MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1 chromosome

Total Repeats: 32875

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011126	CTA	2	6	25110	25115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952406
502	NC_011126	TA	3	6	25129	25134	50 %	50 %	0 %	0 %	195952406
503	NC_011126	GTA	2	6	25176	25181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952406
504	NC_011126	TAT	2	6	25228	25233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952406
505	NC_011126	AAAAT	2	10	25282	25291	80 %	20 %	0 %	0 %	195952407
506	NC_011126	T	6	6	25410	25415	0 %	100 %	0 %	0 %	195952407
507	NC_011126	GTTT	2	8	25420	25427	0 %	75 %	25 %	0 %	195952407
508	NC_011126	CAT	2	6	25582	25587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952407
509	NC_011126	ATC	2	6	25618	25623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952407
510	NC_011126	GTT	2	6	25648	25653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952407
511	NC_011126	ATCTTC	2	12	25663	25674	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	195952407
512	NC_011126	A	6	6	25677	25682	100 %	0 %	0 %	0 %	195952407
513	NC_011126	TTC	2	6	25864	25869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952407
514	NC_011126	AT	3	6	25896	25901	50 %	50 %	0 %	0 %	195952407
515	NC_011126	CTTTTT	2	12	25962	25973	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	195952407
516	NC_011126	TATC	2	8	25989	25996	25 %	50 %	0 %	25 %	195952407
517	NC_011126	T	7	7	26070	26076	0 %	100 %	0 %	0 %	195952407
518	NC_011126	A	6	6	26139	26144	100 %	0 %	0 %	0 %	195952407
519	NC_011126	TATC	2	8	26145	26152	25 %	50 %	0 %	25 %	195952407
520	NC_011126	CTT	2	6	26171	26176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952408
521	NC_011126	T	6	6	26286	26291	0 %	100 %	0 %	0 %	195952408
522	NC_011126	T	7	7	26327	26333	0 %	100 %	0 %	0 %	195952408
523	NC_011126	TAC	2	6	26340	26345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952408
524	NC_011126	AGA	2	6	26349	26354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952408
525	NC_011126	CAG	2	6	26375	26380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195952408
526	NC_011126	TCT	2	6	26530	26535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952408
527	NC_011126	CTTT	2	8	26542	26549	0 %	75 %	0 %	25 %	195952408
528	NC_011126	T	6	6	26559	26564	0 %	100 %	0 %	0 %	195952408
529	NC_011126	GTG	2	6	26579	26584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952408
530	NC_011126	TACC	2	8	26639	26646	25 %	25 %	0 %	50 %	195952408
531	NC_011126	CTA	2	6	26678	26683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952408
532	NC_011126	T	9	9	26731	26739	0 %	100 %	0 %	0 %	195952408
533	NC_011126	TCT	2	6	26860	26865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952409
534	NC_011126	CTC	2	6	26964	26969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195952409
535	NC_011126	AT	3	6	27107	27112	50 %	50 %	0 %	0 %	195952409
536	NC_011126	CCG	2	6	27124	27129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	195952409
537	NC_011126	T	7	7	27144	27150	0 %	100 %	0 %	0 %	195952409
538	NC_011126	CTA	2	6	27161	27166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952409
539	NC_011126	GCT	2	6	27199	27204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195952409
540	NC_011126	GTTT	2	8	27231	27238	0 %	75 %	25 %	0 %	195952409
541	NC_011126	CTTT	2	8	27332	27339	0 %	75 %	0 %	25 %	195952409
542	NC_011126	TATT	2	8	27353	27360	25 %	75 %	0 %	0 %	195952409
543	NC_011126	CTT	2	6	27362	27367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952409
544	NC_011126	ATC	2	6	27480	27485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952409
545	NC_011126	CTT	2	6	27563	27568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952409
546	NC_011126	ATCT	2	8	27633	27640	25 %	50 %	0 %	25 %	195952409
547	NC_011126	T	6	6	27640	27645	0 %	100 %	0 %	0 %	195952409
548	NC_011126	AT	3	6	27662	27667	50 %	50 %	0 %	0 %	195952409
549	NC_011126	AGA	2	6	27671	27676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952409
550	NC_011126	CTT	2	6	27677	27682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952409
551	NC_011126	AAT	2	6	27738	27743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952409
552	NC_011126	CGT	2	6	27836	27841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195952409
553	NC_011126	T	6	6	27851	27856	0 %	100 %	0 %	0 %	195952409
554	NC_011126	AAT	2	6	27863	27868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952409
555	NC_011126	GAA	2	6	27970	27975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952409
556	NC_011126	GTA	2	6	28056	28061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952409
557	NC_011126	TTG	2	6	28069	28074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952409
558	NC_011126	T	6	6	28174	28179	0 %	100 %	0 %	0 %	195952409
559	NC_011126	GTT	2	6	28185	28190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952409
560	NC_011126	TGT	2	6	28196	28201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952409
561	NC_011126	ATT	2	6	28228	28233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195952409
562	NC_011126	T	6	6	28246	28251	0 %	100 %	0 %	0 %	195952409
563	NC_011126	TTG	2	6	28336	28341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952409
