	GCG	2	6	8933	8938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	195952389
94	NC_011126	TGT	2	6	9195	9200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952389
95	NC_011126	CTA	2	6	9336	9341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952389
96	NC_011126	TCC	2	6	9458	9463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195952389
97	NC_011126	GCT	2	6	9561	9566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195952390
98	NC_011126	CCA	2	6	9583	9588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195952390
99	NC_011126	ATC	2	6	9627	9632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952390
100	NC_011126	CCA	2	6	9673	9678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195952390
101	NC_011126	TAT	2	6	9695	9700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952390
102	NC_011126	TAG	2	6	9718	9723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952390
103	NC_011126	CTA	2	6	9805	9810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952390
104	NC_011126	GGT	2	6	10034	10039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952390
105	NC_011126	ATG	2	6	10224	10229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952390
106	NC_011126	CAT	2	6	10249	10254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952390
107	NC_011126	CTA	2	6	10261	10266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952390
108	NC_011126	CCT	2	6	10311	10316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195952390
109	NC_011126	AGC	2	6	10328	10333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195952390
110	NC_011126	CTT	2	6	10353	10358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952390
111	NC_011126	TGT	2	6	10390	10395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952390
112	NC_011126	TAT	2	6	11111	11116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952391
113	NC_011126	TGC	2	6	11204	11209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195952391
114	NC_011126	CTA	2	6	11257	11262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952391
115	NC_011126	TAC	2	6	11267	11272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952391
116	NC_011126	GGC	2	6	11336	11341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	195952391
117	NC_011126	GAA	2	6	11849	11854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952392
118	NC_011126	CTT	2	6	11930	11935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952392
119	NC_011126	GAC	2	6	11975	11980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195952392
120	NC_011126	ATG	2	6	12191	12196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952392
121	NC_011126	ATC	2	6	12306	12311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952392
122	NC_011126	TCA	2	6	12327	12332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952392
123	NC_011126	TGG	2	6	12384	12389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952392
124	NC_011126	ATC	2	6	12606	12611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952393
125	NC_011126	ACC	2	6	12714	12719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195952393
126	NC_011126	ATA	2	6	12720	12725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952393
127	NC_011126	ATG	2	6	12756	12761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952393
128	NC_011126	TAG	2	6	12781	12786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952393
129	NC_011126	TGG	2	6	13195	13200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952393
130	NC_011126	GAA	2	6	13257	13262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952393
131	NC_011126	GCT	2	6	13272	13277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195952393
132	NC_011126	ACG	2	6	13330	13335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195952393
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134	NC_011126	TAA	2	6	13483	13488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952393
135	NC_011126	ATA	2	6	13572	13577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952393
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138	NC_011126	ATA	2	6	13944	13949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952393
139	NC_011126	TCT	2	6	14113	14118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952393
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143	NC_011126	CTT	2	6	14790	14795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952394
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163	NC_011126	TGG	2	6	16978	16983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952396
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167	NC_011126	TGG	2	6	17148	17153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952396
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239	NC_011126	TGA	2	6	22827	22832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952403
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241	NC_011126	TTG	2	6	23012	23017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952403
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244	NC_011126	AGA	3	9	23293	23301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952404
245	NC_011126	AGC	2	6	23307	23312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195952404
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247	NC_011126	AAG	2	6	23446	23451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952404
248	NC_011126	TAT	2	6	23515	23520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952404
249	NC_011126	ACT	2	6	23570	23575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952405
250	NC_011126	ACC	2	6	23707	23712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195952405
251	NC_011126	CTT	3	9	23720	23728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952405
252	NC_011126	TTG	2	6	23793	23798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952405
253	NC_011126	TTC	2	6	23820	23825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952405
254	NC_011126	TCT	2	6	23882	23887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952406
255	NC_011126	TGG	2	6	23926	23931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952406
256	NC_011126	TTA	2	6	23943	23948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952406
257	NC_011126	ACC	2	6	23953	23958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195952406
258	NC_011126	TAT	2	6	23995	24000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952406
259	NC_011126	TAC	2	6	24009	24014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952406
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263	NC_011126	CTT	2	6	24678	24683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952406
264	NC_011126	ACC	2	6	24712	24717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195952406
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