564	NC_011126	AT	4	8	28346	28353	50 %	50 %	0 %	0 %	195952409
565	NC_011126	CCT	2	6	28434	28439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195952410
566	NC_011126	TGA	2	6	28441	28446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952410
567	NC_011126	T	7	7	28451	28457	0 %	100 %	0 %	0 %	195952410
568	NC_011126	TAA	2	6	28517	28522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952410
569	NC_011126	AT	3	6	28568	28573	50 %	50 %	0 %	0 %	195952410
570	NC_011126	TTG	2	6	28598	28603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952410
571	NC_011126	TGTA	2	8	28628	28635	25 %	50 %	25 %	0 %	195952410
572	NC_011126	GGA	2	6	28738	28743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195952410
573	NC_011126	AGA	2	6	28757	28762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952410
574	NC_011126	GGT	2	6	28773	28778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952410
575	NC_011126	TGT	2	6	28803	28808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952410
576	NC_011126	TGG	2	6	28815	28820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952410
577	NC_011126	T	6	6	28846	28851	0 %	100 %	0 %	0 %	195952410
578	NC_011126	AT	3	6	28893	28898	50 %	50 %	0 %	0 %	195952410
579	NC_011126	CTA	2	6	28920	28925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952410
580	NC_011126	TAAC	2	8	29012	29019	50 %	25 %	0 %	25 %	195952410
581	NC_011126	CTT	2	6	29040	29045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952410
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583	NC_011126	TGT	2	6	29142	29147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952410
584	NC_011126	ATTT	2	8	29178	29185	25 %	75 %	0 %	0 %	195952410
585	NC_011126	CAA	2	6	29262	29267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195952410
586	NC_011126	A	7	7	29266	29272	100 %	0 %	0 %	0 %	195952410
587	NC_011126	TA	3	6	29292	29297	50 %	50 %	0 %	0 %	195952410
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589	NC_011126	A	6	6	29585	29590	100 %	0 %	0 %	0 %	195952411
590	NC_011126	GTG	2	6	29601	29606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195952411
591	NC_011126	A	6	6	29653	29658	100 %	0 %	0 %	0 %	195952411
592	NC_011126	AGC	2	6	29677	29682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195952411
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594	NC_011126	AAG	2	6	29772	29777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952411
595	NC_011126	AT	3	6	29784	29789	50 %	50 %	0 %	0 %	195952411
596	NC_011126	CTTT	2	8	30212	30219	0 %	75 %	0 %	25 %	195952412
597	NC_011126	A	6	6	30234	30239	100 %	0 %	0 %	0 %	195952412
598	NC_011126	T	6	6	30317	30322	0 %	100 %	0 %	0 %	195952412
599	NC_011126	AT	3	6	30344	30349	50 %	50 %	0 %	0 %	195952412
600	NC_011126	AGA	2	6	30368	30373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195952412
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602	NC_011126	TGAA	2	8	30389	30396	50 %	25 %	25 %	0 %	195952412
603	NC_011126	AAAT	2	8	30400	30407	75 %	25 %	0 %	0 %	195952412
604	NC_011126	T	6	6	30431	30436	0 %	100 %	0 %	0 %	195952412
605	NC_011126	CTA	2	6	30463	30468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952412
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609	NC_011126	TTCTTT	2	12	30572	30583	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	195952412
610	NC_011126	AGT	2	6	30586	30591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952412
611	NC_011126	AT	3	6	30594	30599	50 %	50 %	0 %	0 %	195952412
612	NC_011126	CATC	2	8	30654	30661	25 %	25 %	0 %	50 %	195952412
613	NC_011126	ACC	2	6	30737	30742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195952412
614	NC_011126	T	7	7	30835	30841	0 %	100 %	0 %	0 %	195952412
615	NC_011126	GTA	2	6	30871	30876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195952412
616	NC_011126	AGC	2	6	30960	30965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195952412
617	NC_011126	GTT	3	9	30980	30988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195952412
618	NC_011126	T	6	6	30987	30992	0 %	100 %	0 %	0 %	195952412
619	NC_011126	ATATT	2	10	31005	31014	40 %	60 %	0 %	0 %	195952412
620	NC_011126	TTC	2	6	31059	31064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952413
621	NC_011126	TAA	2	6	31108	31113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952413
622	NC_011126	CCT	2	6	31114	31119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195952413
623	NC_011126	T	6	6	31140	31145	0 %	100 %	0 %	0 %	195952413
624	NC_011126	CTT	2	6	31175	31180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952413
625	NC_011126	CAT	2	6	31220	31225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195952413
626	NC_011126	T	6	6	31287	31292	0 %	100 %	0 %	0 %	195952413
627	NC_011126	AAT	2	6	31341	31346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195952413
628	NC_011126	TCT	2	6	31360	31365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952413
629	NC_011126	AT	3	6	31367	31372	50 %	50 %	0 %	0 %	195952413
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631	NC_011126	CTT	2	6	31466	31471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195952413
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